EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSACLG00000005420 (Gene tree)
Gene ID: 113016185
Gene Symbol: rab11ba
Alias: rab11b|wu:fb07g11|zgc:55760
Full Name: ras-related protein Rab-11B-like
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6651 bases
Position: chr23:5816365-5823015
Accession: 113016185
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000007973	MMR_HSR1	PF01926.23	2.6e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000008156	-	3382	-	ENSACLP00000007973	218 (aa)	XP_026014594	UPI0003297ECE

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000005420	rab11ba	94	35.885	ENSACLG00000021547	rab33a	62	39.205
ENSACLG00000005420	rab11ba	72	36.943	ENSACLG00000019423	rab41	74	36.943
ENSACLG00000005420	rab11ba	74	47.205	ENSACLG00000008615	-	73	47.205
ENSACLG00000005420	rab11ba	75	43.030	ENSACLG00000007696	rab12	84	38.426
ENSACLG00000005420	rab11ba	94	40.686	ENSACLG00000018066	rab5aa	89	40.686
ENSACLG00000005420	rab11ba	82	45.304	ENSACLG00000027590	-	85	45.304
ENSACLG00000005420	rab11ba	79	47.977	ENSACLG00000019643	-	87	47.977
ENSACLG00000005420	rab11ba	77	53.571	ENSACLG00000007644	rab1ab	83	53.571
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	94.954	ENSACLG00000005446	-	100	94.954
ENSACLG00000005420	rab11ba	78	40.909	ENSACLG00000004795	rab9b	78	40.909
ENSACLG00000005420	rab11ba	72	41.104	ENSACLG00000018847	RAB7A	78	41.104
ENSACLG00000005420	rab11ba	62	30.282	ENSACLG00000016659	-	69	30.282
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.578	ENSACLG00000007076	rab11bb	100	93.578
ENSACLG00000005420	rab11ba	76	43.976	ENSACLG00000026336	rab15	78	43.976
ENSACLG00000005420	rab11ba	89	32.000	ENSACLG00000025138	rab6ba	92	32.000
ENSACLG00000005420	rab11ba	92	36.893	ENSACLG00000024502	-	93	36.893
ENSACLG00000005420	rab11ba	77	35.882	ENSACLG00000025632	rabl2	73	35.882
ENSACLG00000005420	rab11ba	77	53.571	ENSACLG00000003326	-	83	53.571
ENSACLG00000005420	rab11ba	93	90.640	ENSACLG00000018852	-	92	90.640
ENSACLG00000005420	rab11ba	96	46.190	ENSACLG00000006329	-	94	46.190
ENSACLG00000005420	rab11ba	76	33.918	ENSACLG00000021109	si:dkey-13a21.4	82	33.918
ENSACLG00000005420	rab11ba	70	35.484	ENSACLG00000027515	KRAS	87	36.527
ENSACLG00000005420	rab11ba	77	45.562	ENSACLG00000009468	RAB39B	79	45.562
ENSACLG00000005420	rab11ba	74	43.478	ENSACLG00000021470	rab22a	83	43.478
ENSACLG00000005420	rab11ba	78	45.614	ENSACLG00000015289	rab18b	83	45.614
ENSACLG00000005420	rab11ba	83	37.436	ENSACLG00000005720	rab33ba	80	37.436
ENSACLG00000005420	rab11ba	72	35.185	ENSACLG00000008602	RAB29	98	35.185
ENSACLG00000005420	rab11ba	99	81.567	ENSACLG00000010268	rab11al	99	81.567
ENSACLG00000005420	rab11ba	81	43.017	ENSACLG00000007514	rab42a	82	43.017
ENSACLG00000005420	rab11ba	74	46.296	ENSACLG00000011484	rab18a	79	46.296
ENSACLG00000005420	rab11ba	83	45.000	ENSACLG00000018721	si:dkey-16l2.16	100	41.395
ENSACLG00000005420	rab11ba	76	54.819	ENSACLG00000013668	rab1ba	83	54.819
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	85.321	ENSACLG00000001775	rab11a	100	85.321
ENSACLG00000005420	rab11ba	76	37.647	ENSACLG00000006647	rab9a	84	37.647
ENSACLG00000005420	rab11ba	74	47.205	ENSACLG00000002706	rab5c	73	47.205
ENSACLG00000005420	rab11ba	72	35.669	ENSACLG00000026487	rab6bb	76	36.184
ENSACLG00000005420	rab11ba	99	63.927	ENSACLG00000018262	rab25a	100	63.927
ENSACLG00000005420	rab11ba	74	31.214	ENSACLG00000019293	rasl11a	67	31.214
ENSACLG00000005420	rab11ba	74	34.132	ENSACLG00000009103	si:cabz01085950.1	82	34.132
ENSACLG00000005420	rab11ba	82	45.304	ENSACLG00000022893	-	85	45.304
ENSACLG00000005420	rab11ba	77	43.195	ENSACLG00000001218	RAB17	74	43.195
ENSACLG00000005420	rab11ba	70	35.256	ENSACLG00000005733	rab34b	59	35.256
ENSACLG00000005420	rab11ba	95	37.089	ENSACLG00000010965	-	82	37.089
ENSACLG00000005420	rab11ba	70	35.484	ENSACLG00000027677	KRAS	87	36.527
ENSACLG00000005420	rab11ba	79	33.721	ENSACLG00000002819	rab23	80	33.508
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	60.550	ENSACLG00000010251	rab25b	100	60.550
ENSACLG00000005420	rab11ba	83	40.323	ENSACLG00000024456	-	87	40.323
ENSACLG00000005420	rab11ba	77	44.379	ENSACLG00000000860	-	75	44.379
ENSACLG00000005420	rab11ba	81	39.665	ENSACLG00000027006	zgc:101559	76	39.665
ENSACLG00000005420	rab11ba	73	32.500	ENSACLG00000008646	rheb	86	32.500
ENSACLG00000005420	rab11ba	68	36.000	ENSACLG00000001181	hrasb	85	37.037
