EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000009631 (Gene tree)
Gene ID: 113014366
Gene Symbol: celf3a
Alias: celf3|etr-1|etr1|tnrc4
Full Name: cugbp%2C Elav-like family member 3a
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 32856 bases
Position: chr22:11952193-11985048
Accession: ZDB-GENE-000501-2
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000014106	RRM_1	PF00076.22	6.3e-40	1	2
ENSACLP00000014106	RRM_1	PF00076.22	6.3e-40	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000014449	-	1266	-	ENSACLP00000014106	421 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000009631	celf3a	77	97.619	ENSACLG00000016215	si:dkey-205h23.2	89	97.619
ENSACLG00000009631	celf3a	95	44.686	ENSACLG00000003085	-	96	43.961
ENSACLG00000009631	celf3a	51	41.860	ENSACLG00000018260	elavl3	74	41.860
ENSACLG00000009631	celf3a	54	60.563	ENSACLG00000010181	-	97	43.868
ENSACLG00000009631	celf3a	95	42.534	ENSACLG00000013768	-	97	44.318
ENSACLG00000009631	celf3a	97	83.051	ENSACLG00000020342	celf3b	98	83.051
ENSACLG00000009631	celf3a	50	41.975	ENSACLG00000002715	ELAVL2	65	41.975
ENSACLG00000009631	celf3a	97	60.095	ENSACLG00000023709	celf5a	84	60.808
ENSACLG00000009631	celf3a	94	35.632	ENSACLG00000002786	elavl4	83	35.632
ENSACLG00000009631	celf3a	97	66.024	ENSACLG00000011828	celf4	82	66.106

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000009631	celf3a	97	74.588	ENSG00000159409	CELF3	98	74.413	Homo_sapiens
ENSACLG00000009631	celf3a	89	80.267	ENSAPOG00000000910	celf3b	89	80.267	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	93.187	ENSAPOG00000006015	celf3a	96	90.305	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	73.412	ENSAMEG00000000509	CELF3	95	73.176	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000009631	celf3a	97	83.293	ENSACIG00000007698	celf3b	98	83.293	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	88.136	ENSACIG00000010932	celf3a	91	88.136	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	73.123	ENSAOCG00000007824	celf3b	98	73.123	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000009631	celf3a	97	93.431	ENSAOCG00000020552	celf3a	91	93.431	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000009631	celf3a	98	82.212	ENSAPEG00000007642	celf3b	91	82.567	Amphiprion_percula
ENSACLG00000009631	celf3a	97	93.431	ENSAPEG00000008728	celf3a	91	93.431	Amphiprion_percula
ENSACLG00000009631	celf3a	97	84.390	ENSATEG00000023560	celf3b	90	84.390	Anabas_testudineus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	92.457	ENSATEG00000008884	celf3a	98	74.453	Anabas_testudineus
ENSACLG00000009631	celf3a	86	60.870	ENSACAG00000016959	-	99	60.870	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000009631	celf3a	97	75.355	ENSANAG00000030590	CELF3	99	71.625	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000009631	celf3a	86	84.066	ENSAMXG00000012489	celf3b	96	83.791	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000009631	celf3a	86	92.857	ENSAMXG00000009926	celf3a	97	92.857	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	74.941	ENSBTAG00000019131	CELF3	98	74.941	Bos_taurus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	74.178	ENSCJAG00000007857	CELF3	98	74.178	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000009631	celf3a	69	55.892	ENSCJAG00000039430	-	60	55.892	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	74.941	ENSCAFG00000012794	CELF3	82	74.941	Canis_familiaris
ENSACLG00000009631	celf3a	97	72.000	ENSCAFG00020009731	CELF3	98	72.235	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000009631	celf3a	97	75.177	ENSCHIG00000025847	CELF3	98	75.177	Capra_hircus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	72.143	ENSTSYG00000033066	CELF3	98	72.143	Carlito_syrichta
ENSACLG00000009631	celf3a	97	60.093	ENSCAPG00000015341	CELF3	98	59.629	Cavia_aperea
ENSACLG00000009631	celf3a	97	74.941	ENSCPOG00000003539	CELF3	98	74.941	Cavia_porcellus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	74.178	ENSCCAG00000024686	CELF3	98	74.178	Cebus_capucinus
ENSACLG00000009631	celf3a	96	61.557	ENSCATG00000044494	-	81	61.408	Cercocebus_atys
ENSACLG00000009631	celf3a	97	74.941	ENSCATG00000030846	CELF3	98	75.177	Cercocebus_atys
ENSACLG00000009631	celf3a	97	74.941	ENSCLAG00000000586	CELF3	98	74.941	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000009631	celf3a	86	77.128	ENSCSAG00000001812	CELF3	96	77.128	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	77.427	ENSCPBG00000008870	CELF3	91	77.184	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000009631	celf3a	97	75.118	ENSCANG00000038866	CELF3	98	75.355	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000009631	celf3a	72	54.459	ENSCGRG00001002551	Celf5	78	54.341	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000009631	celf3a	97	70.133	ENSCGRG00001019777	Celf3	99	70.354	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000009631	celf3a	97	70.133	ENSCGRG00000015342	Celf3	99	70.354	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000009631	celf3a	97	92.944	ENSCSEG00000007913	celf3a	91	92.944	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000009631	celf3a	97	82.494	ENSCSEG00000002581	celf3b	98	82.494	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000009631	celf3a	97	93.171	ENSCVAG00000018056	celf3a	98	93.171	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	82.014	ENSCVAG00000009184	celf3b	98	82.014	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	89.512	ENSDARG00000034668	celf3a	98	89.512	Danio_rerio
ENSACLG00000009631	celf3a	97	75.787	ENSDARG00000006983	celf3b	99	78.512	Danio_rerio
