EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000001507 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5415 bases
Position: chr3:45779364-45784778
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000002178	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-45	1	7
ENSACLP00000002178	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-45	2	7
ENSACLP00000002178	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-45	3	7
ENSACLP00000002178	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-45	4	7
ENSACLP00000002178	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-45	5	7
ENSACLP00000002178	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-45	6	7
ENSACLP00000002178	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-45	7	7
ENSACLP00000002178	zf-met	PF12874.7	4.3e-24	1	3
ENSACLP00000002178	zf-met	PF12874.7	4.3e-24	2	3
ENSACLP00000002178	zf-met	PF12874.7	4.3e-24	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000002225	-	894	-	ENSACLP00000002178	297 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACLG00000001507's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACLG00000001507's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000001507	-	93	63.861	ENSACLG00000022383	-	97	69.268
ENSACLG00000001507	-	68	49.673	ENSACLG00000023305	-	74	49.673
ENSACLG00000001507	-	70	42.574	ENSACLG00000027424	-	66	42.574
ENSACLG00000001507	-	68	51.445	ENSACLG00000020474	-	81	51.445
ENSACLG00000001507	-	91	47.619	ENSACLG00000020393	-	94	47.619
ENSACLG00000001507	-	94	43.348	ENSACLG00000015989	-	91	43.348
ENSACLG00000001507	-	79	56.383	ENSACLG00000017411	-	87	56.383
ENSACLG00000001507	-	77	45.545	ENSACLG00000020615	-	88	45.545
ENSACLG00000001507	-	84	45.685	ENSACLG00000006702	-	72	45.685
ENSACLG00000001507	-	78	82.266	ENSACLG00000011239	-	75	82.266
ENSACLG00000001507	-	78	46.111	ENSACLG00000021045	-	79	45.926
ENSACLG00000001507	-	74	48.515	ENSACLG00000020339	-	54	48.515
ENSACLG00000001507	-	78	46.809	ENSACLG00000020333	-	53	46.809
ENSACLG00000001507	-	89	35.961	ENSACLG00000020579	znf319b	83	35.961
ENSACLG00000001507	-	75	47.980	ENSACLG00000017576	-	87	47.980
ENSACLG00000001507	-	78	41.573	ENSACLG00000000102	-	62	39.896
ENSACLG00000001507	-	70	44.643	ENSACLG00000017801	-	50	44.643
ENSACLG00000001507	-	88	51.485	ENSACLG00000024308	-	98	51.485
ENSACLG00000001507	-	80	45.872	ENSACLG00000006697	-	67	45.872
ENSACLG00000001507	-	78	46.809	ENSACLG00000006718	-	53	46.809
ENSACLG00000001507	-	75	47.143	ENSACLG00000019291	-	88	47.143
ENSACLG00000001507	-	93	62.048	ENSACLG00000023979	-	96	62.048
ENSACLG00000001507	-	85	43.939	ENSACLG00000018700	-	96	43.939
ENSACLG00000001507	-	92	43.541	ENSACLG00000020268	-	66	43.541
ENSACLG00000001507	-	81	42.331	ENSACLG00000016841	-	68	42.581
ENSACLG00000001507	-	78	51.980	ENSACLG00000025163	-	82	51.980
ENSACLG00000001507	-	75	81.905	ENSACLG00000000411	-	91	81.905
ENSACLG00000001507	-	75	50.909	ENSACLG00000011710	-	56	50.909
ENSACLG00000001507	-	75	70.256	ENSACLG00000003546	-	58	70.256
ENSACLG00000001507	-	77	48.276	ENSACLG00000005708	-	71	48.276
ENSACLG00000001507	-	79	61.881	ENSACLG00000006528	-	96	61.881
ENSACLG00000001507	-	78	45.045	ENSACLG00000022505	-	86	45.045
ENSACLG00000001507	-	76	31.474	ENSACLG00000016648	-	69	31.474
ENSACLG00000001507	-	76	47.191	ENSACLG00000001258	-	95	47.191
ENSACLG00000001507	-	84	74.299	ENSACLG00000001045	-	95	75.000
ENSACLG00000001507	-	98	49.261	ENSACLG00000015462	-	75	49.261
ENSACLG00000001507	-	75	44.792	ENSACLG00000005795	-	60	44.792
ENSACLG00000001507	-	94	62.981	ENSACLG00000021846	-	90	62.981
