EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000010048 (Gene tree)
Gene ID: 113018079
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: GTPase IMAP family member 8-like
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8061 bases
Position: chrLS419796.1:236156-244216
Accession: 113018079
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000014745	MMR_HSR1	PF01926.23	1.1e-21	1	2
ENSACLP00000014745	MMR_HSR1	PF01926.23	1.1e-21	2	2
ENSACLP00000014773	MMR_HSR1	PF01926.23	5.9e-10	1	1
ENSACLP00000014753	MMR_HSR1	PF01926.23	1.9e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000015096	-	3155	-	ENSACLP00000014745	743 (aa)	XP_026016932	UPI000E429556
ENSACLT00000015094	-	900	-	ENSACLP00000014743	299 (aa)	-	-
ENSACLT00000015104	-	996	-	ENSACLP00000014753	331 (aa)	-	-
ENSACLT00000015124	-	753	-	ENSACLP00000014773	250 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000010048	-	92	57.209	ENSACLG00000001968	-	91	57.209
ENSACLG00000010048	-	80	36.181	ENSACLG00000007976	-	93	34.118
ENSACLG00000010048	-	93	37.668	ENSACLG00000006534	-	86	37.668
ENSACLG00000010048	-	88	40.991	ENSACLG00000003393	-	88	40.991
ENSACLG00000010048	-	81	47.343	ENSACLG00000011578	-	86	47.343
ENSACLG00000010048	-	81	47.805	ENSACLG00000011572	-	87	47.805
ENSACLG00000010048	-	75	34.783	ENSACLG00000023739	-	89	34.783
ENSACLG00000010048	-	84	36.019	ENSACLG00000016251	-	80	36.019
ENSACLG00000010048	-	82	51.415	ENSACLG00000016904	-	87	51.163
ENSACLG00000010048	-	90	56.140	ENSACLG00000008599	-	81	57.273
ENSACLG00000010048	-	87	45.022	ENSACLG00000009780	-	79	45.022
ENSACLG00000010048	-	88	35.211	ENSACLG00000001777	-	86	35.211
ENSACLG00000010048	-	88	49.339	ENSACLG00000008006	-	74	56.667
ENSACLG00000010048	-	80	49.510	ENSACLG00000012195	-	63	47.642
ENSACLG00000010048	-	70	34.659	ENSACLG00000011541	-	79	35.057
ENSACLG00000010048	-	73	30.682	ENSACLG00000023728	-	91	30.682
ENSACLG00000010048	-	85	41.463	ENSACLG00000011921	-	81	41.463
ENSACLG00000010048	-	80	64.500	ENSACLG00000025976	-	82	62.802
ENSACLG00000010048	-	88	78.037	ENSACLG00000016933	-	99	78.037
ENSACLG00000010048	-	88	40.291	ENSACLG00000011913	-	72	40.291
ENSACLG00000010048	-	72	36.994	ENSACLG00000023585	-	55	36.994
ENSACLG00000010048	-	87	44.796	ENSACLG00000005066	-	77	47.343
ENSACLG00000010048	-	84	33.641	ENSACLG00000016272	-	88	32.000
ENSACLG00000010048	-	73	35.227	ENSACLG00000011585	-	94	35.227
ENSACLG00000010048	-	59	66.438	ENSACLG00000003287	-	77	66.438
ENSACLG00000010048	-	88	67.980	ENSACLG00000026926	-	99	67.980
ENSACLG00000010048	-	84	59.135	ENSACLG00000027607	-	68	59.135
ENSACLG00000010048	-	91	66.010	ENSACLG00000011804	-	98	60.526
ENSACLG00000010048	-	80	47.783	ENSACLG00000021967	-	85	46.860
ENSACLG00000010048	-	83	65.128	ENSACLG00000017459	-	91	65.128
ENSACLG00000010048	-	84	33.641	ENSACLG00000016327	-	89	32.000
ENSACLG00000010048	-	78	49.495	ENSACLG00000021976	-	78	48.544
ENSACLG00000010048	-	73	49.727	ENSACLG00000005319	-	86	48.404
ENSACLG00000010048	-	82	48.077	ENSACLG00000011599	-	86	48.077
ENSACLG00000010048	-	79	36.269	ENSACLG00000001341	-	51	36.269
ENSACLG00000010048	-	81	48.309	ENSACLG00000011905	-	81	49.510
ENSACLG00000010048	-	84	44.595	ENSACLG00000003262	-	92	44.595
ENSACLG00000010048	-	79	35.233	ENSACLG00000000859	-	70	35.233
ENSACLG00000010048	-	88	36.715	ENSACLG00000003776	-	91	36.715
ENSACLG00000010048	-	80	46.535	ENSACLG00000021959	-	80	45.411
ENSACLG00000010048	-	83	47.087	ENSACLG00000004543	-	92	47.087
