EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000009254 (Gene tree)
Gene ID: 113024129
Gene Symbol: urb2
Alias: fc13e02|si:dkey-162b3.2|wu:fc13e02
Full Name: URB2 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17748 bases
Position: chr1:24024995-24042742
Accession: ZDB-GENE-030131-2621
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000013500	Urb2	PF10441.9	3.8e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000013832	-	5270	-	ENSACLP00000013500	1505 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.101	ENSG00000135763	URB2	99	60.714	Homo_sapiens
ENSACLG00000009254	urb2	100	71.847	ENSAPOG00000000608	urb2	100	71.847	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.250	ENSAMEG00000009206	URB2	89	35.021	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000009254	urb2	100	72.421	ENSAOCG00000019961	urb2	91	72.421	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000009254	urb2	100	72.615	ENSAPEG00000005263	urb2	91	72.615	Amphiprion_percula
ENSACLG00000009254	urb2	100	68.496	ENSATEG00000020930	urb2	91	68.560	Anabas_testudineus
ENSACLG00000009254	urb2	94	36.630	ENSAPLG00000002998	URB2	91	36.939	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000009254	urb2	95	36.130	ENSACAG00000001285	URB2	89	36.141	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.417	ENSANAG00000033963	URB2	90	35.243	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000009254	urb2	94	42.292	ENSAMXG00000003474	urb2	89	42.222	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000009254	urb2	94	35.744	ENSBTAG00000010180	URB2	89	35.606	Bos_taurus
ENSACLG00000009254	urb2	89	61.429	ENSCJAG00000010968	URB2	88	61.429	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000009254	urb2	94	34.138	ENSCAFG00000012118	URB2	89	34.254	Canis_familiaris
ENSACLG00000009254	urb2	95	33.973	ENSCAFG00020027217	URB2	95	34.088	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.172	ENSCHIG00000014513	URB2	89	35.124	Capra_hircus
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.391	ENSTSYG00000006924	URB2	89	35.557	Carlito_syrichta
ENSACLG00000009254	urb2	55	39.326	ENSCPOG00000020777	-	84	38.071	Cavia_porcellus
ENSACLG00000009254	urb2	94	35.978	ENSCCAG00000023932	URB2	89	35.866	Cebus_capucinus
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.377	ENSCATG00000043366	URB2	90	35.314	Cercocebus_atys
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.499	ENSCLAG00000006268	URB2	90	35.758	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.377	ENSCSAG00000010599	URB2	90	35.314	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000009254	urb2	64	41.853	ENSCHOG00000010163	URB2	62	41.853	Choloepus_hoffmanni
ENSACLG00000009254	urb2	95	37.037	ENSCPBG00000006191	URB2	89	37.037	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.266	ENSCANG00000023711	URB2	90	35.202	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000009254	urb2	95	34.128	ENSCGRG00001009591	Urb2	89	34.128	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000009254	urb2	95	34.128	ENSCGRG00000011259	Urb2	89	34.128	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000009254	urb2	100	52.041	ENSCSEG00000000299	urb2	91	52.202	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000009254	urb2	100	60.237	ENSCVAG00000011011	urb2	91	60.237	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000009254	urb2	94	43.058	ENSDARG00000003217	urb2	69	63.556	Danio_rerio
ENSACLG00000009254	urb2	95	32.805	ENSDNOG00000043064	URB2	91	32.877	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000009254	urb2	95	33.948	ENSDORG00000014975	Urb2	90	33.811	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000009254	urb2	90	41.135	ENSETEG00000002869	URB2	85	41.135	Echinops_telfairi
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.414	ENSEASG00005012060	URB2	90	35.554	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000009254	urb2	87	61.538	ENSECAG00000012338	URB2	88	61.538	Equus_caballus
