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Description

Ensembl ID: ENSACLG00000004248 (Gene tree)
Gene ID: 113034143
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: wu:fa56c07|wu:fi27f11|zgc:66238
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 55587 bases
Position: chr12:35182704-35238290
Accession: 11098
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000006382	ResIII	PF04851.15	2.1e-08	1	1
ENSACLP00000006382	BRK	PF07533.16	2.2e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000006529	SMARCA2-201	4656	-	ENSACLP00000006382	1551 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000004248	SMARCA2	91	74.685	ENSACLG00000008638	-	98	73.779
ENSACLG00000004248	SMARCA2	93	71.141	ENSACLG00000000163	smarca4a	98	72.142

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.518	ENSG00000080503	SMARCA2	99	98.000	Homo_sapiens
ENSACLG00000004248	SMARCA2	100	91.798	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	92.486	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	81	85.524	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	85.994	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000004248	SMARCA2	100	94.650	ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	94.331	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	100	92.376	ENSAOCG00000009647	-	100	92.124	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000004248	SMARCA2	100	91.924	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	100	91.929	Amphiprion_percula
ENSACLG00000004248	SMARCA2	99	91.885	ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	91.502	Anabas_testudineus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	87	78.947	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	75	85.374	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.481	ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	80.737	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	81.039	ENSANAG00000026498	SMARCA2	100	80.949	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000004248	SMARCA2	99	84.357	ENSAMXG00000012404	smarca2	100	83.593	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	81.455	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	100	81.737	Bos_taurus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	81.581	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	81.361	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	82.318	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	100	81.940	Canis_familiaris
ENSACLG00000004248	SMARCA2	75	87.113	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	94	86.942	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	81.586	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	100	81.737	Capra_hircus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	79.013	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	80.559	Carlito_syrichta
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	79.202	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	99	78.356	Cavia_aperea
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.915	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	100	80.835	Cavia_porcellus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	81.181	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	100	81.088	Cebus_capucinus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	79.923	ENSCATG00000031470	SMARCA2	100	80.937	Cercocebus_atys
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.326	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	80.643	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000004248	SMARCA2	91	82.591	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	82.114	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	83	81.690	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	86	81.690	Choloepus_hoffmanni
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.245	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	97	85.572	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	81.339	ENSCANG00000039597	SMARCA2	100	81.242	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	75.940	ENSCGRG00001002323	Smarca2	100	75.616	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000004248	SMARCA2	99	87.613	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	98	87.549	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000004248	SMARCA2	84	88.672	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	98	88.473	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	100	84.669	ENSDARG00000008904	smarca2	100	83.521	Danio_rerio
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.387	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	100	80.554	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.869	ENSDORG00000014832	Smarca2	100	80.721	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000004248	SMARCA2	77	62.231	FBgn0000212	brm	72	61.589	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000004248	SMARCA2	95	69.705	ENSEBUG00000011442	-	97	69.786	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000004248	SMARCA2	86	62.221	ENSEBUG00000002449	-	93	64.291	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	81.663	ENSEASG00005010312	SMARCA2	100	81.493	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	62	88.235	ENSEEUG00000015540	-	69	83.562	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	95	83.784	ENSELUG00000010318	smarca2	99	81.481	Esox_lucius
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	82.122	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	100	81.685	Felis_catus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	79.359	ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	81.948	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	79.507	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	100	78.280	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000004248	SMARCA2	100	91.271	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	90.823	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	99	83.959	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	83.376	Gadus_morhua
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	79.744	ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	80.543	Gallus_gallus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	95	83.856	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	95	83.712	Gambusia_affinis
ENSACLG00000004248	SMARCA2	99	88.415	ENSGACG00000014488	SMARCA2	99	87.651	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.946	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	100	80.354	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	78.327	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	100	79.910	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000004248	SMARCA2	99	99.546	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	98	99.546	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.143	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	98	80.178	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	81.591	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	100	81.807	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000004248	SMARCA2	89	83.960	ENSHCOG00000015348	-	100	82.948	Hippocampus_comes
