EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000001775 (Gene tree)
Gene ID: 113034294
Gene Symbol: rab11a
Alias: wu:fi15h09|zgc:103679
Full Name: ras-related protein Rab-11A
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9664 bases
Position: chr1:1754475-1764138
Accession: 113034294
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000002600	MMR_HSR1	PF01926.23	3.7e-07	1	1
ENSACLP00000002617	MMR_HSR1	PF01926.23	1.7e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000002657	-	648	-	ENSACLP00000002600	215 (aa)	XP_026044557	UPI0000363C28
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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000001775	rab11a	96	49.029	ENSACLG00000003326	-	99	49.029
ENSACLG00000001775	rab11a	93	36.408	ENSACLG00000021547	rab33a	71	36.408
ENSACLG00000001775	rab11a	92	42.132	ENSACLG00000002706	rab5c	89	42.132
ENSACLG00000001775	rab11a	80	31.351	ENSACLG00000019293	rasl11a	71	31.351
ENSACLG00000001775	rab11a	75	43.114	ENSACLG00000004795	rab9b	75	43.114
ENSACLG00000001775	rab11a	92	41.538	ENSACLG00000019643	-	93	45.699
ENSACLG00000001775	rab11a	78	42.197	ENSACLG00000024456	-	82	42.197
ENSACLG00000001775	rab11a	80	34.884	ENSACLG00000002819	rab23	80	34.555
ENSACLG00000001775	rab11a	60	30.147	ENSACLG00000016659	-	65	30.147
ENSACLG00000001775	rab11a	84	36.788	ENSACLG00000005720	rab33ba	79	36.788
ENSACLG00000001775	rab11a	94	42.105	ENSACLG00000022893	-	97	42.105
ENSACLG00000001775	rab11a	78	45.562	ENSACLG00000009468	RAB39B	79	45.562
ENSACLG00000001775	rab11a	75	45.062	ENSACLG00000011484	rab18a	79	45.062
ENSACLG00000001775	rab11a	99	64.486	ENSACLG00000018262	rab25a	100	64.486
ENSACLG00000001775	rab11a	93	32.039	ENSACLG00000005733	rab34b	77	32.039
ENSACLG00000001775	rab11a	80	36.416	ENSACLG00000011249	rras	86	36.416
ENSACLG00000001775	rab11a	95	46.117	ENSACLG00000006329	-	96	46.117
ENSACLG00000001775	rab11a	96	41.748	ENSACLG00000018721	si:dkey-16l2.16	99	43.478
ENSACLG00000001775	rab11a	73	41.718	ENSACLG00000024502	-	78	41.718
ENSACLG00000001775	rab11a	75	34.940	ENSACLG00000027515	KRAS	93	35.955
ENSACLG00000001775	rab11a	97	39.815	ENSACLG00000000860	-	96	39.815
ENSACLG00000001775	rab11a	99	86.512	ENSACLG00000010268	rab11al	99	86.512
ENSACLG00000001775	rab11a	91	34.518	ENSACLG00000006647	rab9a	95	34.518
ENSACLG00000001775	rab11a	78	53.571	ENSACLG00000013734	-	79	53.571
ENSACLG00000001775	rab11a	93	41.327	ENSACLG00000018066	rab5aa	90	41.327
ENSACLG00000001775	rab11a	94	32.020	ENSACLG00000019423	rab41	91	33.000
ENSACLG00000001775	rab11a	86	38.710	ENSACLG00000027006	zgc:101559	79	38.710
ENSACLG00000001775	rab11a	73	35.185	ENSACLG00000008602	RAB29	98	35.185
ENSACLG00000001775	rab11a	90	32.105	ENSACLG00000025138	rab6ba	90	32.105
ENSACLG00000001775	rab11a	93	31.401	ENSACLG00000005093	rab34a	77	31.401
ENSACLG00000001775	rab11a	77	40.964	ENSACLG00000001646	-	78	40.964
ENSACLG00000001775	rab11a	78	43.787	ENSACLG00000001218	RAB17	74	43.787
ENSACLG00000001775	rab11a	100	86.239	ENSACLG00000005446	-	100	86.239
ENSACLG00000001775	rab11a	99	79.439	ENSACLG00000018852	-	97	79.439
ENSACLG00000001775	rab11a	92	41.837	ENSACLG00000008615	-	88	41.837
ENSACLG00000001775	rab11a	94	42.105	ENSACLG00000027590	-	97	42.105
ENSACLG00000001775	rab11a	74	35.669	ENSACLG00000026487	rab6bb	76	37.086
ENSACLG00000001775	rab11a	93	45.178	ENSACLG00000013668	rab1ba	97	45.178
ENSACLG00000001775	rab11a	100	64.186	ENSACLG00000010251	rab25b	100	64.186
ENSACLG00000001775	rab11a	77	44.578	ENSACLG00000026336	rab15	78	44.578