ENSACLG00000009254	urb2	86	56.028	ENSEEUG00000002669	URB2	81	56.028	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000009254	urb2	100	47.681	ENSELUG00000014647	urb2	96	47.715	Esox_lucius
ENSACLG00000009254	urb2	95	34.433	ENSFCAG00000007662	URB2	89	34.753	Felis_catus
ENSACLG00000009254	urb2	95	36.997	ENSFALG00000003385	URB2	89	36.846	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.954	ENSFDAG00000021079	URB2	90	35.685	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000009254	urb2	100	60.590	ENSFHEG00000010357	urb2	91	60.721	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000009254	urb2	94	53.430	ENSGMOG00000012459	urb2	89	54.054	Gadus_morhua
ENSACLG00000009254	urb2	95	37.228	ENSGALG00000011101	URB2	89	37.228	Gallus_gallus
ENSACLG00000009254	urb2	95	65.769	ENSGACG00000016179	urb2	89	65.700	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000009254	urb2	95	37.695	ENSGAGG00000021879	URB2	89	37.695	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.057	ENSGGOG00000025643	URB2	90	35.235	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000009254	urb2	100	98.140	ENSHBUG00000018469	urb2	91	98.140	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000009254	urb2	95	34.980	ENSHGLG00000016561	URB2	91	35.482	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000009254	urb2	95	34.169	ENSHGLG00100001838	URB2	90	34.534	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000009254	urb2	95	42.401	ENSIPUG00000020315	urb2	89	42.164	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000009254	urb2	95	34.756	ENSSTOG00000025323	URB2	90	35.144	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000009254	urb2	95	34.871	ENSJJAG00000011998	Urb2	90	34.717	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000009254	urb2	100	63.340	ENSKMAG00000020129	urb2	91	63.079	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000009254	urb2	94	36.731	ENSLACG00000002038	URB2	89	36.824	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000009254	urb2	94	43.936	ENSLOCG00000015462	urb2	89	43.936	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000009254	urb2	96	34.200	ENSLAFG00000012484	URB2	90	34.223	Loxodonta_africana
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.310	ENSMFAG00000039905	URB2	90	35.246	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.266	ENSMMUG00000009509	URB2	90	35.314	Macaca_mulatta
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.310	ENSMNEG00000038762	URB2	90	35.246	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.512	ENSMLEG00000043252	URB2	90	35.449	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000009254	urb2	100	63.250	ENSMAMG00000020365	urb2	91	63.250	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000009254	urb2	100	99.468	ENSMZEG00005011027	urb2	91	99.468	Maylandia_zebra
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.861	ENSMGAG00000012073	URB2	95	35.997	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000009254	urb2	90	58.865	ENSMAUG00000017980	Urb2	89	58.865	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000009254	urb2	96	34.516	ENSMICG00000033302	URB2	90	34.471	Microcebus_murinus
ENSACLG00000009254	urb2	95	34.735	ENSMOCG00000020369	Urb2	90	34.508	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000009254	urb2	100	67.636	ENSMALG00000006529	urb2	91	67.636	Monopterus_albus
ENSACLG00000009254	urb2	95	34.369	ENSMUSG00000031976	Urb2	90	34.331	Mus_musculus
ENSACLG00000009254	urb2	94	35.749	ENSMPUG00000012438	URB2	89	35.768	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000009254	urb2	95	34.377	ENSNGAG00000016524	Urb2	90	34.628	Nannospalax_galili
ENSACLG00000009254	urb2	95	34.862	ENSNLEG00000014450	URB2	90	34.909	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000009254	urb2	87	45.622	ENSMEUG00000016434	URB2	85	45.622	Notamacropus_eugenii
ENSACLG00000009254	urb2	87	37.307	ENSOPRG00000009906	URB2	78	37.307	Ochotona_princeps
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.435	ENSODEG00000005593	URB2	90	35.533	Octodon_degus
