EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000008675 (Gene tree)
Gene ID: 113022705
Gene Symbol: pusl1
Alias: -
Full Name: pseudouridine synthase like 1
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 17529 bases
Position: chr5:24690559-24708087
Accession: 113022705
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000012708	PseudoU_synth_1	PF01416.20	2.3e-32	1	2
ENSACLP00000012708	PseudoU_synth_1	PF01416.20	2.3e-32	2	2
ENSACLP00000012715	PseudoU_synth_1	PF01416.20	8.2e-29	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000013029	-	795	-	ENSACLP00000012715	264 (aa)	-	-
ENSACLT00000013022	-	1835	-	ENSACLP00000012708	300 (aa)	XP_026024176	UPI000329CC55

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000008675	pusl1	95	48.221	ENSG00000169972	PUSL1	98	48.000	Homo_sapiens
ENSACLG00000008675	pusl1	95	78.322	ENSAPOG00000016290	pusl1	96	78.322	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000008675	pusl1	95	48.221	ENSAMEG00000013752	PUSL1	90	48.913	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000008675	pusl1	95	88.048	ENSACIG00000015240	pusl1	100	90.511	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000008675	pusl1	99	72.624	ENSAOCG00000019419	pusl1	86	76.140	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000008675	pusl1	95	76.923	ENSAPEG00000005452	pusl1	96	76.923	Amphiprion_percula
ENSACLG00000008675	pusl1	99	77.441	ENSATEG00000024154	pusl1	99	77.441	Anabas_testudineus
ENSACLG00000008675	pusl1	92	51.986	ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	51.986	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000008675	pusl1	92	53.279	ENSACAG00000014111	PUSL1	98	53.462	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000008675	pusl1	93	49.822	ENSANAG00000037456	PUSL1	92	49.822	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000008675	pusl1	94	62.411	ENSAMXG00000044007	pusl1	96	61.832	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000008675	pusl1	94	48.800	ENSBTAG00000007619	PUSL1	94	49.638	Bos_taurus
ENSACLG00000008675	pusl1	93	49.822	ENSCJAG00000010972	PUSL1	92	49.822	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000008675	pusl1	95	47.826	ENSCAFG00000019291	PUSL1	90	47.122	Canis_familiaris
ENSACLG00000008675	pusl1	95	47.431	ENSCAFG00020011568	PUSL1	90	48.201	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000008675	pusl1	94	48.400	ENSCHIG00000012615	PUSL1	95	49.458	Capra_hircus
ENSACLG00000008675	pusl1	93	47.368	ENSCPOG00000005149	PUSL1	89	48.014	Cavia_porcellus
ENSACLG00000008675	pusl1	93	49.822	ENSCCAG00000027475	PUSL1	92	49.822	Cebus_capucinus
ENSACLG00000008675	pusl1	95	48.617	ENSCATG00000018260	PUSL1	90	50.181	Cercocebus_atys
ENSACLG00000008675	pusl1	93	48.178	ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	48.561	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000008675	pusl1	95	48.221	ENSCSAG00000000680	PUSL1	90	49.819	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000008675	pusl1	93	55.872	ENSCPBG00000022621	PUSL1	96	55.872	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000008675	pusl1	95	48.221	ENSCANG00000034373	PUSL1	90	49.819	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000008675	pusl1	93	47.177	ENSCGRG00001012429	Pusl1	95	47.670	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000008675	pusl1	93	47.177	ENSCGRG00000006466	Pusl1	95	47.670	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000008675	pusl1	96	73.611	ENSCSEG00000005159	pusl1	97	73.611	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000008675	pusl1	92	64.898	ENSCVAG00000012923	pusl1	94	64.898	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000008675	pusl1	96	64.583	ENSDARG00000074565	pusl1	99	64.953	Danio_rerio
ENSACLG00000008675	pusl1	93	32.787	FBgn0083976	CG34140	99	32.787	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000008675	pusl1	93	48.790	ENSECAG00000006248	PUSL1	90	49.458	Equus_caballus
ENSACLG00000008675	pusl1	92	49.104	ENSEEUG00000000837	PUSL1	93	49.104	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000008675	pusl1	94	64.769	ENSELUG00000015945	pusl1	96	64.769	Esox_lucius
ENSACLG00000008675	pusl1	92	49.458	ENSFCAG00000007617	PUSL1	91	49.458	Felis_catus
ENSACLG00000008675	pusl1	96	79.861	ENSFHEG00000006370	pusl1	96	79.861	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000008675	pusl1	93	77.061	ENSGMOG00000019388	pusl1	99	77.061	Gadus_morhua
