EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000006014 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1392 bases
Position: chr23:19784716-19786107
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000008830	RVT_1	PF00078.27	3.5e-43	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000009034	-	1392	-	ENSACLP00000008830	463 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000006014	-	100	52.916	ENSACLG00000024400	-	88	52.916
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ENSACLG00000006014	-	72	59.701	ENSPNAG00000002954	-	95	59.701	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000006014	-	100	58.747	ENSPNAG00000002193	-	81	58.747	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000006014	-	74	72.303	ENSSMAG00000017564	-	81	72.303	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000006014	-	80	73.171	ENSSMAG00000016680	-	79	73.171	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000006014	-	99	74.459	ENSSMAG00000014467	-	82	74.459	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000006014	-	83	74.607	ENSSMAG00000020841	-	92	74.607	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000006014	-	97	74.945	ENSSMAG00000020789	-	82	74.945	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000006014	-	79	50.820	ENSSDUG00000021566	-	99	50.820	Seriola_dumerili
ENSACLG00000006014	-	100	52.700	ENSSDUG00000012909	-	75	52.700	Seriola_dumerili
ENSACLG00000006014	-	97	44.371	ENSSPUG00000004689	-	84	44.371	Sphenodon_punctatus
ENSACLG00000006014	-	72	75.224	ENSSPAG00000005778	-	95	75.224	Stegastes_partitus
ENSACLG00000006014	-	67	47.249	ENSSPAG00000005749	-	99	47.249	Stegastes_partitus
ENSACLG00000006014	-	55	71.937	ENSTRUG00000024195	-	56	71.937	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000006014	-	78	71.866	ENSTRUG00000024564	-	80	71.866	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000006014	-	100	52.052	ENSXMAG00000028039	-	66	52.052	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000006014	-	68	47.785	ENSXMAG00000021176	-	95	47.785	Xiphophorus_maculatus