ENSACLG00000001507	-	74	41.827	ENSACLG00000003679	-	82	41.827
ENSACLG00000001507	-	83	42.222	ENSACLG00000027692	-	69	42.211
ENSACLG00000001507	-	85	48.205	ENSACLG00000021343	-	99	47.525
ENSACLG00000001507	-	82	75.385	ENSACLG00000022499	-	88	75.385
ENSACLG00000001507	-	75	74.257	ENSACLG00000022497	-	93	74.257
ENSACLG00000001507	-	82	40.078	ENSACLG00000017925	-	67	40.078
ENSACLG00000001507	-	79	45.312	ENSACLG00000017487	-	70	45.312
ENSACLG00000001507	-	97	48.020	ENSACLG00000011237	-	99	46.411
ENSACLG00000001507	-	82	74.038	ENSACLG00000000473	-	83	74.038
ENSACLG00000001507	-	75	33.333	ENSACLG00000022191	znf407	57	33.333
ENSACLG00000001507	-	77	57.534	ENSACLG00000014600	-	90	57.534
ENSACLG00000001507	-	93	72.897	ENSACLG00000002844	-	81	72.897
ENSACLG00000001507	-	81	39.901	ENSACLG00000020231	-	94	39.901
ENSACLG00000001507	-	68	47.291	ENSACLG00000017321	-	74	47.291
ENSACLG00000001507	-	74	76.923	ENSACLG00000017329	-	86	76.923
ENSACLG00000001507	-	68	49.268	ENSACLG00000019674	-	88	49.268
ENSACLG00000001507	-	85	62.326	ENSACLG00000023941	-	88	62.326
ENSACLG00000001507	-	78	77.934	ENSACLG00000017336	-	93	77.934
ENSACLG00000001507	-	89	37.500	ENSACLG00000019167	-	88	37.500
ENSACLG00000001507	-	70	50.000	ENSACLG00000022482	-	79	50.000
ENSACLG00000001507	-	78	48.077	ENSACLG00000020610	-	65	48.077
ENSACLG00000001507	-	86	47.343	ENSACLG00000017939	-	97	50.000
ENSACLG00000001507	-	75	57.009	ENSACLG00000014365	-	90	57.009
ENSACLG00000001507	-	88	59.701	ENSACLG00000015816	-	96	59.701
ENSACLG00000001507	-	96	45.695	ENSACLG00000024670	-	95	45.695
ENSACLG00000001507	-	79	51.852	ENSACLG00000017849	-	66	51.852
ENSACLG00000001507	-	98	66.346	ENSACLG00000019499	-	99	66.346
ENSACLG00000001507	-	82	50.990	ENSACLG00000024957	-	93	52.239
ENSACLG00000001507	-	83	50.000	ENSACLG00000019424	-	96	44.444
ENSACLG00000001507	-	82	60.891	ENSACLG00000007749	-	81	60.891
ENSACLG00000001507	-	79	37.811	ENSACLG00000017996	prdm5	78	38.119
ENSACLG00000001507	-	86	61.538	ENSACLG00000007888	-	75	61.538
ENSACLG00000001507	-	75	71.852	ENSACLG00000018716	-	73	71.852
ENSACLG00000001507	-	74	64.356	ENSACLG00000022475	-	98	64.356
ENSACLG00000001507	-	84	48.309	ENSACLG00000024459	-	90	48.309
ENSACLG00000001507	-	89	54.194	ENSACLG00000008821	-	98	47.248
ENSACLG00000001507	-	74	77.103	ENSACLG00000000487	-	86	77.103
ENSACLG00000001507	-	75	43.243	ENSACLG00000017941	-	66	43.243
ENSACLG00000001507	-	74	67.797	ENSACLG00000000521	-	96	67.797
ENSACLG00000001507	-	85	64.904	ENSACLG00000015843	-	87	64.904
ENSACLG00000001507	-	78	47.826	ENSACLG00000019270	-	81	47.826
ENSACLG00000001507	-	86	45.274	ENSACLG00000006870	-	57	45.274
ENSACLG00000001507	-	82	44.521	ENSACLG00000027053	gfi1b	71	44.521
ENSACLG00000001507	-	78	66.321	ENSACLG00000019482	-	75	66.321
ENSACLG00000001507	-	84	42.534	ENSACLG00000008606	-	88	42.534
ENSACLG00000001507	-	78	42.424	ENSACLG00000008641	gfi1aa	53	42.424
ENSACLG00000001507	-	81	66.832	ENSACLG00000003229	-	92	66.832
ENSACLG00000001507	-	82	64.423	ENSACLG00000023963	-	95	64.423
ENSACLG00000001507	-	75	80.288	ENSACLG00000018701	-	75	80.288
ENSACLG00000001507	-	78	47.500	ENSACLG00000018707	-	85	47.500
ENSACLG00000001507	-	76	53.390	ENSACLG00000024294	-	74	53.390
ENSACLG00000001507	-	94	45.771	ENSACLG00000019318	-	96	48.889
ENSACLG00000001507	-	85	77.612	ENSACLG00000000537	-	98	79.397
ENSACLG00000001507	-	76	50.279	ENSACLG00000013454	-	63	50.279
ENSACLG00000001507	-	78	44.776	ENSACLG00000011642	-	78	44.776
ENSACLG00000001507	-	78	61.364	ENSACLG00000014167	-	57	61.364
ENSACLG00000001507	-	79	60.784	ENSACLG00000001003	-	88	60.784
