EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000005615 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1209 bases
Position: chrLS419794.1:469043-470251
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000008249	zf-C2H2	PF00096.26	7.1e-33	1	6
ENSACLP00000008249	zf-C2H2	PF00096.26	7.1e-33	2	6
ENSACLP00000008249	zf-C2H2	PF00096.26	7.1e-33	3	6
ENSACLP00000008249	zf-C2H2	PF00096.26	7.1e-33	4	6
ENSACLP00000008249	zf-C2H2	PF00096.26	7.1e-33	5	6
ENSACLP00000008249	zf-C2H2	PF00096.26	7.1e-33	6	6
ENSACLP00000008249	zf-met	PF12874.7	1.9e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000008439	-	1209	-	ENSACLP00000008249	402 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
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ENSACLG00000005615	-	53	44.444	ENSACLG00000016405	zbtb17	63	43.671
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ENSACLG00000005615	-	52	45.349	ENSACLG00000015816	-	92	45.349
ENSACLG00000005615	-	53	36.416	ENSACLG00000022191	znf407	60	36.416
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ENSACLG00000005615	-	78	47.887	ENSACLG00000006718	-	88	47.887
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ENSACLG00000005615	-	76	55.208	ENSACLG00000024957	-	99	56.061
ENSACLG00000005615	-	81	54.037	ENSACLG00000024459	-	95	54.037
ENSACLG00000005615	-	50	36.232	ENSACLG00000017621	-	51	36.232
ENSACLG00000005615	-	67	59.336	ENSACLG00000005617	-	63	54.983
ENSACLG00000005615	-	54	49.600	ENSACLG00000011658	-	87	49.600
ENSACLG00000005615	-	83	44.355	ENSACLG00000010811	-	78	44.355

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000005615	-	82	54.248	ENSACIG00000017647	-	99	57.098	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000005615	-	86	54.822	ENSAOCG00000003277	-	86	54.822	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000005615	-	58	43.005	ENSAPEG00000016601	-	82	43.005	Amphiprion_percula
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