EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000003766 (Gene tree)
Gene ID: 113016426
Gene Symbol: polrmt
Alias: si:dkey-21e2.1|si:dkeyp-74c5.5|wu:fb73g10
Full Name: RNA polymerase mitochondrial
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 56305 bases
Position: chr23:4716152-4772456
Accession: 113016426
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000005606	RNA_pol	PF00940.19	4e-169	1	1
ENSACLP00000005589	RNA_pol	PF00940.19	4.4e-169	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000005711	-	7939	-	ENSACLP00000005589	1333 (aa)	XP_026015039	UPI00064731B1
ENSACLT00000005727	-	7840	-	ENSACLP00000005606	1300 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000003766	polrmt	78	51.275	ENSG00000099821	POLRMT	66	73.810	Homo_sapiens
ENSACLG00000003766	polrmt	100	83.121	ENSAPOG00000003942	polrmt	100	83.121	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000003766	polrmt	80	50.707	ENSAMEG00000002745	POLRMT	84	51.143	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000003766	polrmt	95	84.194	ENSACIG00000016078	polrmt	100	85.323	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000003766	polrmt	100	82.896	ENSAOCG00000020208	polrmt	100	82.896	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000003766	polrmt	100	82.971	ENSAPEG00000007949	polrmt	100	82.971	Amphiprion_percula
ENSACLG00000003766	polrmt	100	79.552	ENSATEG00000024025	polrmt	97	84.027	Anabas_testudineus
ENSACLG00000003766	polrmt	78	58.829	ENSAPLG00000003051	POLRMT	99	58.641	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000003766	polrmt	85	51.996	ENSANAG00000032916	POLRMT	90	51.996	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000003766	polrmt	100	60.503	ENSAMXG00000018258	polrmt	100	60.178	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000003766	polrmt	78	52.964	ENSBTAG00000015051	POLRMT	83	53.061	Bos_taurus
ENSACLG00000003766	polrmt	82	49.860	ENSCJAG00000012913	POLRMT	82	51.176	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000003766	polrmt	78	52.544	ENSCAFG00000019711	POLRMT	83	52.488	Canis_familiaris
ENSACLG00000003766	polrmt	78	52.544	ENSCAFG00020016843	POLRMT	85	52.488	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000003766	polrmt	87	49.321	ENSCHIG00000013267	POLRMT	83	53.673	Capra_hircus
ENSACLG00000003766	polrmt	75	56.164	ENSCAPG00000016900	POLRMT	88	56.164	Cavia_aperea
ENSACLG00000003766	polrmt	78	48.577	ENSCPOG00000023061	POLRMT	83	48.577	Cavia_porcellus
ENSACLG00000003766	polrmt	78	51.465	ENSCCAG00000025014	POLRMT	82	51.465	Cebus_capucinus
ENSACLG00000003766	polrmt	78	51.172	ENSCATG00000040393	POLRMT	82	51.172	Cercocebus_atys
ENSACLG00000003766	polrmt	89	46.003	ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	49.609	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000003766	polrmt	78	50.195	ENSCSAG00000012942	POLRMT	82	50.195	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000003766	polrmt	88	58.989	ENSCPBG00000009869	POLRMT	97	59.942	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000003766	polrmt	61	44.010	ENSCSAVG00000000440	-	99	44.010	Ciona_savignyi
ENSACLG00000003766	polrmt	78	50.588	ENSCANG00000038011	POLRMT	82	50.588	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000003766	polrmt	78	57.061	ENSCGRG00001021311	Polrmt	83	57.061	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000003766	polrmt	78	52.114	ENSCGRG00000011134	Polrmt	84	52.114	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000003766	polrmt	100	63.029	ENSCSEG00000002734	polrmt	100	62.761	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000003766	polrmt	100	81.409	ENSCVAG00000005949	polrmt	99	86.860	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000003766	polrmt	100	61.377	ENSDARG00000101220	polrmt	94	70.424	Danio_rerio
ENSACLG00000003766	polrmt	79	62.662	ENSDORG00000014125	Polrmt	82	62.662	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000003766	polrmt	78	43.178	FBgn0261938	mtRNApol	78	43.178	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000003766	polrmt	78	66.183	ENSETEG00000003476	POLRMT	80	66.183	Echinops_telfairi