ENSACLG00000004248	SMARCA2	99	83.641	ENSIPUG00000011060	smarca2	100	81.920	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.777	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	100	80.820	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	81.128	ENSJJAG00000010867	Smarca2	100	81.037	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	100	90.518	ENSKMAG00000015844	-	100	90.262	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	82.186	ENSLOCG00000011499	smarca2	99	81.551	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	79.370	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	83	84.527	Loxodonta_africana
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.416	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	100	81.754	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	81.287	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	81.127	Macaca_mulatta
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.624	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	100	80.964	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.143	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	100	81.130	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	100	90.835	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	91.013	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	99	99.870	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	98	99.870	Maylandia_zebra
ENSACLG00000004248	SMARCA2	73	68.428	ENSMGAG00000005160	-	100	68.338	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	81.539	ENSMICG00000005162	SMARCA2	100	81.373	Microcebus_murinus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	81.453	ENSMOCG00000001611	Smarca2	100	80.910	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000004248	SMARCA2	99	87.218	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	99	86.839	Mola_mola
ENSACLG00000004248	SMARCA2	96	80.827	ENSMODG00000003578	SMARCA2	100	80.796	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000004248	SMARCA2	99	92.433	ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	92.303	Monopterus_albus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.450	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	100	79.937	Mus_caroli
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.566	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	98.000	Mus_musculus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	81.032	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	100	80.377	Mus_pahari
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.450	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	97	90.909	Mus_spretus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	81	85.792	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	85.792	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	75.977	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	99	76.482	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.259	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	80.102	Nannospalax_galili
ENSACLG00000004248	SMARCA2	95	80.413	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	89.608	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.000	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	81.130	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000004248	SMARCA2	93	78.788	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	100	74.398	Notamacropus_eugenii
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	76.083	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	76.244	Ochotona_princeps
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	79.844	ENSODEG00000005452	SMARCA2	98	79.949	Octodon_degus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	99	95.854	ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	95.854	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	81	86.857	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	100	80.353	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	100	89.590	ENSORLG00000020820	SMARCA2	100	89.716	Oryzias_latipes
ENSACLG00000004248	SMARCA2	100	90.032	ENSORLG00015006289	SMARCA2	100	90.221	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000004248	SMARCA2	100	91.624	ENSOMEG00000009736	-	100	91.430	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000004248	SMARCA2	81	86.396	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.267	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	79.715	ENSOARG00000013265	SMARCA2	100	80.955	Ovis_aries
ENSACLG00000004248	SMARCA2	80	85.692	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	100	80.937	Pan_paniscus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	82.187	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	100	81.749	Panthera_pardus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.374	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	100	80.505	Pan_troglodytes
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	77.432	ENSPANG00000025121	SMARCA2	100	77.118	Papio_anubis
ENSACLG00000004248	SMARCA2	100	85.264	ENSPKIG00000018469	-	100	84.492	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000004248	SMARCA2	96	79.766	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	100	79.287	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000004248	SMARCA2	99	85.352	ENSPMGG00000013696	-	98	85.286	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.583	ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	80.063	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000004248	SMARCA2	94	70.192	ENSPMAG00000005337	-	79	75.554	Petromyzon_marinus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	81.974	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	100	81.667	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	100	89.586	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	89.586	Poecilia_formosa
ENSACLG00000004248	SMARCA2	99	89.001	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	98	87.637	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000004248	SMARCA2	99	88.931	ENSPMEG00000001815	-	99	87.245	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000004248	SMARCA2	100	88.660	ENSPREG00000013800	SMARCA2	97	87.387	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.949	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	100	80.798	Pongo_abelii
ENSACLG00000004248	SMARCA2	76	73.592	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	73.592	Procavia_capensis
ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	79.465	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	100	79.225	Propithecus_coquereli
ENSACLG00000004248	SMARCA2	90	83.575	ENSPVAG00000000901	SMARCA2	94	83.253	Pteropus_vampyrus
ENSACLG00000004248	SMARCA2	100	93.655	ENSPNYG00000004533	SMARCA2	100	92.826	Pundamilia_nyererei
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