ENSACLG00000008675	pusl1	94	52.482	ENSGALG00000001714	PUSL1	97	52.482	Gallus_gallus
ENSACLG00000008675	pusl1	94	78.445	ENSGAFG00000007546	pusl1	96	78.445	Gambusia_affinis
ENSACLG00000008675	pusl1	99	75.421	ENSGACG00000007848	pusl1	98	75.421	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000008675	pusl1	96	54.325	ENSGAGG00000004730	PUSL1	99	54.325	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000008675	pusl1	91	49.793	ENSGGOG00000005364	PUSL1	93	49.793	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000008675	pusl1	100	98.667	ENSHBUG00000001264	pusl1	100	98.667	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000008675	pusl1	93	46.586	ENSHGLG00000017570	PUSL1	90	47.312	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000008675	pusl1	93	46.586	ENSHGLG00100007641	PUSL1	82	47.809	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000008675	pusl1	94	74.468	ENSHCOG00000010077	pusl1	100	75.362	Hippocampus_comes
ENSACLG00000008675	pusl1	93	64.875	ENSIPUG00000023921	pusl1	96	64.875	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000008675	pusl1	94	48.425	ENSSTOG00000001783	PUSL1	86	49.819	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000008675	pusl1	93	50.534	ENSJJAG00000020471	Pusl1	94	50.534	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000008675	pusl1	92	70.902	ENSKMAG00000005154	pusl1	92	71.111	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000008675	pusl1	97	77.740	ENSLBEG00000013469	pusl1	100	77.740	Labrus_bergylta
ENSACLG00000008675	pusl1	72	54.450	ENSLACG00000018795	PUSL1	95	54.922	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000008675	pusl1	99	55.333	ENSLOCG00000002210	pusl1	99	55.333	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000008675	pusl1	93	48.790	ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	50.403	Loxodonta_africana
ENSACLG00000008675	pusl1	95	48.221	ENSMFAG00000046288	PUSL1	90	49.819	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000008675	pusl1	95	40.711	ENSMMUG00000016279	PUSL1	89	42.960	Macaca_mulatta
ENSACLG00000008675	pusl1	93	48.988	ENSMNEG00000037989	PUSL1	91	49.819	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000008675	pusl1	97	79.725	ENSMAMG00000016538	pusl1	96	79.725	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000008675	pusl1	100	100.000	ENSMZEG00005026990	pusl1	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSACLG00000008675	pusl1	94	51.064	ENSMGAG00000003037	PUSL1	96	51.064	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000008675	pusl1	92	48.029	ENSMAUG00000019924	Pusl1	95	48.029	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000008675	pusl1	92	51.625	ENSMICG00000014171	PUSL1	93	51.625	Microcebus_murinus
ENSACLG00000008675	pusl1	93	48.387	ENSMOCG00000005602	Pusl1	95	49.104	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000008675	pusl1	98	73.818	ENSMMOG00000003269	pusl1	100	77.857	Mola_mola
ENSACLG00000008675	pusl1	99	76.846	ENSMALG00000021686	pusl1	98	76.846	Monopterus_albus
ENSACLG00000008675	pusl1	94	47.410	MGP_CAROLIEiJ_G0026911	Pusl1	95	48.399	Mus_caroli
ENSACLG00000008675	pusl1	94	47.410	ENSMUSG00000051557	Pusl1	94	48.746	Mus_musculus
ENSACLG00000008675	pusl1	94	47.410	MGP_PahariEiJ_G0029260	Pusl1	95	48.754	Mus_pahari
ENSACLG00000008675	pusl1	94	47.809	MGP_SPRETEiJ_G0027906	Pusl1	94	49.462	Mus_spretus
ENSACLG00000008675	pusl1	95	48.432	ENSMPUG00000014313	PUSL1	93	48.432	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000008675	pusl1	97	47.490	ENSNGAG00000004647	Pusl1	83	49.643	Nannospalax_galili
ENSACLG00000008675	pusl1	99	93.309	ENSNBRG00000014762	pusl1	98	93.309	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000008675	pusl1	95	49.206	ENSNLEG00000000051	PUSL1	90	51.004	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000008675	pusl1	92	43.426	ENSMEUG00000005176	-	98	43.426	Notamacropus_eugenii
ENSACLG00000008675	pusl1	92	51.254	ENSMEUG00000011649	-	96	51.254	Notamacropus_eugenii
ENSACLG00000008675	pusl1	93	48.583	ENSODEG00000008247	PUSL1	89	48.921	Octodon_degus
ENSACLG00000008675	pusl1	99	97.315	ENSONIG00000019361	pusl1	99	97.315	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000008675	pusl1	97	72.603	ENSORLG00000016228	pusl1	99	72.603	Oryzias_latipes
