EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000001773 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2253 bases
Position: chr10:16250664-16252916
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000002577	RVT_1	PF00078.27	1.8e-43	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000002634	-	2253	-	ENSACLP00000002577	750 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACLG00000001773's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACLG00000001773's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000001773	-	58	60.230	ENSACLG00000016956	-	78	60.230
ENSACLG00000001773	-	59	30.388	ENSACLG00000012094	-	89	30.769
ENSACLG00000001773	-	93	58.464	ENSACLG00000003707	-	84	58.798
ENSACLG00000001773	-	70	59.623	ENSACLG00000027577	-	86	59.623
ENSACLG00000001773	-	65	31.412	ENSACLG00000006988	-	72	31.412
ENSACLG00000001773	-	99	58.635	ENSACLG00000008988	-	81	58.635
ENSACLG00000001773	-	63	97.468	ENSACLG00000017241	-	79	97.468
ENSACLG00000001773	-	92	64.203	ENSACLG00000004427	-	85	64.203
ENSACLG00000001773	-	71	54.597	ENSACLG00000000579	-	81	54.597
ENSACLG00000001773	-	79	53.188	ENSACLG00000001858	-	83	53.188
ENSACLG00000001773	-	78	59.386	ENSACLG00000019498	-	83	59.386
ENSACLG00000001773	-	58	64.220	ENSACLG00000008558	-	93	64.220
ENSACLG00000001773	-	51	31.043	ENSACLG00000024400	-	75	31.043
ENSACLG00000001773	-	55	30.455	ENSACLG00000008218	-	89	30.909
ENSACLG00000001773	-	50	31.510	ENSACLG00000006327	-	74	31.510
ENSACLG00000001773	-	58	91.096	ENSACLG00000009848	-	99	91.096
ENSACLG00000001773	-	50	31.347	ENSACLG00000001556	-	82	31.347
ENSACLG00000001773	-	50	31.771	ENSACLG00000021814	-	69	31.606
ENSACLG00000001773	-	51	30.576	ENSACLG00000005570	-	62	30.576
ENSACLG00000001773	-	51	31.472	ENSACLG00000000182	-	70	31.472
ENSACLG00000001773	-	99	60.748	ENSACLG00000007650	-	73	60.748
ENSACLG00000001773	-	99	53.262	ENSACLG00000002312	-	74	53.262
ENSACLG00000001773	-	55	30.067	ENSACLG00000022994	-	99	30.067
ENSACLG00000001773	-	99	98.131	ENSACLG00000017200	-	73	98.131
ENSACLG00000001773	-	50	31.854	ENSACLG00000010664	-	69	31.854
ENSACLG00000001773	-	70	59.623	ENSACLG00000020849	-	80	59.623
ENSACLG00000001773	-	99	60.671	ENSACLG00000018002	-	87	60.671
ENSACLG00000001773	-	51	30.905	ENSACLG00000001035	-	96	31.407
ENSACLG00000001773	-	99	58.501	ENSACLG00000016551	-	74	58.501
ENSACLG00000001773	-	93	58.464	ENSACLG00000027127	-	94	58.798
ENSACLG00000001773	-	73	53.430	ENSACLG00000005489	-	82	53.442
ENSACLG00000001773	-	52	33.251	ENSACLG00000016231	-	68	33.251
ENSACLG00000001773	-	82	53.291	ENSACLG00000001102	-	81	53.291
ENSACLG00000001773	-	62	30.309	ENSACLG00000018945	-	71	31.034
ENSACLG00000001773	-	76	60.384	ENSACLG00000020009	-	98	60.384
ENSACLG00000001773	-	52	61.735	ENSACLG00000023788	-	76	61.735
ENSACLG00000001773	-	51	56.883	ENSACLG00000008551	-	70	56.883
ENSACLG00000001773	-	60	49.123	ENSACLG00000005509	-	100	49.672
ENSACLG00000001773	-	53	30.976	ENSACLG00000025525	-	99	30.976
ENSACLG00000001773	-	52	33.499	ENSACLG00000004613	-	95	33.499
ENSACLG00000001773	-	51	60.260	ENSACLG00000026433	-	86	60.260
ENSACLG00000001773	-	76	31.239	ENSACLG00000007200	-	82	31.239
ENSACLG00000001773	-	91	98.542	ENSACLG00000021942	-	100	98.542
ENSACLG00000001773	-	99	53.949	ENSACLG00000013374	-	86	53.949
ENSACLG00000001773	-	99	60.481	ENSACLG00000018778	-	74	60.481
ENSACLG00000001773	-	73	52.899	ENSACLG00000007954	-	82	52.899

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000001773	-	52	56.010	ENSAPEG00000014494	-	86	56.010	Amphiprion_percula
ENSACLG00000001773	-	51	42.078	ENSAMXG00000035582	-	75	42.078	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001773	-	54	31.941	ENSCPBG00000004252	-	98	31.941	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000001773	-	51	30.203	ENSCPBG00000010408	-	77	30.203	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000001773	-	51	31.818	ENSCPBG00000001489	-	70	31.818	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000001773	-	51	30.591	ENSCPBG00000025030	-	74	30.591	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000001773	-	55	30.569	ENSGAGG00000018246	-	74	30.569	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000001773	-	55	32.624	ENSKMAG00000020993	-	99	32.864	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000001773	-	73	50.272	ENSKMAG00000004644	-	81	50.272	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000001773	-	51	66.580	ENSLBEG00000007558	-	99	66.580	Labrus_bergylta
ENSACLG00000001773	-	58	65.525	ENSLBEG00000008627	-	78	65.525	Labrus_bergylta
ENSACLG00000001773	-	68	66.275	ENSLBEG00000009271	-	100	66.275	Labrus_bergylta
ENSACLG00000001773	-	71	65.428	ENSLBEG00000018374	-	81	65.428	Labrus_bergylta
ENSACLG00000001773	-	96	66.205	ENSLBEG00000015802	-	99	66.205	Labrus_bergylta
