EuRBPDB

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000005446 (Gene tree)
Gene ID: 113016583
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: ras-related protein Rab-11B
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4329 bases
Position: chr23:5834637-5838965
Accession: 113016583
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000008012	MMR_HSR1	PF01926.23	3.9e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000008196	-	1074	-	ENSACLP00000008012	218 (aa)	XP_026015272	UPI00022B0D84

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000005446	-	82	38.043	ENSACLG00000021547	rab33a	65	38.043
ENSACLG00000005446	-	62	30.282	ENSACLG00000016659	-	69	30.282
ENSACLG00000005446	-	95	33.645	ENSACLG00000003898	rab32b	94	33.645
ENSACLG00000005446	-	79	34.302	ENSACLG00000002819	rab23	80	34.031
ENSACLG00000005446	-	78	46.199	ENSACLG00000015289	rab18b	83	46.199
ENSACLG00000005446	-	78	40.462	ENSACLG00000027006	zgc:101559	73	40.462
ENSACLG00000005446	-	68	35.333	ENSACLG00000001181	hrasb	85	36.420
ENSACLG00000005446	-	83	41.530	ENSACLG00000007514	rab42a	84	41.530
ENSACLG00000005446	-	100	94.954	ENSACLG00000005420	rab11ba	100	94.954
ENSACLG00000005446	-	67	43.421	ENSACLG00000010965	-	63	43.421
ENSACLG00000005446	-	77	52.096	ENSACLG00000006329	-	78	52.096
ENSACLG00000005446	-	70	34.839	ENSACLG00000027515	KRAS	87	35.928
ENSACLG00000005446	-	100	62.385	ENSACLG00000010251	rab25b	100	62.385
ENSACLG00000005446	-	79	40.449	ENSACLG00000004795	rab9b	79	40.449
ENSACLG00000005446	-	94	41.176	ENSACLG00000002706	rab5c	89	41.176
ENSACLG00000005446	-	77	45.562	ENSACLG00000000860	-	75	45.562
ENSACLG00000005446	-	75	43.636	ENSACLG00000007696	rab12	84	38.679
ENSACLG00000005446	-	74	33.537	ENSACLG00000007804	si:ch73-116o1.2	82	35.227
ENSACLG00000005446	-	72	39.877	ENSACLG00000018847	RAB7A	78	39.877
ENSACLG00000005446	-	74	43.478	ENSACLG00000021470	rab22a	83	43.478
ENSACLG00000005446	-	99	82.488	ENSACLG00000010268	rab11al	99	82.488
ENSACLG00000005446	-	93	88.177	ENSACLG00000018852	-	92	88.177
ENSACLG00000005446	-	76	37.647	ENSACLG00000006647	rab9a	84	37.647
ENSACLG00000005446	-	73	32.500	ENSACLG00000008646	rheb	86	32.500
ENSACLG00000005446	-	72	35.669	ENSACLG00000026487	rab6bb	76	36.184
ENSACLG00000005446	-	76	40.964	ENSACLG00000001646	-	78	40.964
ENSACLG00000005446	-	79	45.977	ENSACLG00000027590	-	82	45.977
ENSACLG00000005446	-	94	32.870	ENSACLG00000005093	rab34a	77	32.870
ENSACLG00000005446	-	79	45.977	ENSACLG00000022893	-	82	45.977
ENSACLG00000005446	-	65	30.612	ENSACLG00000013597	arl8ba	51	30.612
ENSACLG00000005446	-	76	43.976	ENSACLG00000026336	rab15	78	43.976
ENSACLG00000005446	-	76	53.012	ENSACLG00000003326	-	82	53.012
ENSACLG00000005446	-	77	44.970	ENSACLG00000009468	RAB39B	79	44.970
ENSACLG00000005446	-	99	65.297	ENSACLG00000018262	rab25a	100	65.297
ENSACLG00000005446	-	96	45.933	ENSACLG00000013668	rab1ba	99	45.933
ENSACLG00000005446	-	72	39.877	ENSACLG00000024502	-	78	39.877
ENSACLG00000005446	-	72	36.943	ENSACLG00000019423	rab41	74	36.943
ENSACLG00000005446	-	80	45.402	ENSACLG00000018721	si:dkey-16l2.16	98	41.627
ENSACLG00000005446	-	96	40.476	ENSACLG00000023526	rab30	97	40.476
ENSACLG00000005446	-	74	45.679	ENSACLG00000011484	rab18a	79	45.679
ENSACLG00000005446	-	89	32.500	ENSACLG00000025138	rab6ba	92	32.500
ENSACLG00000005446	-	77	52.381	ENSACLG00000007644	rab1ab	83	52.381
ENSACLG00000005446	-	76	33.333	ENSACLG00000021109	si:dkey-13a21.4	82	33.333
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSACLG00000007076	rab11bb	100	97.706
ENSACLG00000005446	-	77	52.695	ENSACLG00000013505	-	78	52.695
ENSACLG00000005446	-	54	30.579	ENSACLG00000024991	arl4d	59	30.579
ENSACLG00000005446	-	75	47.239	ENSACLG00000008615	-	73	47.239
ENSACLG00000005446	-	77	51.190	ENSACLG00000013734	-	79	51.190
ENSACLG00000005446	-	77	40.462	ENSACLG00000024456	-	82	40.462
