EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000006528 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11196 bases
Position: chrLS420002.1:16012-27207
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSACLP00000009553	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-76	15	15
ENSACLP00000009553	zf-met	PF12874.7	3.2e-08	1	2
ENSACLP00000009553	zf-met	PF12874.7	3.2e-08	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000009775	-	1458	-	ENSACLP00000009553	485 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000006528	-	84	44.444	ENSACLG00000011710	-	57	48.276
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ENSACLG00000006528	-	96	37.983	ENSTNIG00000003979	-	99	37.983	Tetraodon_nigroviridis
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ENSACLG00000006528	-	97	45.625	ENSVVUG00000002015	-	94	43.261	Vulpes_vulpes
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ENSACLG00000006528	-	97	42.457	ENSXETG00000030307	-	100	42.457	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000006528	-	97	38.519	ENSXETG00000010512	-	99	37.941	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000006528	-	98	39.229	ENSXMAG00000000617	-	72	39.111	Xiphophorus_maculatus