EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000003857 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3366 bases
Position: chr16:30628729-30632094
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000005705	RVT_1	PF00078.27	1e-40	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000005827	-	3366	-	ENSACLP00000005705	1121 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000003857	-	80	40.088	ENSACLG00000015667	-	100	40.088
ENSACLG00000003857	-	69	42.537	ENSACLG00000027996	-	99	42.537
ENSACLG00000003857	-	53	48.350	ENSACLG00000014642	-	99	48.350
ENSACLG00000003857	-	67	60.505	ENSACLG00000019194	-	99	60.505
ENSACLG00000003857	-	97	39.983	ENSACLG00000027511	-	81	43.511
ENSACLG00000003857	-	56	46.178	ENSACLG00000005547	-	99	46.178
ENSACLG00000003857	-	75	48.161	ENSACLG00000009590	-	99	48.161
ENSACLG00000003857	-	80	39.978	ENSACLG00000015650	-	100	39.978
ENSACLG00000003857	-	52	45.623	ENSACLG00000015659	-	99	45.623
ENSACLG00000003857	-	64	58.485	ENSACLG00000013061	-	99	58.485
ENSACLG00000003857	-	54	38.499	ENSACLG00000012279	-	98	38.499
ENSACLG00000003857	-	57	51.944	ENSACLG00000005570	-	100	51.944
ENSACLG00000003857	-	73	43.030	ENSACLG00000019519	-	99	43.030
ENSACLG00000003857	-	78	47.743	ENSACLG00000009939	-	88	47.856
ENSACLG00000003857	-	59	42.152	ENSACLG00000005212	-	100	42.152
ENSACLG00000003857	-	68	41.944	ENSACLG00000015331	-	97	41.944
ENSACLG00000003857	-	74	38.810	ENSACLG00000008383	-	100	38.810
ENSACLG00000003857	-	64	48.257	ENSACLG00000009807	-	99	48.396
ENSACLG00000003857	-	80	40.197	ENSACLG00000025376	-	100	40.197
ENSACLG00000003857	-	62	41.185	ENSACLG00000002614	-	99	41.185
ENSACLG00000003857	-	74	68.144	ENSACLG00000021051	-	99	68.144
ENSACLG00000003857	-	57	37.463	ENSACLG00000004144	-	87	37.463
ENSACLG00000003857	-	64	58.345	ENSACLG00000017692	-	99	58.345
ENSACLG00000003857	-	80	39.978	ENSACLG00000025119	-	100	39.978
ENSACLG00000003857	-	74	42.442	ENSACLG00000008391	-	99	42.442
ENSACLG00000003857	-	59	45.052	ENSACLG00000005017	-	99	45.052
ENSACLG00000003857	-	74	42.326	ENSACLG00000002468	-	99	42.326
ENSACLG00000003857	-	56	42.381	ENSACLG00000022841	-	81	42.381
ENSACLG00000003857	-	80	39.978	ENSACLG00000022844	-	100	39.978
ENSACLG00000003857	-	80	39.759	ENSACLG00000000393	-	100	39.759
ENSACLG00000003857	-	56	46.178	ENSACLG00000014746	-	99	46.178
ENSACLG00000003857	-	65	55.693	ENSACLG00000013805	-	87	55.693
ENSACLG00000003857	-	59	42.687	ENSACLG00000001405	-	99	42.687
ENSACLG00000003857	-	50	44.643	ENSACLG00000021814	-	99	44.643
ENSACLG00000003857	-	74	42.442	ENSACLG00000021287	-	99	42.442
ENSACLG00000003857	-	56	43.349	ENSACLG00000023557	-	99	43.349
ENSACLG00000003857	-	59	42.239	ENSACLG00000001758	-	99	42.239
ENSACLG00000003857	-	69	38.540	ENSACLG00000018252	-	98	38.540
ENSACLG00000003857	-	56	46.490	ENSACLG00000003670	-	99	46.490
ENSACLG00000003857	-	67	48.742	ENSACLG00000020248	-	99	48.742
ENSACLG00000003857	-	74	42.326	ENSACLG00000023885	-	99	42.326
ENSACLG00000003857	-	74	42.442	ENSACLG00000004826	-	99	42.442
ENSACLG00000003857	-	59	45.052	ENSACLG00000014413	-	99	45.052
ENSACLG00000003857	-	57	42.462	ENSACLG00000014915	-	99	42.462
ENSACLG00000003857	-	57	42.344	ENSACLG00000014911	-	98	42.344
ENSACLG00000003857	-	76	40.000	ENSACLG00000009850	-	96	40.000
ENSACLG00000003857	-	73	39.686	ENSACLG00000017448	-	99	39.686
ENSACLG00000003857	-	50	44.643	ENSACLG00000000182	-	99	44.643
ENSACLG00000003857	-	61	44.109	ENSACLG00000000736	-	98	44.109
