EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000010007 (Gene tree)
Gene ID: 113018119
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC113018119
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4478 bases
Position: chrLS419796.1:33936-38413
Accession: 113018119
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000014680	MMR_HSR1	PF01926.23	5.3e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000015032	-	2131	-	ENSACLP00000014680	645 (aa)	XP_026016962	UPI000E403CF6

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000010007	-	73	65.714	ENSACLG00000006538	-	94	65.714
ENSACLG00000010007	-	70	37.267	ENSACLG00000023474	-	86	36.853
ENSACLG00000010007	-	73	36.328	ENSACLG00000023481	-	90	36.257
ENSACLG00000010007	-	64	64.264	ENSACLG00000009330	-	85	64.264
ENSACLG00000010007	-	76	61.961	ENSACLG00000009261	-	96	61.961
ENSACLG00000010007	-	70	35.425	ENSACLG00000023468	-	83	34.818
ENSACLG00000010007	-	51	39.489	ENSACLG00000023033	-	89	39.205
ENSACLG00000010007	-	74	54.694	ENSACLG00000018271	-	90	54.694
ENSACLG00000010007	-	74	56.379	ENSACLG00000018599	-	94	56.379
ENSACLG00000010007	-	72	60.421	ENSACLG00000006543	-	88	60.499
ENSACLG00000010007	-	68	64.286	ENSACLG00000006285	-	96	64.286
ENSACLG00000010007	-	71	64.548	ENSACLG00000017259	-	91	64.548
ENSACLG00000010007	-	58	58.312	ENSACLG00000015361	-	96	58.312
ENSACLG00000010007	-	69	34.839	ENSACLG00000023126	-	88	35.118
ENSACLG00000010007	-	72	59.834	ENSACLG00000021761	-	89	59.834

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000010007	-	76	57.822	ENSAPOG00000005726	-	93	57.822	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010007	-	67	34.773	ENSAPOG00000016636	-	92	34.773	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010007	-	76	57.312	ENSAPOG00000021040	-	84	57.312	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010007	-	75	57.086	ENSAPOG00000005749	-	92	57.086	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010007	-	58	60.614	ENSACIG00000023712	-	97	60.614	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010007	-	76	60.971	ENSACIG00000010569	-	94	60.583	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010007	-	75	61.952	ENSACIG00000008585	-	97	61.952	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010007	-	76	60.750	ENSACIG00000001022	-	94	60.750	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010007	-	74	58.384	ENSACIG00000021882	-	93	58.266	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010007	-	78	61.122	ENSACIG00000021889	-	93	61.122	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010007	-	74	62.097	ENSACIG00000002240	-	93	62.903	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010007	-	78	58.745	ENSACIG00000012148	-	96	58.745	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010007	-	74	59.921	ENSACIG00000003168	-	94	59.921	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010007	-	75	60.400	ENSACIG00000021449	-	92	60.400	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010007	-	75	60.729	ENSACIG00000014973	-	94	60.729	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010007	-	66	33.630	ENSACIG00000022269	-	75	33.630	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010007	-	76	62.745	ENSACIG00000008256	-	94	62.992	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010007	-	76	56.349	ENSACIG00000008246	-	91	55.952	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010007	-	74	58.635	ENSACIG00000003888	-	93	58.635	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010007	-	74	62.151	ENSACIG00000023726	-	94	62.151	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010007	-	71	38.223	ENSACIG00000009814	-	87	37.810	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010007	-	76	58.869	ENSACIG00000014961	-	94	58.869	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010007	-	75	58.218	ENSACIG00000014898	-	91	58.218	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010007	-	75	62.351	ENSACIG00000014982	-	94	63.347	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010007	-	75	58.233	ENSAPEG00000000062	-	93	58.233	Amphiprion_percula
