EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000001865 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1516 bases
Position: chr1:2075363-2076878
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000002718	RVT_1	PF00078.27	2.8e-31	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000002776	-	1516	-	ENSACLP00000002718	363 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000001865	-	77	51.773	ENSACLG00000017297	-	52	51.773
ENSACLG00000001865	-	84	46.711	ENSACLG00000024414	-	83	47.170
ENSACLG00000001865	-	88	47.799	ENSACLG00000017363	-	72	47.799
ENSACLG00000001865	-	71	47.104	ENSACLG00000005259	-	80	47.104
ENSACLG00000001865	-	89	59.006	ENSACLG00000015659	-	54	59.006
ENSACLG00000001865	-	72	44.867	ENSACLG00000015652	-	100	44.867
ENSACLG00000001865	-	89	52.322	ENSACLG00000005570	-	50	52.322
ENSACLG00000001865	-	61	43.694	ENSACLG00000004754	-	55	44.492
ENSACLG00000001865	-	85	46.774	ENSACLG00000025562	-	72	47.170
ENSACLG00000001865	-	89	59.627	ENSACLG00000015536	-	84	59.627
ENSACLG00000001865	-	80	47.405	ENSACLG00000027135	-	83	47.405
ENSACLG00000001865	-	83	48.000	ENSACLG00000000907	-	79	48.000
ENSACLG00000001865	-	89	52.615	ENSACLG00000009011	-	68	52.615
ENSACLG00000001865	-	88	36.478	ENSACLG00000024587	-	68	36.478
ENSACLG00000001865	-	79	82.986	ENSACLG00000019417	-	83	83.108
ENSACLG00000001865	-	86	43.038	ENSACLG00000004579	-	76	43.252
ENSACLG00000001865	-	88	59.434	ENSACLG00000023425	-	84	58.696
ENSACLG00000001865	-	87	51.887	ENSACLG00000020302	-	82	51.887
ENSACLG00000001865	-	83	48.505	ENSACLG00000022741	-	83	48.505
ENSACLG00000001865	-	74	47.191	ENSACLG00000012447	-	60	47.687
ENSACLG00000001865	-	83	47.841	ENSACLG00000000802	-	94	47.756
ENSACLG00000001865	-	85	47.883	ENSACLG00000013183	-	84	48.254
ENSACLG00000001865	-	88	50.000	ENSACLG00000014537	-	67	50.000
ENSACLG00000001865	-	85	47.742	ENSACLG00000004232	-	72	48.113
ENSACLG00000001865	-	73	44.906	ENSACLG00000027774	-	83	44.906
ENSACLG00000001865	-	86	42.722	ENSACLG00000018346	-	72	42.945
ENSACLG00000001865	-	54	39.899	ENSACLG00000026307	-	52	39.899
ENSACLG00000001865	-	89	59.627	ENSACLG00000022169	-	54	59.627
ENSACLG00000001865	-	80	52.055	ENSACLG00000002725	-	79	52.055
ENSACLG00000001865	-	88	58.805	ENSACLG00000002685	-	86	58.805
ENSACLG00000001865	-	89	58.696	ENSACLG00000020926	-	84	58.696
ENSACLG00000001865	-	85	47.097	ENSACLG00000026769	-	72	47.484
ENSACLG00000001865	-	85	47.097	ENSACLG00000021814	-	57	47.484
ENSACLG00000001865	-	84	48.693	ENSACLG00000025009	-	67	49.527
ENSACLG00000001865	-	89	52.615	ENSACLG00000011570	-	85	52.615
ENSACLG00000001865	-	89	84.783	ENSACLG00000024568	-	76	84.783
ENSACLG00000001865	-	78	32.281	ENSACLG00000021422	-	71	32.281
ENSACLG00000001865	-	89	52.308	ENSACLG00000022051	-	84	52.308
ENSACLG00000001865	-	85	47.097	ENSACLG00000019420	-	63	47.484
ENSACLG00000001865	-	88	57.862	ENSACLG00000005921	-	61	57.862
ENSACLG00000001865	-	88	58.491	ENSACLG00000004998	-	71	58.491
ENSACLG00000001865	-	55	50.495	ENSACLG00000007824	-	55	50.495
ENSACLG00000001865	-	89	52.615	ENSACLG00000003670	-	51	52.615
ENSACLG00000001865	-	92	51.632	ENSACLG00000022656	-	77	51.632
