EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000006886 (Gene tree)
Gene ID: 113014433
Gene Symbol: skiv2l
Alias: fb70b07|wu:fb70b07
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 19363 bases
Position: chr22:10650353-10669715
Accession: 113014433
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000010150	rRNA_proc-arch	PF13234.6	6.9e-31	1	1
ENSACLP00000010200	rRNA_proc-arch	PF13234.6	3e-27	1	1
ENSACLP00000010200	DEAD	PF00270.29	3.2e-16	1	1
ENSACLP00000010150	DEAD	PF00270.29	3.4e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000010392	-	4575	-	ENSACLP00000010150	1242 (aa)	XP_026011753	UPI000E40CDB1
ENSACLT00000010446	-	3573	-	ENSACLP00000010200	1190 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACLG00000006886's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACLG00000006886's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000006886	skiv2l	77	35.514	ENSACLG00000001921	mtrex	89	35.835

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.687	ENSG00000204351	SKIV2L	99	61.569	Homo_sapiens
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	90.273	ENSAPOG00000008257	skiv2l	100	90.273	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.464	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	61.587	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	92.376	ENSACIG00000016719	skiv2l	100	92.214	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	90.997	ENSAOCG00000017352	skiv2l	100	90.997	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	90.756	ENSAPEG00000001055	skiv2l	100	90.756	Amphiprion_percula
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	90.756	ENSATEG00000007601	skiv2l	100	90.836	Anabas_testudineus
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	63.388	ENSACAG00000011746	SKIV2L	99	63.679	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	62.027	ENSANAG00000037992	SKIV2L	99	61.886	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	82.626	ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	82.626	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.365	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	99	61.410	Bos_taurus
ENSACLG00000006886	skiv2l	95	41.446	WBGene00008502	skih-2	99	41.135	Caenorhabditis_elegans
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.977	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.667	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.298	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	99	61.349	Canis_familiaris
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.298	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	99	61.349	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.687	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	99	61.727	Capra_hircus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.464	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	99	61.353	Carlito_syrichta
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.228	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	99	61.116	Cavia_porcellus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.866	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	99	61.727	Cebus_capucinus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.625	ENSCATG00000036901	SKIV2L	99	61.429	Cercocebus_atys
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.303	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.252	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.947	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	99	61.667	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000006886	skiv2l	89	60.375	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	97	62.353	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000006886	skiv2l	93	51.330	ENSCING00000005576	-	99	51.109	Ciona_intestinalis
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.866	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	61.018	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.890	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	99	61.679	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	86.715	ENSCSEG00000011326	skiv2l	99	86.715	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	89.888	ENSCVAG00000003072	skiv2l	100	89.798	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	83.920	ENSDARG00000062206	skiv2l	100	83.920	Danio_rerio
ENSACLG00000006886	skiv2l	92	65.637	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	99	58.556	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000006886	skiv2l	94	46.010	FBgn0039117	tst	97	46.050	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000006886	skiv2l	69	79.167	ENSETEG00000009522	SKIV2L	68	79.167	Echinops_telfairi
ENSACLG00000006886	skiv2l	90	55.383	ENSEBUG00000013680	-	98	54.471	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000006886	skiv2l	93	62.319	ENSEASG00005015534	SKIV2L	100	62.660	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000006886	skiv2l	93	61.662	ENSECAG00000021823	SKIV2L	95	61.873	Equus_caballus
ENSACLG00000006886	skiv2l	54	74.803	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	74.803	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	84.560	ENSELUG00000000181	skiv2l	100	84.400	Esox_lucius
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.446	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	99	61.587	Felis_catus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	60.370	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.428	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	89.406	ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	89.165	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	81.481	ENSGMOG00000005926	skiv2l	99	81.481	Gadus_morhua
ENSACLG00000006886	skiv2l	78	57.188	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	57.128	Gallus_gallus
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	89.968	ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	89.968	Gambusia_affinis
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	88.729	ENSGACG00000002927	skiv2l	99	88.729	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.866	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	99	61.727	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	99.597	ENSHBUG00000000726	skiv2l	100	99.597	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.365	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	99	61.331	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	59.839	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	99	59.826	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000006886	skiv2l	98	82.799	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	82.898	Hippocampus_comes
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	81.608	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	82.750	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.252	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.569	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000006886	skiv2l	56	64.041	ENSLACG00000002986	-	60	64.041	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.576	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.392	Loxodonta_africana
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.866	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	99	61.667	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.866	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	99	61.667	Macaca_mulatta
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.866	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.825	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.625	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	99	61.429	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	90.369	ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	90.369	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	99.758	ENSMZEG00005026415	skiv2l	100	99.758	Maylandia_zebra
