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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSACLG00000001663 (Gene tree)
Gene ID: 113036807
Gene Symbol: polr2i
Alias: zgc:103515
Full Name: RNA polymerase II subunit I
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10163 bases
Position: chr14:23862965-23873127
Accession: 113036807
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000002430	RNA_POL_M_15KD	PF02150.16	9.8e-17	1	1
ENSACLP00000002406	RNA_POL_M_15KD	PF02150.16	1e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000002484	-	2791	-	ENSACLP00000002430	126 (aa)	XP_026049099	UPI00022B135D
ENSACLT00000002457	-	2469	-	ENSACLP00000002406	127 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSG00000105258	POLR2I	100	95.455	Homo_sapiens
ENSACLG00000001663	polr2i	100	99.206	ENSAPOG00000012409	polr2i	100	99.206	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSAMEG00000000993	POLR2I	100	95.200	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000001663	polr2i	100	99.206	ENSAOCG00000024378	polr2i	100	99.206	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000001663	polr2i	100	99.206	ENSAPEG00000021748	polr2i	100	99.206	Amphiprion_percula
ENSACLG00000001663	polr2i	100	98.413	ENSATEG00000000758	polr2i	100	98.413	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSANAG00000035318	POLR2I	100	95.200	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000001663	polr2i	100	98.413	ENSAMXG00000030198	polr2i	100	98.413	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSBTAG00000015002	POLR2I	100	95.200	Bos_taurus
ENSACLG00000001663	polr2i	98	63.710	WBGene00022400	rpb-9	74	63.710	Caenorhabditis_elegans
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSCJAG00000009671	POLR2I	100	95.200	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSCAFG00000006601	POLR2I	100	95.200	Canis_familiaris
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSCAFG00020018113	POLR2I	100	95.200	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSCHIG00000011961	POLR2I	100	95.200	Capra_hircus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSTSYG00000028318	-	100	97.087	Carlito_syrichta
ENSACLG00000001663	polr2i	82	68.932	ENSTSYG00000031752	-	95	68.932	Carlito_syrichta
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSCPOG00000012097	POLR2I	100	95.200	Cavia_porcellus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSCCAG00000022138	-	100	95.200	Cebus_capucinus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	95.868	ENSCCAG00000032214	-	100	93.600	Cebus_capucinus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSCATG00000017413	POLR2I	100	95.200	Cercocebus_atys
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSCLAG00000011800	POLR2I	100	95.200	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSCSAG00000004254	POLR2I	100	95.200	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSCPBG00000006726	POLR2I	100	95.200	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000001663	polr2i	93	80.342	ENSCSAVG00000010630	-	93	80.342	Ciona_savignyi
ENSACLG00000001663	polr2i	83	94.286	ENSCANG00000031951	POLR2I	100	94.286	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000001663	polr2i	100	96.032	ENSCSEG00000002213	polr2i	100	96.032	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000001663	polr2i	100	96.032	ENSCVAG00000014797	polr2i	100	96.032	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000001663	polr2i	100	97.619	ENSDARG00000040443	polr2i	100	97.619	Danio_rerio
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSDNOG00000015842	POLR2I	100	95.200	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000001663	polr2i	88	74.775	ENSDORG00000028728	-	95	74.775	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000001663	polr2i	76	75.000	ENSDORG00000028026	-	99	75.000	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSDORG00000001852	-	100	95.200	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000001663	polr2i	90	76.316	ENSDORG00000029259	-	95	76.316	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000001663	polr2i	98	74.400	FBgn0004855	RpII15	97	74.400	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSETEG00000012679	POLR2I	100	95.200	Echinops_telfairi
ENSACLG00000001663	polr2i	100	88.976	ENSEBUG00000007333	polr2i	100	94.175	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSEASG00005002231	POLR2I	100	95.200	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSECAG00000013654	POLR2I	100	95.200	Equus_caballus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSEEUG00000002113	POLR2I	100	95.200	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000001663	polr2i	100	98.413	ENSELUG00000018012	polr2i	100	98.413	Esox_lucius
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSFCAG00000026052	POLR2I	100	95.200	Felis_catus
ENSACLG00000001663	polr2i	50	90.476	ENSFALG00000006198	POLR2I	100	93.651	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSFDAG00000011350	POLR2I	100	95.200	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000001663	polr2i	100	95.238	ENSFHEG00000015659	polr2i	100	95.238	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000001663	polr2i	100	99.206	ENSGMOG00000013806	polr2i	100	99.206	Gadus_morhua
ENSACLG00000001663	polr2i	96	93.388	ENSGALG00000038595	POLR2I	96	91.200	Gallus_gallus
ENSACLG00000001663	polr2i	100	98.413	ENSGAFG00000001037	polr2i	100	98.413	Gambusia_affinis
