EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000008624 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2582 bases
Position: chr14:113450-116031
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000012628	zf-C2H2	PF00096.26	4.6e-22	1	4
ENSACLP00000012628	zf-C2H2	PF00096.26	4.6e-22	2	4
ENSACLP00000012628	zf-C2H2	PF00096.26	4.6e-22	3	4
ENSACLP00000012628	zf-C2H2	PF00096.26	4.6e-22	4	4
ENSACLP00000012628	zf-met	PF12874.7	2.1e-10	1	2
ENSACLP00000012628	zf-met	PF12874.7	2.1e-10	2	2
ENSACLP00000012628	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	2.4e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000012935	-	696	-	ENSACLP00000012628	231 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000008624	-	89	36.585	ENSACLG00000006702	-	81	36.585
ENSACLG00000008624	-	79	43.636	ENSACLG00000015843	-	86	43.636
ENSACLG00000008624	-	87	43.636	ENSACLG00000001045	-	97	44.848
ENSACLG00000008624	-	86	45.679	ENSACLG00000019424	-	96	38.000
ENSACLG00000008624	-	82	40.571	ENSACLG00000020339	-	53	40.571
ENSACLG00000008624	-	72	45.324	ENSACLG00000024294	-	76	45.324
ENSACLG00000008624	-	78	44.853	ENSACLG00000022482	-	81	44.853
ENSACLG00000008624	-	63	40.206	ENSACLG00000013531	-	91	40.206
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ENSACLG00000008624	-	71	46.491	ENSACLG00000001368	-	90	43.609
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ENSACLG00000008624	-	77	41.212	ENSACLG00000022475	-	91	41.212
ENSACLG00000008624	-	79	40.854	ENSACLG00000027424	-	60	40.854
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ENSACLG00000008624	-	84	39.806	ENSACLG00000005708	-	68	40.000
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ENSACLG00000008624	-	82	44.118	ENSACLG00000016841	-	53	43.103
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ENSACLG00000008624	-	72	44.231	ENSACLG00000007749	-	76	44.231
ENSACLG00000008624	-	95	39.726	ENSACLG00000017449	-	62	39.726
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ENSACLG00000008624	-	87	43.713	ENSACLG00000028002	-	92	44.848
ENSACLG00000008624	-	77	41.606	ENSACLG00000020333	-	53	41.606
ENSACLG00000008624	-	87	38.125	ENSACLG00000019167	-	96	42.500
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ENSACLG00000008624	-	81	44.545	ENSACLG00000023979	-	96	44.545
ENSACLG00000008624	-	77	44.512	ENSACLG00000020610	-	65	44.737
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ENSACLG00000008624	-	70	37.662	ENSACLG00000018551	snai2	58	36.190
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ENSACLG00000008624	-	81	36.478	ENSACLG00000005594	ZNF319	82	36.478
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ENSACLG00000008624	-	85	44.242	ENSACLG00000000537	-	97	43.293
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ENSACLG00000008624	-	79	43.421	ENSACLG00000005615	-	50	43.421
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ENSACLG00000008624	-	76	39.130	ENSACLG00000005795	-	60	42.105
ENSACLG00000008624	-	72	41.250	ENSACLG00000000521	-	92	41.250
ENSACLG00000008624	-	78	43.636	ENSACLG00000022497	-	95	43.636
ENSACLG00000008624	-	81	42.197	ENSACLG00000019349	-	70	42.197
ENSACLG00000008624	-	77	46.078	ENSACLG00000018746	-	88	42.143
ENSACLG00000008624	-	79	32.298	ENSACLG00000016648	-	62	38.710
ENSACLG00000008624	-	77	42.775	ENSACLG00000026538	-	80	44.030
ENSACLG00000008624	-	71	43.151	ENSACLG00000017411	-	86	42.759
ENSACLG00000008624	-	79	37.297	ENSACLG00000025353	ZNF384	53	37.297

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000008624	-	87	82.090	ENSAPOG00000001563	-	86	73.611	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000008624	-	84	91.429	ENSACIG00000015411	-	88	91.279	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000008624	-	74	43.103	ENSAOCG00000013505	-	54	43.103	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000008624	-	88	74.286	ENSAOCG00000013589	-	92	74.286	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000008624	-	74	43.103	ENSAPEG00000022756	-	50	43.103	Amphiprion_percula
ENSACLG00000008624	-	88	74.286	ENSAPEG00000022774	-	88	74.286	Amphiprion_percula
ENSACLG00000008624	-	74	85.799	ENSATEG00000019261	-	80	82.873	Anabas_testudineus
ENSACLG00000008624	-	74	42.553	ENSATEG00000019284	-	50	42.017	Anabas_testudineus
ENSACLG00000008624	-	90	71.498	ENSCSEG00000008903	-	84	75.658	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000008624	-	86	42.857	ENSCVAG00000016534	-	59	42.857	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000008624	-	73	69.939	ENSGMOG00000000494	-	98	68.452	Gadus_morhua
ENSACLG00000008624	-	97	75.120	ENSGAFG00000002659	-	70	72.581	Gambusia_affinis
ENSACLG00000008624	-	97	81.977	ENSGACG00000001377	-	98	81.977	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000008624	-	81	98.925	ENSHBUG00000008502	-	90	98.925	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000008624	-	86	77.889	ENSHCOG00000000511	-	66	77.889	Hippocampus_comes
ENSACLG00000008624	-	89	76.166	ENSLBEG00000018509	-	93	79.054	Labrus_bergylta
ENSACLG00000008624	-	91	80.000	ENSMAMG00000018137	-	72	80.000	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000008624	-	81	98.925	ENSMZEG00005002583	-	89	98.925	Maylandia_zebra
ENSACLG00000008624	-	74	40.373	ENSMMOG00000009733	-	82	40.373	Mola_mola
ENSACLG00000008624	-	75	81.818	ENSMALG00000019991	-	96	81.818	Monopterus_albus
ENSACLG00000008624	-	94	97.990	ENSNBRG00000008223	-	84	98.844	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000008624	-	76	96.591	ENSONIG00000017233	-	99	96.591	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000008624	-	74	41.732	ENSOMEG00000016463	-	59	42.241	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000008624	-	86	75.214	ENSPMGG00000002384	-	77	75.214	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000008624	-	90	74.163	ENSPFOG00000006287	-	72	74.163	Poecilia_formosa
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ENSACLG00000008624	-	90	74.163	ENSPMEG00000005897	-	66	74.163	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000008624	-	89	66.341	ENSPREG00000021246	-	98	66.341	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000008624	-	81	99.462	ENSPNYG00000023088	-	90	99.462	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000008624	-	95	81.500	ENSSDUG00000004892	-	62	81.500	Seriola_dumerili
ENSACLG00000008624	-	83	85.714	ENSSLDG00000005670	-	90	85.714	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000008624	-	87	85.572	ENSSPAG00000022219	-	65	83.092	Stegastes_partitus
ENSACLG00000008624	-	75	78.698	ENSTNIG00000011188	-	99	78.698	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000008624	-	97	75.120	ENSXMAG00000000866	-	62	75.120	Xiphophorus_maculatus