ENSACLG00000006886	skiv2l	68	49.571	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	95	49.785	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.298	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	61.094	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.767	ENSMICG00000046331	SKIV2L	99	61.886	Microcebus_murinus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	60.514	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	60.524	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	85.738	ENSMMOG00000014547	skiv2l	99	85.738	Mola_mola
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.569	ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	62.203	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	85.124	ENSMALG00000010535	skiv2l	99	85.124	Monopterus_albus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	62.127	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	99	61.606	Mus_caroli
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.886	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	99	61.606	Mus_musculus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	62.047	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	99	61.844	Mus_pahari
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.724	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	99	61.447	Mus_spretus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.187	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	99	61.410	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.303	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	99	61.111	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	94.265	ENSNBRG00000018650	skiv2l	99	94.265	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.116	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.942	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000006886	skiv2l	79	63.717	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	63.717	Notamacropus_eugenii
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	60.897	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	61.028	Ochotona_princeps
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.303	ENSODEG00000017516	SKIV2L	99	61.190	Octodon_degus
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	98.473	ENSONIG00000013500	skiv2l	100	98.473	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.786	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	99	61.667	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	88.443	ENSORLG00000002021	skiv2l	100	88.523	Oryzias_latipes
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	88.283	ENSORLG00020009462	skiv2l	100	88.363	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	88.202	ENSORLG00015016750	skiv2l	100	88.283	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	88.826	ENSOMEG00000008531	skiv2l	100	88.826	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.897	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	99	61.587	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	58.222	ENSOARG00000002411	-	99	58.307	Ovis_aries
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.280	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	100	61.186	Pan_paniscus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.786	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	99	61.746	Panthera_pardus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.384	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	61.349	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.706	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	99	61.569	Pan_troglodytes
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	60.769	ENSPANG00000011501	SKIV2L	100	60.618	Papio_anubis
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	79.077	ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	79.077	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	86.925	ENSPMGG00000019707	skiv2l	99	86.925	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.483	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	99	61.447	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.599	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	99	61.916	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	89.647	ENSPFOG00000002424	skiv2l	100	89.647	Poecilia_formosa
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	89.486	ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	89.486	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	89.807	ENSPMEG00000006997	skiv2l	100	89.807	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	85.548	ENSPREG00000002277	skiv2l	99	85.406	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.464	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	61.331	Pongo_abelii
ENSACLG00000006886	skiv2l	78	62.745	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	62.745	Procavia_capensis
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.928	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	99	61.965	Propithecus_coquereli
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.947	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	99	61.746	Pteropus_vampyrus
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	92.378	ENSPNYG00000017853	skiv2l	99	97.059	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	84.309	ENSPNAG00000011823	skiv2l	100	84.029	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	62.288	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	99	61.844	Rattus_norvegicus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	60.592	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	60.545	Rhinopithecus_bieti
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.786	ENSRROG00000036429	SKIV2L	99	61.587	Rhinopithecus_roxellana
ENSACLG00000006886	skiv2l	93	38.523	YLR398C	-	77	42.263	Saccharomyces_cerevisiae
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	62.008	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.886	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.429	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.935	Sarcophilus_harrisii
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	81.579	ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.405	Scleropages_formosus
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	89.567	ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	89.636	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	90.361	ENSSDUG00000019977	skiv2l	100	90.361	Seriola_dumerili
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	84.036	ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	84.123	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	60.217	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	99	60.062	Sphenodon_punctatus
ENSACLG00000006886	skiv2l	95	90.932	ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	90.932	Stegastes_partitus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.429	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	60.779	Sus_scrofa
ENSACLG00000006886	skiv2l	68	92.045	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	70.583	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	85.016	ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	85.096	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000006886	skiv2l	93	63.558	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	63.558	Tupaia_belangeri
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	57.522	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.607	Tursiops_truncatus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.625	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.727	Ursus_americanus
ENSACLG00000006886	skiv2l	93	62.340	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	100	62.596	Ursus_maritimus
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.218	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	99	61.306	Vulpes_vulpes
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	58.432	ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.195	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000006886	skiv2l	99	88.164	ENSXCOG00000019517	skiv2l	97	88.164	Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000006886	skiv2l	100	89.478	ENSXMAG00000014079	skiv2l	100	89.317	Xiphophorus_maculatus