EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000002243 (Gene tree)
Gene ID: 113007139
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: uncharacterized protein K02A2.6-like
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5148 bases
Position: chr15:38148958-38154105
Accession: 113007139
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000003266	RVT_1	PF00078.27	1.6e-24	1	1
ENSACLP00000003266	zf-CCHC	PF00098.23	2.2e-06	1	2
ENSACLP00000003266	zf-CCHC	PF00098.23	2.2e-06	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000003343	-	5148	XM_026143579	ENSACLP00000003266	1333 (aa)	XP_025999364	UPI000E40809D

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000002243	-	57	30.238	ENSACLG00000003799	-	59	30.238
ENSACLG00000002243	-	51	30.440	ENSACLG00000024556	-	99	30.083
ENSACLG00000002243	-	59	33.043	ENSACLG00000027702	-	93	33.085
ENSACLG00000002243	-	52	32.489	ENSACLG00000019989	-	75	32.489
ENSACLG00000002243	-	57	32.438	ENSACLG00000021546	-	59	32.438
ENSACLG00000002243	-	59	34.793	ENSACLG00000011588	-	96	34.265
ENSACLG00000002243	-	54	35.590	ENSACLG00000002180	-	50	35.590
ENSACLG00000002243	-	50	31.929	ENSACLG00000027730	-	60	33.248
ENSACLG00000002243	-	88	33.607	ENSACLG00000014813	-	96	32.564
ENSACLG00000002243	-	71	31.493	ENSACLG00000008642	-	90	31.493
ENSACLG00000002243	-	61	35.867	ENSACLG00000017452	-	92	35.867
ENSACLG00000002243	-	53	31.557	ENSACLG00000025904	-	50	31.557
ENSACLG00000002243	-	52	34.454	ENSACLG00000000373	-	68	34.454
ENSACLG00000002243	-	93	30.692	ENSACLG00000002701	-	94	30.614
ENSACLG00000002243	-	68	32.378	ENSACLG00000022170	-	96	32.378
ENSACLG00000002243	-	96	43.196	ENSACLG00000018325	-	95	43.196
ENSACLG00000002243	-	60	30.222	ENSACLG00000016581	-	76	30.104
ENSACLG00000002243	-	57	30.238	ENSACLG00000006945	-	54	31.088
ENSACLG00000002243	-	56	97.337	ENSACLG00000027124	-	100	97.337
ENSACLG00000002243	-	53	39.917	ENSACLG00000002535	-	99	39.806
ENSACLG00000002243	-	57	30.807	ENSACLG00000014688	-	67	30.807
ENSACLG00000002243	-	77	57.495	ENSACLG00000005909	-	89	60.513
ENSACLG00000002243	-	51	30.780	ENSACLG00000025657	-	69	31.538
ENSACLG00000002243	-	78	34.483	ENSACLG00000007713	-	98	33.247
ENSACLG00000002243	-	99	55.369	ENSACLG00000016675	-	99	55.296
ENSACLG00000002243	-	57	30.989	ENSACLG00000013947	-	77	31.071
ENSACLG00000002243	-	54	32.190	ENSACLG00000001555	-	50	32.061
ENSACLG00000002243	-	52	34.454	ENSACLG00000012657	-	68	34.454
ENSACLG00000002243	-	99	31.140	ENSACLG00000008224	-	98	30.994
ENSACLG00000002243	-	96	43.196	ENSACLG00000002872	-	95	43.196
ENSACLG00000002243	-	57	32.438	ENSACLG00000013669	-	60	32.438
ENSACLG00000002243	-	56	34.266	ENSACLG00000026879	-	51	34.925
ENSACLG00000002243	-	57	32.475	ENSACLG00000020048	-	56	32.475
ENSACLG00000002243	-	78	30.402	ENSACLG00000018225	-	89	30.402
ENSACLG00000002243	-	95	30.385	ENSACLG00000027304	-	97	30.342
ENSACLG00000002243	-	92	31.067	ENSACLG00000026192	-	97	30.691
ENSACLG00000002243	-	54	32.000	ENSACLG00000013171	-	50	32.190
ENSACLG00000002243	-	73	34.269	ENSACLG00000004561	-	93	33.868
ENSACLG00000002243	-	93	32.046	ENSACLG00000024627	-	94	31.737
ENSACLG00000002243	-	53	30.663	ENSACLG00000010161	-	89	30.417
ENSACLG00000002243	-	87	31.464	ENSACLG00000013242	-	87	31.381
ENSACLG00000002243	-	51	30.140	ENSACLG00000018344	-	61	30.140
ENSACLG00000002243	-	54	33.551	ENSACLG00000018181	-	73	35.733
ENSACLG00000002243	-	51	31.774	ENSACLG00000021770	-	56	31.774
ENSACLG00000002243	-	66	99.772	ENSACLG00000004748	-	100	99.772
ENSACLG00000002243	-	55	31.724	ENSACLG00000008010	-	71	31.840
ENSACLG00000002243	-	61	31.180	ENSACLG00000027627	-	74	31.292
ENSACLG00000002243	-	87	31.381	ENSACLG00000007417	-	87	31.297
ENSACLG00000002243	-	99	31.241	ENSACLG00000014671	-	98	31.067
ENSACLG00000002243	-	55	33.333	ENSACLG00000013905	-	93	33.730
ENSACLG00000002243	-	85	44.281	ENSACLG00000027633	-	99	44.281
ENSACLG00000002243	-	89	41.970	ENSACLG00000002238	-	100	41.736
ENSACLG00000002243	-	72	30.030	ENSACLG00000017062	-	95	30.030

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000002243	-	94	43.313	ENSAPOG00000007435	-	94	43.258	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000002243	-	50	48.458	ENSAPOG00000012937	-	92	48.458	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000002243	-	51	49.120	ENSAPOG00000021580	-	92	49.120	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000002243	-	99	49.041	ENSCSEG00000010440	-	99	48.894	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000002243	-	91	45.218	ENSFHEG00000022554	-	86	45.218	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000002243	-	93	33.811	ENSLACG00000014947	-	97	38.201	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000002243	-	62	38.655	ENSLACG00000007131	-	99	38.655	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000002243	-	83	45.022	ENSLACG00000003314	-	96	45.022	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000002243	-	53	46.910	ENSONIG00000020960	-	93	46.910	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000002243	-	87	53.878	ENSOMEG00000023951	-	97	53.962	Oryzias_melastigma