EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000001777 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2347 bases
Position: chr3:29501187-29503533
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000002589	MMR_HSR1	PF01926.23	3.3e-08	1	1
ENSACLP00000002597	MMR_HSR1	PF01926.23	5e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000002646	-	1700	-	ENSACLP00000002589	451 (aa)	-	-
ENSACLT00000002654	-	1581	-	ENSACLP00000002597	526 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000001777	-	86	35.211	ENSACLG00000010048	-	88	35.211
ENSACLG00000001777	-	70	49.530	ENSACLG00000006534	-	78	50.172
ENSACLG00000001777	-	70	48.742	ENSACLG00000003763	-	86	49.141
ENSACLG00000001777	-	51	38.095	ENSACLG00000023502	-	94	38.095
ENSACLG00000001777	-	52	41.315	ENSACLG00000008397	-	90	40.845
ENSACLG00000001777	-	57	39.382	ENSACLG00000001936	-	92	39.483
ENSACLG00000001777	-	59	54.167	ENSACLG00000001927	-	88	54.167
ENSACLG00000001777	-	99	73.894	ENSACLG00000001800	-	99	73.230
ENSACLG00000001777	-	62	46.263	ENSACLG00000003776	-	94	46.263
ENSACLG00000001777	-	60	55.762	ENSACLG00000001892	-	55	56.180
ENSACLG00000001777	-	53	33.654	ENSACLG00000014795	-	72	33.654
ENSACLG00000001777	-	53	41.949	ENSACLG00000024857	-	50	41.949
ENSACLG00000001777	-	61	92.727	ENSACLG00000001790	-	91	92.727
ENSACLG00000001777	-	61	54.874	ENSACLG00000001909	-	83	54.874
ENSACLG00000001777	-	51	36.797	ENSACLG00000011572	-	92	36.797
ENSACLG00000001777	-	60	31.707	ENSACLG00000016242	-	88	31.707
ENSACLG00000001777	-	55	32.540	ENSACLG00000011913	-	72	32.540
ENSACLG00000001777	-	99	79.885	ENSACLG00000001833	-	99	77.969
ENSACLG00000001777	-	70	46.984	ENSACLG00000017422	-	81	48.110
ENSACLG00000001777	-	56	56.306	ENSACLG00000017459	-	95	56.306
ENSACLG00000001777	-	61	38.947	ENSACLG00000021967	-	87	38.947
ENSACLG00000001777	-	56	37.959	ENSACLG00000011804	-	90	37.946
ENSACLG00000001777	-	67	50.162	ENSACLG00000001886	-	91	52.837
ENSACLG00000001777	-	61	39.928	ENSACLG00000001968	-	93	40.217
ENSACLG00000001777	-	59	39.405	ENSACLG00000026926	-	85	39.405
ENSACLG00000001777	-	51	38.559	ENSACLG00000016872	-	85	37.945
ENSACLG00000001777	-	59	48.496	ENSACLG00000017433	-	91	48.496
ENSACLG00000001777	-	51	40.086	ENSACLG00000027607	-	68	40.086
ENSACLG00000001777	-	57	38.224	ENSACLG00000001976	-	91	38.182
ENSACLG00000001777	-	54	32.661	ENSACLG00000011921	-	81	32.661
ENSACLG00000001777	-	51	34.483	ENSACLG00000023747	-	93	34.483
ENSACLG00000001777	-	53	35.802	ENSACLG00000005066	-	81	35.802
ENSACLG00000001777	-	52	38.750	ENSACLG00000005659	-	74	38.912
ENSACLG00000001777	-	52	42.373	ENSACLG00000024836	-	81	42.373
ENSACLG00000001777	-	77	47.839	ENSACLG00000001869	-	73	54.887
ENSACLG00000001777	-	57	34.483	ENSACLG00000016222	-	84	34.483
ENSACLG00000001777	-	59	40.755	ENSACLG00000008592	-	95	40.755
ENSACLG00000001777	-	53	37.500	ENSACLG00000008599	-	75	37.500
ENSACLG00000001777	-	77	48.127	ENSACLG00000001896	-	74	55.263

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000001777	-	54	53.689	ENSAPOG00000002527	-	94	50.871	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001777	-	99	60.000	ENSAPOG00000000444	-	90	60.377	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001777	-	51	36.245	ENSAPOG00000021365	-	72	36.245	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001777	-	50	38.696	ENSAPOG00000002337	-	65	38.272	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001777	-	53	38.174	ENSAPOG00000000066	-	66	38.174	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001777	-	57	51.163	ENSACIG00000012061	-	72	50.187	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001777	-	51	34.934	ENSACIG00000012714	-	74	34.934	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001777	-	57	34.211	