ENSACLG00000001775	rab11a	75	42.857	ENSACLG00000021470	rab22a	83	42.857
ENSACLG00000001775	rab11a	93	45.320	ENSACLG00000007644	rab1ab	95	48.958
ENSACLG00000001775	rab11a	72	34.615	ENSACLG00000021109	si:dkey-13a21.4	75	34.615
ENSACLG00000001775	rab11a	81	32.778	ENSACLG00000009103	si:cabz01085950.1	88	32.778
ENSACLG00000001775	rab11a	79	45.614	ENSACLG00000015289	rab18b	83	45.614
ENSACLG00000001775	rab11a	100	85.321	ENSACLG00000005420	rab11ba	100	85.321
ENSACLG00000001775	rab11a	84	41.530	ENSACLG00000007514	rab42a	84	41.530
ENSACLG00000001775	rab11a	75	34.940	ENSACLG00000027677	KRAS	93	35.955
ENSACLG00000001775	rab11a	78	36.905	ENSACLG00000025632	rabl2	73	36.905
ENSACLG00000001775	rab11a	64	30.657	ENSACLG00000027139	arl3	71	30.657
ENSACLG00000001775	rab11a	96	41.627	ENSACLG00000023526	rab30	97	41.627
ENSACLG00000001775	rab11a	73	41.718	ENSACLG00000018847	RAB7A	78	41.718
ENSACLG00000001775	rab11a	72	42.236	ENSACLG00000010965	-	67	42.236
ENSACLG00000001775	rab11a	69	36.667	ENSACLG00000001181	hrasb	91	34.659
ENSACLG00000001775	rab11a	76	33.129	ENSACLG00000008646	rheb	88	33.129
ENSACLG00000001775	rab11a	94	46.635	ENSACLG00000013505	-	97	46.635
ENSACLG00000001775	rab11a	100	87.156	ENSACLG00000007076	rab11bb	100	87.156
ENSACLG00000001775	rab11a	76	33.333	ENSACLG00000007804	si:ch73-116o1.2	82	35.028
ENSACLG00000001775	rab11a	94	33.173	ENSACLG00000003898	rab32b	92	33.173
ENSACLG00000001775	rab11a	95	38.967	ENSACLG00000007696	rab12	84	38.967

Orthologs

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ENSACLG00000001775	rab11a	100	94.907	ENSG00000103769	RAB11A	100	100.000	Homo_sapiens
ENSACLG00000001775	rab11a	100	100.000	ENSAPOG00000018256	rab11a	100	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001775	rab11a	100	94.907	ENSAMEG00000003119	RAB11A	84	94.907	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000001775	rab11a	100	100.000	ENSACIG00000003092	rab11a	100	100.000	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001775	rab11a	100	100.000	ENSAOCG00000020106	rab11a	100	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000001775	rab11a	100	100.000	ENSAPEG00000000075	rab11a	100	100.000	Amphiprion_percula
ENSACLG00000001775	rab11a	100	100.000	ENSATEG00000022531	rab11a	100	100.000	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001775	rab11a	98	92.453	ENSAPLG00000014962	RAB11A	98	92.453	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000001775	rab11a	99	94.884	ENSACAG00000004479	RAB11A	99	94.884	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000001775	rab11a	100	94.907	ENSANAG00000008429	RAB11A	100	94.907	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000001775	rab11a	96	94.686	ENSAMXG00000003155	rab11a	96	94.686	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001775	rab11a	99	74.766	ENSBTAG00000048711	-	95	78.125	Bos_taurus
ENSACLG00000001775	rab11a	100	94.907	ENSBTAG00000018959	RAB11A	100	94.907	Bos_taurus
ENSACLG00000001775	rab11a	100	94.907	ENSCJAG00000042037	RAB11A	100	94.907	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000001775	rab11a	100	94.907	ENSCAFG00000017255	RAB11A	100	94.907	Canis_familiaris
ENSACLG00000001775	rab11a	100	94.907	ENSCAFG00020008478	RAB11A	100	94.907	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000001775	rab11a	100	94.907	ENSCHIG00000012183	-	100	94.907	Capra_hircus
ENSACLG00000001775	rab11a	100	91.204	ENSTSYG00000031189	RAB11A	97	96.324	Carlito_syrichta
ENSACLG00000001775	rab11a	100	94.907	ENSCPOG00000037599	RAB11A	100	94.907	Cavia_porcellus
