EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000002804 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1284 bases
Position: chr15:19314796-19316079
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000004136	RVT_1	PF00078.27	1.2e-37	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000004226	-	1284	-	ENSACLP00000004136	427 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000002804	-	96	53.528	ENSACLG00000010342	-	77	53.528
ENSACLG00000002804	-	96	54.015	ENSACLG00000010340	-	77	54.015
ENSACLG00000002804	-	94	53.000	ENSACLG00000005668	-	99	53.000
ENSACLG00000002804	-	89	97.906	ENSACLG00000006494	-	100	97.906
ENSACLG00000002804	-	95	53.317	ENSACLG00000013575	-	86	53.317
ENSACLG00000002804	-	94	52.750	ENSACLG00000006471	-	99	52.750
ENSACLG00000002804	-	96	53.155	ENSACLG00000016139	-	91	53.155
ENSACLG00000002804	-	58	31.102	ENSACLG00000015445	-	66	31.102
ENSACLG00000002804	-	87	56.649	ENSACLG00000003745	-	100	56.649
ENSACLG00000002804	-	95	53.317	ENSACLG00000027079	-	81	53.317
ENSACLG00000002804	-	68	50.171	ENSACLG00000010751	-	96	50.171
ENSACLG00000002804	-	95	53.431	ENSACLG00000023234	-	89	53.431
ENSACLG00000002804	-	69	51.515	ENSACLG00000008537	-	97	51.515
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ENSACLG00000002804	-	79	53.571	ENSACLG00000022316	-	76	53.571
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Orthologs

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ENSACLG00000002804	-	72	49.518	ENSXMAG00000028321	-	100	49.518	Xiphophorus_maculatus