ENSACLG00000010048	-	80	47.525	ENSACLG00000023600	-	84	47.525
ENSACLG00000010048	-	82	51.232	ENSACLG00000016872	-	87	51.232
ENSACLG00000010048	-	81	45.366	ENSACLG00000005669	-	81	45.366
ENSACLG00000010048	-	81	49.519	ENSACLG00000024836	-	78	49.519
ENSACLG00000010048	-	90	39.726	ENSACLG00000001909	-	81	39.726
ENSACLG00000010048	-	94	39.269	ENSACLG00000003763	-	95	39.269
ENSACLG00000010048	-	76	38.418	ENSACLG00000023509	-	88	38.418
ENSACLG00000010048	-	82	48.780	ENSACLG00000023502	-	88	48.780
ENSACLG00000010048	-	83	38.384	ENSACLG00000014795	-	82	33.624
ENSACLG00000010048	-	96	38.053	ENSACLG00000001800	-	85	36.744
ENSACLG00000010048	-	88	36.232	ENSACLG00000017433	-	89	36.232
ENSACLG00000010048	-	96	48.058	ENSACLG00000024857	-	61	44.390
ENSACLG00000010048	-	91	59.615	ENSACLG00000001936	-	95	59.615
ENSACLG00000010048	-	71	35.795	ENSACLG00000023161	-	82	35.795
ENSACLG00000010048	-	76	33.000	ENSACLG00000023539	-	70	33.000
ENSACLG00000010048	-	76	57.068	ENSACLG00000003401	-	79	57.068
ENSACLG00000010048	-	83	47.393	ENSACLG00000004980	-	68	37.220
ENSACLG00000010048	-	93	39.269	ENSACLG00000017422	-	88	39.269
ENSACLG00000010048	-	84	65.842	ENSACLG00000008592	-	89	65.842
ENSACLG00000010048	-	96	38.532	ENSACLG00000001927	-	89	38.532
ENSACLG00000010048	-	79	47.475	ENSACLG00000023525	-	74	43.946
ENSACLG00000010048	-	97	73.655	ENSACLG00000008397	-	97	73.655
ENSACLG00000010048	-	88	40.265	ENSACLG00000001790	-	88	40.265
ENSACLG00000010048	-	81	49.289	ENSACLG00000005220	-	51	49.289
ENSACLG00000010048	-	91	58.685	ENSACLG00000001954	-	97	58.685
ENSACLG00000010048	-	83	45.933	ENSACLG00000023555	-	88	45.933
ENSACLG00000010048	-	94	40.179	ENSACLG00000001886	-	94	40.179
ENSACLG00000010048	-	81	48.529	ENSACLG00000023760	-	86	48.529
ENSACLG00000010048	-	90	40.789	ENSACLG00000023766	zgc:113625	95	40.789
ENSACLG00000010048	-	90	41.593	ENSACLG00000001833	-	61	41.593
ENSACLG00000010048	-	83	36.058	ENSACLG00000016222	-	77	34.389
ENSACLG00000010048	-	72	37.766	ENSACLG00000003298	-	86	37.766
ENSACLG00000010048	-	82	43.204	ENSACLG00000003290	-	93	38.710
ENSACLG00000010048	-	87	48.058	ENSACLG00000005232	-	88	48.058
ENSACLG00000010048	-	91	38.991	ENSACLG00000001896	-	72	38.991
ENSACLG00000010048	-	83	41.704	ENSACLG00000016235	-	67	41.518
ENSACLG00000010048	-	80	48.780	ENSACLG00000024859	-	50	41.262
ENSACLG00000010048	-	85	48.058	ENSACLG00000024854	-	76	48.058
ENSACLG00000010048	-	91	60.099	ENSACLG00000001976	-	90	60.099
ENSACLG00000010048	-	72	36.813	ENSACLG00000023570	-	81	36.813
ENSACLG00000010048	-	91	39.450	ENSACLG00000001869	-	72	39.450
ENSACLG00000010048	-	87	42.358	ENSACLG00000009774	-	70	44.156
ENSACLG00000010048	-	80	45.545	ENSACLG00000023747	-	84	45.545
ENSACLG00000010048	-	84	49.029	ENSACLG00000005659	-	76	49.029
ENSACLG00000010048	-	91	38.725	ENSACLG00000016242	-	77	34.286
ENSACLG00000010048	-	78	44.385	ENSACLG00000003276	-	77	44.385

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000010048	-	81	54.187	ENSAPOG00000006488	-	86	54.187	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010048	-	79	54.592	ENSAPOG00000011509	-	74	54.592	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010048	-	79	44.059	ENSAPOG00000014243	-	85	44.059	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010048	-	88	57.547	ENSAPOG00000008063	-	84	57.547	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010048	-	81	53.883	ENSAPOG00000006169	-	62	54.455	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010048	