ENSACLG00000005446	-	72	48.408	ENSACLG00000018066	rab5aa	73	48.408
ENSACLG00000005446	-	77	36.905	ENSACLG00000025632	rabl2	73	36.905
ENSACLG00000005446	-	71	35.000	ENSACLG00000008602	RAB29	96	35.000
ENSACLG00000005446	-	100	86.239	ENSACLG00000001775	rab11a	100	86.239
ENSACLG00000005446	-	74	31.214	ENSACLG00000019293	rasl11a	67	31.214
ENSACLG00000005446	-	74	33.908	ENSACLG00000005733	rab34b	66	33.908
ENSACLG00000005446	-	77	43.195	ENSACLG00000001218	RAB17	74	43.195
ENSACLG00000005446	-	74	34.132	ENSACLG00000009103	si:cabz01085950.1	82	34.132
ENSACLG00000005446	-	79	47.977	ENSACLG00000019643	-	87	47.977
ENSACLG00000005446	-	70	34.839	ENSACLG00000027677	KRAS	87	35.928
ENSACLG00000005446	-	78	37.059	ENSACLG00000011249	rras	84	37.059
ENSACLG00000005446	-	83	36.923	ENSACLG00000005720	rab33ba	75	38.043

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSAPOG00000023455	rab11bb	100	97.706	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000005446	-	100	100.000	ENSACIG00000024376	-	100	100.000	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000005446	-	100	85.780	ENSACIG00000019631	rab11bb	100	85.780	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000005446	-	100	100.000	ENSAOCG00000018849	-	100	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSAOCG00000018239	rab11bb	100	97.706	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSAPEG00000016590	rab11bb	100	97.706	Amphiprion_percula
ENSACLG00000005446	-	100	99.541	ENSATEG00000023725	-	100	99.541	Anabas_testudineus
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSATEG00000017696	rab11bb	100	97.706	Anabas_testudineus
ENSACLG00000005446	-	94	98.544	ENSAPLG00000011046	-	94	98.544	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000005446	-	100	99.083	ENSAMXG00000042655	rab11bb	100	99.083	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000005446	-	100	96.789	ENSAMXG00000037623	-	100	96.789	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000005446	-	100	96.789	ENSBTAG00000002475	RAB11B	100	96.789	Bos_taurus
ENSACLG00000005446	-	96	95.215	ENSCHIG00000022426	-	93	95.215	Capra_hircus
ENSACLG00000005446	-	100	96.789	ENSCATG00000029188	-	100	96.789	Cercocebus_atys
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSCPBG00000017056	-	100	97.706	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000005446	-	100	99.541	ENSCSEG00000007239	-	100	99.541	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSCSEG00000012149	rab11bb	100	97.706	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSCVAG00000017021	-	100	97.706	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000005446	-	100	95.872	ENSCVAG00000019751	-	100	95.872	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000005446	-	100	99.083	ENSCVAG00000019718	-	100	99.083	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSDARG00000090086	rab11bb	100	97.706	Danio_rerio
ENSACLG00000005446	-	99	94.470	ENSETEG00000000905	-	99	94.470	Echinops_telfairi
ENSACLG00000005446	-	99	94.419	ENSEASG00005003708	-	99	94.419	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000005446	-	99	94.419	ENSECAG00000000716	RAB11B	99	94.419	Equus_caballus
ENSACLG00000005446	-	100	98.624	ENSELUG00000020948	-	98	100.000	Esox_lucius
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSELUG00000000916	-	100	97.706	Esox_lucius
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSELUG00000021148	rab11bb	100	97.706	Esox_lucius
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSFALG00000011828	-	100	97.706	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000005446	-	100	99.541	ENSFHEG00000022676	-	100	99.541	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSFHEG00000018353	rab11bb	100	97.706	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000005446	-	99	95.370	ENSGMOG00000009668	-	99	95.370	Gadus_morhua