ENSACLG00000008675	pusl1	95	74.386	ENSORLG00020013710	pusl1	96	74.386	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000008675	pusl1	94	74.377	ENSORLG00015008715	pusl1	99	74.377	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000008675	pusl1	95	74.035	ENSOMEG00000018897	pusl1	98	74.035	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000008675	pusl1	93	49.798	ENSOGAG00000031692	PUSL1	95	50.542	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000008675	pusl1	93	48.988	ENSOARG00000004905	PUSL1	92	50.403	Ovis_aries
ENSACLG00000008675	pusl1	95	48.617	ENSPPAG00000029283	PUSL1	90	50.181	Pan_paniscus
ENSACLG00000008675	pusl1	92	49.819	ENSPPRG00000023329	PUSL1	91	49.819	Panthera_pardus
ENSACLG00000008675	pusl1	94	48.606	ENSPTIG00000018532	PUSL1	91	50.806	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000008675	pusl1	95	48.221	ENSPTRG00000000021	PUSL1	90	49.819	Pan_troglodytes
ENSACLG00000008675	pusl1	95	48.221	ENSPANG00000000591	PUSL1	90	49.819	Papio_anubis
ENSACLG00000008675	pusl1	94	61.702	ENSPKIG00000002447	pusl1	97	61.702	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000008675	pusl1	92	57.551	ENSPSIG00000002781	PUSL1	94	58.893	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000008675	pusl1	92	72.101	ENSPMGG00000011051	pusl1	99	72.101	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000008675	pusl1	93	48.790	ENSPEMG00000013541	Pusl1	95	49.462	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000008675	pusl1	95	47.244	ENSPCIG00000007816	-	64	48.763	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000008675	pusl1	99	74.662	ENSPFOG00000015448	pusl1	98	74.662	Poecilia_formosa
ENSACLG00000008675	pusl1	97	75.510	ENSPLAG00000004348	pusl1	99	75.510	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000008675	pusl1	97	75.510	ENSPMEG00000000931	pusl1	99	75.510	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000008675	pusl1	97	73.469	ENSPREG00000002324	pusl1	99	73.469	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000008675	pusl1	93	47.984	ENSPPYG00000002014	PUSL1	88	47.984	Pongo_abelii
ENSACLG00000008675	pusl1	91	42.562	ENSPCAG00000002272	PUSL1	98	42.562	Procavia_capensis
ENSACLG00000008675	pusl1	67	54.795	ENSPVAG00000001016	PUSL1	66	54.795	Pteropus_vampyrus
ENSACLG00000008675	pusl1	80	99.583	ENSPNYG00000006588	pusl1	100	99.583	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000008675	pusl1	94	65.248	ENSPNAG00000024441	pusl1	97	65.248	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000008675	pusl1	92	49.097	ENSRNOG00000022354	Pusl1	98	47.619	Rattus_norvegicus
ENSACLG00000008675	pusl1	95	48.221	ENSRBIG00000036842	PUSL1	90	49.458	Rhinopithecus_bieti
ENSACLG00000008675	pusl1	95	48.221	ENSRROG00000030704	PUSL1	90	49.458	Rhinopithecus_roxellana
ENSACLG00000008675	pusl1	91	49.383	ENSSBOG00000032249	PUSL1	90	50.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACLG00000008675	pusl1	50	51.880	ENSSHAG00000004840	-	84	47.239	Sarcophilus_harrisii
ENSACLG00000008675	pusl1	97	62.457	ENSSFOG00015008281	pusl1	96	62.457	Scleropages_formosus
ENSACLG00000008675	pusl1	97	77.740	ENSSMAG00000007187	pusl1	97	77.740	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000008675	pusl1	99	80.268	ENSSDUG00000000287	pusl1	95	77.395	Seriola_dumerili
ENSACLG00000008675	pusl1	99	80.268	ENSSLDG00000009605	pusl1	96	80.268	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000008675	pusl1	60	48.428	ENSSARG00000005323	-	86	49.390	Sorex_araneus
ENSACLG00000008675	pusl1	91	72.263	ENSSPAG00000002528	pusl1	100	72.263	Stegastes_partitus
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ENSACLG00000008675	pusl1	91	51.460	ENSTGUG00000003214	PUSL1	96	51.636	Taeniopygia_guttata
ENSACLG00000008675	pusl1	98	73.720	ENSTRUG00000010102	pusl1	99	73.720	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000008675	pusl1	68	71.111	ENSTNIG00000005789	pusl1	82	70.166	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000008675	pusl1	67	43.889	ENSTBEG00000005001	PUSL1	74	43.889	Tupaia_belangeri
ENSACLG00000008675	pusl1	93	44.355	ENSTTRG00000017030	PUSL1	91	43.929	Tursiops_truncatus
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ENSACLG00000008675	pusl1	93	48.387	ENSUMAG00000002084	PUSL1	81	48.387	Ursus_maritimus
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ENSACLG00000008675	pusl1	76	53.913	ENSXETG00000011145	pusl1	100	53.913	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000008675	pusl1	96	75.984	ENSXCOG00000017748	pusl1	99	74.733	Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000008675	pusl1	97	78.231	ENSXMAG00000018846	pusl1	99	78.231	Xiphophorus_maculatus