EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000010251 (Gene tree)
Gene ID: 113031622
Gene Symbol: rab25b
Alias: zgc:112037
Full Name: RAB25%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13522 bases
Position: chr11:33759607-33773128
Accession: 113031622
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000015055	MMR_HSR1	PF01926.23	8.2e-08	1	1
ENSACLP00000015059	MMR_HSR1	PF01926.23	8.2e-08	1	1
ENSACLP00000015068	MMR_HSR1	PF01926.23	1.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000015413	-	1869	-	ENSACLP00000015059	207 (aa)	XP_026039654	UPI000E4041AB
ENSACLT00000015422	-	1248	-	ENSACLP00000015068	211 (aa)	-	-
ENSACLT00000015409	-	1960	-	ENSACLP00000015055	207 (aa)	XP_026039654	UPI000E4041AB

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000010251	rab25b	98	33.333	ENSACLG00000026487	rab6bb	96	33.333
ENSACLG00000010251	rab25b	75	30.380	ENSACLG00000007804	si:ch73-116o1.2	81	31.765
ENSACLG00000010251	rab25b	94	31.100	ENSACLG00000005733	rab34b	77	31.100
ENSACLG00000010251	rab25b	96	43.689	ENSACLG00000006329	-	96	43.689
ENSACLG00000010251	rab25b	94	32.692	ENSACLG00000005093	rab34a	78	32.536
ENSACLG00000010251	rab25b	78	31.288	ENSACLG00000008646	rheb	88	31.288
ENSACLG00000010251	rab25b	75	36.810	ENSACLG00000006647	rab9a	79	36.810
ENSACLG00000010251	rab25b	76	47.468	ENSACLG00000018721	si:dkey-16l2.16	98	42.927
ENSACLG00000010251	rab25b	91	37.255	ENSACLG00000005720	rab33ba	85	37.198
ENSACLG00000010251	rab25b	82	50.588	ENSACLG00000013505	-	79	50.588
ENSACLG00000010251	rab25b	82	36.416	ENSACLG00000001646	-	82	36.416
ENSACLG00000010251	rab25b	83	47.674	ENSACLG00000013734	-	81	47.674
ENSACLG00000010251	rab25b	73	34.868	ENSACLG00000027677	KRAS	91	35.632
ENSACLG00000010251	rab25b	98	33.816	ENSACLG00000025138	rab6ba	96	33.816
ENSACLG00000010251	rab25b	69	38.732	ENSACLG00000002819	rab23	68	38.509
ENSACLG00000010251	rab25b	73	34.868	ENSACLG00000027515	KRAS	91	35.632
ENSACLG00000010251	rab25b	78	34.337	ENSACLG00000021109	si:dkey-13a21.4	80	34.337
ENSACLG00000010251	rab25b	80	41.818	ENSACLG00000026336	rab15	77	41.818
ENSACLG00000010251	rab25b	98	62.085	ENSACLG00000010268	rab11al	98	62.085
ENSACLG00000010251	rab25b	94	40.206	ENSACLG00000021470	rab22a	97	40.206
ENSACLG00000010251	rab25b	84	46.023	ENSACLG00000022893	-	83	46.023
ENSACLG00000010251	rab25b	100	60.550	ENSACLG00000005420	rab11ba	100	60.550
ENSACLG00000010251	rab25b	81	38.150	ENSACLG00000024456	-	83	37.714
ENSACLG00000010251	rab25b	86	43.850	ENSACLG00000001218	RAB17	82	43.850
ENSACLG00000010251	rab25b	96	45.729	ENSACLG00000007644	rab1ab	98	45.729
ENSACLG00000010251	rab25b	95	33.663	ENSACLG00000004795	rab9b	89	33.663
ENSACLG00000010251	rab25b	79	46.012	ENSACLG00000002706	rab5c	74	46.012
ENSACLG00000010251	rab25b	99	79.048	ENSACLG00000018262	rab25a	100	79.048
ENSACLG00000010251	rab25b	100	62.385	ENSACLG00000007076	rab11bb	100	62.385
ENSACLG00000010251	rab25b	84	46.023	ENSACLG00000027590	-	83	46.023
ENSACLG00000010251	rab25b	83	30.058	ENSACLG00000009103	si:cabz01085950.1	85	30.058
ENSACLG00000010251	rab25b	78	45.679	ENSACLG00000015289	rab18b	79	45.679
ENSACLG00000010251	rab25b	87	30.769	ENSACLG00000001181	hrasb	96	31.959
ENSACLG00000010251	rab25b	94	40.816	ENSACLG00000008615	-	88	40.816
ENSACLG00000010251	rab25b	95	42.132	ENSACLG00000018066	rab5aa	90	42.132
ENSACLG00000010251	rab25b	91	38.537	ENSACLG00000007514	rab42a	94	38.537
ENSACLG00000010251	rab25b	83	44.253	ENSACLG00000009468	RAB39B	82	44.253
ENSACLG00000010251	rab25b	74	31.875	ENSACLG00000008602	RAB29	96	31.875
ENSACLG00000010251	rab25b	79	32.927	ENSACLG00000011249	rras	85	31.792
ENSACLG00000010251	rab25b	96	44.949	ENSACLG00000013668	rab1ba	98	44.949
ENSACLG00000010251	rab25b	71	40.132	ENSACLG00000010965	-	66	39.241
ENSACLG00000010251	rab25b	100	64.186	ENSACLG00000001775	rab11a	100	64.186
ENSACLG00000010251	rab25b	76	36.196	ENSACLG00000018847	RAB7A	78	36.196
ENSACLG00000010251	rab25b	78	43.210	ENSACLG00000011484	rab18a	79	43.210