ENSACLG00000001507	-	85	48.205	ENSACLG00000025251	-	96	49.065
ENSACLG00000001507	-	76	51.244	ENSACLG00000026703	-	70	51.244
ENSACLG00000001507	-	83	74.519	ENSACLG00000022302	-	97	74.519
ENSACLG00000001507	-	70	40.964	ENSACLG00000022305	-	88	32.627
ENSACLG00000001507	-	83	49.763	ENSACLG00000023513	-	90	44.550
ENSACLG00000001507	-	71	43.939	ENSACLG00000013531	-	88	43.939
ENSACLG00000001507	-	68	38.421	ENSACLG00000004663	-	80	40.000
ENSACLG00000001507	-	75	50.259	ENSACLG00000014336	-	92	50.259
ENSACLG00000001507	-	85	50.000	ENSACLG00000024647	-	93	49.693
ENSACLG00000001507	-	81	33.641	ENSACLG00000012712	znf646	72	35.096
ENSACLG00000001507	-	81	39.375	ENSACLG00000019094	-	93	39.375
ENSACLG00000001507	-	71	37.615	ENSACLG00000018551	snai2	55	37.615
ENSACLG00000001507	-	93	46.193	ENSACLG00000017449	-	69	46.193
ENSACLG00000001507	-	73	45.638	ENSACLG00000008624	-	71	45.638
ENSACLG00000001507	-	78	78.095	ENSACLG00000001018	-	88	78.095
ENSACLG00000001507	-	77	51.786	ENSACLG00000016405	zbtb17	57	46.212
ENSACLG00000001507	-	94	37.619	ENSACLG00000005594	ZNF319	93	37.619
ENSACLG00000001507	-	83	64.286	ENSACLG00000003332	-	97	64.286
ENSACLG00000001507	-	77	42.268	ENSACLG00000026538	-	83	42.268
ENSACLG00000001507	-	90	48.205	ENSACLG00000020260	-	99	48.205
ENSACLG00000001507	-	74	51.351	ENSACLG00000013033	-	81	51.351
ENSACLG00000001507	-	78	81.356	ENSACLG00000028002	-	86	81.356
ENSACLG00000001507	-	73	57.488	ENSACLG00000014176	-	83	57.488
ENSACLG00000001507	-	76	44.444	ENSACLG00000021022	-	61	44.444
ENSACLG00000001507	-	78	46.890	ENSACLG00000021056	-	59	46.890
ENSACLG00000001507	-	79	47.248	ENSACLG00000013935	-	84	47.248
ENSACLG00000001507	-	77	38.793	ENSACLG00000022287	-	59	38.793
ENSACLG00000001507	-	70	61.905	ENSACLG00000022360	-	97	61.905
ENSACLG00000001507	-	76	47.619	ENSACLG00000020975	-	85	47.619
ENSACLG00000001507	-	83	48.851	ENSACLG00000025196	-	93	48.851
ENSACLG00000001507	-	79	51.777	ENSACLG00000018746	-	97	43.119
ENSACLG00000001507	-	72	41.573	ENSACLG00000022439	-	77	41.573
ENSACLG00000001507	-	78	50.249	ENSACLG00000024491	-	81	50.249
ENSACLG00000001507	-	74	39.888	ENSACLG00000005694	-	50	38.158
ENSACLG00000001507	-	82	68.500	ENSACLG00000019349	-	71	68.500
ENSACLG00000001507	-	76	48.889	ENSACLG00000008374	-	51	48.889
ENSACLG00000001507	-	76	52.500	ENSACLG00000001368	-	87	52.500

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000001507	-	88	46.860	ENSACIG00000019791	-	92	47.143	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001507	-	76	56.098	ENSACIG00000011153	-	64	56.098	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001507	-	78	49.425	ENSANAG00000032414	-	80	49.425	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000001507	-	77	51.754	ENSAMXG00000031646	-	97	51.754	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001507	-	97	54.327	ENSAMXG00000010078	-	85	54.327	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001507	-	83	50.885	ENSAMXG00000038324	-	78	50.885	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001507	-	78	52.910	ENSAMXG00000036849	-	79	52.910	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001507	-	77	56.000	ENSAMXG00000031501	-	89	56.000	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001507	-	76	56.250	ENSAMXG00000039162	-	95	56.250	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001507	-	83	51.244	ENSAMXG00000039770	-	88	51.244	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001507	-	90	52.000	ENSAMXG00000031844	-	98	52.000	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001507	-	93	42.788	ENSCHIG00000015741	-	90	42.788	Capra_hircus
