EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000006007 (Gene tree)
Gene ID: 113019280
Gene Symbol: rexo4
Alias: im:7156740|si:ch73-209e20.4
Full Name: REX4 homolog%2C 3'-5' exonuclease
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3347 bases
Position: chr3:31851085-31854431
Accession: 113019280
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000008816	RNase_T	PF00929.24	4.5e-21	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000009020	-	1284	-	ENSACLP00000008816	427 (aa)	XP_026018666	UPI000E4060D2

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000006007	rexo4	81	53.591	ENSG00000148300	REXO4	97	45.500	Homo_sapiens
ENSACLG00000006007	rexo4	86	73.514	ENSAPOG00000019264	rexo4	96	69.734	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000006007	rexo4	81	51.821	ENSAMEG00000011649	REXO4	91	49.612	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000006007	rexo4	91	73.077	ENSAOCG00000004087	rexo4	96	70.944	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000006007	rexo4	91	72.564	ENSAPEG00000009106	rexo4	96	70.460	Amphiprion_percula
ENSACLG00000006007	rexo4	92	69.925	ENSATEG00000017662	rexo4	98	67.981	Anabas_testudineus
ENSACLG00000006007	rexo4	79	55.491	ENSAPLG00000005865	REXO4	99	55.491	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000006007	rexo4	81	51.420	ENSANAG00000028404	REXO4	91	47.859	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000006007	rexo4	83	56.300	ENSAMXG00000013291	rexo4	86	55.897	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000006007	rexo4	81	49.861	ENSBTAG00000019721	REXO4	83	49.861	Bos_taurus
ENSACLG00000006007	rexo4	81	52.617	ENSCJAG00000009774	REXO4	91	50.374	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000006007	rexo4	81	50.000	ENSCAFG00000019767	REXO4	85	50.000	Canis_familiaris
ENSACLG00000006007	rexo4	81	50.556	ENSCAFG00020000983	-	82	50.556	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000006007	rexo4	84	49.072	ENSCHIG00000009517	REXO4	90	48.346	Capra_hircus
ENSACLG00000006007	rexo4	81	52.473	ENSTSYG00000027492	REXO4	90	50.248	Carlito_syrichta
ENSACLG00000006007	rexo4	72	53.846	ENSCAPG00000014583	REXO4	88	54.487	Cavia_aperea
ENSACLG00000006007	rexo4	81	50.270	ENSCPOG00000001386	REXO4	81	50.541	Cavia_porcellus
ENSACLG00000006007	rexo4	81	46.499	ENSCCAG00000027049	REXO4	90	43.532	Cebus_capucinus
ENSACLG00000006007	rexo4	81	53.867	ENSCATG00000028646	REXO4	89	51.759	Cercocebus_atys
ENSACLG00000006007	rexo4	72	52.648	ENSCLAG00000006919	REXO4	98	51.807	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000006007	rexo4	81	53.867	ENSCSAG00000015280	REXO4	89	51.880	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000006007	rexo4	93	50.351	ENSCPBG00000021152	REXO4	95	50.351	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000006007	rexo4	53	56.388	ENSCING00000010751	-	93	52.574	Ciona_intestinalis
ENSACLG00000006007	rexo4	81	53.867	ENSCANG00000029855	REXO4	89	51.880	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000006007	rexo4	83	50.270	ENSCGRG00001013126	Rexo4	82	50.270	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000006007	rexo4	83	50.270	ENSCGRG00000009819	Rexo4	85	50.270	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000006007	rexo4	92	58.794	ENSCSEG00000019343	rexo4	98	56.613	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000006007	rexo4	89	56.201	ENSCVAG00000014963	rexo4	89	56.201	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000006007	rexo4	99	51.693	ENSDARG00000088619	rexo4	86	73.950	Danio_rerio
ENSACLG00000006007	rexo4	81	46.585	ENSDNOG00000002429	REXO4	84	46.585	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000006007	rexo4	52	69.820	ENSDORG00000006190	Rexo4	62	69.820	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000006007	rexo4	55	49.398	ENSEASG00005009915	-	78	49.398	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000006007	rexo4	83	50.954	ENSECAG00000007896	REXO4	83	49.490	Equus_caballus
ENSACLG00000006007	rexo4	85	62.532	ENSELUG00000003539	rexo4	88	62.155	Esox_lucius
ENSACLG00000006007	rexo4	81	50.282	ENSFCAG00000011652	REXO4	86	47.917	Felis_catus
ENSACLG00000006007	rexo4	83	50.815	ENSFALG00000001520	REXO4	87	50.678	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000006007	rexo4	81	52.113	ENSFDAG00000016050	REXO4	91	49.620	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000006007	rexo4	94	62.010	ENSFHEG00000002413	rexo4	99	60.993	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000006007	rexo4	53	64.758	ENSGMOG00000012876	rexo4	67	64.758	Gadus_morhua