ENSACIG00000012707	-	94	34.211	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001777	-	55	37.600	ENSACIG00000005780	-	72	37.600	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001777	-	56	34.351	ENSACIG00000006478	-	94	34.351	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001777	-	59	54.340	ENSACIG00000005587	-	94	53.676	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001777	-	56	41.825	ENSACIG00000016635	-	91	41.825	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001777	-	53	42.857	ENSACIG00000022355	-	80	42.857	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001777	-	59	35.448	ENSACIG00000007178	-	83	35.448	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001777	-	51	36.052	ENSAOCG00000015984	-	72	36.638	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000001777	-	65	49.671	ENSAOCG00000016082	-	65	51.825	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000001777	-	50	38.696	ENSAPEG00000021653	si:dkey-73p2.1	79	47.321	Amphiprion_percula
ENSACLG00000001777	-	52	36.481	ENSAPEG00000003513	-	79	45.614	Amphiprion_percula
ENSACLG00000001777	-	60	54.647	ENSATEG00000010978	-	92	54.647	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001777	-	53	36.111	ENSATEG00000011789	-	75	36.364	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001777	-	77	52.738	ENSATEG00000011021	-	93	51.585	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001777	-	53	37.037	ENSATEG00000011594	-	84	37.037	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001777	-	100	58.412	ENSATEG00000011040	-	74	58.523	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001777	-	57	57.031	ENSATEG00000010991	-	98	57.031	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001777	-	67	52.961	ENSATEG00000010942	-	50	57.303	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001777	-	78	51.093	ENSATEG00000010901	-	94	51.366	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001777	-	59	48.679	ENSATEG00000010951	-	53	49.421	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001777	-	54	35.600	ENSATEG00000011837	-	73	35.600	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001777	-	67	46.711	ENSAMXG00000025201	si:dkey-125e8.4	76	48.551	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001777	-	53	42.857	ENSAMXG00000038580	-	84	42.857	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001777	-	52	41.880	ENSAMXG00000032276	-	60	39.922	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001777	-	60	37.011	ENSAMXG00000042238	-	65	33.028	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001777	-	63	37.979	ENSAMXG00000041154	-	89	37.979	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001777	-	52	41.176	ENSAMXG00000031962	-	73	41.991	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001777	-	59	34.783	ENSAMXG00000043537	-	80	34.783	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001777	-	53	37.037	ENSAMXG00000041969	si:ch1073-185p12.2	71	37.037	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001777	-	51	41.631	ENSAMXG00000038930	-	70	41.631	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001777	-	50	41.228	ENSAMXG00000029731	-	84	40.167	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001777	-	71	45.201	ENSCSEG00000020077	-	56	42.821	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000001777	-	53	38.589	ENSCVAG00000009387	-	70	38.589	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000001777	-	70	39.773	ENSCVAG00000013132	-	73	41.509	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000001777	-	57	47.471	ENSCVAG00000005688	-	83	47.471	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000001777	-	68	42.540	ENSCVAG00000005659	-	69	44.906	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000001777	-	52	39.241	ENSCVAG00000005473	-	79	39.241	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000001777	-	50	34.956	ENSCVAG00000000429	-	69	34.956	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000001777	-	57	49.425	ENSCVAG00000005709	-	73	49.425	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000001777	-	50	41.410	ENSCVAG00000007827	-	81	41.410	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000001777	-	50	40.611	ENSCVAG00000023285	-	88	40.611	Cyprinodon_variegatus
