EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000010059 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3268 bases
Position: chr14:13607356-13610623
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000014765	RVT_1	PF00078.27	2.1e-49	1	1
ENSACLP00000014765	Exo_endo_phos	PF03372.23	2.4e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000015116	-	3268	-	ENSACLP00000014765	911 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000010059	-	68	38.871	ENSACLG00000027433	-	63	38.871
ENSACLG00000010059	-	80	40.928	ENSACLG00000010561	-	68	40.928
ENSACLG00000010059	-	98	35.943	ENSACLG00000023850	-	71	35.943
ENSACLG00000010059	-	52	42.767	ENSACLG00000027045	-	57	42.767
ENSACLG00000010059	-	51	99.143	ENSACLG00000020885	-	58	99.143
ENSACLG00000010059	-	82	42.420	ENSACLG00000003130	-	83	42.420
ENSACLG00000010059	-	51	85.867	ENSACLG00000008786	-	59	85.867
ENSACLG00000010059	-	84	43.005	ENSACLG00000015440	-	70	43.005
ENSACLG00000010059	-	51	85.867	ENSACLG00000020106	-	60	85.867
ENSACLG00000010059	-	99	37.746	ENSACLG00000018177	-	80	37.746
ENSACLG00000010059	-	98	37.444	ENSACLG00000005466	-	70	37.444
ENSACLG00000010059	-	89	38.773	ENSACLG00000002748	-	68	38.773
ENSACLG00000010059	-	50	32.522	ENSACLG00000023741	-	96	32.522
ENSACLG00000010059	-	53	45.473	ENSACLG00000011463	-	58	45.473
ENSACLG00000010059	-	68	99.194	ENSACLG00000007324	-	65	99.194
ENSACLG00000010059	-	99	38.148	ENSACLG00000026023	-	84	38.148
ENSACLG00000010059	-	94	95.683	ENSACLG00000025597	-	70	95.683
ENSACLG00000010059	-	96	37.710	ENSACLG00000019378	-	60	37.710
ENSACLG00000010059	-	99	96.374	ENSACLG00000009410	-	95	96.374
ENSACLG00000010059	-	98	41.547	ENSACLG00000012503	-	71	41.547
ENSACLG00000010059	-	98	41.547	ENSACLG00000023207	-	71	41.547
ENSACLG00000010059	-	100	38.847	ENSACLG00000023597	-	72	38.847
ENSACLG00000010059	-	96	37.978	ENSACLG00000023216	-	60	37.978
ENSACLG00000010059	-	98	36.889	ENSACLG00000014178	-	94	36.889
ENSACLG00000010059	-	99	36.796	ENSACLG00000014342	-	64	36.796
ENSACLG00000010059	-	97	87.528	ENSACLG00000009895	-	69	87.528
ENSACLG00000010059	-	99	39.956	ENSACLG00000003800	-	71	39.956
ENSACLG00000010059	-	98	38.631	ENSACLG00000019734	-	72	38.631
ENSACLG00000010059	-	99	40.458	ENSACLG00000002299	-	71	40.458
ENSACLG00000010059	-	62	98.932	ENSACLG00000018473	-	63	98.932
ENSACLG00000010059	-	97	36.302	ENSACLG00000022582	-	62	36.302
ENSACLG00000010059	-	99	40.458	ENSACLG00000007947	-	83	40.458
ENSACLG00000010059	-	70	41.615	ENSACLG00000012223	-	62	41.615
ENSACLG00000010059	-	99	36.796	ENSACLG00000002829	-	68	36.796
ENSACLG00000010059	-	97	35.818	ENSACLG00000012298	-	72	35.714
ENSACLG00000010059	-	81	37.077	ENSACLG00000020021	-	88	37.077
ENSACLG00000010059	-	98	38.889	ENSACLG00000014673	-	71	38.889

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000010059	-	100	52.832	ENSAPEG00000024005	-	73	52.832	Amphiprion_percula
ENSACLG00000010059	-	78	32.918	ENSACAG00000029072	-	65	32.918	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000010059	-	97	33.186	ENSACAG00000028996	-	71	33.186	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000010059	-	58	35.120	ENSACAG00000029084	-	57	35.120	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000010059	-	74	34.012	ENSACAG00000029468	-	65	34.012	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000010059	-	83	31.373	ENSACAG00000029657	-	99	31.373	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000010059	-	58	33.147	ENSACAG00000029157	-	57	33.147	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000010059	-	57	35.417	ENSACAG00000028357	-	58	35.417	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000010059	-	98	31.311	ENSACAG00000028699	-	73	31.528	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000010059	-	83	34.625	ENSACAG00000029120	-	75	34.625	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000010059	-	96	31.849	ENSACAG00000029004	-	70	31.960	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000010059	-	63	35.751	ENSACAG00000028658	-	62	35.880	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000010059	-	99	30.240	ENSACAG00000028347	-	70	30.240	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000010059	-	95	41.858	ENSAMXG00000042337	-	98	41.858	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010059	-	98	41.538	ENSAMXG00000036080	-	79	41.538	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010059	-	88	38.725	ENSDARG00000112132	BX470182.1	69	38.725	Danio_rerio