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSGMOG00000009211	rab11bb	100	97.706	Gadus_morhua
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSGALG00000000613	RAB11B	100	97.706	Gallus_gallus
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSGAFG00000007102	rab11bb	100	97.706	Gambusia_affinis
ENSACLG00000005446	-	100	95.413	ENSGACG00000013297	-	99	95.413	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000005446	-	100	97.248	ENSGACG00000015479	rab11bb	100	97.248	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000005446	-	100	96.789	ENSGGOG00000014516	RAB11B	100	96.789	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSHBUG00000014777	rab11bb	100	97.706	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000005446	-	100	100.000	ENSHBUG00000009947	-	100	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000005446	-	100	98.165	ENSHCOG00000002423	rab11bb	100	98.165	Hippocampus_comes
ENSACLG00000005446	-	100	93.578	ENSHCOG00000000985	-	100	93.578	Hippocampus_comes
ENSACLG00000005446	-	100	96.789	ENSHCOG00000000954	-	100	96.789	Hippocampus_comes
ENSACLG00000005446	-	100	98.624	ENSIPUG00000019927	rab11bb	100	98.624	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000005446	-	100	96.789	ENSIPUG00000025100	rab11b	100	96.789	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSKMAG00000009033	rab11bb	100	97.706	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000005446	-	100	100.000	ENSKMAG00000006170	-	100	100.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000005446	-	100	91.743	ENSLBEG00000005981	-	100	91.743	Labrus_bergylta
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSLBEG00000015248	rab11bb	100	97.706	Labrus_bergylta
ENSACLG00000005446	-	100	99.083	ENSLBEG00000004172	-	100	99.083	Labrus_bergylta
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSLACG00000016857	-	100	97.706	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000005446	-	100	96.789	ENSMFAG00000003654	RAB11B	100	96.789	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000005446	-	100	96.789	ENSMLEG00000030601	-	100	96.789	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000005446	-	100	98.624	ENSMAMG00000018533	-	100	98.624	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000005446	-	100	97.248	ENSMAMG00000006378	rab11bb	100	97.248	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000005446	-	100	100.000	ENSMZEG00005010975	-	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSMZEG00005003352	rab11bb	100	97.706	Maylandia_zebra
ENSACLG00000005446	-	100	96.789	ENSMICG00000034065	-	100	96.789	Microcebus_murinus
ENSACLG00000005446	-	94	97.561	ENSMMOG00000007917	rab11bb	100	97.561	Mola_mola
ENSACLG00000005446	-	99	95.853	ENSMMOG00000001238	-	99	95.853	Mola_mola
ENSACLG00000005446	-	100	100.000	ENSMMOG00000001250	-	100	100.000	Mola_mola
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSMODG00000003841	-	100	97.706	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.706	Monopterus_albus
ENSACLG00000005446	-	94	88.889	ENSMLUG00000006677	-	100	88.889	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSNBRG00000000372	rab11bb	100	97.706	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000005446	-	100	100.000	ENSNBRG00000023885	-	100	100.000	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSMEUG00000003686	-	100	97.706	Notamacropus_eugenii
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ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSONIG00000010435	rab11bb	100	97.706	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000005446	-	52	94.737	ENSOANG00000031567	-	82	94.737	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACLG00000005446	-	100	97.248	ENSORLG00000013938	rab11bb	100	97.248	Oryzias_latipes
ENSACLG00000005446	-	99	98.157	ENSORLG00000015284	-	72	98.157	Oryzias_latipes