ENSACLG00000001865	-	77	48.239	ENSACLG00000008836	-	53	48.239
ENSACLG00000001865	-	77	49.286	ENSACLG00000013521	-	71	49.286
ENSACLG00000001865	-	85	47.097	ENSACLG00000027855	-	72	47.484
ENSACLG00000001865	-	87	31.562	ENSACLG00000016231	-	54	31.562
ENSACLG00000001865	-	89	98.762	ENSACLG00000002680	-	79	98.762
ENSACLG00000001865	-	73	50.566	ENSACLG00000005711	-	81	50.566
ENSACLG00000001865	-	85	47.097	ENSACLG00000000182	-	57	47.484
ENSACLG00000001865	-	56	44.828	ENSACLG00000015324	-	52	44.828
ENSACLG00000001865	-	60	48.636	ENSACLG00000027256	-	54	48.636
ENSACLG00000001865	-	80	47.751	ENSACLG00000013213	-	86	48.185
ENSACLG00000001865	-	77	48.387	ENSACLG00000013483	-	81	48.387
ENSACLG00000001865	-	86	47.923	ENSACLG00000022277	-	76	47.923
ENSACLG00000001865	-	86	43.038	ENSACLG00000014661	-	69	43.252
ENSACLG00000001865	-	62	49.123	ENSACLG00000021947	-	73	49.123
ENSACLG00000001865	-	85	47.742	ENSACLG00000013944	-	72	48.113
ENSACLG00000001865	-	54	40.404	ENSACLG00000001254	-	64	40.404
ENSACLG00000001865	-	88	50.938	ENSACLG00000005593	-	84	51.393
ENSACLG00000001865	-	85	46.774	ENSACLG00000020601	-	72	47.170
ENSACLG00000001865	-	89	52.615	ENSACLG00000014746	-	51	52.615
ENSACLG00000001865	-	88	50.155	ENSACLG00000017402	-	69	50.155
ENSACLG00000001865	-	74	84.015	ENSACLG00000012352	-	55	84.015
ENSACLG00000001865	-	84	48.355	ENSACLG00000011151	-	84	48.254
ENSACLG00000001865	-	79	52.414	ENSACLG00000026286	-	77	52.414
ENSACLG00000001865	-	72	30.827	ENSACLG00000027508	-	56	30.827
ENSACLG00000001865	-	75	44.086	ENSACLG00000024268	-	81	45.427
ENSACLG00000001865	-	84	50.814	ENSACLG00000002591	-	99	50.814
ENSACLG00000001865	-	80	47.751	ENSACLG00000027738	-	89	47.751
ENSACLG00000001865	-	88	52.632	ENSACLG00000026963	-	84	52.632
ENSACLG00000001865	-	88	50.467	ENSACLG00000009983	-	84	50.467
ENSACLG00000001865	-	82	93.939	ENSACLG00000000597	-	83	93.939
ENSACLG00000001865	-	86	58.842	ENSACLG00000015732	-	84	58.842
ENSACLG00000001865	-	67	47.561	ENSACLG00000003644	-	75	47.561
ENSACLG00000001865	-	82	48.161	ENSACLG00000010474	-	65	48.161
ENSACLG00000001865	-	92	49.555	ENSACLG00000006014	-	72	49.555
ENSACLG00000001865	-	75	30.182	ENSACLG00000008558	-	57	30.182
ENSACLG00000001865	-	53	33.505	ENSACLG00000016290	-	61	33.505
ENSACLG00000001865	-	85	47.742	ENSACLG00000016639	-	70	48.113
ENSACLG00000001865	-	88	49.536	ENSACLG00000005126	-	97	49.536
ENSACLG00000001865	-	88	51.393	ENSACLG00000011440	-	88	51.393
ENSACLG00000001865	-	85	47.883	ENSACLG00000017093	-	72	47.799
ENSACLG00000001865	-	79	48.252	ENSACLG00000022104	-	81	48.667
ENSACLG00000001865	-	90	50.303	ENSACLG00000022219	-	86	50.303
ENSACLG00000001865	-	89	84.472	ENSACLG00000014642	-	53	84.472
ENSACLG00000001865	-	85	47.557	ENSACLG00000006202	-	84	47.937
ENSACLG00000001865	-	78	47.518	ENSACLG00000017680	-	81	47.518
ENSACLG00000001865	-	61	45.045	ENSACLG00000025525	-	54	45.045
ENSACLG00000001865	-	87	48.571	ENSACLG00000008024	-	84	48.571
ENSACLG00000001865	-	80	47.405	ENSACLG00000003344	-	93	47.405
ENSACLG00000001865	-	74	46.642	ENSACLG00000010284	-	75	46.642
ENSACLG00000001865	-	85	47.883	ENSACLG00000020184	-	69	47.799
