EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000003401 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3649 bases
Position: chr15:19918184-19921832
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000005064	MMR_HSR1	PF01926.23	3.1e-07	1	1

Transcripts

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ENSACLT00000005169	-	726	-	ENSACLP00000005064	241 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
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ENSACLG00000003401	-	75	31.492	ENSACLG00000023739	-	79	31.492
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ENSACLG00000003401	-	79	48.691	ENSACLG00000016904	-	72	48.691
ENSACLG00000003401	-	79	38.806	ENSACLG00000017422	-	56	38.806
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ENSACLG00000003401	-	79	56.021	ENSACLG00000001968	-	69	56.021
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ENSACLG00000003401	-	79	37.113	ENSACLG00000016222	-	68	37.113
ENSACLG00000003401	-	79	59.686	ENSACLG00000008592	-	73	59.686
ENSACLG00000003401	-	79	56.477	ENSACLG00000008599	-	63	56.477
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ENSACLG00000003401	-	79	45.876	ENSACLG00000012195	-	52	45.876
ENSACLG00000003401	-	79	40.796	ENSACLG00000001800	-	62	38.220
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ENSACLG00000003401	-	79	48.438	ENSACLG00000011578	-	80	48.438
ENSACLG00000003401	-	79	47.938	ENSACLG00000024857	-	51	47.938
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ENSACLG00000003401	-	82	45.545	ENSACLG00000003276	-	77	45.545
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ENSACLG00000003401	-	78	31.633	ENSACLG00000001341	-	50	31.633
ENSACLG00000003401	-	79	34.673	ENSACLG00000016251	-	70	34.673
ENSACLG00000003401	-	79	49.479	ENSACLG00000023760	-	80	49.479
ENSACLG00000003401	-	79	47.396	ENSACLG00000023766	zgc:113625	80	47.396
ENSACLG00000003401	-	79	57.068	ENSACLG00000010048	-	76	57.068
ENSACLG00000003401	-	79	47.396	ENSACLG00000023600	-	80	47.396
ENSACLG00000003401	-	79	46.354	ENSACLG00000023555	-	81	46.354
ENSACLG00000003401	-	79	36.500	ENSACLG00000001909	-	60	36.500

Orthologs

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ENSACLG00000003401	-	79	42.487	ENSAPOG00000001315	-	59	42.487	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000003401	-	79	64.398	ENSAPOG00000021159	-	62	64.398	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000003401	-	79	47.423	ENSAPOG00000008344	zgc:113625	68	47.423	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000003401	-	79	59.686	ENSAPOG00000012716	-	64	59.686	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000003401	-	79	50.262	ENSAPOG00000006169	-	53	50.262	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000003401	-	79	44.503	ENSAPOG00000020897	-	72	44.503	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000003401	-	79	52.356	ENSAPOG00000014759	-	63	52.356	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000003401	-	78	46.875	ENSAPOG00000014243	-	79	46.875	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000003401	-	76	55.495	ENSAPOG00000001262	-	87	55.495	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000003401	-	78	49.735	ENSAPOG00000011509	-	64	49.735	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000003401	-	79	50.262	ENSAPOG00000006488	-	74	50.262	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000003401	-	79	57.592	ENSAPOG00000008063	-	62	57.592	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000003401	-	79	47.396	ENSAPOG00000007322	-	66	47.396	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000003401	-	79	48.705	ENSAPOG00000007333	-	56	48.705	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000003401	-	79	48.168	ENSACIG00000014690	-	73	48.168	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	79	60.733	ENSACIG00000001070	-	69	60.733	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	79	48.969	ENSACIG00000020244	-	82	48.969	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	79	57.368	ENSACIG00000006503	-	60	57.368	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	79	57.068	ENSACIG00000008045	-	81	52.582	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	79	46.875	ENSACIG00000014703	-	79	46.875	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	79	41.969	ENSACIG00000016502	-	82	41.969	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	79	60.209	ENSACIG00000016888	-	63	60.209	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	71	60.465	ENSACIG00000008666	-	83	60.465	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	79	48.691	ENSACIG00000004040	-	75	48.691	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	75	55.556	ENSACIG00000001596	-	71	55.556	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	78	56.316	ENSACIG00000008001	-	81	56.316	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	79	45.312	ENSACIG00000014745	-	87	45.312	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	93	39.207	ENSACIG00000020234	-	67	43.229	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	79	60.733	ENSACIG00000004245	-	68	60.733	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	79	63.874	ENSACIG00000001455	-	70	63.874	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	85	41.121	ENSACIG00000014646	zgc:113625	83	41.121	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	81	57.949	ENSACIG00000007466	-	79	57.949	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	79	46.354	ENSACIG00000019524	-	80	46.354	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	65	48.408	ENSACIG00000000976	-	77	48.718	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	79	48.187	ENSACIG00000020225	-	65	48.187	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	79	64.921	ENSACIG00000002263	-	69	64.921	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	79	56.771	ENSACIG00000023381	-	76	56.771	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	79	61.780	ENSACIG00000022370	-	68	61.780	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	79	59.686	ENSACIG00000022366	-	69	59.686	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	80	60.825	ENSACIG00000022362	-	70	60.825	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	50	55.372	ENSACIG00000001465	-	74	55.372	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	79	56.250	ENSACIG00000007494	-	63	57.292	Amphilophus_citrinellus
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ENSACLG00000003401	-	79	48.187	ENSACIG00000014634	zgc:113625	77	48.187	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003401	-	79	60.526	ENSACIG00000003582	-	61	60.526	Amphilophus_citrinellus
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