-	80	51.759	ENSAPOG00000020897	-	87	51.759	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010048	-	94	60.099	ENSAPOG00000021159	-	90	60.099	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010048	-	85	51.598	ENSAPOG00000006177	-	52	51.598	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010048	-	82	44.444	ENSAPOG00000007322	-	85	44.928	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010048	-	86	44.660	ENSAPOG00000008344	zgc:113625	90	44.660	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010048	-	80	48.515	ENSAPOG00000007333	-	77	48.058	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010048	-	83	40.385	ENSAPOG00000001315	-	67	40.376	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010048	-	91	51.244	ENSAPOG00000014759	-	98	51.244	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010048	-	78	48.469	ENSAPOG00000022240	-	64	48.469	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010048	-	74	54.497	ENSAPOG00000001262	-	90	54.497	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010048	-	84	46.860	ENSAPOG00000001268	-	55	46.860	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010048	-	86	60.680	ENSAPOG00000012716	-	97	60.680	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010048	-	93	47.660	ENSACIG00000004040	-	92	47.660	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010048	-	50	56.452	ENSACIG00000001465	-	76	56.452	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010048	-	93	63.054	ENSACIG00000022362	-	95	63.054	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010048	-	91	60.294	ENSACIG00000022366	-	97	60.294	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010048	-	81	50.490	ENSACIG00000019524	-	85	50.490	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010048	-	73	61.017	ENSACIG00000008666	-	89	61.017	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010048	-	64	51.572	ENSACIG00000000976	-	80	51.572	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010048	-	82	45.673	ENSACIG00000014662	-	85	45.854	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010048	-	81	45.238	ENSACIG00000020244	-	91	42.857	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010048	-	87	66.010	ENSACIG00000003582	-	93	65.534	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010048	-	76	59.898	ENSACIG00000001596	-	78	59.898	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010048	-	82	61.463	ENSACIG00000008045	-	90	58.065	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010048	-	86	65.829	ENSACIG00000001455	-	83	65.829	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010048	-	84	63.902	ENSACIG00000023381	-	90	62.559	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010048	-	84	62.687	ENSACIG00000004245	-	93	62.376	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010048	-	84	66.337	ENSACIG00000002263	-	87	66.337	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010048	-	79	47.761	ENSACIG00000014745	-	91	47.761	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010048	-	86	63.265	ENSACIG00000008001	-	96	58.636	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010048	-	84	44.545	ENSACIG00000014655	-	89	44.545	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010048	-	80	60.697	ENSACIG00000006503	-	95	55.603	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010048	-	83	45.498	ENSACIG00000014703	-	86	45.498	Amphilophus_citrinellus
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