ENSACLG00000009631	celf3a	97	75.179	ENSDNOG00000041501	CELF3	98	75.656	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	72.706	ENSDORG00000002488	Celf3	99	72.706	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000009631	celf3a	97	74.413	ENSEASG00005005254	CELF3	98	74.413	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	75.177	ENSECAG00000020365	CELF3	98	75.414	Equus_caballus
ENSACLG00000009631	celf3a	66	77.876	ENSEEUG00000010622	CELF3	67	77.876	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	75.917	ENSELUG00000013477	celf3b	99	76.147	Esox_lucius
ENSACLG00000009631	celf3a	97	85.888	ENSELUG00000006121	celf3a	96	88.089	Esox_lucius
ENSACLG00000009631	celf3a	97	74.528	ENSFCAG00000007908	CELF3	98	74.528	Felis_catus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	74.292	ENSFDAG00000011452	CELF3	98	74.292	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000009631	celf3a	97	82.809	ENSFHEG00000021947	celf3b	98	82.809	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	87.591	ENSFHEG00000012530	celf3a	91	87.591	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	71.256	ENSGMOG00000006107	celf3b	89	71.256	Gadus_morhua
ENSACLG00000009631	celf3a	97	73.723	ENSGMOG00000002937	celf3a	98	73.723	Gadus_morhua
ENSACLG00000009631	celf3a	97	67.981	ENSGALG00000028478	CELF3	98	70.120	Gallus_gallus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	92.927	ENSGAFG00000004128	celf3a	96	92.500	Gambusia_affinis
ENSACLG00000009631	celf3a	97	81.295	ENSGAFG00000012731	celf3b	98	81.295	Gambusia_affinis
ENSACLG00000009631	celf3a	97	87.105	ENSGACG00000003274	celf3a	91	87.105	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	81.687	ENSGACG00000011707	celf3b	98	81.687	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	65.542	ENSGAGG00000019676	CELF3	98	64.337	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000009631	celf3a	86	77.540	ENSGGOG00000023049	-	96	77.540	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000009631	celf3a	97	74.588	ENSGGOG00000021973	-	98	74.588	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000009631	celf3a	95	61.614	ENSGGOG00000041211	CELF5	100	61.463	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000009631	celf3a	97	82.734	ENSHBUG00000003367	celf3b	98	82.734	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000009631	celf3a	97	94.161	ENSHBUG00000001061	celf3a	91	94.161	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000009631	celf3a	97	74.353	ENSHGLG00000006045	CELF3	98	74.353	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000009631	celf3a	97	74.353	ENSHGLG00100008013	CELF3	98	74.353	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000009631	celf3a	86	85.676	ENSHCOG00000000397	celf3b	96	85.676	Hippocampus_comes
ENSACLG00000009631	celf3a	97	77.561	ENSHCOG00000005746	celf3a	90	78.049	Hippocampus_comes
ENSACLG00000009631	celf3a	97	89.512	ENSIPUG00000008218	celf3a	87	89.512	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	74.764	ENSSTOG00000022934	CELF3	98	74.764	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	69.079	ENSJJAG00000020104	Celf3	99	69.079	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000009631	celf3a	68	55.973	ENSJJAG00000006902	Celf5	73	55.973	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000009631	celf3a	86	87.052	ENSKMAG00000001269	celf3b	84	87.052	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	92.927	ENSKMAG00000011999	celf3a	91	92.927	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	82.039	ENSLBEG00000026140	celf3b	91	82.039	Labrus_bergylta
ENSACLG00000009631	celf3a	97	88.725	ENSLBEG00000026936	celf3a	90	88.725	Labrus_bergylta
ENSACLG00000009631	celf3a	97	76.923	ENSLACG00000002301	CELF3	98	78.846	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000009631	celf3a	90	81.984	ENSLOCG00000006518	celf3b	100	81.984	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	67.991	ENSLAFG00000030147	CELF3	99	68.182	Loxodonta_africana
ENSACLG00000009631	celf3a	97	73.550	ENSMFAG00000040182	CELF3	99	73.550	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000009631	celf3a	95	61.614	ENSMFAG00000022580	-	100	61.463	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000009631	celf3a	97	74.065	ENSMMUG00000016952	CELF3	96	76.316	Macaca_mulatta
ENSACLG00000009631	celf3a	99	59.198	ENSMMUG00000015513	-	90	59.709	Macaca_mulatta
ENSACLG00000009631	celf3a	69	55.892	ENSMNEG00000001853	-	76	56.855	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000009631	celf3a	97	73.550	ENSMNEG00000044120	CELF3	99	73.550	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000009631	celf3a	97	74.764	ENSMLEG00000028006	CELF3	98	75.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	82.494	ENSMAMG00000015079	celf3b	98	82.494	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	92.944	ENSMAMG00000001436	celf3a	91	87.835	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	94.390	ENSMZEG00005026501	celf3a	91	94.390	Maylandia_zebra
ENSACLG00000009631	celf3a	97	83.051	ENSMZEG00005016013	celf3b	98	83.051	Maylandia_zebra
ENSACLG00000009631	celf3a	97	75.297	ENSMAUG00000007850	Celf3	98	74.941	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000009631	celf3a	72	54.459	ENSMAUG00000020336	Celf5	78	54.341	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	74.588	ENSMICG00000010644	CELF3	98	74.588	Microcebus_murinus
ENSACLG00000009631	celf3a	97	73.832	ENSMOCG00000001878	Celf3	99	73.832	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000009631	celf3a	72	54.633	ENSMOCG00000005573	Celf5	78	54.516	Microtus_ochrogaster
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ENSACLG00000009631	celf3a	86	60.440	ENSMODG00000019151	-	95	60.165	Monodelphis_domestica
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