ENSACLG00000010007	-	75	57.200	ENSATEG00000012558	-	93	57.200	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010007	-	75	59.839	ENSATEG00000023346	-	92	59.839	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010007	-	75	57.430	ENSATEG00000019965	-	93	57.430	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010007	-	75	52.104	ENSATEG00000017635	-	92	52.104	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010007	-	70	32.929	ENSAMXG00000035937	-	87	32.929	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010007	-	74	37.751	ENSAMXG00000041770	-	91	37.550	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010007	-	74	52.174	ENSAMXG00000030535	-	92	49.758	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010007	-	66	33.843	ENSAMXG00000036353	-	78	33.843	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010007	-	76	36.811	ENSAMXG00000037920	-	95	38.788	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010007	-	69	43.396	ENSAMXG00000029346	-	90	43.004	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010007	-	71	39.463	ENSAMXG00000039672	-	92	39.463	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010007	-	70	40.928	ENSAMXG00000033407	-	90	40.295	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010007	-	73	38.327	ENSAMXG00000032695	-	93	38.132	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010007	-	76	39.245	ENSAMXG00000034407	-	95	39.057	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010007	-	77	53.191	ENSCVAG00000007256	-	97	53.191	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000010007	-	75	53.293	ENSCVAG00000007251	-	98	53.293	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000010007	-	77	48.638	ENSCVAG00000000224	-	86	49.027	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000010007	-	66	34.889	ENSCVAG00000015205	-	80	34.222	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000010007	-	74	50.101	ENSCVAG00000006308	-	90	49.091	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000010007	-	68	57.616	ENSCVAG00000005819	-	98	57.616	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000010007	-	75	55.289	ENSCVAG00000007803	-	95	55.289	Cyprinodon_variegatus
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ENSACLG00000010007	-	50	56.509	ENSCVAG00000022676	-	100	56.213	Cyprinodon_variegatus
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ENSACLG00000010007	-	72	57.917	ENSCVAG00000007831	-	97	56.016	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000010007	-	76	62.112	ENSCVAG00000007794	-	96	62.112	Cyprinodon_variegatus
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ENSACLG00000010007	-	73	40.040	ENSDARG00000078093	zgc:172065	92	40.040	Danio_rerio
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ENSACLG00000010007	-	67	34.292	ENSEBUG00000008009	zgc:171695	81	33.850	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000010007	-	73	46.843	ENSELUG00000009603	-	94	46.843	Esox_lucius
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ENSACLG00000010007	-	74	51.509	ENSFHEG00000012343	-	97	51.509	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000010007	-	77	56.175	ENSFHEG00000006411	-	95	56.175	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000010007	-	74	53.226	ENSFHEG00000016342	-	97	53.226	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000010007	-	67	37.716	ENSFHEG00000021963	-	86	37.284	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000010007	-	75	55.467	ENSFHEG00000006385	-	92	55.467	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000010007	-	75	54.582	ENSFHEG00000006408	-	95	54.382	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000010007	-	79	32.969	ENSGMOG00000017552	-	92	32.969	Gadus_morhua
ENSACLG00000010007	-	69	36.229	ENSGMOG00000005680	-	79	36.229	Gadus_morhua
ENSACLG00000010007	-	70	32.238	ENSGMOG00000019825	-	98	32.640	Gadus_morhua
ENSACLG00000010007	-	69	36.638	ENSGMOG00000019330	-	79	36.638	Gadus_morhua
ENSACLG00000010007	-	66	32.880	ENSGMOG00000008232	-	94	32.653	Gadus_morhua
ENSACLG00000010007	-	70	34.820	ENSGMOG00000011319	-	91	34.820	Gadus_morhua
ENSACLG00000010007	-	76	54.724	ENSGAFG00000005032	-	93	54.724	Gambusia_affinis
ENSACLG00000010007	-	76	54.343	ENSGAFG00000005023	-	94	54.000	Gambusia_affinis
ENSACLG00000010007	-	57	57.592	ENSGACG00000005035	-	96	57.743	Gasterosteus_aculeatus
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