ENSACLG00000009254	urb2	98	88.319	ENSONIG00000017078	urb2	92	88.319	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000009254	urb2	93	33.098	ENSOANG00000013732	URB2	88	33.217	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACLG00000009254	urb2	95	34.925	ENSOCUG00000010700	URB2	90	35.021	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000009254	urb2	100	61.057	ENSORLG00000010915	urb2	93	61.187	Oryzias_latipes
ENSACLG00000009254	urb2	100	61.187	ENSORLG00020003361	urb2	91	61.187	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000009254	urb2	100	60.861	ENSORLG00015001534	urb2	91	60.861	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000009254	urb2	100	61.151	ENSOMEG00000010076	urb2	91	61.347	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000009254	urb2	95	33.902	ENSOGAG00000003021	URB2	90	34.151	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000009254	urb2	95	34.986	ENSOARG00000003102	URB2	89	34.917	Ovis_aries
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.057	ENSPPAG00000040629	URB2	90	35.235	Pan_paniscus
ENSACLG00000009254	urb2	95	34.530	ENSPPRG00000012767	URB2	89	34.852	Panthera_pardus
ENSACLG00000009254	urb2	95	34.708	ENSPTIG00000012577	URB2	93	35.027	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000009254	urb2	95	34.946	ENSPTRG00000002092	URB2	90	35.235	Pan_troglodytes
ENSACLG00000009254	urb2	95	34.164	ENSPANG00000002245	URB2	89	34.099	Papio_anubis
ENSACLG00000009254	urb2	94	43.182	ENSPKIG00000005787	urb2	89	43.251	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000009254	urb2	95	36.642	ENSPSIG00000002690	URB2	89	36.692	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000009254	urb2	91	32.717	ENSPEMG00000019551	Urb2	89	32.765	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000009254	urb2	94	35.533	ENSPCIG00000030071	URB2	89	35.695	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000009254	urb2	100	60.343	ENSPFOG00000014330	urb2	91	60.079	Poecilia_formosa
ENSACLG00000009254	urb2	100	60.382	ENSPLAG00000014654	urb2	91	60.119	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000009254	urb2	100	60.672	ENSPMEG00000012356	urb2	91	60.408	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000009254	urb2	100	60.343	ENSPREG00000010268	urb2	91	60.079	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.137	ENSPPYG00000000123	URB2	89	35.117	Pongo_abelii
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.202	ENSPCOG00000023537	URB2	90	35.230	Propithecus_coquereli
ENSACLG00000009254	urb2	96	32.273	ENSPVAG00000002108	URB2	90	32.273	Pteropus_vampyrus
ENSACLG00000009254	urb2	100	98.870	ENSPNYG00000016840	urb2	100	98.870	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000009254	urb2	94	43.266	ENSPNAG00000013684	urb2	89	43.057	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000009254	urb2	95	34.345	ENSRNOG00000026853	Urb2	87	34.457	Rattus_norvegicus
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.198	ENSRBIG00000037937	URB2	90	35.270	Rhinopithecus_bieti
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.266	ENSRROG00000039854	URB2	90	35.338	Rhinopithecus_roxellana
ENSACLG00000009254	urb2	95	35.374	ENSSBOG00000023055	URB2	90	35.198	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACLG00000009254	urb2	94	34.955	ENSSHAG00000014735	URB2	89	35.161	Sarcophilus_harrisii
ENSACLG00000009254	urb2	95	43.133	ENSSFOG00015015432	urb2	90	43.271	Scleropages_formosus
ENSACLG00000009254	urb2	100	65.876	ENSSMAG00000004984	urb2	100	65.683	Scophthalmus_maximus
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ENSACLG00000009254	urb2	100	71.873	ENSSPAG00000013632	urb2	91	71.743	Stegastes_partitus
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ENSACLG00000009254	urb2	95	34.270	ENSVVUG00000006747	URB2	92	34.452	Vulpes_vulpes
ENSACLG00000009254	urb2	94	32.880	ENSXETG00000023331	urb2	89	32.812	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000009254	urb2	100	59.552	ENSXMAG00000015059	urb2	91	59.289	Xiphophorus_maculatus