ENSACLG00000006007	rexo4	78	56.176	ENSGAFG00000015404	-	99	56.891	Gambusia_affinis
ENSACLG00000006007	rexo4	99	59.165	ENSGACG00000008065	rexo4	100	59.165	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000006007	rexo4	82	55.163	ENSGAGG00000010260	REXO4	85	55.707	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000006007	rexo4	81	53.867	ENSGGOG00000014508	REXO4	89	51.880	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000006007	rexo4	100	99.063	ENSHBUG00000000542	rexo4	100	99.063	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000006007	rexo4	82	51.404	ENSHGLG00000016901	REXO4	90	50.129	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000006007	rexo4	82	51.404	ENSHGLG00100017444	REXO4	90	50.129	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000006007	rexo4	57	66.116	ENSHCOG00000018196	rexo4	61	66.116	Hippocampus_comes
ENSACLG00000006007	rexo4	95	51.544	ENSIPUG00000021084	rexo4	93	52.019	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000006007	rexo4	88	48.990	ENSSTOG00000003754	REXO4	89	48.990	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000006007	rexo4	83	53.333	ENSJJAG00000013002	Rexo4	86	51.414	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000006007	rexo4	98	66.435	ENSKMAG00000015039	rexo4	100	67.453	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000006007	rexo4	99	66.975	ENSLBEG00000025570	rexo4	99	68.287	Labrus_bergylta
ENSACLG00000006007	rexo4	82	55.372	ENSLACG00000012399	REXO4	83	55.372	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000006007	rexo4	83	55.586	ENSLOCG00000003577	rexo4	81	57.337	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000006007	rexo4	81	50.136	ENSLAFG00000011274	REXO4	85	50.136	Loxodonta_africana
ENSACLG00000006007	rexo4	81	53.867	ENSMFAG00000042425	REXO4	89	51.493	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000006007	rexo4	81	54.144	ENSMMUG00000000935	REXO4	89	51.741	Macaca_mulatta
ENSACLG00000006007	rexo4	81	53.591	ENSMNEG00000031604	REXO4	89	51.244	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000006007	rexo4	81	54.144	ENSMLEG00000037716	REXO4	89	51.741	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000006007	rexo4	88	71.618	ENSMAMG00000011251	rexo4	98	66.042	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000006007	rexo4	98	95.215	ENSMZEG00005012336	rexo4	98	95.215	Maylandia_zebra
ENSACLG00000006007	rexo4	83	54.645	ENSMGAG00000006521	REXO4	99	54.645	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000006007	rexo4	83	51.220	ENSMAUG00000015137	Rexo4	82	51.220	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000006007	rexo4	81	50.696	ENSMICG00000008422	REXO4	82	50.696	Microcebus_murinus
ENSACLG00000006007	rexo4	81	50.700	ENSMOCG00000020607	Rexo4	88	47.870	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000006007	rexo4	86	53.846	ENSMODG00000012817	REXO4	86	53.846	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000006007	rexo4	93	65.842	ENSMALG00000019705	rexo4	94	65.842	Monopterus_albus
ENSACLG00000006007	rexo4	83	52.486	MGP_CAROLIEiJ_G0023332	-	85	52.486	Mus_caroli
ENSACLG00000006007	rexo4	83	52.762	ENSMUSG00000052406	Rexo4	85	52.762	Mus_musculus
ENSACLG00000006007	rexo4	83	50.815	MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	85	52.342	Mus_pahari
ENSACLG00000006007	rexo4	83	52.747	MGP_SPRETEiJ_G0024249	-	85	52.747	Mus_spretus
ENSACLG00000006007	rexo4	55	64.378	ENSMPUG00000012315	REXO4	64	64.378	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000006007	rexo4	81	53.448	ENSNGAG00000010700	Rexo4	83	53.448	Nannospalax_galili
ENSACLG00000006007	rexo4	98	94.511	ENSNBRG00000011712	rexo4	98	94.511	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000006007	rexo4	83	52.174	ENSNLEG00000013130	-	91	50.000	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000006007	rexo4	80	51.404	ENSNLEG00000007556	-	85	51.111	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000006007	rexo4	86	43.158	ENSMEUG00000006513	-	92	42.494	Notamacropus_eugenii
ENSACLG00000006007	rexo4	52	67.568	ENSODEG00000015721	REXO4	62	67.568	Octodon_degus
ENSACLG00000006007	rexo4	99	93.412	ENSONIG00000020052	rexo4	100	93.412	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000006007	rexo4	82	56.319	ENSOANG00000002453	REXO4	92	56.319	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACLG00000006007	rexo4	98	62.322	ENSORLG00000006904	rexo4	95	62.322	Oryzias_latipes
