EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000009780 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5248 bases
Position: chrLS419828.1:49026-54273
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000014342	MMR_HSR1	PF01926.23	3.1e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000014686	-	975	-	ENSACLP00000014342	324 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000009780	-	73	43.697	ENSACLG00000001936	-	84	43.933
ENSACLG00000009780	-	71	59.914	ENSACLG00000005232	-	87	59.914
ENSACLG00000009780	-	74	43.210	ENSACLG00000026926	-	80	43.210
ENSACLG00000009780	-	68	46.500	ENSACLG00000017459	-	94	46.500
ENSACLG00000009780	-	60	31.633	ENSACLG00000000859	-	70	31.633
ENSACLG00000009780	-	72	43.689	ENSACLG00000008397	-	86	43.689
ENSACLG00000009780	-	65	43.602	ENSACLG00000023525	-	69	43.602
ENSACLG00000009780	-	52	35.088	ENSACLG00000011541	-	76	35.088
ENSACLG00000009780	-	82	36.330	ENSACLG00000011913	-	77	36.330
ENSACLG00000009780	-	90	82.253	ENSACLG00000004980	-	56	82.759
ENSACLG00000009780	-	80	40.458	ENSACLG00000011599	-	96	40.458
ENSACLG00000009780	-	70	34.746	ENSACLG00000001869	-	64	34.746
ENSACLG00000009780	-	65	48.095	ENSACLG00000016904	-	89	46.581
ENSACLG00000009780	-	78	55.686	ENSACLG00000005220	-	61	55.686
ENSACLG00000009780	-	62	35.122	ENSACLG00000016242	-	66	35.122
ENSACLG00000009780	-	56	35.870	ENSACLG00000023539	-	65	35.870
ENSACLG00000009780	-	62	67.327	ENSACLG00000011905	-	85	64.253
ENSACLG00000009780	-	59	45.361	ENSACLG00000003401	-	79	45.361
ENSACLG00000009780	-	56	35.870	ENSACLG00000011585	-	88	35.870
ENSACLG00000009780	-	62	45.274	ENSACLG00000023760	-	84	45.274
ENSACLG00000009780	-	79	54.231	ENSACLG00000005669	-	92	54.231
ENSACLG00000009780	-	63	40.686	ENSACLG00000003393	-	80	40.686
ENSACLG00000009780	-	63	30.841	ENSACLG00000016272	-	78	30.841
ENSACLG00000009780	-	76	46.696	ENSACLG00000011804	-	84	46.696
ENSACLG00000009780	-	63	45.854	ENSACLG00000023766	zgc:113625	85	45.854
ENSACLG00000009780	-	71	36.475	ENSACLG00000001896	-	66	36.475
ENSACLG00000009780	-	72	35.060	ENSACLG00000001892	-	52	34.661
ENSACLG00000009780	-	62	46.000	ENSACLG00000023555	-	84	46.000
ENSACLG00000009780	-	95	94.839	ENSACLG00000009774	-	84	94.839
ENSACLG00000009780	-	73	46.218	ENSACLG00000016872	-	85	46.218
ENSACLG00000009780	-	72	43.333	ENSACLG00000016933	-	79	43.333
ENSACLG00000009780	-	69	37.872	ENSACLG00000017422	-	65	37.872
ENSACLG00000009780	-	71	36.100	ENSACLG00000001886	-	77	36.100
ENSACLG00000009780	-	67	43.578	ENSACLG00000023747	-	87	43.578
ENSACLG00000009780	-	58	44.560	ENSACLG00000003276	-	72	44.560
ENSACLG00000009780	-	60	35.610	ENSACLG00000023161	-	90	35.610
ENSACLG00000009780	-	69	46.460	ENSACLG00000025976	-	74	45.344
ENSACLG00000009780	-	77	36.508	ENSACLG00000014795	-	79	36.508
ENSACLG00000009780	-	65	48.571	ENSACLG00000001954	-	81	46.809
ENSACLG00000009780	-	63	36.150	ENSACLG00000017433	-	77	36.150
ENSACLG00000009780	-	79	45.022	ENSACLG00000010048	-	87	45.022
ENSACLG00000009780	-	67	45.000	ENSACLG00000003262	-	78	46.154
ENSACLG00000009780	-	60	35.385	ENSACLG00000023570	-	85	35.385
ENSACLG00000009780	-	74	43.154	ENSACLG00000027607	-	73	43.154
ENSACLG00000009780	-	70	45.815	ENSACLG00000001968	-	81	45.374
ENSACLG00000009780	-	64	44.712	ENSACLG00000021967	-	74	43.750
ENSACLG00000009780	-	78	54.724	ENSACLG00000024836	-	93	54.724
ENSACLG00000009780	-	72	43.777	ENSACLG00000008006	-	66	42.041
ENSACLG00000009780	-	79	55.556	ENSACLG00000024857	-	56	55.556
