EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000007048 (Gene tree)
Gene ID: 113020985
Gene Symbol: xpo6
Alias: Ranbp20|fi24f12|wu:fi24f12
Full Name: exportin 6
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 22967 bases
Position: chr4:19922834-19945800
Accession: 113020985
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000010362	Xpo1	PF08389.12	2e-22	1	1
ENSACLP00000010338	Xpo1	PF08389.12	3.3e-22	1	1
ENSACLP00000010362	IBN_N	PF03810.19	1.5e-06	1	1
ENSACLP00000010338	IBN_N	PF03810.19	1.6e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000010587	-	7538	-	ENSACLP00000010338	1152 (aa)	XP_026021109	UPI000E3FB50D
ENSACLT00000010611	-	3363	-	ENSACLP00000010362	1120 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACLG00000007048's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACLG00000007048's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.362	ENSG00000169180	XPO6	100	94.118	Homo_sapiens
ENSACLG00000007048	xpo6	100	95.312	ENSAPOG00000012873	xpo6	100	95.312	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.273	ENSAMEG00000011014	XPO6	99	77.273	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000007048	xpo6	100	94.872	ENSACIG00000008055	xpo6	100	94.872	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000007048	xpo6	100	95.747	ENSAOCG00000001326	xpo6	100	95.747	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000007048	xpo6	100	95.660	ENSAPEG00000016304	xpo6	100	95.660	Amphiprion_percula
ENSACLG00000007048	xpo6	100	93.663	ENSATEG00000002273	xpo6	100	93.663	Anabas_testudineus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	78.699	ENSAPLG00000007480	XPO6	99	78.699	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000007048	xpo6	99	69.060	ENSACAG00000016883	XPO6	99	69.060	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.005	ENSANAG00000031761	XPO6	99	77.005	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000007048	xpo6	100	76.577	ENSAMXG00000032539	xpo6	100	76.577	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	76.827	ENSBTAG00000010309	XPO6	99	76.827	Bos_taurus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.273	ENSCJAG00000006014	XPO6	99	77.273	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.362	ENSCAFG00000017356	XPO6	99	77.362	Canis_familiaris
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.362	ENSCAFG00020011808	XPO6	100	76.806	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.094	ENSCHIG00000022341	XPO6	99	77.094	Capra_hircus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	74.064	ENSTSYG00000012249	XPO6	100	74.064	Carlito_syrichta
ENSACLG00000007048	xpo6	99	76.916	ENSCPOG00000012824	XPO6	99	76.916	Cavia_porcellus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.005	ENSCCAG00000036360	XPO6	99	77.005	Cebus_capucinus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.451	ENSCATG00000034030	XPO6	99	77.451	Cercocebus_atys
ENSACLG00000007048	xpo6	99	76.827	ENSCLAG00000012270	XPO6	99	76.827	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000007048	xpo6	91	76.449	ENSCHOG00000004369	XPO6	91	76.449	Choloepus_hoffmanni
ENSACLG00000007048	xpo6	89	76.777	ENSCPBG00000024660	XPO6	99	82.353	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000007048	xpo6	100	44.511	ENSCING00000006884	-	100	44.416	Ciona_intestinalis
ENSACLG00000007048	xpo6	99	44.387	ENSCSAVG00000000850	-	99	44.387	Ciona_savignyi
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.273	ENSCANG00000041578	XPO6	99	77.273	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.094	ENSCGRG00001013173	Xpo6	99	77.094	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000007048	xpo6	100	91.840	ENSCSEG00000013622	xpo6	100	91.840	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000007048	xpo6	100	92.101	ENSCVAG00000017399	xpo6	100	92.773	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000007048	xpo6	97	76.089	ENSDARG00000041217	xpo6	99	76.089	Danio_rerio
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.184	ENSDNOG00000012449	XPO6	99	77.184	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	76.916	ENSDORG00000000919	Xpo6	99	76.916	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000007048	xpo6	81	31.250	FBgn0266572	ebo	87	31.250	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000007048	xpo6	83	76.062	ENSETEG00000018768	XPO6	85	76.062	Echinops_telfairi
ENSACLG00000007048	xpo6	99	60.695	ENSEBUG00000015560	xpo6	99	60.749	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.273	ENSEASG00005017296	XPO6	99	77.273	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.362	ENSECAG00000008601	XPO6	99	77.362	Equus_caballus
ENSACLG00000007048	xpo6	97	71.166	ENSEEUG00000014587	XPO6	99	71.166	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	87.186	ENSELUG00000009159	xpo6	99	87.186	Esox_lucius