ENSACLG00000005420	rab11ba	70	36.538	ENSACLG00000005093	rab34a	58	36.538
ENSACLG00000005420	rab11ba	77	52.695	ENSACLG00000013505	-	78	52.695
ENSACLG00000005420	rab11ba	76	40.361	ENSACLG00000001646	-	78	40.361
ENSACLG00000005420	rab11ba	54	30.579	ENSACLG00000024991	arl4d	59	30.579
ENSACLG00000005420	rab11ba	74	34.756	ENSACLG00000007804	si:ch73-116o1.2	82	36.364
ENSACLG00000005420	rab11ba	78	37.647	ENSACLG00000011249	rras	84	37.647
ENSACLG00000005420	rab11ba	77	52.381	ENSACLG00000013734	-	79	52.381
ENSACLG00000005420	rab11ba	95	32.710	ENSACLG00000003898	rab32b	94	32.710
ENSACLG00000005420	rab11ba	96	40.952	ENSACLG00000023526	rab30	97	40.952

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSG00000185236	RAB11B	100	95.652	Homo_sapiens
ENSACLG00000005420	rab11ba	99	92.237	ENSAMEG00000004955	RAB11B	99	92.237	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000005420	rab11ba	86	91.979	ENSACIG00000024374	rab11ba	77	91.979	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	97.706	ENSAOCG00000018050	rab11ba	100	97.706	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	97.248	ENSAPEG00000009177	rab11ba	100	97.248	Amphiprion_percula
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	97.706	ENSATEG00000023730	rab11ba	100	97.706	Anabas_testudineus
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSANAG00000037616	RAB11B	100	93.119	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000005420	rab11ba	99	77.880	WBGene00004274	rab-11.1	99	77.880	Caenorhabditis_elegans
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	93.119	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSCAFG00000032060	RAB11B	100	93.119	Canis_familiaris
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSCAFG00020022184	RAB11B	100	93.119	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSTSYG00000014758	RAB11B	100	93.119	Carlito_syrichta
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	92.661	ENSCPOG00000030154	RAB11B	100	92.661	Cavia_porcellus
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSCCAG00000031042	RAB11B	100	93.119	Cebus_capucinus
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSCLAG00000003207	RAB11B	100	93.119	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSCSAG00000008024	RAB11B	100	93.119	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	79.358	ENSCHOG00000013525	RAB11B	100	79.358	Choloepus_hoffmanni
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	81.651	ENSCING00000009526	-	100	81.651	Ciona_intestinalis
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSCANG00000040517	RAB11B	100	93.119	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSCGRG00001013827	Rab11b	100	93.119	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSCGRG00000010967	Rab11b	100	93.119	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	95.413	ENSCSEG00000007121	rab11ba	84	95.413	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	92.202	ENSDARG00000041878	rab11ba	100	92.202	Danio_rerio
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	91.284	ENSDNOG00000004134	-	100	91.284	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSDNOG00000014618	RAB11B	97	93.119	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSDORG00000006304	Rab11b	100	93.119	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	89.908	ENSEBUG00000011775	rab11ba	99	89.268	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	78.899	ENSEBUG00000015447	-	100	78.899	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000005420	rab11ba	66	97.902	ENSEEUG00000009165	-	100	97.902	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000005420	rab11ba	89	91.237	ENSELUG00000019240	-	99	91.237	Esox_lucius
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	92.661	ENSFCAG00000015216	RAB11B	100	92.661	Felis_catus
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	92.661	ENSFDAG00000019872	RAB11B	100	92.661	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	96.330	ENSFHEG00000022642	rab11ba	100	96.330	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	94.037	ENSGMOG00000007390	rab11ba	99	94.037	Gadus_morhua
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	96.789	ENSGAFG00000005679	rab11ba	100	96.789	Gambusia_affinis