ENSACLG00000009780	-	86	58.929	ENSACLG00000024854	-	86	62.121
ENSACLG00000009780	-	61	31.553	ENSACLG00000016327	-	76	31.553
ENSACLG00000009780	-	69	37.657	ENSACLG00000006534	-	64	37.657
ENSACLG00000009780	-	72	46.186	ENSACLG00000001976	-	82	46.186
ENSACLG00000009780	-	56	62.703	ENSACLG00000005319	-	84	62.703
ENSACLG00000009780	-	64	44.444	ENSACLG00000021976	-	66	42.259
ENSACLG00000009780	-	78	34.470	ENSACLG00000001800	-	76	32.917
ENSACLG00000009780	-	81	56.654	ENSACLG00000005659	-	83	57.752
ENSACLG00000009780	-	90	58.333	ENSACLG00000012195	-	69	58.333
ENSACLG00000009780	-	67	46.789	ENSACLG00000011572	-	87	46.789
ENSACLG00000009780	-	70	38.494	ENSACLG00000003763	-	70	38.494
ENSACLG00000009780	-	72	34.263	ENSACLG00000001909	-	75	33.865
ENSACLG00000009780	-	72	32.068	ENSACLG00000007976	-	86	32.068
ENSACLG00000009780	-	62	45.771	ENSACLG00000011578	-	84	45.771
ENSACLG00000009780	-	64	45.192	ENSACLG00000021959	-	74	43.333
ENSACLG00000009780	-	50	34.545	ENSACLG00000023728	-	75	34.545
ENSACLG00000009780	-	78	42.023	ENSACLG00000008599	-	82	42.023
ENSACLG00000009780	-	66	40.826	ENSACLG00000016235	-	60	40.826
ENSACLG00000009780	-	68	46.575	ENSACLG00000023502	-	89	46.789
ENSACLG00000009780	-	59	36.458	ENSACLG00000023509	-	84	36.458
ENSACLG00000009780	-	71	48.291	ENSACLG00000008592	-	88	48.291
ENSACLG00000009780	-	73	35.865	ENSACLG00000001927	-	78	35.865
ENSACLG00000009780	-	64	37.156	ENSACLG00000001790	-	72	37.156
ENSACLG00000009780	-	60	37.436	ENSACLG00000023739	-	84	37.949
ENSACLG00000009780	-	60	31.633	ENSACLG00000001341	-	51	31.633
ENSACLG00000009780	-	66	32.870	ENSACLG00000016222	-	76	33.180
ENSACLG00000009780	-	65	43.868	ENSACLG00000023600	-	85	43.868
ENSACLG00000009780	-	56	36.598	ENSACLG00000003298	-	87	36.598
ENSACLG00000009780	-	73	44.068	ENSACLG00000003290	-	90	44.068
ENSACLG00000009780	-	63	58.852	ENSACLG00000005066	-	88	53.036
ENSACLG00000009780	-	78	37.354	ENSACLG00000011921	-	86	37.354
ENSACLG00000009780	-	63	36.150	ENSACLG00000003776	-	77	36.150
ENSACLG00000009780	-	65	60.664	ENSACLG00000004543	-	93	60.444

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000009780	-	89	64.828	ENSAPOG00000009034	-	52	64.828	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000009780	-	80	55.212	ENSAPOG00000001447	-	87	55.212	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000009780	-	89	63.265	ENSAPOG00000017368	-	52	63.265	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000009780	-	89	62.585	ENSAPOG00000008987	-	51	62.585	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000009780	-	79	70.196	ENSACIG00000012718	-	89	79.621	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000009780	-	77	57.312	ENSACIG00000012648	-	85	57.312	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000009780	-	78	58.268	ENSACIG00000007191	-	71	58.268	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000009780	-	64	63.592	ENSAOCG00000002389	-	64	63.592	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000009780	-	64	58.673	ENSAOCG00000013686	-	90	58.673	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000009780	-	82	55.794	ENSAOCG00000022545	-	75	54.965	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000009780	-	88	57.544	ENSAOCG00000001095	-	55	57.544	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000009780	-	84	55.882	ENSAPEG00000021634	-	84	58.730	Amphiprion_percula
ENSACLG00000009780	-	75	64.876	ENSATEG00000011352	-	62	64.876	Anabas_testudineus
