EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000005025 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2361 bases
Position: chr8:11365146-11367506
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000007412	RVT_1	PF00078.27	6.9e-31	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000007577	-	2361	-	ENSACLP00000007412	786 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
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ENSACLG00000005025	-	57	40.848	ENSORLG00015014646	-	88	37.743	Oryzias_latipes_hsok
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ENSACLG00000005025	-	96	37.716	ENSOMEG00000000840	-	73	37.386	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000005025	-	54	44.444	ENSPREG00000012043	-	84	44.444	Poecilia_reticulata
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ENSACLG00000005025	-	92	38.219	ENSSFOG00015011549	-	81	38.102	Scleropages_formosus
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