EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000010042 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5017 bases
Position: chrLS419796.1:206555-211571
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000014734	RVT_1	PF00078.27	8.3e-17	1	1
ENSACLP00000014734	zf-CCHC	PF00098.23	1.2e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000015085	-	5017	-	ENSACLP00000014734	1236 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000010042	-	63	38.401	ENSACLG00000013572	-	54	36.910
ENSACLG00000010042	-	90	38.732	ENSACLG00000026879	-	76	38.732
ENSACLG00000010042	-	65	90.706	ENSACLG00000015735	-	99	90.706
ENSACLG00000010042	-	89	31.466	ENSACLG00000014870	-	73	31.466
ENSACLG00000010042	-	85	34.475	ENSACLG00000018060	-	71	34.475
ENSACLG00000010042	-	50	46.377	ENSACLG00000016581	-	58	44.395
ENSACLG00000010042	-	94	36.693	ENSACLG00000017161	-	72	39.011
ENSACLG00000010042	-	89	31.466	ENSACLG00000000499	-	73	31.466
ENSACLG00000010042	-	69	38.880	ENSACLG00000002180	-	57	38.880
ENSACLG00000010042	-	68	85.476	ENSACLG00000000367	-	92	85.476
ENSACLG00000010042	-	89	31.466	ENSACLG00000017808	-	73	31.466
ENSACLG00000010042	-	57	36.799	ENSACLG00000018181	-	76	36.799
ENSACLG00000010042	-	96	99.747	ENSACLG00000014619	-	81	99.747
ENSACLG00000010042	-	78	40.409	ENSACLG00000001563	-	98	40.409
ENSACLG00000010042	-	89	30.998	ENSACLG00000027291	-	74	31.162
ENSACLG00000010042	-	68	99.405	ENSACLG00000027730	-	76	99.405
ENSACLG00000010042	-	90	38.774	ENSACLG00000024091	-	75	38.774
ENSACLG00000010042	-	57	81.000	ENSACLG00000022183	-	98	81.000
ENSACLG00000010042	-	96	99.747	ENSACLG00000019876	-	81	99.747
ENSACLG00000010042	-	54	99.406	ENSACLG00000004062	-	92	99.406
ENSACLG00000010042	-	90	38.774	ENSACLG00000009628	-	75	38.774
ENSACLG00000010042	-	90	38.774	ENSACLG00000025719	-	75	38.774

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000010042	-	59	35.533	ENSAPOG00000013711	-	91	35.533	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010042	-	59	35.533	ENSAPOG00000013817	-	99	35.533	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010042	-	69	43.938	ENSAPOG00000012135	-	77	43.938	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010042	-	55	48.759	ENSAPOG00000008045	-	70	48.759	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010042	-	87	30.308	ENSAMXG00000038578	-	83	30.308	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010042	-	90	42.000	ENSAMXG00000030987	-	76	41.447	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010042	-	52	38.095	ENSAMXG00000043892	-	84	38.393	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010042	-	70	38.438	ENSAMXG00000030902	-	60	38.438	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010042	-	65	37.518	ENSAMXG00000031698	-	55	37.518	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010042	-	80	42.928	ENSAMXG00000038169	-	76	42.928	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010042	-	54	41.349	ENSCPBG00000011626	-	81	41.349	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000010042	-	51	37.631	ENSELUG00000000948	-	56	37.631	Esox_lucius
ENSACLG00000010042	-	78	35.644	ENSFHEG00000000971	-	86	35.545	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000010042	-	78	41.888	ENSGAGG00000025282	-	84	41.888	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000010042	-	62	42.584	ENSGAGG00000023170	-	77	42.584	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000010042	-	58	44.751	ENSGAGG00000014450	-	65	44.751	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000010042	-	62	42.389	ENSGAGG00000002373	-	83	42.823	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000010042	-	89	42.231	ENSGAGG00000022240	-	70	42.231	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000010042	-	54	40.000	ENSGAGG00000003017	-	85	40.456	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000010042	-	51	31.213	ENSKMAG00000018163	-	82	31.858	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000010042	-	56	34.610	ENSMAMG00000018393	-	67	34.610	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000010042	-	50	40.376	ENSMZEG00005000633	-	60	40.376	Maylandia_zebra
