EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000001790 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4223 bases
Position: chr3:29516771-29520993
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000002620	MMR_HSR1	PF01926.23	1.5e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000002677	-	909	-	ENSACLP00000002620	302 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000001790	-	86	39.768	ENSACLG00000001936	-	96	37.943
ENSACLG00000001790	-	71	38.710	ENSACLG00000023600	-	86	38.710
ENSACLG00000001790	-	69	37.143	ENSACLG00000005066	-	72	37.143
ENSACLG00000001790	-	78	39.749	ENSACLG00000005659	-	74	39.749
ENSACLG00000001790	-	65	32.323	ENSACLG00000023739	-	82	32.323
ENSACLG00000001790	-	90	53.506	ENSACLG00000003763	-	80	53.506
ENSACLG00000001790	-	70	45.755	ENSACLG00000016933	-	93	40.000
ENSACLG00000001790	-	91	92.727	ENSACLG00000001777	-	61	92.727
ENSACLG00000001790	-	75	40.175	ENSACLG00000011578	-	92	40.175
ENSACLG00000001790	-	73	38.462	ENSACLG00000011572	-	88	38.462
ENSACLG00000001790	-	87	54.373	ENSACLG00000001927	-	86	54.373
ENSACLG00000001790	-	76	38.627	ENSACLG00000008006	-	64	38.627
ENSACLG00000001790	-	88	54.717	ENSACLG00000001886	-	85	54.717
ENSACLG00000001790	-	77	38.723	ENSACLG00000011804	-	88	37.281
ENSACLG00000001790	-	68	41.262	ENSACLG00000021959	-	83	37.906
ENSACLG00000001790	-	72	37.156	ENSACLG00000009774	-	57	37.156
ENSACLG00000001790	-	73	38.739	ENSACLG00000003401	-	84	38.739
ENSACLG00000001790	-	67	35.294	ENSACLG00000003393	-	77	35.294
ENSACLG00000001790	-	72	37.156	ENSACLG00000009780	-	64	37.156
ENSACLG00000001790	-	78	41.102	ENSACLG00000008397	-	88	40.265
ENSACLG00000001790	-	93	55.319	ENSACLG00000001892	-	58	55.714
ENSACLG00000001790	-	79	32.692	ENSACLG00000014795	-	73	32.692
ENSACLG00000001790	-	62	31.579	ENSACLG00000023728	-	83	31.579
ENSACLG00000001790	-	65	35.354	ENSACLG00000023570	-	82	35.354
ENSACLG00000001790	-	88	56.391	ENSACLG00000001869	-	73	56.391
ENSACLG00000001790	-	73	41.364	ENSACLG00000016904	-	80	41.364
ENSACLG00000001790	-	88	56.767	ENSACLG00000001896	-	74	56.767
ENSACLG00000001790	-	82	33.333	ENSACLG00000011913	-	89	30.000
ENSACLG00000001790	-	89	48.699	ENSACLG00000017433	-	92	48.699
ENSACLG00000001790	-	90	56.089	ENSACLG00000001909	-	81	56.089
ENSACLG00000001790	-	70	39.810	ENSACLG00000021976	-	65	37.500
ENSACLG00000001790	-	63	32.984	ENSACLG00000023161	-	80	32.984
ENSACLG00000001790	-	72	41.475	ENSACLG00000027607	-	63	41.475
ENSACLG00000001790	-	68	42.233	ENSACLG00000021967	-	82	39.259
ENSACLG00000001790	-	76	34.914	ENSACLG00000023747	-	93	34.914
ENSACLG00000001790	-	74	37.333	ENSACLG00000003290	-	82	37.333
ENSACLG00000001790	-	69	39.713	ENSACLG00000023555	-	84	39.713
ENSACLG00000001790	-	73	39.013	ENSACLG00000016872	-	80	39.419
ENSACLG00000001790	-	89	86.194	ENSACLG00000001800	-	87	74.906
ENSACLG00000001790	-	81	33.468	ENSACLG00000011921	-	94	32.872
ENSACLG00000001790	-	90	52.399	ENSACLG00000017422	-	76	52.399
ENSACLG00000001790	-	72	37.104	ENSACLG00000003262	-	80	37.104
ENSACLG00000001790	-	62	34.010	ENSACLG00000003298	-	85	34.010
ENSACLG00000001790	-	65	32.323	ENSACLG00000011585	-	91	32.323
ENSACLG00000001790	-	72	41.553	ENSACLG00000005220	-	50	41.553
ENSACLG00000001790	-	75	57.658	ENSACLG00000017459	-	95	57.658
ENSACLG00000001790	-	65	38.889	ENSACLG00000003276	-	72	38.889
ENSACLG00000001790	-	64	39.594	ENSACLG00000005319	-	85	39.594
ENSACLG00000001790	-	97	30.519	ENSACLG00000016242	-	89	30.519