ENSACLG00000001507	-	76	45.175	ENSCCAG00000035188	-	83	44.068	Cebus_capucinus
ENSACLG00000001507	-	78	44.000	ENSCPBG00000001258	-	93	44.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000001507	-	90	50.000	ENSDNOG00000048084	-	82	50.000	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000001507	-	79	47.236	ENSETEG00000002865	-	83	47.236	Echinops_telfairi
ENSACLG00000001507	-	84	48.187	ENSEBUG00000012748	-	71	46.701	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000001507	-	76	42.169	ENSEBUG00000011582	-	74	42.169	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000001507	-	84	45.614	ENSEBUG00000011479	-	73	45.614	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000001507	-	78	45.026	ENSEBUG00000008157	-	97	45.026	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000001507	-	89	42.308	ENSECAG00000035557	-	82	42.308	Equus_caballus
ENSACLG00000001507	-	79	42.268	ENSFHEG00000016184	-	73	42.268	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000001507	-	80	41.071	ENSGMOG00000004315	-	97	41.071	Gadus_morhua
ENSACLG00000001507	-	79	39.048	ENSGACG00000019863	-	98	39.048	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000001507	-	79	50.000	ENSGAGG00000007230	-	76	50.000	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000001507	-	84	47.692	ENSGAGG00000013851	-	74	47.692	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000001507	-	74	64.851	ENSHBUG00000013264	-	93	64.851	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000001507	-	83	46.809	ENSHBUG00000000146	-	90	46.809	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000001507	-	78	49.718	ENSHBUG00000019800	-	89	49.718	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000001507	-	75	59.091	ENSHBUG00000006238	-	92	59.091	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000001507	-	88	42.731	ENSHBUG00000017372	-	93	45.455	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000001507	-	68	50.000	ENSHBUG00000021028	-	82	41.202	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000001507	-	98	49.746	ENSHGLG00000018394	-	94	49.746	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000001507	-	93	50.704	ENSIPUG00000021527	-	95	50.495	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000001507	-	85	50.000	ENSIPUG00000001941	-	82	50.000	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000001507	-	88	51.892	ENSIPUG00000021484	-	97	51.892	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000001507	-	79	51.675	ENSIPUG00000021434	-	94	51.675	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000001507	-	79	52.475	ENSIPUG00000013065	-	95	52.475	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000001507	-	85	48.611	ENSIPUG00000021518	-	92	48.611	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000001507	-	81	51.208	ENSIPUG00000006936	-	95	51.562	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000001507	-	87	56.853	ENSIPUG00000021472	-	72	56.853	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000001507	-	78	51.196	ENSIPUG00000011073	-	97	51.196	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000001507	-	87	55.307	ENSIPUG00000022751	-	99	51.980	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000001507	-	95	52.239	ENSIPUG00000009750	-	94	52.239	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000001507	-	76	51.500	ENSIPUG00000015233	-	56	51.500	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000001507	-	71	50.521	ENSIPUG00000003960	-	77	50.521	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000001507	