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ENSACLG00000005446	-	99	98.157	ENSORLG00015016999	RAB11B	99	98.157	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000005446	-	100	97.248	ENSORLG00015020173	rab11bb	100	97.248	Oryzias_latipes_hsok
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ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSPKIG00000011640	rab11bb	100	97.706	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000005446	-	98	97.196	ENSPKIG00000001389	-	69	97.196	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000005446	-	98	93.607	ENSPSIG00000010242	-	85	93.607	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000005446	-	99	94.470	ENSPMGG00000014336	-	99	94.470	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000005446	-	100	98.165	ENSPMGG00000014333	-	100	98.165	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSPMGG00000009435	rab11bb	100	97.706	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000005446	-	97	97.170	ENSPCIG00000020371	-	99	97.170	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSPFOG00000024114	-	100	97.706	Poecilia_formosa
ENSACLG00000005446	-	100	100.000	ENSPFOG00000006224	-	100	100.000	Poecilia_formosa
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ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSPLAG00000001598	rab11bb	100	97.706	Poecilia_latipinna
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ENSACLG00000005446	-	100	100.000	ENSPMEG00000007842	-	100	100.000	Poecilia_mexicana
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ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSPREG00000014269	rab11bb	100	97.706	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000005446	-	100	100.000	ENSPNYG00000019611	-	100	100.000	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSPNYG00000004098	rab11bb	100	97.706	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000005446	-	100	96.789	ENSRROG00000037812	-	100	96.789	Rhinopithecus_roxellana
ENSACLG00000005446	-	97	96.698	ENSSHAG00000006816	-	97	96.698	Sarcophilus_harrisii
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ENSACLG00000005446	-	100	97.248	ENSSMAG00000004922	rab11bb	100	97.248	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000005446	-	100	96.330	ENSSMAG00000018613	-	100	96.330	Scophthalmus_maximus
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ENSACLG00000005446	-	100	100.000	ENSSDUG00000002934	-	100	100.000	Seriola_dumerili
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ENSACLG00000005446	-	100	100.000	ENSSLDG00000005275	-	100	100.000	Seriola_lalandi_dorsalis
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ENSACLG00000005446	-	100	100.000	ENSSPAG00000014559	-	100	100.000	Stegastes_partitus
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSTGUG00000000084	-	100	97.706	Taeniopygia_guttata
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ENSACLG00000005446	-	99	99.537	ENSTRUG00000021619	-	100	99.537	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000005446	-	100	96.789	ENSTNIG00000011081	rab11bb	100	96.789	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000005446	-	99	99.537	ENSTNIG00000013182	-	100	99.537	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000005446	-	99	95.392	ENSTNIG00000013184	-	99	95.392	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000005446	-	93	97.044	ENSTNIG00000002003	-	100	97.044	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000005446	-	94	97.561	ENSUAMG00000006639	-	99	97.561	Ursus_americanus
ENSACLG00000005446	-	100	96.804	ENSXETG00000025484	rab11b.1	99	96.804	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSXCOG00000008042	-	100	97.706	Xiphophorus_couchianus
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ENSACLG00000005446	-	100	97.706	ENSXMAG00000011926	rab11bb	100	97.706	Xiphophorus_maculatus
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