ENSACLG00000003766	polrmt	71	52.468	ENSEBUG00000013453	-	99	52.468	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000003766	polrmt	78	53.229	ENSEASG00005021493	POLRMT	82	53.425	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000003766	polrmt	78	53.033	ENSECAG00000032711	POLRMT	82	53.229	Equus_caballus
ENSACLG00000003766	polrmt	100	66.740	ENSELUG00000019319	polrmt	100	66.150	Esox_lucius
ENSACLG00000003766	polrmt	80	52.772	ENSFCAG00000018808	POLRMT	84	52.772	Felis_catus
ENSACLG00000003766	polrmt	67	60.341	ENSFALG00000013910	POLRMT	82	60.341	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000003766	polrmt	98	42.911	ENSFDAG00000020312	POLRMT	81	48.246	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000003766	polrmt	99	80.285	ENSFHEG00000021239	polrmt	99	82.594	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000003766	polrmt	94	71.353	ENSGMOG00000011829	polrmt	100	65.382	Gadus_morhua
ENSACLG00000003766	polrmt	97	51.459	ENSGALG00000001377	POLRMT	99	51.729	Gallus_gallus
ENSACLG00000003766	polrmt	100	79.520	ENSGAFG00000003953	polrmt	100	79.220	Gambusia_affinis
ENSACLG00000003766	polrmt	97	72.958	ENSGACG00000012957	polrmt	98	81.818	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000003766	polrmt	80	63.742	ENSGAGG00000005522	POLRMT	90	63.742	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000003766	polrmt	65	69.876	ENSGGOG00000023264	-	79	69.876	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000003766	polrmt	100	99.175	ENSHBUG00000010005	polrmt	100	99.175	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000003766	polrmt	98	43.175	ENSHGLG00000019286	POLRMT	97	43.932	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000003766	polrmt	98	43.266	ENSHGLG00100005762	POLRMT	97	42.912	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000003766	polrmt	97	76.069	ENSHCOG00000001565	polrmt	100	76.069	Hippocampus_comes
ENSACLG00000003766	polrmt	100	63.949	ENSIPUG00000000789	polrmt	100	64.354	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000003766	polrmt	72	64.706	ENSSTOG00000003431	POLRMT	81	64.646	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000003766	polrmt	74	59.683	ENSJJAG00000012916	Polrmt	83	59.683	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000003766	polrmt	100	74.438	ENSKMAG00000004426	polrmt	100	74.438	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000003766	polrmt	100	81.045	ENSLBEG00000016529	polrmt	100	80.746	Labrus_bergylta
ENSACLG00000003766	polrmt	96	60.474	ENSLACG00000011518	POLRMT	99	59.674	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000003766	polrmt	100	58.197	ENSLOCG00000005222	polrmt	100	57.291	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000003766	polrmt	78	51.855	ENSLAFG00000001860	POLRMT	84	52.335	Loxodonta_africana
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ENSACLG00000003766	polrmt	66	67.227	ENSMLEG00000037404	POLRMT	80	67.227	Mandrillus_leucophaeus
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ENSACLG00000003766	polrmt	78	62.798	ENSMAUG00000019392	Polrmt	83	62.957	Mesocricetus_auratus
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ENSACLG00000003766	polrmt	82	48.318	ENSMOCG00000008868	Polrmt	86	48.757	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000003766	polrmt	96	74.568	ENSMMOG00000000705	polrmt	99	75.000	Mola_mola
ENSACLG00000003766	polrmt	78	55.945	ENSMODG00000006478	POLRMT	81	55.945	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000003766	polrmt	100	77.055	ENSMALG00000021224	polrmt	100	76.682	Monopterus_albus
ENSACLG00000003766	polrmt	76	63.291	MGP_CAROLIEiJ_G0015538	Polrmt	100	62.529	Mus_caroli
ENSACLG00000003766	polrmt	76	63.175	ENSMUSG00000020329	Polrmt	99	62.356	Mus_musculus
ENSACLG00000003766	polrmt	76	63.016	MGP_PahariEiJ_G0030951	Polrmt	100	61.894	Mus_pahari
ENSACLG00000003766	polrmt	76	63.333	MGP_SPRETEiJ_G0016356	Polrmt	100	62.587	Mus_spretus
ENSACLG00000003766	polrmt	81	49.816	ENSMPUG00000009910	POLRMT	87	49.862	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000003766	polrmt	82	51.959	ENSMLUG00000009223	POLRMT	83	53.165	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000003766	polrmt	75	63.449	ENSNGAG00000005498	Polrmt	82	63.449	Nannospalax_galili
