EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000007076 (Gene tree)
Gene ID: 113011118
Gene Symbol: rab11bb
Alias: zgc:92772
Full Name: ras-related protein Rab-11B-like
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3199 bases
Position: chr18:22849754-22852952
Accession: 113011118
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000010344	MMR_HSR1	PF01926.23	3.9e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000010593	-	657	-	ENSACLP00000010344	218 (aa)	XP_026006289	UPI0000364045

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000007076	rab11bb	77	41.040	ENSACLG00000024456	-	82	41.040
ENSACLG00000007076	rab11bb	70	35.897	ENSACLG00000005093	rab34a	58	35.897
ENSACLG00000007076	rab11bb	94	33.175	ENSACLG00000003898	rab32b	92	33.175
ENSACLG00000007076	rab11bb	79	34.884	ENSACLG00000002819	rab23	80	34.555
ENSACLG00000007076	rab11bb	71	35.000	ENSACLG00000008602	RAB29	96	35.000
ENSACLG00000007076	rab11bb	77	36.905	ENSACLG00000025632	rabl2	73	36.905
ENSACLG00000007076	rab11bb	75	43.636	ENSACLG00000007696	rab12	84	38.426
ENSACLG00000007076	rab11bb	72	36.306	ENSACLG00000026487	rab6bb	76	36.842
ENSACLG00000007076	rab11bb	79	40.449	ENSACLG00000004795	rab9b	79	40.449
ENSACLG00000007076	rab11bb	75	47.239	ENSACLG00000008615	-	73	47.239
ENSACLG00000007076	rab11bb	79	36.994	ENSACLG00000011249	rras	86	36.994
ENSACLG00000007076	rab11bb	76	40.964	ENSACLG00000001646	-	78	40.964
ENSACLG00000007076	rab11bb	99	81.567	ENSACLG00000010268	rab11al	99	81.567
ENSACLG00000007076	rab11bb	74	43.478	ENSACLG00000021470	rab22a	83	43.478
ENSACLG00000007076	rab11bb	94	34.862	ENSACLG00000005720	rab33ba	80	36.923
ENSACLG00000007076	rab11bb	93	87.685	ENSACLG00000018852	-	92	87.685
ENSACLG00000007076	rab11bb	78	46.199	ENSACLG00000015289	rab18b	83	46.199
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	93.578	ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.578
ENSACLG00000007076	rab11bb	74	33.908	ENSACLG00000005733	rab34b	66	33.908
ENSACLG00000007076	rab11bb	96	46.411	ENSACLG00000003326	-	99	46.411
ENSACLG00000007076	rab11bb	76	33.333	ENSACLG00000021109	si:dkey-13a21.4	82	33.333
ENSACLG00000007076	rab11bb	77	45.562	ENSACLG00000000860	-	75	45.562
ENSACLG00000007076	rab11bb	80	45.402	ENSACLG00000018721	si:dkey-16l2.16	98	41.148
ENSACLG00000007076	rab11bb	74	45.679	ENSACLG00000011484	rab18a	79	45.679
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	97.706	ENSACLG00000005446	-	100	97.706
ENSACLG00000007076	rab11bb	79	47.977	ENSACLG00000019643	-	87	47.977
ENSACLG00000007076	rab11bb	59	30.075	ENSACLG00000016659	-	65	30.075
ENSACLG00000007076	rab11bb	54	30.579	ENSACLG00000024991	arl4d	59	30.579
ENSACLG00000007076	rab11bb	67	43.421	ENSACLG00000010965	-	63	43.421
ENSACLG00000007076	rab11bb	77	43.195	ENSACLG00000001218	RAB17	74	43.195
ENSACLG00000007076	rab11bb	70	34.839	ENSACLG00000027677	KRAS	87	35.928
ENSACLG00000007076	rab11bb	83	41.530	ENSACLG00000007514	rab42a	84	41.530
ENSACLG00000007076	rab11bb	96	40.476	ENSACLG00000023526	rab30	97	40.476
ENSACLG00000007076	rab11bb	94	41.176	ENSACLG00000002706	rab5c	89	41.176
ENSACLG00000007076	rab11bb	74	31.214	ENSACLG00000019293	rasl11a	67	31.214
ENSACLG00000007076	rab11bb	87	48.438	ENSACLG00000007644	rab1ab	95	48.438
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	87.156	ENSACLG00000001775	rab11a	100	87.156
ENSACLG00000007076	rab11bb	96	45.933	ENSACLG00000013668	rab1ba	99	45.933
ENSACLG00000007076	rab11bb	65	30.137	ENSACLG00000013597	arl8ba	72	30.137
ENSACLG00000007076	rab11bb	99	64.840	ENSACLG00000018262	rab25a	100	64.840
ENSACLG00000007076	rab11bb	79	45.977	ENSACLG00000027590	-	82	45.977
ENSACLG00000007076	rab11bb	74	34.132	ENSACLG00000009103	si:cabz01085950.1	82	34.132
ENSACLG00000007076	rab11bb	70	34.839	ENSACLG00000027515	KRAS	87	35.928
ENSACLG00000007076	rab11bb	82	38.587	ENSACLG00000021547	rab33a	65	38.587
ENSACLG00000007076	rab11bb	77	44.970	ENSACLG00000009468	RAB39B	79	44.970
ENSACLG00000007076	rab11bb	89	32.500	ENSACLG00000025138	rab6ba	92	32.500
ENSACLG00000007076	rab11bb	76	43.976	ENSACLG00000026336	rab15	78	43.976
ENSACLG00000007076	rab11bb	94	41.262	ENSACLG00000018066	rab5aa	90	41.262
ENSACLG00000007076	rab11bb	73	33.125	ENSACLG00000008646	rheb	86	33.125
ENSACLG00000007076	rab11bb	81	37.363	ENSACLG00000006647	rab9a	87	37.363
ENSACLG00000007076	rab11bb	72	37.580	ENSACLG00000019423	rab41	74	37.580
ENSACLG00000007076	rab11bb	77	51.190	ENSACLG00000013734	-	79	51.190
ENSACLG00000007076	rab11bb	79	45.977	ENSACLG00000022893	-	82	45.977
ENSACLG00000007076	rab11bb	83	37.968	ENSACLG00000024502	-	87	37.968
ENSACLG00000007076	rab11bb	74	34.969	ENSACLG00000007804	si:ch73-116o1.2	82	36.364
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	62.385	ENSACLG00000010251	rab25b	100	62.385
ENSACLG00000007076	rab11bb	72	40.491	ENSACLG00000018847	RAB7A	78	40.491
ENSACLG00000007076	rab11bb	77	52.695	ENSACLG00000013505	-	78	52.695
ENSACLG00000007076	rab11bb	77	52.096	ENSACLG00000006329	-	78	52.096