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ENSACLG00000001777	-	76	48.588	ENSCVAG00000020148	-	89	48.023	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000001777	-	57	46.899	ENSCVAG00000009944	-	76	46.899	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000001777	-	51	39.914	ENSCVAG00000023288	-	51	39.914	Cyprinodon_variegatus
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ENSACLG00000001777	-	57	49.425	ENSCVAG00000009937	-	73	49.425	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000001777	-	78	46.742	ENSCVAG00000009934	-	96	46.961	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000001777	-	62	46.763	ENSCVAG00000005676	-	69	46.931	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000001777	-	67	41.304	ENSDARG00000092823	si:dkeyp-67a8.4	66	44.366	Danio_rerio
ENSACLG00000001777	-	51	37.247	ENSDARG00000056443	zgc:152753	84	37.247	Danio_rerio
ENSACLG00000001777	-	50	35.111	ENSDARG00000115760	si:dkey-30g5.1	87	35.111	Danio_rerio
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ENSACLG00000001777	-	66	42.424	ENSDARG00000041333	si:dkey-125e8.4	96	43.554	Danio_rerio
ENSACLG00000001777	-	54	37.751	ENSDARG00000112755	CR394546.4	94	37.751	Danio_rerio
ENSACLG00000001777	-	51	46.154	ENSDARG00000063108	CABZ01059392.1	66	49.231	Danio_rerio
ENSACLG00000001777	-	64	40.550	ENSDARG00000060049	zgc:195075	66	40.550	Danio_rerio
ENSACLG00000001777	-	59	45.556	ENSDARG00000090099	si:dkeyp-67a8.4	67	44.948	Danio_rerio
ENSACLG00000001777	-	55	38.866	ENSDARG00000040497	BX004816.1	59	38.866	Danio_rerio
ENSACLG00000001777	-	60	31.752	ENSDARG00000116893	BX005442.3	87	32.117	Danio_rerio
ENSACLG00000001777	-	52	37.712	ENSDARG00000039752	si:ch73-308m11.1	73	37.712	Danio_rerio
ENSACLG00000001777	-	65	50.671	ENSELUG00000004821	-	64	53.585	Esox_lucius
ENSACLG00000001777	-	61	54.874	ENSELUG00000007537	-	93	54.874	Esox_lucius
ENSACLG00000001777	-	60	52.747	ENSELUG00000014970	-	91	46.944	Esox_lucius
ENSACLG00000001777	-	66	47.333	ENSFHEG00000010646	-	81	47.440	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000001777	-	57	51.765	ENSFHEG00000010641	-	93	51.111	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000001777	-	52	40.678	ENSFHEG00000013922	-	61	40.678	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000001777	-	86	57.918	ENSFHEG00000010603	-	69	53.745	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000001777	-	78	56.667	ENSFHEG00000010623	-	93	57.778	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000001777	-	99	53.803	ENSFHEG00000010614	-	70	53.803	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000001777	-	55	34.884	ENSGAFG00000017534	-	79	34.109	Gambusia_affinis
ENSACLG00000001777	-	99	54.664	ENSGAFG00000006087	-	67	54.104	Gambusia_affinis
ENSACLG00000001777	-	78	39.552	ENSGAFG00000006141	-	60	49.064	Gambusia_affinis
ENSACLG00000001777	-	51	34.199	ENSGAFG00000000305	-	71	34.199	Gambusia_affinis
ENSACLG00000001777	-	55	54.251	ENSGACG00000018975	-	88	54.251	Gasterosteus_aculeatus
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ENSACLG00000001777	-	58	47.710	ENSXMAG00000001449	-	77	47.710	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000001777	-	57	49.225	ENSXMAG00000023270	-	58	48.689	Xiphophorus_maculatus