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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSACLG00000005561 (Gene tree)
Gene ID: 113008954
Gene Symbol: tnpo3
Alias: zgc:55409
Full Name: transportin 3
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10128 bases
Position: chr17:15524121-15534248
Accession: 113008954
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000008221	Xpo1	PF08389.12	4.2e-25	1	1
ENSACLP00000008221	IBN_N	PF03810.19	7.7e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000008409	-	3061	-	ENSACLP00000008221	923 (aa)	XP_026002717	UPI000329C51A

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	ENSG00000064419	TNPO3	100	85.998	Homo_sapiens
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	97.075	ENSAPOG00000018347	tnpo3	100	97.075	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000005561	tnpo3	99	82.773	ENSAMEG00000005135	TNPO3	98	82.773	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000005561	tnpo3	96	95.372	ENSACIG00000005897	tnpo3	99	95.372	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	97.183	ENSAOCG00000008264	tnpo3	100	97.183	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000005561	tnpo3	96	97.169	ENSAPEG00000024300	tnpo3	100	97.169	Amphiprion_percula
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	95.991	ENSATEG00000003197	tnpo3	100	95.991	Anabas_testudineus
ENSACLG00000005561	tnpo3	72	83.115	ENSAPLG00000005946	TNPO3	91	83.115	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000005561	tnpo3	82	85.658	ENSACAG00000013470	TNPO3	94	86.074	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	ENSANAG00000037940	TNPO3	100	86.111	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	92.741	ENSAMXG00000016236	tnpo3	100	92.741	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	86.132	ENSBTAG00000004992	TNPO3	100	86.231	Bos_taurus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	86.024	ENSCJAG00000018085	TNPO3	100	86.111	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	ENSCAFG00000001543	TNPO3	100	85.915	Canis_familiaris
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	ENSCAFG00020022462	TNPO3	99	85.514	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	86.024	ENSCHIG00000011721	TNPO3	100	86.024	Capra_hircus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	86.024	ENSTSYG00000002989	TNPO3	100	86.111	Carlito_syrichta
ENSACLG00000005561	tnpo3	72	84.946	ENSCAPG00000005843	TNPO3	91	84.946	Cavia_aperea
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.590	ENSCPOG00000039784	TNPO3	100	85.590	Cavia_porcellus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	86.024	ENSCCAG00000033826	TNPO3	100	86.114	Cebus_capucinus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	ENSCATG00000030018	TNPO3	100	85.998	Cercocebus_atys
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	84.790	ENSCLAG00000016298	TNPO3	100	84.790	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	ENSCSAG00000009966	TNPO3	100	85.915	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000005561	tnpo3	99	61.199	ENSCHOG00000011547	TNPO3	99	61.199	Choloepus_hoffmanni
ENSACLG00000005561	tnpo3	93	85.648	ENSCPBG00000017497	TNPO3	100	85.648	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000005561	tnpo3	99	49.237	ENSCING00000005042	-	99	49.237	Ciona_intestinalis
ENSACLG00000005561	tnpo3	99	47.874	ENSCSAVG00000008623	-	94	54.909	Ciona_savignyi
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	ENSCANG00000033070	TNPO3	100	85.998	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	ENSCGRG00001015925	Tnpo3	100	85.915	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	ENSCGRG00000010379	Tnpo3	100	85.915	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	93.824	ENSCSEG00000005952	tnpo3	100	93.824	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	94.475	ENSCVAG00000020285	tnpo3	100	94.475	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	91.983	ENSDARG00000045680	tnpo3	100	91.983	Danio_rerio
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.807	ENSDNOG00000002556	TNPO3	100	85.807	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000005561	tnpo3	62	84.629	ENSDORG00000002433	Tnpo3	95	84.629	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000005561	tnpo3	99	43.488	FBgn0031456	Tnpo-SR	99	43.488	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000005561	tnpo3	94	85.495	ENSETEG00000002101	TNPO3	90	85.495	Echinops_telfairi
ENSACLG00000005561	tnpo3	99	70.217	ENSEBUG00000016931	tnpo3	99	70.217	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.807	ENSEASG00005008677	TNPO3	100	85.807	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.807	ENSECAG00000012815	TNPO3	100	85.881	Equus_caballus
ENSACLG00000005561	tnpo3	99	80.638	ENSEEUG00000005178	TNPO3	98	80.638	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000005561	tnpo3	99	94.124	ENSELUG00000012153	tnpo3	99	94.124	Esox_lucius
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	ENSFCAG00000018186	TNPO3	100	85.998	Felis_catus
ENSACLG00000005561	tnpo3	96	81.717	ENSFALG00000010667	TNPO3	100	81.717	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.514	ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	85.514	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000005561	tnpo3	99	94.239	ENSFHEG00000012859	tnpo3	99	94.239	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	93.824	ENSGMOG00000007324	tnpo3	100	93.824	Gadus_morhua
ENSACLG00000005561	tnpo3	61	85.159	ENSGALG00000039420	TNPO3	99	85.159	Gallus_gallus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	95.233	ENSGACG00000000699	tnpo3	100	95.233	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000005561	tnpo3	93	85.531	ENSGAGG00000006777	TNPO3	100	85.531	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	ENSGGOG00000008339	TNPO3	100	85.998	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	100.000	ENSHBUG00000008351	tnpo3	100	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.807	ENSHGLG00000004463	TNPO3	100	85.807	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.807	ENSHGLG00100005509	TNPO3	100	85.807	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	92.741	ENSHCOG00000007221	tnpo3	100	92.741	Hippocampus_comes