ENSACLG00000003857	-	78	47.153	ENSACLG00000000734	-	99	47.153
ENSACLG00000003857	-	67	48.609	ENSACLG00000012019	-	99	48.609
ENSACLG00000003857	-	80	40.088	ENSACLG00000012014	-	100	40.088
ENSACLG00000003857	-	59	42.388	ENSACLG00000020183	-	99	42.388
ENSACLG00000003857	-	59	42.090	ENSACLG00000008571	-	99	42.090
ENSACLG00000003857	-	83	48.875	ENSACLG00000017412	-	99	48.875
ENSACLG00000003857	-	57	45.814	ENSACLG00000008859	-	96	45.814
ENSACLG00000003857	-	59	42.302	ENSACLG00000000536	-	99	42.302
ENSACLG00000003857	-	69	42.040	ENSACLG00000020864	-	99	42.040
ENSACLG00000003857	-	51	46.644	ENSACLG00000022169	-	97	46.644
ENSACLG00000003857	-	65	38.844	ENSACLG00000013844	-	96	38.844
ENSACLG00000003857	-	80	39.759	ENSACLG00000010900	-	100	39.759
ENSACLG00000003857	-	78	39.909	ENSACLG00000000395	-	100	39.909
ENSACLG00000003857	-	80	40.088	ENSACLG00000005662	-	100	40.088
ENSACLG00000003857	-	85	49.220	ENSACLG00000007643	-	90	49.220

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000003857	-	54	47.213	ENSATEG00000015490	-	98	47.213	Anabas_testudineus
ENSACLG00000003857	-	56	35.783	ENSATEG00000023197	-	98	35.942	Anabas_testudineus
ENSACLG00000003857	-	86	33.505	ENSATEG00000012907	-	99	33.607	Anabas_testudineus
ENSACLG00000003857	-	76	43.322	ENSATEG00000019512	-	99	43.322	Anabas_testudineus
ENSACLG00000003857	-	76	43.322	ENSATEG00000010674	-	99	43.322	Anabas_testudineus
ENSACLG00000003857	-	54	47.541	ENSATEG00000002739	-	98	47.541	Anabas_testudineus
ENSACLG00000003857	-	72	33.374	ENSATEG00000005707	-	99	33.496	Anabas_testudineus
ENSACLG00000003857	-	72	39.927	ENSAMXG00000039914	-	99	39.927	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000003857	-	71	39.630	ENSAMXG00000043574	-	98	39.630	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000003857	-	73	41.241	ENSAMXG00000033551	-	98	41.241	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000003857	-	63	35.664	ENSAMXG00000030246	-	98	35.972	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000003857	-	56	41.784	ENSAMXG00000041791	-	95	41.784	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000003857	-	83	35.106	ENSAMXG00000040053	-	95	35.213	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000003857	-	67	43.883	ENSAMXG00000043096	-	99	43.825	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000003857	-	50	34.418	ENSAMXG00000041363	-	97	34.589	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000003857	-	59	41.867	ENSAMXG00000032588	-	99	41.867	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000003857	-	73	34.360	ENSAMXG00000036646	-	92	35.006	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000003857	-	59	34.361	ENSAMXG00000033415	-	90	35.163	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000003857	-	52	45.315	ENSHBUG00000016298	-	99	45.205	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000003857	-	60	37.593	ENSIPUG00000013060	-	90	35.827	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000003857	-	59	42.879	ENSLBEG00000004554	-	97	42.879	Labrus_bergylta
ENSACLG00000003857	-	61	38.881	ENSMAMG00000000974	-	93	38.881	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000003857	-	57	43.808	ENSMAMG00000005648	-	93	43.808	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000003857	-	50	44.286	ENSMZEG00005020016	-	99	44.286	Maylandia_zebra
ENSACLG00000003857	-	50	44.643	ENSMZEG00005005149	-	99	44.643	Maylandia_zebra
ENSACLG00000003857	-	59	42.388	ENSMZEG00005007942	-	99	42.388	Maylandia_zebra
ENSACLG00000003857	-	59	41.940	ENSMZEG00005006441	-	99	41.940	Maylandia_zebra