ENSACLG00000010059	-	99	39.459	ENSDARG00000100065	CU467837.1	72	39.459	Danio_rerio
ENSACLG00000010059	-	98	35.872	ENSDNOG00000032631	-	79	35.872	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000010059	-	86	36.041	ENSEASG00005016304	-	95	36.041	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000010059	-	80	36.971	ENSEASG00005020069	-	79	36.971	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000010059	-	96	35.609	ENSEASG00005022910	-	78	35.609	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000010059	-	96	35.722	ENSEASG00005016911	-	69	35.722	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000010059	-	89	35.610	ENSEASG00005018086	-	80	35.610	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000010059	-	87	34.831	ENSECAG00000017913	-	96	34.994	Equus_caballus
ENSACLG00000010059	-	62	36.442	ENSECAG00000038498	-	73	36.442	Equus_caballus
ENSACLG00000010059	-	76	33.714	ENSECAG00000012123	-	98	33.714	Equus_caballus
ENSACLG00000010059	-	72	36.119	ENSFCAG00000044938	-	66	36.119	Felis_catus
ENSACLG00000010059	-	99	40.263	ENSKMAG00000002570	-	72	40.263	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000010059	-	98	37.458	ENSKMAG00000009901	-	71	37.458	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000010059	-	98	37.542	ENSKMAG00000016041	-	79	37.542	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000010059	-	98	37.431	ENSKMAG00000000374	-	83	37.431	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000010059	-	87	37.500	ENSLACG00000003989	-	96	37.500	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000010059	-	96	36.323	ENSMFAG00000021078	-	69	36.323	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000010059	-	90	36.925	ENSMFAG00000021158	-	67	36.925	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000010059	-	96	35.563	ENSMFAG00000016983	-	69	35.563	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000010059	-	97	35.706	ENSMFAG00000027683	-	73	35.706	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000010059	-	96	37.117	ENSMMUG00000043159	-	82	37.117	Macaca_mulatta
ENSACLG00000010059	-	57	39.286	ENSMMUG00000030948	-	79	39.286	Macaca_mulatta
ENSACLG00000010059	-	86	37.468	ENSMMUG00000047485	-	74	37.468	Macaca_mulatta
ENSACLG00000010059	-	57	41.226	ENSMMUG00000047716	-	92	41.226	Macaca_mulatta
ENSACLG00000010059	-	96	36.663	ENSMMUG00000039574	-	80	36.663	Macaca_mulatta
ENSACLG00000010059	-	99	62.747	ENSORLG00000025803	-	73	62.747	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.747	ENSORLG00000025035	-	73	62.747	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.747	ENSORLG00000030174	-	70	62.747	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	92	59.832	ENSORLG00000022464	-	99	59.832	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.088	ENSORLG00000028439	-	88	62.088	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.088	ENSORLG00000024212	-	73	62.088	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	98	62.054	ENSORLG00000023192	-	72	62.054	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	61.758	ENSORLG00000027333	-	80	61.758	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.857	ENSORLG00000025213	-	73	62.857	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.747	ENSORLG00000022848	-	73	62.747	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	61.978	ENSORLG00000022925	-	73	61.978	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.857	ENSORLG00000024230	-	73	62.857	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	65.275	ENSORLG00000022093	-	88	65.275	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.857	ENSORLG00000025676	-	75	62.857	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.308	ENSORLG00000027816	-	86	62.308	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.747	ENSORLG00000022453	-	73	62.747	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.527	ENSORLG00000022458	-	73	62.527	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.857	ENSORLG00000025057	-	73	62.857	