ENSACLG00000007076	rab11bb	78	41.040	ENSACLG00000027006	zgc:101559	73	41.040
ENSACLG00000007076	rab11bb	77	33.929	ENSACLG00000001181	hrasb	92	35.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	100.000	ENSAPOG00000023455	rab11bb	100	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	97.706	ENSACIG00000024376	-	100	97.706	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	87.156	ENSACIG00000019631	rab11bb	100	87.156	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	100.000	ENSAOCG00000018239	rab11bb	100	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	97.706	ENSAOCG00000018849	-	100	97.706	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	100.000	ENSAPEG00000016590	rab11bb	100	100.000	Amphiprion_percula
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	100.000	ENSATEG00000017696	rab11bb	100	100.000	Anabas_testudineus
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	98.165	ENSATEG00000023725	-	100	98.165	Anabas_testudineus
ENSACLG00000007076	rab11bb	94	98.058	ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	98.624	ENSAMXG00000042655	rab11bb	100	98.624	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	96.789	ENSAMXG00000037623	-	100	96.789	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	96.330	ENSBTAG00000002475	RAB11B	100	96.330	Bos_taurus
ENSACLG00000007076	rab11bb	96	94.737	ENSCHIG00000022426	-	93	94.737	Capra_hircus
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	96.330	ENSCATG00000029188	-	100	96.330	Cercocebus_atys
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	97.248	ENSCPBG00000017056	-	100	97.248	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	100.000	ENSCSEG00000012149	rab11bb	100	100.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	97.248	ENSCSEG00000007239	-	100	97.248	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	94.495	ENSCVAG00000019751	-	100	94.495	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	100.000	ENSCVAG00000017021	-	100	100.000	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	96.789	ENSCVAG00000019718	-	100	96.789	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	98.165	ENSDARG00000090086	rab11bb	100	98.165	Danio_rerio
ENSACLG00000007076	rab11bb	99	94.931	ENSETEG00000000905	-	99	94.931	Echinops_telfairi
ENSACLG00000007076	rab11bb	99	94.884	ENSEASG00005003708	-	99	94.884	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000007076	rab11bb	99	94.884	ENSECAG00000000716	RAB11B	99	94.884	Equus_caballus
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	98.165	ENSELUG00000021148	rab11bb	100	98.165	Esox_lucius
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	95.413	ENSELUG00000000916	-	100	95.413	Esox_lucius
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	96.330	ENSELUG00000020948	-	98	100.000	Esox_lucius
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	97.248	ENSFALG00000011828	-	100	97.248	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	98.165	ENSFHEG00000022676	-	100	98.165	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	100.000	ENSFHEG00000018353	rab11bb	100	100.000	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	99.541	ENSGMOG00000009211	rab11bb	100	99.541	Gadus_morhua
ENSACLG00000007076	rab11bb	99	93.519	ENSGMOG00000009668	-	99	93.519	Gadus_morhua
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	97.248	ENSGALG00000000613	RAB11B	100	97.248	Gallus_gallus
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	100.000	ENSGAFG00000007102	rab11bb	100	100.000	Gambusia_affinis
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	99.541	ENSGACG00000015479	rab11bb	100	99.541	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	94.495	ENSGACG00000013297	-	99	94.495	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	96.330	ENSGGOG00000014516	RAB11B	100	96.330	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	100.000	ENSHBUG00000014777	rab11bb	100	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	97.706	ENSHBUG00000009947	-	100	97.706	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	93.578	ENSHCOG00000000985	-	100	93.578	Hippocampus_comes
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	95.413	ENSHCOG00000000954	-	100	95.413	Hippocampus_comes
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	99.541	ENSHCOG00000002423	rab11bb	100	99.541	Hippocampus_comes
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	99.083	ENSIPUG00000019927	rab11bb	100	99.083	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	97.248	ENSIPUG00000025100	rab11b	100	97.248	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	100.000	ENSKMAG00000009033	rab11bb	100	100.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000007076	rab11bb	100	97.706	ENSKMAG00000006170	-	100	97.706	Kryptolebias_marmoratus
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ENSACLG00000007076	rab11bb	100	97.706	ENSMMOG00000001250	-	100	97.706	Mola_mola
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