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.451	ENSFCAG00000010309	XPO6	99	77.451	Felis_catus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	78.053	ENSFALG00000004441	XPO6	98	78.053	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.273	ENSFDAG00000012689	XPO6	99	77.273	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000007048	xpo6	100	91.840	ENSFHEG00000021190	xpo6	100	91.753	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	78.610	ENSGALG00000035360	XPO6	99	78.610	Gallus_gallus
ENSACLG00000007048	xpo6	100	91.927	ENSGAFG00000004044	xpo6	100	91.840	Gambusia_affinis
ENSACLG00000007048	xpo6	95	78.257	ENSGAGG00000022738	XPO6	100	78.257	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.273	ENSGGOG00000005609	XPO6	99	77.273	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000007048	xpo6	100	99.653	ENSHBUG00000019504	xpo6	100	99.653	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.362	ENSHGLG00000009679	-	99	77.362	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000007048	xpo6	94	58.502	ENSHGLG00000003865	-	99	59.055	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000007048	xpo6	94	63.622	ENSHGLG00100001081	-	99	63.622	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.362	ENSHGLG00100003673	-	99	77.362	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000007048	xpo6	100	91.146	ENSHCOG00000004987	xpo6	100	91.146	Hippocampus_comes
ENSACLG00000007048	xpo6	99	76.337	ENSIPUG00000006516	xpo6	100	75.536	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	76.916	ENSSTOG00000012161	XPO6	99	76.916	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	76.381	ENSJJAG00000019392	Xpo6	99	76.381	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000007048	xpo6	100	93.661	ENSKMAG00000010403	xpo6	100	93.661	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000007048	xpo6	100	94.097	ENSLBEG00000023039	xpo6	100	94.097	Labrus_bergylta
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.005	ENSLACG00000017930	XPO6	99	77.005	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000007048	xpo6	94	82.836	ENSLOCG00000003304	xpo6	100	82.836	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	76.738	ENSLAFG00000011960	XPO6	99	76.738	Loxodonta_africana
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.451	ENSMFAG00000045067	XPO6	99	77.451	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.451	ENSMMUG00000018623	XPO6	99	77.451	Macaca_mulatta
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.451	ENSMNEG00000028587	XPO6	99	77.451	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.451	ENSMLEG00000029685	XPO6	99	77.451	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000007048	xpo6	100	93.750	ENSMAMG00000001351	xpo6	100	93.750	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000007048	xpo6	100	99.913	ENSMZEG00005010620	xpo6	100	99.913	Maylandia_zebra
ENSACLG00000007048	xpo6	97	77.778	ENSMGAG00000009566	XPO6	100	77.778	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000007048	xpo6	99	68.121	ENSMAUG00000012539	Xpo6	100	67.854	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.273	ENSMICG00000001923	XPO6	99	77.273	Microcebus_murinus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.094	ENSMOCG00000008015	Xpo6	99	77.094	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000007048	xpo6	99	94.002	ENSMMOG00000011992	xpo6	99	94.002	Mola_mola
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.986	ENSMODG00000015516	XPO6	99	77.807	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000007048	xpo6	99	83.407	ENSMALG00000020612	xpo6	99	83.496	Monopterus_albus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.094	MGP_CAROLIEiJ_G0030439	Xpo6	99	78.393	Mus_caroli
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.005	ENSMUSG00000000131	Xpo6	99	77.005	Mus_musculus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.094	MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	77.094	Mus_pahari
ENSACLG00000007048	xpo6	99	76.827	MGP_SPRETEiJ_G0031553	Xpo6	99	76.827	Mus_spretus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	76.916	ENSMPUG00000012920	XPO6	98	76.916	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000007048	xpo6	99	76.827	ENSMLUG00000012970	XPO6	99	76.827	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.094	ENSNGAG00000012740	Xpo6	99	77.094	Nannospalax_galili
ENSACLG00000007048	xpo6	100	99.479	ENSNBRG00000007275	xpo6	100	99.479	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.362	ENSNLEG00000011518	XPO6	99	77.362	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000007048	xpo6	86	79.427	ENSOPRG00000009278	XPO6	86	79.427	Ochotona_princeps
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.273	ENSODEG00000012917	XPO6	99	77.273	Octodon_degus
ENSACLG00000007048	xpo6	100	98.438	ENSONIG00000019366	xpo6	100	98.438	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.184	ENSOCUG00000002727	XPO6	99	77.184	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000007048	xpo6	100	91.240	ENSORLG00000011231	xpo6	100	91.067	Oryzias_latipes