ENSACLG00000001865	-	89	52.308	ENSACLG00000007318	-	84	52.308
ENSACLG00000001865	-	57	36.364	ENSACLG00000014463	-	92	36.364
ENSACLG00000001865	-	61	30.508	ENSACLG00000009971	-	74	30.508
ENSACLG00000001865	-	89	52.000	ENSACLG00000005547	-	51	52.000
ENSACLG00000001865	-	55	50.249	ENSACLG00000022966	-	56	50.249
ENSACLG00000001865	-	85	47.742	ENSACLG00000006327	-	61	48.113
ENSACLG00000001865	-	78	52.098	ENSACLG00000021354	-	75	52.098
ENSACLG00000001865	-	88	58.491	ENSACLG00000022877	-	71	58.491
ENSACLG00000001865	-	85	48.065	ENSACLG00000008572	-	72	48.428
ENSACLG00000001865	-	88	48.923	ENSACLG00000003937	-	81	48.923
ENSACLG00000001865	-	84	47.039	ENSACLG00000018107	-	57	47.484
ENSACLG00000001865	-	72	46.388	ENSACLG00000001556	-	56	46.388
ENSACLG00000001865	-	85	47.883	ENSACLG00000023557	-	50	47.799
ENSACLG00000001865	-	89	52.308	ENSACLG00000012219	-	68	52.308
ENSACLG00000001865	-	84	48.366	ENSACLG00000000230	-	67	49.211
ENSACLG00000001865	-	88	51.887	ENSACLG00000010082	-	57	51.887
ENSACLG00000001865	-	85	46.774	ENSACLG00000010080	-	72	47.170
ENSACLG00000001865	-	88	50.155	ENSACLG00000025957	-	60	50.155
ENSACLG00000001865	-	67	45.082	ENSACLG00000020388	-	69	45.020
ENSACLG00000001865	-	85	46.452	ENSACLG00000024184	-	72	46.855
ENSACLG00000001865	-	89	51.385	ENSACLG00000013583	-	84	51.385
ENSACLG00000001865	-	87	51.572	ENSACLG00000012076	-	83	51.572
ENSACLG00000001865	-	85	47.097	ENSACLG00000024400	-	61	47.484
ENSACLG00000001865	-	66	50.622	ENSACLG00000021583	-	58	50.622
ENSACLG00000001865	-	66	46.888	ENSACLG00000005746	-	54	46.888
ENSACLG00000001865	-	85	47.557	ENSACLG00000000437	-	84	47.937
ENSACLG00000001865	-	87	31.562	ENSACLG00000021775	-	80	31.562
ENSACLG00000001865	-	88	47.059	ENSACLG00000004581	-	84	47.059
ENSACLG00000001865	-	86	44.514	ENSACLG00000021937	-	67	46.341
ENSACLG00000001865	-	89	59.006	ENSACLG00000013932	-	59	59.006
ENSACLG00000001865	-	74	47.566	ENSACLG00000002171	-	82	47.566
ENSACLG00000001865	-	85	47.419	ENSACLG00000010664	-	57	47.799
ENSACLG00000001865	-	84	48.366	ENSACLG00000022853	-	59	49.211

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000001865	-	60	51.598	ENSACIG00000019567	-	95	51.598	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001865	-	86	48.553	ENSAOCG00000004576	-	84	48.553	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000001865	-	51	40.212	ENSAOCG00000022972	-	98	40.212	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000001865	-	86	48.875	ENSAPEG00000024502	-	84	48.875	Amphiprion_percula
ENSACLG00000001865	-	89	55.901	ENSATEG00000015490	-	52	55.901	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001865	-	88	44.444	ENSATEG00000023197	-	50	44.444	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001865	-	79	43.197	ENSATEG00000019241	-	82	43.197	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001865	-	60	47.465	ENSATEG00000014313	-	62	47.465	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001865	-	89	56.522	ENSATEG00000014607	-	62	56.522	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001865	-	89	56.211	ENSATEG00000002739	-	52	56.211	Anabas_testudineus
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