EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000004360 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1668 bases
Position: chr23:40050183-40051850
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000006456	RVT_1	PF00078.27	4.8e-38	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000006604	-	1668	-	ENSACLP00000006456	555 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000004360	-	81	52.328	ENSACLG00000023234	-	98	52.328
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ENSACLG00000004360	-	60	52.870	ENSACLG00000015747	-	99	52.870
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ENSACLG00000004360	-	67	50.938	ENSACLG00000013992	-	98	50.938
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ENSACLG00000004360	-	98	47.426	ENSACLG00000017714	-	87	51.974
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ENSACLG00000004360	-	67	49.471	ENSACLG00000015142	-	99	49.471
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ENSACLG00000004360	-	84	52.239	ENSXMAG00000023438	-	79	52.814	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000004360	-	55	49.837	ENSXMAG00000028321	-	100	49.837	Xiphophorus_maculatus