ENSACLG00000010042	-	88	39.050	ENSORLG00000025739	-	73	39.050	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010042	-	88	40.608	ENSORLG00000028795	-	73	40.608	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010042	-	87	38.214	ENSORLG00000024904	-	73	38.214	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010042	-	88	38.874	ENSORLG00000030265	-	73	38.874	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010042	-	88	40.519	ENSORLG00000030542	-	73	40.519	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010042	-	88	38.835	ENSORLG00000024220	-	73	38.835	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010042	-	89	30.827	ENSORLG00000026873	-	73	30.994	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010042	-	89	30.500	ENSORLG00000026629	-	73	30.667	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010042	-	55	47.186	ENSORLG00000029791	-	97	47.186	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010042	-	56	39.528	ENSORLG00000028632	-	68	39.286	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010042	-	95	37.728	ENSORLG00000026665	-	82	37.728	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010042	-	95	37.719	ENSORLG00000024233	-	82	37.719	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010042	-	88	38.874	ENSORLG00000027568	-	73	38.874	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010042	-	85	45.946	ENSORLG00000027831	-	69	45.946	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010042	-	59	37.252	ENSORLG00000026676	-	77	37.517	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010042	-	89	30.417	ENSORLG00000023181	-	73	30.583	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010042	-	95	37.689	ENSORLG00000026546	-	82	37.640	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010042	-	88	40.466	ENSORLG00000022369	-	77	40.466	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010042	-	88	40.751	ENSORLG00000028609	-	73	40.608	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010042	-	90	39.531	ENSORLG00020001422	-	75	39.531	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000010042	-	87	38.214	ENSORLG00020020268	-	74	38.214	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000010042	-	87	38.125	ENSORLG00020014203	-	72	38.125	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000010042	-	88	38.874	ENSORLG00020008293	-	73	38.874	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000010042	-	87	38.214	ENSORLG00020003869	-	72	38.214	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000010042	-	88	40.698	ENSORLG00015018878	-	73	40.555	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000010042	-	88	40.608	ENSORLG00015017778	-	73	40.608	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000010042	-	88	41.092	ENSOMEG00000003712	-	73	41.092	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000010042	-	86	46.140	ENSPSIG00000000767	-	79	46.140	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000010042	-	90	45.749	ENSPSIG00000000994	-	81	45.899	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000010042	-	92	45.142	ENSPSIG00000000489	-	81	45.272	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000010042	-	66	50.363	ENSPSIG00000000353	-	70	50.363	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000010042	-	69	40.830	ENSPMEG00000016355	-	74	40.830	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000010042	-	91	31.727	ENSPREG00000000390	-	77	31.727	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000010042	-	69	38.222	ENSPREG00000004954	-	57	38.222	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000010042	-	57	31.644	ENSPNAG00000022277	-	84	31.507	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000010042	-	80	39.831	ENSSDUG00000002460	-	82	39.831	Seriola_dumerili
ENSACLG00000010042	-	65	36.543	ENSSLDG00000004385	-	85	36.543	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000010042	-	76	35.463	ENSXMAG00000021298	-	59	35.425	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000010042	-	58	36.884	ENSXMAG00000030089	-	69	36.884	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000010042	-	87	31.520	ENSXMAG00000021213	-	74	31.520	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000010042	-	74	36.704	ENSXMAG00000023319	-	57	36.552	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000010042	-	87	31.606	ENSXMAG00000026594	-	74	31.606	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000010042	-	88	39.805	ENSXMAG00000030100	-	79	40.213	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000010042	-	88	39.805	ENSXMAG00000026031	-	73	40.124	Xiphophorus_maculatus