EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000005708 (Gene tree)
Gene ID: 113024527
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: zinc finger protein 2-like
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10270 bases
Position: chr6:31344313-31354582
Accession: 113024527
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000008389	zf-C2H2	PF00096.26	9.2e-66	1	12
ENSACLP00000008389	zf-C2H2	PF00096.26	9.2e-66	2	12
ENSACLP00000008389	zf-C2H2	PF00096.26	9.2e-66	3	12
ENSACLP00000008389	zf-C2H2	PF00096.26	9.2e-66	4	12
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ENSACLP00000008389	zf-C2H2	PF00096.26	9.2e-66	6	12
ENSACLP00000008389	zf-C2H2	PF00096.26	9.2e-66	7	12
ENSACLP00000008389	zf-C2H2	PF00096.26	9.2e-66	8	12
ENSACLP00000008389	zf-C2H2	PF00096.26	9.2e-66	9	12
ENSACLP00000008389	zf-C2H2	PF00096.26	9.2e-66	10	12
ENSACLP00000008389	zf-C2H2	PF00096.26	9.2e-66	11	12
ENSACLP00000008389	zf-C2H2	PF00096.26	9.2e-66	12	12
ENSACLP00000008389	zf-met	PF12874.7	4.5e-21	1	3
ENSACLP00000008389	zf-met	PF12874.7	4.5e-21	2	3
ENSACLP00000008389	zf-met	PF12874.7	4.5e-21	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000008582	-	5799	-	ENSACLP00000008389	693 (aa)	XP_026027476	UPI000C24DC9D

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000005708	-	91	33.224	ENSACLG00000003229	-	92	51.534
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ENSACLG00000005708	-	60	44.099	ENSACLG00000019482	-	88	44.099
ENSACLG00000005708	-	64	44.720	ENSACLG00000005615	-	57	44.720
ENSACLG00000005708	-	67	44.785	ENSACLG00000020268	-	62	44.785
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ENSACLG00000005708	-	64	43.293	ENSACLG00000013454	-	70	43.293
ENSACLG00000005708	-	66	43.860	ENSACLG00000017329	-	82	43.860
ENSACLG00000005708	-	65	38.614	ENSACLG00000004663	-	88	38.614
ENSACLG00000005708	-	65	40.351	ENSACLG00000014176	-	96	40.491
ENSACLG00000005708	-	65	42.857	ENSACLG00000003546	-	58	42.857
ENSACLG00000005708	-	78	49.107	ENSACLG00000018746	-	100	47.170
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ENSACLG00000005708	-	94	40.777	ENSACLG00000001045	-	99	46.626
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Orthologs

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ENSACLG00000005708	-	72	95.088	ENSACIG00000013163	-	85	96.377	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000005708	-	99	86.043	ENSAOCG00000013124	-	100	86.043	Amphiprion_ocellaris
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ENSACLG00000005708	-	90	93.023	ENSATEG00000004127	-	99	94.981	Anabas_testudineus
ENSACLG00000005708	-	88	66.765	ENSCVAG00000014734	-	96	79.762	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000005708	-	70	40.606	FBgn0003567	su(Hw)	51	40.606	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000005708	-	64	83.333	ENSFHEG00000014060	-	72	83.333	Fundulus_heteroclitus
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ENSACLG00000005708	-	99	76.538	ENSGAFG00000011174	-	100	76.218	Gambusia_affinis
ENSACLG00000005708	-	92	95.021	ENSGACG00000019550	-	86	95.021	Gasterosteus_aculeatus
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ENSACLG00000005708	-	99	79.654	ENSKMAG00000009979	-	99	79.365	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000005708	-	99	81.322	ENSLBEG00000010165	-	98	92.704	Labrus_bergylta
ENSACLG00000005708	-	95	89.091	ENSMAMG00000006312	-	100	92.000	Mastacembelus_armatus
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ENSACLG00000005708	-	89	95.167	ENSMMOG00000011282	-	92	95.703	Mola_mola
ENSACLG00000005708	-	99	82.878	ENSMALG00000000494	-	100	82.521	Monopterus_albus
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ENSACLG00000005708	-	89	40.541	ENSPNYG00000007781	-	96	42.857	Pundamilia_nyererei
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ENSACLG00000005708	-	93	96.000	ENSSMAG00000021251	-	99	93.165	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000005708	-	99	83.960	ENSSDUG00000013904	-	99	83.960	Seriola_dumerili
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ENSACLG00000005708	-	99	85.447	ENSSPAG00000011524	-	100	85.014	Stegastes_partitus
ENSACLG00000005708	-	95	88.350	ENSTRUG00000015687	-	99	93.750	Takifugu_rubripes
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ENSACLG00000005708	-	89	85.866	ENSXCOG00000015947	-	98	93.130	Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000005708	-	91	87.329	ENSXMAG00000023291	-	96	93.701	Xiphophorus_maculatus