ENSACLG00000001773	-	51	30.052	ENSLACG00000022681	-	78	30.052	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000001773	-	51	30.334	ENSLACG00000022282	-	72	30.334	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000001773	-	51	30.591	ENSLACG00000015198	-	66	30.591	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000001773	-	51	30.591	ENSLACG00000022410	-	75	30.591	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000001773	-	51	30.591	ENSLACG00000017681	-	72	30.591	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000001773	-	70	59.811	ENSMZEG00005026189	-	80	59.811	Maylandia_zebra
ENSACLG00000001773	-	59	57.336	ENSMALG00000021030	-	78	57.336	Monopterus_albus
ENSACLG00000001773	-	52	61.168	ENSMALG00000018635	-	79	61.069	Monopterus_albus
ENSACLG00000001773	-	53	61.000	ENSMALG00000009608	-	89	61.000	Monopterus_albus
ENSACLG00000001773	-	99	56.779	ENSMALG00000007417	-	97	56.779	Monopterus_albus
ENSACLG00000001773	-	50	31.854	ENSMALG00000009397	-	97	31.854	Monopterus_albus
ENSACLG00000001773	-	59	56.885	ENSMALG00000007425	-	78	56.885	Monopterus_albus
ENSACLG00000001773	-	52	59.033	ENSMALG00000003303	-	76	59.033	Monopterus_albus
ENSACLG00000001773	-	59	57.111	ENSMALG00000018226	-	78	57.111	Monopterus_albus
ENSACLG00000001773	-	78	55.857	ENSMALG00000020948	-	83	55.857	Monopterus_albus
ENSACLG00000001773	-	59	56.659	ENSMALG00000008286	-	78	56.659	Monopterus_albus
ENSACLG00000001773	-	79	53.277	ENSONIG00000021263	-	78	53.277	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000001773	-	71	57.570	ENSONIG00000020746	-	97	57.570	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000001773	-	62	58.174	ENSORLG00000022703	-	75	58.174	Oryzias_latipes
ENSACLG00000001773	-	79	53.950	ENSORLG00000030053	-	82	53.950	Oryzias_latipes
ENSACLG00000001773	-	73	59.239	ENSORLG00000030445	-	81	59.239	Oryzias_latipes
ENSACLG00000001773	-	90	58.211	ENSORLG00000026858	-	81	58.211	Oryzias_latipes
ENSACLG00000001773	-	58	31.891	ENSORLG00000025054	-	76	31.891	Oryzias_latipes
ENSACLG00000001773	-	74	30.674	ENSORLG00000024294	-	98	30.570	Oryzias_latipes
ENSACLG00000001773	-	99	55.274	ENSORLG00000028049	-	73	55.274	Oryzias_latipes
ENSACLG00000001773	-	99	59.600	ENSORLG00000023570	-	76	59.600	Oryzias_latipes
ENSACLG00000001773	-	53	61.596	ENSORLG00000025899	-	75	61.596	Oryzias_latipes
ENSACLG00000001773	-	53	61.596	ENSORLG00000026969	-	75	61.596	Oryzias_latipes
ENSACLG00000001773	-	54	30.435	ENSORLG00020009687	-	73	30.435	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000001773	-	53	61.596	ENSORLG00020019661	-	75	61.596	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000001773	-	59	31.626	ENSORLG00015020629	-	68	32.143	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000001773	-	99	50.333	ENSOMEG00000004858	-	73	50.333	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000001773	-	57	55.196	ENSOMEG00000008180	-	78	55.196	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000001773	-	72	37.050	ENSOMEG00000012000	-	98	37.050	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000001773	-	99	50.333	ENSOMEG00000013089	-	73	50.333	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000001773	-	53	32.446	ENSPKIG00000019910	-	89	32.446	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000001773	-	51	31.633	ENSPSIG00000001343	-	73	31.633	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000001773	-	63	30.328	ENSPSIG00000000025	-	86	30.328	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000001773	-	52	30.905	ENSPSIG00000001186	-	92	30.905	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000001773	-	58	30.201	ENSPSIG00000001439	-	76	30.201	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000001773	-	52	32.000	ENSPSIG00000001720	-	95	32.000	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000001773	-	55	30.476	ENSPSIG00000000402	-	83	31.362	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000001773	-	51	31.392	ENSPSIG00000017129	-	74	31.392	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000001773	-	56	31.019	ENSPSIG00000001440	-	91	31.019	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000001773	-	56	31.148	ENSPSIG00000001250	-	96	31.148	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000001773	-	58	30.023	ENSPSIG00000000799	-	73	30.023	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000001773	-	57	30.536	ENSPSIG00000001873	-	92	30.536	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000001773	-	53	32.187	ENSPSIG00000001709	-	89	32.187	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000001773	-	53	31.034	ENSPSIG00000000480	-	93	31.034	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000001773	-	58	91.954	ENSPNYG00000010168	-	77	91.954	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000001773	-	80	47.761	ENSXMAG00000026064	-	82	47.761	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000001773	-	81	46.906	ENSXMAG00000024044	-	87	46.906	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000001773	-	90	53.207	ENSXMAG00000023609	-	85	53.207	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000001773	-	96	47.310	ENSXMAG00000029300	-	100	47.310	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000001773	-	99	46.524	ENSXMAG00000023391	-	75	46.524	Xiphophorus_maculatus