ENSACLG00000003766	polrmt	99	98.789	ENSNBRG00000023530	polrmt	100	98.789	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000003766	polrmt	78	51.765	ENSNLEG00000000718	POLRMT	82	51.765	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000003766	polrmt	61	56.180	ENSOPRG00000013579	POLRMT	67	56.910	Ochotona_princeps
ENSACLG00000003766	polrmt	90	97.261	ENSONIG00000002405	polrmt	100	97.261	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000003766	polrmt	100	77.978	ENSORLG00000004329	polrmt	97	77.903	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003766	polrmt	100	76.981	ENSORLG00020003896	polrmt	100	77.453	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000003766	polrmt	100	77.181	ENSORLG00015022238	polrmt	97	77.107	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000003766	polrmt	100	73.877	ENSOMEG00000008292	polrmt	100	74.494	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000003766	polrmt	97	46.882	ENSOGAG00000007912	POLRMT	89	52.838	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000003766	polrmt	75	67.932	ENSOARG00000008898	POLRMT	86	44.685	Ovis_aries
ENSACLG00000003766	polrmt	78	50.294	ENSPPAG00000030853	POLRMT	81	50.294	Pan_paniscus
ENSACLG00000003766	polrmt	78	49.118	ENSPPAG00000043321	-	81	49.118	Pan_paniscus
ENSACLG00000003766	polrmt	65	61.175	ENSPPRG00000001547	POLRMT	77	60.423	Panthera_pardus
ENSACLG00000003766	polrmt	78	50.686	ENSPTRG00000010157	POLRMT	78	50.686	Pan_troglodytes
ENSACLG00000003766	polrmt	78	49.510	ENSPTRG00000039638	-	81	49.510	Pan_troglodytes
ENSACLG00000003766	polrmt	78	51.074	ENSPANG00000006649	POLRMT	82	51.074	Papio_anubis
ENSACLG00000003766	polrmt	100	60.507	ENSPKIG00000024580	polrmt	100	60.656	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000003766	polrmt	91	76.063	ENSPMGG00000014627	polrmt	99	76.017	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000003766	polrmt	78	56.198	ENSPEMG00000011671	Polrmt	83	56.198	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000003766	polrmt	67	57.078	ENSPMAG00000005070	-	99	57.078	Petromyzon_marinus
ENSACLG00000003766	polrmt	100	50.459	ENSPCIG00000006103	POLRMT	93	57.884	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000003766	polrmt	100	78.245	ENSPFOG00000003911	polrmt	100	78.095	Poecilia_formosa
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ENSACLG00000003766	polrmt	72	70.488	ENSPMEG00000011484	polrmt	94	77.205	Poecilia_mexicana
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ENSACLG00000003766	polrmt	73	61.088	ENSPPYG00000009282	POLRMT	80	61.088	Pongo_abelii
ENSACLG00000003766	polrmt	73	60.326	ENSPCAG00000010816	POLRMT	77	60.326	Procavia_capensis
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ENSACLG00000003766	polrmt	62	61.255	ENSSHAG00000009387	-	100	61.378	Sarcophilus_harrisii
ENSACLG00000003766	polrmt	88	69.036	ENSSFOG00015005074	polrmt	92	69.036	Scleropages_formosus
ENSACLG00000003766	polrmt	100	79.104	ENSSMAG00000011851	polrmt	100	79.104	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000003766	polrmt	100	82.239	ENSSDUG00000004410	polrmt	100	83.809	Seriola_dumerili
ENSACLG00000003766	polrmt	100	82.313	ENSSLDG00000010643	polrmt	100	83.901	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000003766	polrmt	100	82.265	ENSSPAG00000018740	polrmt	100	82.489	Stegastes_partitus
ENSACLG00000003766	polrmt	86	48.670	ENSSSCG00000035693	POLRMT	83	52.872	Sus_scrofa
ENSACLG00000003766	polrmt	75	61.405	ENSTGUG00000000621	POLRMT	100	61.609	Taeniopygia_guttata
ENSACLG00000003766	polrmt	100	73.557	ENSTRUG00000018040	polrmt	99	80.398	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000003766	polrmt	78	86.193	ENSTNIG00000010642	polrmt	100	86.193	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000003766	polrmt	62	65.654	ENSTTRG00000011329	POLRMT	65	65.654	Tursiops_truncatus
ENSACLG00000003766	polrmt	80	51.100	ENSUAMG00000019616	POLRMT	84	51.096	Ursus_americanus
ENSACLG00000003766	polrmt	78	49.323	ENSVVUG00000022627	POLRMT	84	49.373	Vulpes_vulpes
ENSACLG00000003766	polrmt	97	54.885	ENSXETG00000006545	polrmt	85	61.918	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000003766	polrmt	100	80.195	ENSXMAG00000012464	polrmt	100	80.195	Xiphophorus_maculatus