EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000002020 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 28843 bases
Position: chr4:17904976-17933818
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000002964	MMR_HSR1	PF01926.23	9.6e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000003059	-	792	-	ENSACLP00000002993	263 (aa)	-	-
ENSACLT00000003030	-	744	-	ENSACLP00000002964	247 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000002020	-	94	44.015	ENSACLG00000027615	-	97	44.015
ENSACLG00000002020	-	98	33.579	ENSACLG00000013499	-	61	33.824
ENSACLG00000002020	-	99	39.493	ENSACLG00000010292	-	98	39.493
ENSACLG00000002020	-	98	32.721	ENSACLG00000022141	-	59	32.721
ENSACLG00000002020	-	97	36.940	ENSACLG00000018321	-	95	38.519
ENSACLG00000002020	-	94	47.451	ENSACLG00000016487	-	86	47.451
ENSACLG00000002020	-	85	40.343	ENSACLG00000016390	-	91	40.343
ENSACLG00000002020	-	98	31.365	ENSACLG00000022167	-	61	31.618
ENSACLG00000002020	-	98	31.955	ENSACLG00000009420	zgc:153654	56	31.955
ENSACLG00000002020	-	98	32.584	ENSACLG00000021969	-	62	32.576

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000002020	-	94	47.104	ENSACIG00000015684	-	92	47.104	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000002020	-	89	39.056	ENSACIG00000015237	-	91	39.056	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000002020	-	94	47.893	ENSACIG00000004408	-	90	47.893	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000002020	-	96	46.617	ENSACIG00000004501	-	93	46.617	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000002020	-	96	46.008	ENSACIG00000004444	-	96	46.008	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000002020	-	97	48.120	ENSACIG00000015616	-	96	48.120	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000002020	-	94	50.787	ENSACIG00000004426	-	88	50.787	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000002020	-	98	60.448	ENSACIG00000000741	-	94	60.448	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000002020	-	94	47.244	ENSACIG00000004521	-	91	47.244	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000002020	-	94	49.808	ENSAOCG00000002056	-	86	49.808	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000002020	-	97	51.136	ENSAPEG00000021053	-	94	50.554	Amphiprion_percula
ENSACLG00000002020	-	98	41.758	ENSATEG00000002718	-	82	41.985	Anabas_testudineus
ENSACLG00000002020	-	97	49.805	ENSATEG00000002869	-	95	49.805	Anabas_testudineus
ENSACLG00000002020	-	92	35.802	ENSAMXG00000037563	-	89	35.802	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000002020	-	96	45.385	ENSCSEG00000018832	-	97	45.385	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000002020	-	93	46.094	ENSCVAG00000023166	-	97	46.094	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000002020	-	67	39.665	ENSCVAG00000014640	-	82	39.665	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000002020	-	91	44.048	ENSCVAG00000007214	-	98	44.048	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000002020	-	99	36.101	ENSCVAG00000016719	-	96	36.101	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000002020	-	67	32.955	ENSDARG00000092361	si:dkey-79f11.7	74	32.955	Danio_rerio
ENSACLG00000002020	-	98	33.333	ENSDARG00000092634	CABZ01000634.1	90	33.333	Danio_rerio
ENSACLG00000002020	-	89	32.400	ENSDARG00000095309	si:dkey-79f11.9	89	32.400	Danio_rerio
ENSACLG00000002020	-	68	44.633	ENSDARG00000015678	si:dkeyp-75b4.9	85	44.633	Danio_rerio
ENSACLG00000002020	-	97	35.338	ENSDARG00000107486	CR855320.3	89	35.338	Danio_rerio
ENSACLG00000002020	-	98	34.082	ENSDARG00000093857	si:dkey-79f11.10	83	34.082	Danio_rerio
ENSACLG00000002020	-	96	33.585	ENSDARG00000010729	CABZ01073795.1	92	33.585	Danio_rerio
ENSACLG00000002020	-	94	32.319	ENSDARG00000029720	si:dkeyp-9d4.2	88	31.939	Danio_rerio
ENSACLG00000002020	-	96	36.226	ENSDARG00000095673	si:dkey-79f11.8	82	35.955	Danio_rerio
ENSACLG00000002020	-	96	35.206	ENSDARG00000075791	si:dkey-79f11.5	85	35.206	Danio_rerio
ENSACLG00000002020	-	99	43.066	ENSFHEG00000021105	-	92	43.066	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000002020	-	93	38.492	ENSFHEG00000018078	-	92	38.492	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000002020	-	93	41.339	ENSFHEG00000018069	-	87	41.339	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000002020	-	79	38.667	ENSFHEG00000019992	-	76	38.667	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000002020	-	86	37.768	ENSGAFG00000019422	-	93	37.768	Gambusia_affinis
ENSACLG00000002020	-	99	38.545	ENSGAFG00000019423	-	60	38.545	Gambusia_affinis
ENSACLG00000002020	-	95	50.193	ENSGACG00000012556	-	83	50.193	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000002020	-	95	48.649	ENSGACG00000012548	-	88	48.649	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000002020	-	95	50.193	ENSGACG00000001319	-	96	50.193	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000002020	-	90	48.770	ENSHBUG00000010945	-	91	48.770	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000002020	-	96	36.154	ENSIPUG00000005624	-	96	36.154	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000002020	-	96	33.840	ENSIPUG00000007632	-	76	33.840	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000002020	-	96	34.615	ENSIPUG00000006852	-	81	34.615	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000002020	-	92	47.410	ENSKMAG00000000325	-	90	47.410	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000002020	-	97	43.561	ENSKMAG00000006729	-	98	43.561	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000002020	-	92	46.400	ENSKMAG00000000369	-	93	46.400	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000002020	-	97	40.809	ENSMAMG00000003546	-	90	40.809	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000002020	-	95	49.219	ENSMAMG00000003570	-	90	49.219	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000002020	-	97	40.000	ENSMZEG00005015498	-	96	40.000	Maylandia_zebra