ENSACLG00000006007	rexo4	98	62.441	ENSORLG00020013768	rexo4	99	62.441	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000006007	rexo4	98	62.322	ENSORLG00015012070	rexo4	95	62.322	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000006007	rexo4	89	65.699	ENSOMEG00000018327	rexo4	87	65.699	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000006007	rexo4	87	50.000	ENSOGAG00000014040	REXO4	90	49.870	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000006007	rexo4	81	53.867	ENSPPAG00000027911	REXO4	89	51.880	Pan_paniscus
ENSACLG00000006007	rexo4	87	48.082	ENSPPRG00000002894	REXO4	91	48.082	Panthera_pardus
ENSACLG00000006007	rexo4	87	43.536	ENSPTIG00000012007	REXO4	89	43.536	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000006007	rexo4	81	53.867	ENSPTRG00000023363	REXO4	89	51.880	Pan_troglodytes
ENSACLG00000006007	rexo4	81	54.144	ENSPANG00000026040	REXO4	89	51.741	Papio_anubis
ENSACLG00000006007	rexo4	84	59.299	ENSPKIG00000024761	rexo4	84	59.140	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000006007	rexo4	87	52.736	ENSPSIG00000016908	REXO4	95	51.276	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000006007	rexo4	89	59.045	ENSPMGG00000005312	rexo4	95	56.813	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000006007	rexo4	83	52.778	ENSPEMG00000017982	Rexo4	85	52.778	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000006007	rexo4	89	52.099	ENSPCIG00000017379	REXO4	92	52.099	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000006007	rexo4	85	66.576	ENSPFOG00000017751	rexo4	89	64.767	Poecilia_formosa
ENSACLG00000006007	rexo4	85	66.216	ENSPLAG00000010487	rexo4	89	64.433	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000006007	rexo4	88	64.230	ENSPMEG00000020767	rexo4	94	62.594	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000006007	rexo4	94	61.836	ENSPREG00000021841	rexo4	100	60.739	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000006007	rexo4	81	53.315	ENSPPYG00000019735	REXO4	89	51.378	Pongo_abelii
ENSACLG00000006007	rexo4	85	46.594	ENSPCAG00000010581	REXO4	90	45.288	Procavia_capensis
ENSACLG00000006007	rexo4	81	51.831	ENSPCOG00000025466	REXO4	89	49.872	Propithecus_coquereli
ENSACLG00000006007	rexo4	85	45.383	ENSPVAG00000001429	REXO4	89	45.078	Pteropus_vampyrus
ENSACLG00000006007	rexo4	100	99.297	ENSPNYG00000013712	rexo4	100	99.297	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000006007	rexo4	91	53.535	ENSPNAG00000019227	rexo4	91	52.530	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000006007	rexo4	83	50.678	ENSRNOG00000027867	Rexo4	85	50.678	Rattus_norvegicus
ENSACLG00000006007	rexo4	81	54.144	ENSRBIG00000037515	REXO4	82	54.144	Rhinopithecus_bieti
ENSACLG00000006007	rexo4	81	53.867	ENSRROG00000028864	REXO4	82	53.867	Rhinopithecus_roxellana
ENSACLG00000006007	rexo4	81	42.045	ENSSBOG00000032587	REXO4	90	40.291	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACLG00000006007	rexo4	82	55.228	ENSSHAG00000005827	REXO4	89	55.228	Sarcophilus_harrisii
ENSACLG00000006007	rexo4	57	74.286	ENSSFOG00015017394	rexo4	67	73.790	Scleropages_formosus
ENSACLG00000006007	rexo4	88	72.149	ENSSMAG00000015441	rexo4	98	66.745	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000006007	rexo4	87	69.452	ENSSDUG00000023346	rexo4	97	67.352	Seriola_dumerili
ENSACLG00000006007	rexo4	87	72.386	ENSSLDG00000011085	rexo4	99	70.023	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000006007	rexo4	82	55.402	ENSSPUG00000015868	REXO4	92	52.513	Sphenodon_punctatus
ENSACLG00000006007	rexo4	91	74.103	ENSSPAG00000007221	rexo4	97	71.053	Stegastes_partitus
ENSACLG00000006007	rexo4	91	47.482	ENSSSCG00000023173	REXO4	93	47.482	Sus_scrofa
ENSACLG00000006007	rexo4	83	53.261	ENSTGUG00000005537	REXO4	92	52.910	Taeniopygia_guttata
ENSACLG00000006007	rexo4	87	64.550	ENSTRUG00000013225	rexo4	95	64.345	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000006007	rexo4	82	68.750	ENSTNIG00000005873	rexo4	96	67.714	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000006007	rexo4	81	52.381	ENSUAMG00000018676	REXO4	81	52.381	Ursus_americanus
ENSACLG00000006007	rexo4	52	63.063	ENSUMAG00000023164	REXO4	56	63.063	Ursus_maritimus
ENSACLG00000006007	rexo4	81	50.000	ENSVVUG00000027337	REXO4	82	50.000	Vulpes_vulpes
ENSACLG00000006007	rexo4	74	50.462	ENSXETG00000023096	rexo4	88	51.360	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000006007	rexo4	94	62.683	ENSXMAG00000013686	rexo4	100	60.981	Xiphophorus_maculatus