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	90.791	ENSIPUG00000014979	TNPO3	99	90.791	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.807	ENSSTOG00000004885	TNPO3	100	85.881	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	79.677	ENSJJAG00000013530	Tnpo3	100	79.677	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	95.233	ENSKMAG00000010497	tnpo3	100	95.233	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000005561	tnpo3	96	93.318	ENSLBEG00000016595	tnpo3	100	93.318	Labrus_bergylta
ENSACLG00000005561	tnpo3	96	91.053	ENSLBEG00000011988	-	99	91.053	Labrus_bergylta
ENSACLG00000005561	tnpo3	83	87.713	ENSLACG00000002351	TNPO3	99	87.713	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	91.874	ENSLOCG00000015556	tnpo3	100	91.874	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.221	ENSLAFG00000002738	TNPO3	100	85.221	Loxodonta_africana
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	ENSMFAG00000032385	TNPO3	100	85.998	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	ENSMMUG00000004311	TNPO3	100	85.998	Macaca_mulatta
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	ENSMNEG00000045277	TNPO3	100	85.998	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	ENSMLEG00000037881	TNPO3	100	85.998	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	96.533	ENSMAMG00000021096	tnpo3	100	96.533	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	100.000	ENSMZEG00005015084	tnpo3	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSACLG00000005561	tnpo3	78	81.379	ENSMGAG00000002839	TNPO3	99	81.379	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.807	ENSMAUG00000013463	Tnpo3	100	85.807	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000005561	tnpo3	89	33.077	ENSMICG00000011003	IPO13	81	33.728	Microcebus_murinus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	ENSMICG00000000140	TNPO3	100	85.915	Microcebus_murinus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	ENSMOCG00000013264	Tnpo3	100	85.915	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	94.908	ENSMMOG00000005887	tnpo3	100	94.908	Mola_mola
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	86.349	ENSMODG00000014700	TNPO3	100	86.349	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	95.775	ENSMALG00000006675	tnpo3	100	95.775	Monopterus_albus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.699	MGP_CAROLIEiJ_G0028176	Tnpo3	100	85.699	Mus_caroli
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.699	ENSMUSG00000012535	Tnpo3	100	85.699	Mus_musculus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.807	MGP_PahariEiJ_G0021934	Tnpo3	100	85.807	Mus_pahari
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.590	MGP_SPRETEiJ_G0029176	Tnpo3	100	85.590	Mus_spretus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	ENSMPUG00000006021	TNPO3	100	85.915	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	77.465	ENSMLUG00000000947	TNPO3	100	77.465	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.807	ENSNGAG00000008722	Tnpo3	100	85.807	Nannospalax_galili
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	98.375	ENSNBRG00000019001	tnpo3	100	100.000	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	82.759	ENSNLEG00000012491	TNPO3	100	85.833	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000005561	tnpo3	92	71.994	ENSMEUG00000002445	TNPO3	91	71.994	Notamacropus_eugenii
ENSACLG00000005561	tnpo3	91	84.783	ENSOPRG00000006163	TNPO3	90	84.783	Ochotona_princeps
ENSACLG00000005561	tnpo3	98	85.588	ENSODEG00000012826	TNPO3	100	85.588	Octodon_degus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	99.350	ENSONIG00000007604	tnpo3	100	99.350	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000005561	tnpo3	95	82.628	ENSOANG00000011451	TNPO3	100	82.628	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACLG00000005561	tnpo3	99	82.773	ENSOCUG00000010105	TNPO3	99	82.773	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	94.583	ENSORLG00000029369	tnpo3	100	94.583	Oryzias_latipes
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	94.583	ENSORLG00020003464	tnpo3	100	94.583	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	94.691	ENSORLG00015002610	tnpo3	100	94.691	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	94.583	ENSOMEG00000021006	tnpo3	100	94.583	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	86.132	ENSOGAG00000015340	TNPO3	100	86.132	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	86.024	ENSOARG00000004026	TNPO3	100	86.024	Ovis_aries
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	ENSPPAG00000034975	TNPO3	100	85.998	Pan_paniscus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	85.915	Panthera_pardus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	ENSPTIG00000016167	TNPO3	100	85.915	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	ENSPTRG00000019676	TNPO3	100	85.998	Pan_troglodytes
ENSACLG00000005561	tnpo3	98	85.746	ENSPANG00000022226	TNPO3	100	85.833	Papio_anubis
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.097	ENSPKIG00000008628	-	100	85.097	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	88.624	ENSPKIG00000023234	tnpo3	100	88.624	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000005561	tnpo3	62	88.380	ENSPMGG00000009763	tnpo3	99	88.380	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.807	ENSPEMG00000000422	Tnpo3	100	85.807	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000005561	tnpo3	95	72.367	ENSPMAG00000008621	tnpo3	100	72.367	Petromyzon_marinus
ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	ENSPCIG00000011366	TNPO3	100	85.915	Phascolarctos_cinereus
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