-	88	50.467	ENSSTOG00000034297	-	66	50.990	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000001507	-	78	45.701	ENSMFAG00000046052	-	87	45.701	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000001507	-	79	45.701	ENSMNEG00000041636	-	87	45.701	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000001507	-	78	45.701	ENSMLEG00000032640	-	87	45.701	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000001507	-	85	47.727	ENSMAMG00000009051	-	84	47.727	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000001507	-	81	51.759	ENSMZEG00005019982	-	95	54.315	Maylandia_zebra
ENSACLG00000001507	-	79	70.673	ENSMZEG00005020736	-	91	68.333	Maylandia_zebra
ENSACLG00000001507	-	78	64.773	ENSMZEG00005027285	-	82	64.773	Maylandia_zebra
ENSACLG00000001507	-	75	76.923	ENSMZEG00005012737	-	79	76.923	Maylandia_zebra
ENSACLG00000001507	-	75	71.429	ENSMZEG00005027950	-	90	71.429	Maylandia_zebra
ENSACLG00000001507	-	74	90.826	ENSMZEG00005021421	-	98	90.826	Maylandia_zebra
ENSACLG00000001507	-	78	58.730	ENSMALG00000004413	-	99	58.730	Monopterus_albus
ENSACLG00000001507	-	78	50.000	ENSNBRG00000016582	-	83	50.000	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000001507	-	88	44.633	ENSNBRG00000015652	-	87	44.633	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000001507	-	75	47.826	ENSNBRG00000016603	-	87	47.826	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000001507	-	85	44.954	ENSNBRG00000015873	-	96	47.742	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000001507	-	76	43.192	ENSNBRG00000013604	-	69	43.192	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000001507	-	81	74.576	ENSONIG00000000122	-	98	74.576	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000001507	-	78	45.294	ENSONIG00000020516	-	98	45.562	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000001507	-	75	51.124	ENSONIG00000008953	-	93	51.124	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000001507	-	81	55.024	ENSONIG00000001834	-	99	55.024	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000001507	-	74	50.327	ENSONIG00000007931	-	84	50.327	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000001507	-	78	62.000	ENSONIG00000021124	-	100	62.000	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000001507	-	74	50.968	ENSONIG00000000093	-	99	50.968	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000001507	-	89	73.077	ENSONIG00000015166	-	99	73.077	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000001507	-	84	45.455	ENSORLG00015012951	-	79	46.635	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000001507	-	96	46.330	ENSOGAG00000025289	-	86	46.330	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000001507	-	78	45.701	ENSPANG00000030978	-	91	45.701	Papio_anubis
ENSACLG00000001507	-	76	48.309	ENSPEMG00000016975	Zfp940	80	48.309	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000001507	-	98	42.289	ENSPMEG00000004595	-	94	42.584	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000001507	-	76	53.774	ENSPPYG00000009906	-	74	53.774	Pongo_abelii
ENSACLG00000001507	-	82	62.981	ENSPNYG00000024244	-	85	62.981	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000001507	-	77	52.288	ENSPNAG00000011625	-	82	52.288	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000001507	-	78	55.224	ENSPNAG00000019338	-	93	55.224	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000001507	-	76	45.701	ENSSBOG00000029728	-	87	45.701	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACLG00000001507	-	79	51.442	ENSSPUG00000010059	-	83	51.442	Sphenodon_punctatus