ENSACLG00000001790	-	70	38.498	ENSACLG00000023766	zgc:113625	85	38.498
ENSACLG00000001790	-	69	40.476	ENSACLG00000023760	-	84	40.476
ENSACLG00000001790	-	65	32.828	ENSACLG00000023539	-	67	32.828
ENSACLG00000001790	-	71	42.396	ENSACLG00000011599	-	86	42.396
ENSACLG00000001790	-	72	38.182	ENSACLG00000005232	-	81	39.130
ENSACLG00000001790	-	88	40.265	ENSACLG00000010048	-	88	40.265
ENSACLG00000001790	-	68	42.233	ENSACLG00000023525	-	67	42.233
ENSACLG00000001790	-	86	39.382	ENSACLG00000001976	-	93	38.078
ENSACLG00000001790	-	88	91.386	ENSACLG00000001833	-	51	91.386
ENSACLG00000001790	-	88	39.552	ENSACLG00000026926	-	86	38.971
ENSACLG00000001790	-	92	32.862	ENSACLG00000016222	-	93	32.862
ENSACLG00000001790	-	71	41.818	ENSACLG00000004543	-	87	41.892
ENSACLG00000001790	-	94	40.845	ENSACLG00000001968	-	96	40.845
ENSACLG00000001790	-	89	54.613	ENSACLG00000006534	-	73	54.613
ENSACLG00000001790	-	72	38.356	ENSACLG00000025976	-	82	36.232
ENSACLG00000001790	-	72	40.639	ENSACLG00000005669	-	82	38.843
ENSACLG00000001790	-	74	38.288	ENSACLG00000016235	-	60	38.288
ENSACLG00000001790	-	77	41.949	ENSACLG00000024836	-	81	41.949
ENSACLG00000001790	-	71	40.465	ENSACLG00000023502	-	87	40.465
ENSACLG00000001790	-	62	34.737	ENSACLG00000023509	-	79	34.737
ENSACLG00000001790	-	62	35.751	ENSACLG00000011541	-	80	35.751
ENSACLG00000001790	-	74	39.732	ENSACLG00000001954	-	98	37.113
ENSACLG00000001790	-	69	39.524	ENSACLG00000011905	-	80	39.623
ENSACLG00000001790	-	79	34.156	ENSACLG00000024854	-	77	34.156
ENSACLG00000001790	-	71	55.607	ENSACLG00000003776	-	77	55.607
ENSACLG00000001790	-	87	40.755	ENSACLG00000008592	-	95	40.755
ENSACLG00000001790	-	79	38.174	ENSACLG00000008599	-	75	38.174

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000001790	-	67	61.765	ENSAPOG00000002517	-	71	61.765	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001790	-	75	31.140	ENSAPOG00000020108	-	63	31.140	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001790	-	72	39.091	ENSAPOG00000002337	-	63	38.627	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001790	-	72	38.462	ENSAPOG00000001075	-	97	38.462	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001790	-	74	35.676	ENSAPOG00000022321	-	86	35.676	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001790	-	68	39.423	ENSAPOG00000018915	-	85	39.423	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001790	-	74	36.000	ENSAPOG00000010738	-	69	36.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001790	-	81	54.918	ENSAPOG00000002527	-	86	55.344	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001790	-	70	52.830	ENSAPOG00000009288	-	79	52.830	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001790	-	79	37.190	ENSAPOG00000000066	-	66	37.190	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001790	-	64	36.364	ENSAPOG00000009059	-	89	37.209	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001790	-	76	37.555	ENSAPOG00000021365	-	72	37.555	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001790	-	66	31.034	ENSAPOG00000008819	-	85	31.683	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001790	-	68	37.981	ENSAPOG00000007123	-	74	37.981	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001790	-	52	37.037	ENSAPOG00000007631	-	75	37.037	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001790	-	73	39.462	ENSACIG00000002950	-	65	36.364	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	70	40.465	ENSACIG00000019149	-	63	40.000	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	69	37.441	