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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000002844 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 27768 bases
Position: chr3:46995824-47023591
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSACLP00000004262	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-59	10	10
ENSACLP00000004262	zf-met	PF12874.7	1.6e-14	1	1

Transcripts

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ENSACLT00000004349	-	1668	-	ENSACLP00000004262	555 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

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ENSACLG00000002844	-	70	48.148	ENSACLG00000018707	-	98	48.148
ENSACLG00000002844	-	86	53.305	ENSACLG00000001018	-	87	53.548
ENSACLG00000002844	-	83	31.716	ENSACLG00000022287	-	60	32.422

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000002844	-	88	51.579	ENSACIG00000017644	-	97	51.579	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000002844	-	85	54.599	ENSHBUG00000006250	-	96	54.599	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000002844	-	85	60.651	ENSMZEG00005012727	-	67	60.651	Maylandia_zebra
ENSACLG00000002844	-	86	65.964	ENSMZEG00005021801	-	83	65.964	Maylandia_zebra
ENSACLG00000002844	-	83	51.604	ENSMZEG00005020759	-	99	53.254	Maylandia_zebra
ENSACLG00000002844	-	82	76.250	ENSNBRG00000002542	-	82	76.250	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000002844	-	85	50.658	ENSNBRG00000009815	-	89	50.407	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000002844	-	82	66.202	ENSNBRG00000001608	-	94	62.025	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000002844	-	83	63.141	ENSONIG00000007886	-	99	58.806	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000002844	-	94	51.714	ENSPNYG00000023637	-	86	51.491	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000002844	-	83	59.036	ENSPNYG00000021571	-	84	59.036	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000002844	-	86	63.844	ENSPNYG00000005777	-	86	68.846	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000002844	-	89	74.178	ENSPNYG00000023916	-	78	74.178	Pundamilia_nyererei