ENSACLG00000007048	xpo6	100	91.339	ENSORLG00020000386	xpo6	100	91.339	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000007048	xpo6	100	91.067	ENSORLG00015003636	xpo6	100	90.893	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000007048	xpo6	100	91.761	ENSOMEG00000016505	xpo6	100	91.587	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.362	ENSOGAG00000012844	XPO6	99	77.362	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.005	ENSOARG00000000960	XPO6	99	77.005	Ovis_aries
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.362	ENSPPAG00000033668	XPO6	99	77.362	Pan_paniscus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.428	ENSPPRG00000001454	XPO6	100	77.428	Panthera_pardus
ENSACLG00000007048	xpo6	97	76.633	ENSPTIG00000016663	XPO6	99	76.633	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.362	ENSPTRG00000007919	XPO6	99	77.362	Pan_troglodytes
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.451	ENSPANG00000017103	XPO6	99	77.451	Papio_anubis
ENSACLG00000007048	xpo6	99	82.500	ENSPKIG00000022550	xpo6	99	82.500	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.179	ENSPSIG00000018225	XPO6	100	77.179	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000007048	xpo6	99	91.547	ENSPMGG00000014436	xpo6	100	91.547	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.094	ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	77.094	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000007048	xpo6	99	68.486	ENSPMAG00000003127	xpo6	99	68.546	Petromyzon_marinus
ENSACLG00000007048	xpo6	97	77.502	ENSPCIG00000003863	XPO6	100	77.111	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000007048	xpo6	100	92.368	ENSPFOG00000008763	xpo6	100	92.281	Poecilia_formosa
ENSACLG00000007048	xpo6	100	92.361	ENSPLAG00000014054	xpo6	100	92.274	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000007048	xpo6	100	92.448	ENSPMEG00000018994	xpo6	100	92.361	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000007048	xpo6	97	92.685	ENSPREG00000016421	xpo6	96	92.596	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.273	ENSPPYG00000007218	XPO6	99	77.273	Pongo_abelii
ENSACLG00000007048	xpo6	90	77.035	ENSPCAG00000008918	XPO6	90	77.035	Procavia_capensis
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.362	ENSPCOG00000017886	XPO6	99	77.362	Propithecus_coquereli
ENSACLG00000007048	xpo6	80	88.406	ENSPVAG00000012234	XPO6	80	88.406	Pteropus_vampyrus
ENSACLG00000007048	xpo6	100	99.566	ENSPNYG00000008375	xpo6	100	99.566	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000007048	xpo6	100	76.252	ENSPNAG00000008284	xpo6	100	76.252	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000007048	xpo6	99	76.738	ENSRNOG00000016722	Xpo6	99	76.738	Rattus_norvegicus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.451	ENSRBIG00000031469	XPO6	99	77.451	Rhinopithecus_bieti
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.362	ENSRROG00000044864	XPO6	99	77.362	Rhinopithecus_roxellana
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.005	ENSSBOG00000027650	XPO6	99	77.005	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.986	ENSSHAG00000013864	XPO6	99	77.986	Sarcophilus_harrisii
ENSACLG00000007048	xpo6	99	79.732	ENSSFOG00015009347	xpo6	99	79.643	Scleropages_formosus
ENSACLG00000007048	xpo6	100	93.750	ENSSMAG00000010566	xpo6	100	93.750	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000007048	xpo6	100	95.573	ENSSDUG00000017294	xpo6	100	95.573	Seriola_dumerili
ENSACLG00000007048	xpo6	100	95.399	ENSSLDG00000006580	xpo6	100	95.399	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000007048	xpo6	93	77.839	ENSSARG00000013120	XPO6	93	77.839	Sorex_araneus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	78.164	ENSSPUG00000009217	XPO6	99	78.164	Sphenodon_punctatus
ENSACLG00000007048	xpo6	100	95.833	ENSSPAG00000009469	xpo6	100	95.833	Stegastes_partitus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.362	ENSSSCG00000007812	XPO6	100	77.321	Sus_scrofa
ENSACLG00000007048	xpo6	87	78.310	ENSTGUG00000003781	XPO6	99	78.310	Taeniopygia_guttata
ENSACLG00000007048	xpo6	100	91.406	ENSTRUG00000004696	xpo6	100	91.146	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000007048	xpo6	99	91.225	ENSTNIG00000018949	xpo6	99	91.225	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000007048	xpo6	93	88.889	ENSTBEG00000009945	XPO6	93	88.889	Tupaia_belangeri
ENSACLG00000007048	xpo6	99	76.916	ENSTTRG00000009558	XPO6	99	76.916	Tursiops_truncatus
ENSACLG00000007048	xpo6	99	75.649	ENSUMAG00000007086	XPO6	99	75.649	Ursus_maritimus
ENSACLG00000007048	xpo6	91	88.235	ENSVPAG00000008493	XPO6	94	88.235	Vicugna_pacos
ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.362	ENSVVUG00000024150	XPO6	99	77.362	Vulpes_vulpes
ENSACLG00000007048	xpo6	99	73.019	ENSXETG00000010326	xpo6	99	73.019	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000007048	xpo6	100	92.622	ENSXMAG00000011630	xpo6	100	92.535	Xiphophorus_maculatus