ENSACIG00000012707	-	77	37.441	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	72	40.909	ENSACIG00000022222	-	67	40.909	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	77	40.084	ENSACIG00000005780	-	68	40.084	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	76	35.622	ENSACIG00000012714	-	74	35.622	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	52	40.000	ENSACIG00000022374	-	82	40.000	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	72	39.819	ENSACIG00000006484	-	64	39.819	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	72	36.199	ENSACIG00000012159	-	54	36.199	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	57	34.091	ENSACIG00000014670	-	68	34.091	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	66	35.354	ENSACIG00000015088	-	75	35.354	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	87	35.075	ENSACIG00000007178	-	83	35.075	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	55	32.353	ENSACIG00000003050	-	74	32.353	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	57	34.857	ENSACIG00000019509	-	81	34.857	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	55	39.053	ENSACIG00000012204	-	73	39.053	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	88	56.226	ENSACIG00000005587	-	92	56.226	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	65	33.636	ENSACIG00000009149	-	70	33.636	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	87	51.331	ENSACIG00000012061	-	71	51.331	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	71	39.352	ENSACIG00000006478	-	77	39.352	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	78	42.449	ENSACIG00000022355	-	80	42.449	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	72	62.212	ENSACIG00000005573	-	90	62.212	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	79	43.210	ENSACIG00000016635	-	86	43.210	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	67	40.594	ENSACIG00000007158	-	63	37.712	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	59	40.223	ENSACIG00000000631	-	62	40.223	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	52	40.000	ENSACIG00000012761	-	70	40.000	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	64	39.286	ENSACIG00000005223	-	72	39.286	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	72	36.486	ENSACIG00000016313	-	66	36.937	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001790	-	67	76.119	ENSAOCG00000016099	-	89	76.119	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000001790	-	77	34.188	ENSAOCG00000013326	-	79	34.188	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000001790	-	76	37.069	ENSAOCG00000015984	-	72	37.069	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000001790	-	94	50.847	ENSAOCG00000016082	-	69	50.847	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000001790	-	55	41.071	ENSAOCG00000022559	si:dkey-73p2.1	67	41.071	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000001790	-	53	42.138	ENSAOCG00000007815	-	59	42.138	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000001790	-	72	38.532	ENSAPEG00000013508	-	88	38.532	Amphiprion_percula
ENSACLG00000001790	-	77	36.481	ENSAPEG00000003513	-	83	42.500	Amphiprion_percula
ENSACLG00000001790	-	53	42.767	ENSAPEG00000013378	-	58	42.767	Amphiprion_percula
ENSACLG00000001790	-	67	76.119	ENSAPEG00000002121	-	89	76.119	Amphiprion_percula
ENSACLG00000001790	-	71	32.407	ENSAPEG00000008662	-	52	32.407	Amphiprion_percula
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