ENSACLG00000002020	-	94	50.000	ENSMZEG00005008301	-	96	50.000	Maylandia_zebra
ENSACLG00000002020	-	94	47.674	ENSMZEG00005008329	-	97	47.674	Maylandia_zebra
ENSACLG00000002020	-	94	48.945	ENSNBRG00000006414	-	86	48.945	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000002020	-	97	40.909	ENSNBRG00000023290	-	89	40.909	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000002020	-	97	43.077	ENSNBRG00000020744	-	90	43.077	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000002020	-	88	49.383	ENSNBRG00000020781	-	98	49.383	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000002020	-	94	48.837	ENSNBRG00000006386	-	97	48.837	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000002020	-	96	40.221	ENSNBRG00000024253	-	91	40.221	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000002020	-	96	49.802	ENSNBRG00000020806	-	89	49.802	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000002020	-	96	47.490	ENSNBRG00000022075	-	93	47.490	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000002020	-	89	45.833	ENSONIG00000016843	-	99	45.833	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000002020	-	94	47.287	ENSONIG00000015247	-	91	47.287	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000002020	-	94	48.638	ENSONIG00000015167	-	99	48.638	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000002020	-	64	48.619	ENSONIG00000013227	-	100	48.619	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000002020	-	88	47.934	ENSONIG00000012317	-	97	47.934	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000002020	-	97	41.758	ENSONIG00000018790	-	93	41.758	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000002020	-	94	48.450	ENSONIG00000012319	-	99	48.450	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000002020	-	93	45.850	ENSONIG00000015371	-	99	45.850	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000002020	-	90	46.964	ENSONIG00000017465	-	99	46.964	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000002020	-	99	42.164	ENSPMGG00000004994	-	95	42.164	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000002020	-	97	43.130	ENSPMGG00000022341	-	80	43.130	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000002020	-	90	44.177	ENSPMGG00000002695	-	95	44.177	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000002020	-	94	50.813	ENSPMGG00000012906	-	91	50.813	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000002020	-	96	41.985	ENSPFOG00000015455	-	89	41.985	Poecilia_formosa
ENSACLG00000002020	-	97	39.777	ENSPFOG00000015382	-	94	39.777	Poecilia_formosa
ENSACLG00000002020	-	99	45.290	ENSPFOG00000003807	-	96	45.290	Poecilia_formosa
ENSACLG00000002020	-	95	45.385	ENSPFOG00000003841	-	92	44.610	Poecilia_formosa
ENSACLG00000002020	-	99	39.636	ENSPFOG00000015493	-	94	39.636	Poecilia_formosa
ENSACLG00000002020	-	99	40.076	ENSPLAG00000018274	-	96	40.076	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000002020	-	98	39.338	ENSPMEG00000018635	-	95	39.338	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000002020	-	94	42.688	ENSPMEG00000018626	-	90	42.688	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000002020	-	97	47.393	ENSPREG00000005137	-	95	47.393	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000002020	-	91	48.387	ENSPNYG00000005478	-	87	48.387	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000002020	-	94	39.453	ENSPNYG00000001584	-	90	39.453	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000002020	-	94	45.850	ENSPNYG00000024019	-	87	45.850	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000002020	-	94	39.130	ENSPNAG00000009266	-	94	39.130	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000002020	-	97	35.636	ENSPNAG00000006327	-	68	35.636	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000002020	-	95	47.177	ENSSDUG00000002359	-	96	47.177	Seriola_dumerili
ENSACLG00000002020	-	95	46.825	ENSSDUG00000002417	-	95	46.825	Seriola_dumerili
ENSACLG00000002020	-	94	47.876	ENSSLDG00000016397	-	96	47.876	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000002020	-	95	46.800	ENSSLDG00000008952	-	91	46.800	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000002020	-	94	50.000	ENSSPAG00000012915	-	98	50.000	Stegastes_partitus
ENSACLG00000002020	-	97	52.652	ENSSPAG00000012856	-	93	52.652	Stegastes_partitus
ENSACLG00000002020	-	83	42.009	ENSXCOG00000008517	-	68	42.009	Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000002020	-	64	40.361	ENSXCOG00000003913	-	88	40.361	Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000002020	-	82	35.526	ENSXCOG00000019639	-	87	35.526	Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000002020	-	96	39.098	ENSXMAG00000009973	-	91	39.300	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000002020	-	97	41.328	ENSXMAG00000029117	-	96	41.328	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000002020	-	95	38.314	ENSXMAG00000009971	-	68	38.314	Xiphophorus_maculatus