ENSACLG00000003857	-	78	49.035	ENSMALG00000019721	-	99	49.035	Monopterus_albus
ENSACLG00000003857	-	83	40.106	ENSORLG00000029083	-	97	40.149	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	64	37.860	ENSORLG00000024275	-	97	37.912	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	99	46.532	ENSORLG00000029224	-	90	48.410	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	83	45.165	ENSORLG00000028985	-	100	45.165	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	84	39.662	ENSORLG00000024780	-	99	39.662	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	83	40.446	ENSORLG00000029806	-	97	40.446	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	83	40.340	ENSORLG00000029022	-	97	40.340	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	60	43.088	ENSORLG00000022764	-	92	43.088	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	83	40.403	ENSORLG00000029677	-	97	40.446	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	50	44.640	ENSORLG00000026102	-	100	44.640	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	60	42.647	ENSORLG00000025312	-	96	42.647	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	85	39.605	ENSORLG00000028561	-	99	39.605	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	54	43.140	ENSORLG00000029959	-	99	43.140	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	58	42.770	ENSORLG00000027920	-	99	42.770	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	61	37.554	ENSORLG00000025214	-	94	37.554	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	57	42.946	ENSORLG00000022342	-	98	42.946	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	50	50.438	ENSORLG00000028297	-	99	50.438	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	68	40.285	ENSORLG00000028326	-	99	40.285	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	99	44.385	ENSORLG00000028245	-	74	47.237	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	72	43.542	ENSORLG00000026492	-	99	43.542	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	50	38.339	ENSORLG00000030463	-	100	38.339	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	83	40.444	ENSORLG00000028622	-	97	40.444	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	77	39.770	ENSORLG00000023110	-	97	39.770	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	63	41.326	ENSORLG00000025670	-	94	41.326	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	80	42.494	ENSORLG00000024647	-	99	42.494	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	78	40.271	ENSORLG00000026935	-	97	40.271	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	83	39.915	ENSORLG00000025146	-	97	39.915	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	80	42.605	ENSORLG00000026215	-	99	42.605	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	60	42.604	ENSORLG00000029550	-	95	42.604	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	72	40.368	ENSORLG00000025955	-	98	40.418	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	60	42.941	ENSORLG00000028204	-	68	42.941	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	60	42.647	ENSORLG00000024475	-	98	42.647	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	85	39.689	ENSORLG00000025231	-	99	39.689	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	84	39.979	ENSORLG00000027420	-	99	39.979	Oryzias_latipes
ENSACLG00000003857	-	74	40.785	ENSORLG00000024191	-	99	40.785	Oryzias_latipes
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