EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000002238 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3553 bases
Position: chr22:21048405-21051957
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000003265	RVT_1	PF00078.27	3.4e-21	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000003342	-	3553	-	ENSACLP00000003265	1171 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000002238	-	99	30.819	ENSACLG00000008224	-	88	30.819
ENSACLG00000002238	-	51	34.358	ENSACLG00000012657	-	58	34.358
ENSACLG00000002238	-	99	50.372	ENSACLG00000018325	-	89	50.454
ENSACLG00000002238	-	99	30.657	ENSACLG00000014671	-	88	30.657
ENSACLG00000002238	-	64	34.959	ENSACLG00000025904	-	56	34.959
ENSACLG00000002238	-	92	30.804	ENSACLG00000002701	-	81	30.804
ENSACLG00000002238	-	73	30.211	ENSACLG00000027627	-	78	30.211
ENSACLG00000002238	-	90	31.978	ENSACLG00000024627	-	78	31.919
ENSACLG00000002238	-	83	33.266	ENSACLG00000004561	-	92	33.266
ENSACLG00000002238	-	63	33.607	ENSACLG00000009118	-	57	33.607
ENSACLG00000002238	-	94	31.378	ENSACLG00000027304	-	85	31.378
ENSACLG00000002238	-	64	34.267	ENSACLG00000017161	-	53	34.267
ENSACLG00000002238	-	65	32.164	ENSACLG00000005531	-	62	32.164
ENSACLG00000002238	-	60	31.102	ENSACLG00000019989	-	77	31.102
ENSACLG00000002238	-	88	53.258	ENSACLG00000027633	-	92	53.258
ENSACLG00000002238	-	62	30.885	ENSACLG00000021770	-	57	30.885
ENSACLG00000002238	-	64	34.064	ENSACLG00000013455	-	55	34.064
ENSACLG00000002238	-	63	33.402	ENSACLG00000016624	-	59	32.943
ENSACLG00000002238	-	100	41.736	ENSACLG00000002243	-	89	41.970
ENSACLG00000002238	-	75	33.921	ENSACLG00000017452	-	97	33.921
ENSACLG00000002238	-	66	33.504	ENSACLG00000022170	-	82	33.587
ENSACLG00000002238	-	88	45.548	ENSACLG00000005909	-	97	45.548
ENSACLG00000002238	-	51	34.358	ENSACLG00000000373	-	58	34.358
ENSACLG00000002238	-	53	33.895	ENSACLG00000018344	-	54	33.895
ENSACLG00000002238	-	70	33.259	ENSACLG00000026879	-	64	33.259
ENSACLG00000002238	-	63	34.151	ENSACLG00000027747	-	51	34.151
ENSACLG00000002238	-	62	32.338	ENSACLG00000014688	-	64	32.338
ENSACLG00000002238	-	65	34.429	ENSACLG00000013171	-	53	34.429
ENSACLG00000002238	-	89	33.486	ENSACLG00000007713	-	94	32.977
ENSACLG00000002238	-	61	34.004	ENSACLG00000020048	-	61	34.004
ENSACLG00000002238	-	56	35.090	ENSACLG00000013905	-	82	35.241
ENSACLG00000002238	-	65	34.429	ENSACLG00000001555	-	52	34.429
ENSACLG00000002238	-	67	33.582	ENSACLG00000011588	-	93	33.582
ENSACLG00000002238	-	63	31.929	ENSACLG00000025719	-	52	31.929
ENSACLG00000002238	-	58	30.043	ENSACLG00000027730	-	70	30.043
ENSACLG00000002238	-	63	45.344	ENSACLG00000027124	-	99	45.344
ENSACLG00000002238	-	83	32.049	ENSACLG00000007417	-	72	32.049
ENSACLG00000002238	-	90	30.833	ENSACLG00000026192	-	83	30.833
ENSACLG00000002238	-	86	33.043	ENSACLG00000008642	-	94	33.043
ENSACLG00000002238	-	64	34.064	ENSACLG00000003361	-	55	34.064
ENSACLG00000002238	-	74	45.403	ENSACLG00000004748	-	99	45.403
ENSACLG00000002238	-	60	32.696	ENSACLG00000007343	-	91	32.696
ENSACLG00000002238	-	64	33.265	ENSACLG00000001282	-	57	33.265
ENSACLG00000002238	-	66	30.706	ENSACLG00000003852	-	61	30.706
ENSACLG00000002238	-	83	30.409	ENSACLG00000018225	-	83	30.409
ENSACLG00000002238	-	83	32.150	ENSACLG00000013242	-	72	32.150
ENSACLG00000002238	-	60	32.569	ENSACLG00000008010	-	66	33.257
ENSACLG00000002238	-	95	44.569	ENSACLG00000016675	-	85	44.569
ENSACLG00000002238	-	97	31.711	ENSACLG00000016676	-	88	32.023
ENSACLG00000002238	-	65	31.310	ENSACLG00000013947	-	78	31.310
ENSACLG00000002238	-	63	31.264	ENSACLG00000009628	-	52	31.264
ENSACLG00000002238	-	64	34.490	ENSACLG00000012963	-	51	34.490
ENSACLG00000002238	-	63	31.486	ENSACLG00000024091	-	52	31.486
ENSACLG00000002238	-	94	32.155	ENSACLG00000014813	-	87	31.711
ENSACLG00000002238	-	58	32.667	ENSACLG00000014619	-	53	32.667
ENSACLG00000002238	-	58	32.667	ENSACLG00000019876	-	53	32.667
ENSACLG00000002238	-	71	31.323	ENSACLG00000027702	-	98	31.323
ENSACLG00000002238	-	99	50.289	ENSACLG00000002872	-	89	50.372
ENSACLG00000002238	-	63	31.102	ENSACLG00000018181	-	80	31.102

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000002238	-	57	47.415	ENSAPOG00000021580	-	92	47.415	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000002238	-	61	46.399	ENSAPOG00000012937	-	97	46.399	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000002238	-	99	49.466	ENSAPOG00000007435	-	89	49.466	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000002238	-	98	43.232	ENSCSEG00000010440	-	87	43.232	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000002238	-	97	45.360	ENSFHEG00000022554	-	81	45.360	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000002238	-	94	37.309	ENSLACG00000014947	-	86	43.308	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000002238	-	71	44.922	ENSLACG00000007131	-	100	44.922	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000002238	-	94	39.856	ENSLACG00000003314	-	96	39.856	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000002238	-	63	52.457	ENSONIG00000020960	-	99	52.590	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000002238	-	90	45.622	ENSOMEG00000023951	-	89	45.714	Oryzias_melastigma