EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000007200 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2347 bases
Position: chrLS419816.1:241314-243660
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000010527	RVT_1	PF00078.27	2.3e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000010778	-	2347	-	ENSACLP00000010527	699 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000007200	-	54	32.398	ENSACLG00000008836	-	73	32.398
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ENSACLG00000007200	-	96	30.713	ENSACLG00000027996	-	84	30.290
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ENSACLG00000007200	-	66	30.238	ENSACLG00000006688	-	97	30.303
ENSACLG00000007200	-	52	31.421	ENSACLG00000006202	-	97	31.421
ENSACLG00000007200	-	97	31.503	ENSACLG00000000734	-	76	31.503
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ENSACLG00000007200	-	86	30.682	ENSACLG00000023557	-	93	31.494
ENSACLG00000007200	-	69	31.911	ENSACLG00000022853	-	91	31.062
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ENSACLG00000007200	-	68	30.061	ENSACLG00000018945	-	81	30.061
ENSACLG00000007200	-	86	31.107	ENSACLG00000005547	-	94	30.506
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ENSACLG00000007200	-	64	30.753	ENSACLG00000011058	-	95	30.753
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ENSACLG00000007200	-	54	33.681	ENSACLG00000021583	-	91	33.850
ENSACLG00000007200	-	63	33.259	ENSACLG00000018346	-	99	33.929
ENSACLG00000007200	-	61	32.273	ENSACLG00000012094	-	88	32.414
ENSACLG00000007200	-	81	68.717	ENSACLG00000016231	-	98	68.717
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ENSACLG00000007200	-	59	33.095	ENSACLG00000024568	-	98	32.143
ENSACLG00000007200	-	65	30.621	ENSACLG00000005642	-	78	30.621
ENSACLG00000007200	-	52	34.140	ENSACLG00000026286	-	99	34.309
ENSACLG00000007200	-	64	33.113	ENSACLG00000021937	-	95	33.113
ENSACLG00000007200	-	83	30.102	ENSACLG00000017241	-	80	32.049
ENSACLG00000007200	-	71	31.089	ENSACLG00000017297	-	92	31.238
ENSACLG00000007200	-	85	30.259	ENSACLG00000019519	-	73	30.259
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ENSACLG00000007200	-	53	30.607	ENSACLG00000015536	-	97	30.256
ENSACLG00000007200	-	57	73.232	ENSACLG00000021422	-	99	73.232
ENSACLG00000007200	-	54	36.554	ENSACLG00000008558	-	79	36.772
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ENSACLG00000007200	-	55	30.334	ENSACLG00000024108	-	66	30.245
ENSACLG00000007200	-	54	31.937	ENSACLG00000013521	-	97	32.199
ENSACLG00000007200	-	77	30.309	ENSACLG00000018252	-	68	30.309
ENSACLG00000007200	-	52	32.240	ENSACLG00000011151	-	97	33.333
ENSACLG00000007200	-	62	30.562	ENSACLG00000005509	-	98	30.562
ENSACLG00000007200	-	50	31.933	ENSACLG00000019219	-	77	31.933
ENSACLG00000007200	-	63	32.957	ENSACLG00000004998	-	98	32.054
ENSACLG00000007200	-	57	33.501	ENSACLG00000026433	-	70	37.855
ENSACLG00000007200	-	61	34.411	ENSACLG00000020184	-	93	35.566
ENSACLG00000007200	-	62	34.554	ENSACLG00000027855	-	98	35.698
ENSACLG00000007200	-	71	31.361	ENSACLG00000012352	-	99	31.361
ENSACLG00000007200	-	92	30.909	ENSACLG00000021287	-	74	30.468
ENSACLG00000007200	-	62	34.467	ENSACLG00000016639	-	95	35.601
ENSACLG00000007200	-	54	33.247	ENSACLG00000025525	-	86	34.085
ENSACLG00000007200	-	64	32.667	ENSACLG00000010366	-	97	31.778
ENSACLG00000007200	-	52	31.967	ENSACLG00000013183	-	97	33.060
ENSACLG00000007200	-	52	30.790	ENSACLG00000012076	-	96	30.790
ENSACLG00000007200	-	60	31.455	ENSACLG00000022656	-	96	30.769
ENSACLG00000007200	-	66	33.970	ENSACLG00000000230	-	98	32.845
ENSACLG00000007200	-	67	32.906	ENSACLG00000023590	-	93	32.051
ENSACLG00000007200	-	86	31.877	ENSACLG00000027511	-	52	31.230
ENSACLG00000007200	-	60	31.690	ENSACLG00000001556	-	90	31.690
ENSACLG00000007200	-	69	33.605	ENSACLG00000024400	-	93	34.623
ENSACLG00000007200	-	50	34.857	ENSACLG00000026307	-	94	34.857
ENSACLG00000007200	-	72	32.283	ENSACLG00000022169	-	84	32.422
ENSACLG00000007200	-	69	32.591	ENSACLG00000013932	-	89	32.591
ENSACLG00000007200	-	93	30.152	ENSACLG00000005570	-	99	30.152

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000007200	-	52	32.796	ENSAOCG00000004576	-	97	32.796	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000007200	-	52	32.708	ENSAPEG00000024502	-	97	32.708	Amphiprion_percula
ENSACLG00000007200	-	87	31.826	ENSATEG00000002739	-	97	31.179	Anabas_testudineus
ENSACLG00000007200	-	72	34.051	ENSATEG00000014607	-	97	33.268	Anabas_testudineus
ENSACLG00000007200	-	57	33.000	ENSATEG00000004857	-	85	32.000	Anabas_testudineus
ENSACLG00000007200	-	69	34.553	ENSATEG00000015931	-	96	33.740	Anabas_testudineus
ENSACLG00000007200	-	87	31.929	ENSATEG00000015490	-	97	31.280	Anabas_testudineus
ENSACLG00000007200	-	70	30.862	ENSATEG00000004798	-	74	32.000	Anabas_testudineus
ENSACLG00000007200	-	61	30.184	ENSAMXG00000033415	-	57	30.184	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000007200	-	79	30.631	ENSAMXG00000030359	-	79	30.631	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000007200	-	80	31.359	ENSAMXG00000032588	-	91	30.174	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000007200	-	58	45.274	ENSAMXG00000029344	-	96	45.636	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000007200	-	67	33.404	ENSAMXG00000043740	-	95	33.404	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000007200	-	62	50.000	ENSAMXG00000033695	-	95	50.000	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000007200	-	69	33.198	ENSAMXG00000039914	-	73	30.492	Astyanax_mexicanus
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