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.747	ENSORLG00000023962	-	73	62.747	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.857	ENSORLG00000026236	-	73	62.857	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.198	ENSORLG00000025887	-	78	62.198	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.088	ENSORLG00000024335	-	73	62.088	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.459	ENSORLG00000026574	-	73	62.459	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	61.978	ENSORLG00000022241	-	74	61.978	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.857	ENSORLG00000022242	-	73	62.857	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	61.868	ENSORLG00000025984	-	73	61.868	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	96	38.914	ENSORLG00000029532	-	71	38.914	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.088	ENSORLG00000029560	-	73	62.088	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.088	ENSORLG00000028545	-	73	62.088	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	61.978	ENSORLG00000028541	-	73	61.978	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	97	39.527	ENSORLG00000027601	-	70	39.527	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	61.868	ENSORLG00000022606	-	73	61.868	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.857	ENSORLG00000026409	-	74	62.857	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	61.978	ENSORLG00000030319	-	73	61.978	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.637	ENSORLG00000027879	-	73	62.637	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	61.868	ENSORLG00000029461	-	73	61.868	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	61.910	ENSORLG00000027430	-	73	61.910	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	61.868	ENSORLG00000023904	-	73	61.868	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	61.361	ENSORLG00000029348	-	74	61.361	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	34.802	ENSORLG00000023409	-	98	34.873	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	61.758	ENSORLG00000028057	-	73	61.758	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	61.690	ENSORLG00000023842	-	74	61.690	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	61.978	ENSORLG00000022264	-	73	61.978	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.198	ENSORLG00000028129	-	73	62.198	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	40.505	ENSORLG00000026117	-	71	40.505	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010059	-	99	62.637	ENSORLG00020005656	-	73	62.637	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000010059	-	99	38.335	ENSORLG00020019330	-	72	38.335	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000010059	-	99	61.648	ENSORLG00020011033	-	73	61.648	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000010059	-	99	62.637	ENSORLG00020002923	-	73	62.637	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000010059	-	99	62.418	ENSORLG00020004575	-	73	62.418	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000010059	-	99	62.527	ENSORLG00020018889	-	73	62.527	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000010059	-	99	40.864	ENSORLG00015003402	-	79	40.864	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000010059	-	90	61.416	ENSORLG00015002019	-	91	61.416	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000010059	-	99	35.903	ENSORLG00015011318	-	77	35.903	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000010059	-	78	38.375	ENSORLG00015010651	-	65	38.375	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000010059	-	99	36.224	ENSOMEG00000007552	-	72	36.224	Oryzias_melastigma
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ENSACLG00000010059	-	95	36.633	ENSPTRG00000051987	-	70	36.633	Pan_troglodytes
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ENSACLG00000010059	-	98	36.394	ENSPMEG00000000819	-	88	36.394	Poecilia_mexicana
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ENSACLG00000010059	-	60	45.304	ENSSDUG00000000789	-	93	45.304	Seriola_dumerili
ENSACLG00000010059	-	59	38.447	ENSSPUG00000006153	-	67	38.447	Sphenodon_punctatus
ENSACLG00000010059	-	66	36.678	ENSSPUG00000015682	-	70	36.678	Sphenodon_punctatus