ENSACLG00000009780	-	79	58.301	ENSATEG00000011336	-	67	58.301	Anabas_testudineus
ENSACLG00000009780	-	85	52.143	ENSATEG00000012058	-	68	50.178	Anabas_testudineus
ENSACLG00000009780	-	77	74.502	ENSATEG00000011735	-	67	74.502	Anabas_testudineus
ENSACLG00000009780	-	77	45.635	ENSAMXG00000030288	-	69	45.635	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000009780	-	78	49.799	ENSAMXG00000030783	-	72	49.799	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000009780	-	78	47.826	ENSAMXG00000024930	-	84	47.826	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000009780	-	74	42.149	ENSAMXG00000036745	-	82	42.149	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000009780	-	83	44.326	ENSAMXG00000041224	-	50	44.014	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000009780	-	69	47.085	ENSAMXG00000030926	-	67	46.444	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000009780	-	77	35.971	ENSAMXG00000030715	-	63	39.095	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000009780	-	97	48.819	ENSAMXG00000037741	-	99	48.819	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000009780	-	60	45.361	ENSAMXG00000039685	-	83	45.361	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000009780	-	54	50.575	ENSAMXG00000030826	-	85	50.575	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000009780	-	83	52.612	ENSCVAG00000018481	-	64	52.612	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000009780	-	78	51.477	ENSDARG00000086048	si:ch211-229i14.2	80	50.000	Danio_rerio
ENSACLG00000009780	-	89	46.181	ENSELUG00000015135	-	70	41.958	Esox_lucius
ENSACLG00000009780	-	89	50.000	ENSELUG00000015076	si:ch211-229i14.2	59	50.000	Esox_lucius
ENSACLG00000009780	-	87	50.709	ENSELUG00000015106	-	69	50.709	Esox_lucius
ENSACLG00000009780	-	89	48.973	ENSELUG00000005405	-	78	52.590	Esox_lucius
ENSACLG00000009780	-	60	53.571	ENSFHEG00000021828	-	84	53.571	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000009780	-	82	58.052	ENSFHEG00000013865	-	58	56.537	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000009780	-	81	54.753	ENSFHEG00000000207	-	55	54.753	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000009780	-	86	51.590	ENSFHEG00000011334	-	70	51.590	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000009780	-	73	55.417	ENSFHEG00000019202	-	58	55.245	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000009780	-	65	31.556	ENSFHEG00000007909	-	79	31.416	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000009780	-	63	31.250	ENSGMOG00000006359	-	93	31.250	Gadus_morhua
ENSACLG00000009780	-	75	60.086	ENSGAFG00000015999	-	62	60.086	Gambusia_affinis
ENSACLG00000009780	-	78	50.394	ENSGAFG00000001852	-	62	50.000	Gambusia_affinis
ENSACLG00000009780	-	98	56.122	ENSGAFG00000015917	-	75	56.122	Gambusia_affinis
ENSACLG00000009780	-	85	55.290	ENSGACG00000013107	-	80	55.290	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000009780	-	67	60.550	ENSGACG00000002627	-	98	57.143	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000009780	-	65	58.685	ENSHBUG00000000157	-	88	55.602	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000009780	-	75	58.678	ENSHBUG00000002999	-	87	58.678	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000009780	-	76	60.324	ENSHBUG00000006928	-	77	60.324	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000009780	-	90	58.333	ENSHBUG00000010247	-	69	58.333	Haplochromis_burtoni
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