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	94.037	ENSGAGG00000012557	-	100	94.037	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSHGLG00000014984	RAB11B	100	93.119	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSHGLG00100003638	RAB11B	100	93.119	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSSTOG00000031571	RAB11B	100	93.119	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSJJAG00000018891	Rab11b	100	93.119	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	97.248	ENSKMAG00000006082	-	100	97.248	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	94.495	ENSLBEG00000006087	rab11ba	100	94.495	Labrus_bergylta
ENSACLG00000005420	rab11ba	78	97.059	ENSLACG00000016974	RAB11B	99	97.059	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSLAFG00000013598	RAB11B	100	93.119	Loxodonta_africana
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSMNEG00000039759	-	100	93.119	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	96.789	ENSMAMG00000018556	rab11ba	100	96.789	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	100.000	ENSMZEG00005010947	rab11ba	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSACLG00000005420	rab11ba	93	90.640	ENSMZEG00005019251	-	92	90.640	Maylandia_zebra
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.578	ENSMAUG00000021579	Rab11b	100	93.578	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	92.661	ENSMOCG00000012667	Rab11b	100	92.661	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	92.661	ENSMALG00000021949	rab11ba	100	92.661	Monopterus_albus
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	MGP_CAROLIEiJ_G0021415	Rab11b	97	97.241	Mus_caroli
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	94.037	ENSMUSG00000077450	Rab11b	97	97.241	Mus_musculus
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	MGP_PahariEiJ_G0020420	Rab11b	100	93.119	Mus_pahari
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	MGP_SPRETEiJ_G0022327	Rab11b	97	97.241	Mus_spretus
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	92.661	ENSMPUG00000007263	RAB11B	100	92.661	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	88.688	ENSMLUG00000002308	-	100	88.688	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSNGAG00000015757	Rab11b	100	93.119	Nannospalax_galili
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	99.541	ENSNBRG00000023898	rab11ba	84	99.541	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSNLEG00000001733	RAB11B	100	93.119	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSODEG00000011371	RAB11B	100	93.119	Octodon_degus
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	99.083	ENSONIG00000002535	rab11ba	100	99.083	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000005420	rab11ba	72	96.815	ENSOCUG00000028208	RAB11B	64	95.031	Oryctolagus_cuniculus
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ENSACLG00000005420	rab11ba	99	96.296	ENSORLG00015016946	rab11ba	81	96.296	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000005420	rab11ba	99	96.313	ENSOMEG00000002581	rab11ba	99	96.313	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	93.119	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSOARG00000003801	RAB11B	97	93.119	Ovis_aries
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ENSACLG00000005420	rab11ba	67	95.890	ENSPCOG00000008655	-	100	95.890	Propithecus_coquereli
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSPVAG00000009645	RAB11B	100	93.119	Pteropus_vampyrus
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ENSACLG00000005420	rab11ba	100	100.000	ENSPNYG00000019644	rab11ba	100	100.000	Pundamilia_nyererei
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ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSRNOG00000007648	Rab11b	100	93.119	Rattus_norvegicus
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ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSTTRG00000009758	RAB11B	100	93.119	Tursiops_truncatus
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ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	ENSVVUG00000025210	RAB11B	100	93.119	Vulpes_vulpes
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.578	ENSXETG00000021890	rab11b.2	99	93.578	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000005420	rab11ba	61	96.992	ENSXCOG00000009194	-	98	96.992	Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000005420	rab11ba	100	96.789	ENSXMAG00000013416	rab11ba	100	96.789	Xiphophorus_maculatus