ENSACLG00000001663	polr2i	100	98.413	ENSGACG00000006679	polr2i	100	98.413	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSGAGG00000015806	POLR2I	100	95.200	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSGGOG00000015426	POLR2I	100	95.200	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000001663	polr2i	100	99.206	ENSHBUG00000004140	polr2i	100	99.206	Haplochromis_burtoni
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ENSACLG00000001663	polr2i	82	97.087	ENSHGLG00100014515	POLR2I	100	97.087	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000001663	polr2i	100	98.413	ENSHCOG00000010967	polr2i	100	98.413	Hippocampus_comes
ENSACLG00000001663	polr2i	100	97.619	ENSIPUG00000001127	polr2i	100	97.619	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSSTOG00000009411	POLR2I	100	95.200	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSJJAG00000014400	Polr2i	100	95.200	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000001663	polr2i	100	99.206	ENSKMAG00000001567	polr2i	100	99.206	Kryptolebias_marmoratus
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ENSACLG00000001663	polr2i	100	98.413	ENSLBEG00000001220	polr2i	100	98.413	Labrus_bergylta
ENSACLG00000001663	polr2i	96	95.868	ENSLACG00000009590	POLR2I	100	93.600	Latimeria_chalumnae
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ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSLAFG00000015527	POLR2I	100	95.200	Loxodonta_africana
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSMFAG00000039443	POLR2I	100	95.200	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000001663	polr2i	82	97.087	ENSMMUG00000000522	POLR2I	100	97.087	Macaca_mulatta
ENSACLG00000001663	polr2i	96	96.694	ENSMNEG00000029421	POLR2I	100	94.400	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSMLEG00000039720	POLR2I	100	95.200	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000001663	polr2i	100	98.413	ENSMAMG00000013970	polr2i	100	98.413	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000001663	polr2i	100	100.000	ENSMZEG00005013082	polr2i	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSACLG00000001663	polr2i	96	93.388	ENSMGAG00000008576	POLR2I	100	91.200	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSMAUG00000001001	Polr2i	100	95.200	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSMICG00000010241	POLR2I	100	95.200	Microcebus_murinus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSMOCG00000011984	Polr2i	100	95.200	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000001663	polr2i	82	100.000	ENSMMOG00000004945	polr2i	100	100.000	Mola_mola
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSMODG00000014172	POLR2I	100	95.200	Monodelphis_domestica
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ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSMUSG00000019738	Polr2i	100	97.087	Mus_musculus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	MGP_PahariEiJ_G0012741	Polr2i	100	97.087	Mus_pahari
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	MGP_SPRETEiJ_G0030603	Polr2i	100	97.087	Mus_spretus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSMPUG00000005702	POLR2I	100	95.200	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSMLUG00000012317	POLR2I	100	95.200	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSNGAG00000014966	Polr2i	100	95.200	Nannospalax_galili
ENSACLG00000001663	polr2i	100	99.206	ENSNBRG00000000723	polr2i	100	99.206	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSNLEG00000011691	POLR2I	100	95.200	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSOPRG00000001789	-	100	95.200	Ochotona_princeps
ENSACLG00000001663	polr2i	96	96.694	ENSOPRG00000008681	-	100	94.400	Ochotona_princeps
ENSACLG00000001663	polr2i	92	80.172	ENSODEG00000017901	-	88	80.172	Octodon_degus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSODEG00000015015	-	100	95.200	Octodon_degus
ENSACLG00000001663	polr2i	100	100.000	ENSONIG00000005397	polr2i	100	100.000	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	96.694	ENSOCUG00000024998	-	100	94.400	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSOCUG00000013044	POLR2I	100	95.200	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000001663	polr2i	100	97.619	ENSORLG00000013308	polr2i	100	97.619	Oryzias_latipes
ENSACLG00000001663	polr2i	100	96.825	ENSORLG00020011281	polr2i	100	96.825	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000001663	polr2i	100	96.825	ENSORLG00015019529	polr2i	100	96.825	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000001663	polr2i	100	96.825	ENSOMEG00000012586	polr2i	100	96.825	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSOGAG00000024254	POLR2I	100	95.200	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSOARG00000005266	POLR2I	100	95.200	Ovis_aries
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSPPAG00000033446	POLR2I	100	95.200	Pan_paniscus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSPPRG00000007194	POLR2I	100	95.200	Panthera_pardus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSPTIG00000018661	POLR2I	100	95.200	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSPTRG00000010885	POLR2I	100	95.200	Pan_troglodytes
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ENSACLG00000001663	polr2i	82	97.087	ENSPSIG00000011560	POLR2I	100	97.087	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000001663	polr2i	100	93.077	ENSPMGG00000016154	polr2i	100	93.077	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000001663	polr2i	96	97.521	ENSPEMG00000014212	Polr2i	100	95.200	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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