ENSACLG00000001775	rab11a	100	94.907	ENSCCAG00000021286	RAB11A	100	94.907	Cebus_capucinus
ENSACLG00000001775	rab11a	100	94.907	ENSCATG00000034739	-	100	94.907	Cercocebus_atys
ENSACLG00000001775	rab11a	100	94.907	ENSCLAG00000007435	RAB11A	100	94.907	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000001775	rab11a	100	94.907	ENSCSAG00000013038	RAB11A	100	94.907	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000001775	rab11a	100	95.370	ENSCPBG00000014614	RAB11A	100	95.370	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000001775	rab11a	100	94.907	ENSCANG00000034570	-	100	94.907	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000001775	rab11a	100	94.907	ENSCGRG00001023313	Rab11a	100	94.907	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000001775	rab11a	100	94.907	ENSCGRG00000018359	Rab11a	100	94.907	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000001775	rab11a	100	99.535	ENSCSEG00000007383	rab11a	100	99.535	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000001775	rab11a	100	100.000	ENSCVAG00000013878	rab11a	100	100.000	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000001775	rab11a	100	97.209	ENSDARG00000041450	rab11a	100	97.209	Danio_rerio
ENSACLG00000001775	rab11a	100	94.907	ENSDNOG00000038479	RAB11A	83	94.907	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000001775	rab11a	99	84.112	FBgn0015790	Rab11	100	84.112	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000001775	rab11a	100	89.815	ENSETEG00000004920	RAB11A	99	89.815	Echinops_telfairi
ENSACLG00000001775	rab11a	100	87.097	ENSEBUG00000007493	rab11a	100	87.097	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000001775	rab11a	100	94.907	ENSEASG00005006431	RAB11A	100	94.907	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000001775	rab11a	100	94.907	ENSECAG00000023865	RAB11A	88	93.500	Equus_caballus
ENSACLG00000001775	rab11a	100	97.674	ENSELUG00000002999	rab11a	100	97.674	Esox_lucius
ENSACLG00000001775	rab11a	100	94.907	ENSFCAG00000030174	RAB11A	100	94.907	Felis_catus
ENSACLG00000001775	rab11a	97	92.823	ENSFALG00000010052	RAB11A	100	92.823	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000001775	rab11a	96	94.686	ENSFDAG00000021495	RAB11A	96	94.686	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000001775	rab11a	100	100.000	ENSFHEG00000019668	rab11a	100	100.000	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000001775	rab11a	100	95.349	ENSGMOG00000008355	rab11a	99	95.349	Gadus_morhua
ENSACLG00000001775	rab11a	100	97.727	ENSGMOG00000004096	-	100	97.727	Gadus_morhua
ENSACLG00000001775	rab11a	100	94.907	ENSGALG00000007615	RAB11A	100	94.907	Gallus_gallus
ENSACLG00000001775	rab11a	100	100.000	ENSGAFG00000016549	rab11a	100	100.000	Gambusia_affinis
ENSACLG00000001775	rab11a	100	95.370	ENSGAGG00000014814	RAB11A	100	95.370	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000001775	rab11a	100	94.907	ENSGGOG00000014252	RAB11A	100	94.907	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000001775	rab11a	94	99.505	ENSHBUG00000023035	rab11a	88	99.505	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000001775	rab11a	100	94.907	ENSHGLG00000005396	RAB11A	100	94.907	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000001775	rab11a	94	82.266	ENSHGLG00000006346	-	99	82.266	Heterocephalus_glaber_female
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ENSACLG00000001775	rab11a	94	82.266	ENSHGLG00100015502	-	99	82.266	Heterocephalus_glaber_male
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