ENSACLG00000010251	rab25b	85	38.251	ENSACLG00000027006	zgc:101559	78	38.251
ENSACLG00000010251	rab25b	96	44.949	ENSACLG00000003326	-	98	44.949
ENSACLG00000010251	rab25b	81	42.604	ENSACLG00000007696	rab12	70	42.353
ENSACLG00000010251	rab25b	100	62.385	ENSACLG00000005446	-	100	62.385
ENSACLG00000010251	rab25b	94	34.158	ENSACLG00000024502	-	97	34.158
ENSACLG00000010251	rab25b	97	39.815	ENSACLG00000000860	-	96	39.815
ENSACLG00000010251	rab25b	87	64.088	ENSACLG00000018852	-	82	64.088
ENSACLG00000010251	rab25b	99	33.971	ENSACLG00000019423	rab41	96	33.971
ENSACLG00000010251	rab25b	95	42.857	ENSACLG00000019643	-	95	42.857
ENSACLG00000010251	rab25b	86	43.258	ENSACLG00000023526	rab30	88	43.258
ENSACLG00000010251	rab25b	96	30.332	ENSACLG00000019293	rasl11a	82	30.332
ENSACLG00000010251	rab25b	80	32.143	ENSACLG00000025632	rabl2	72	32.143
ENSACLG00000010251	rab25b	81	37.209	ENSACLG00000021547	rab33a	62	37.209
ENSACLG00000010251	rab25b	66	30.986	ENSACLG00000021872	arl8bb	69	30.986

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000010251	rab25b	98	71.014	ENSG00000132698	RAB25	97	71.014	Homo_sapiens
ENSACLG00000010251	rab25b	99	80.000	ENSAPOG00000021268	rab25a	99	80.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010251	rab25b	100	88.462	ENSAPOG00000008216	rab25b	100	88.462	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010251	rab25b	98	70.874	ENSAMEG00000014249	RAB25	97	70.874	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000010251	rab25b	100	90.338	ENSACIG00000017414	rab25b	100	90.338	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010251	rab25b	99	79.048	ENSACIG00000019803	rab25a	99	79.048	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010251	rab25b	100	89.904	ENSAOCG00000015713	rab25b	100	89.904	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000010251	rab25b	99	79.048	ENSAOCG00000003528	rab25a	99	79.048	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000010251	rab25b	99	79.048	ENSAPEG00000013500	rab25a	99	79.048	Amphiprion_percula
ENSACLG00000010251	rab25b	100	89.904	ENSAPEG00000022106	rab25b	100	89.904	Amphiprion_percula
ENSACLG00000010251	rab25b	99	83.333	ENSATEG00000014851	rab25a	99	83.333	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010251	rab25b	100	88.942	ENSATEG00000006124	rab25b	100	88.942	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010251	rab25b	98	70.531	ENSANAG00000036045	RAB25	97	70.531	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000010251	rab25b	99	77.251	ENSAMXG00000040879	rab25a	99	77.251	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010251	rab25b	100	82.938	ENSAMXG00000029712	rab25b	100	82.938	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010251	rab25b	98	71.845	ENSBTAG00000018914	RAB25	97	71.845	Bos_taurus
ENSACLG00000010251	rab25b	98	70.048	ENSCJAG00000007715	RAB25	97	70.048	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000010251	rab25b	98	70.388	ENSCAFG00000016866	RAB25	97	70.388	Canis_familiaris
ENSACLG00000010251	rab25b	98	70.388	ENSCAFG00020006179	RAB25	97	70.388	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000010251	rab25b	98	71.359	ENSCHIG00000018911	RAB25	97	71.359	Capra_hircus
ENSACLG00000010251	rab25b	98	71.014	ENSTSYG00000013028	RAB25	97	71.014	Carlito_syrichta
ENSACLG00000010251	rab25b	81	79.042	ENSCAPG00000006181	RAB25	97	79.042	Cavia_aperea
ENSACLG00000010251	rab25b	98	70.048	ENSCPOG00000002472	RAB25	97	70.048	Cavia_porcellus
ENSACLG00000010251	rab25b	88	60.833	ENSCCAG00000021873	RAB25	96	60.833	Cebus_capucinus
ENSACLG00000010251	rab25b	98	51.442	ENSCATG00000029662	RAB25	97	51.691	Cercocebus_atys
ENSACLG00000010251	rab25b	98	70.388	ENSCLAG00000003784	RAB25	97	70.388	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000010251	rab25b	98	71.014	ENSCSAG00000002096	RAB25	97	71.014	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000010251	rab25b	99	70.142	ENSCPBG00000025817	RAB25	99	70.142	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000010251	rab25b	93	69.898	ENSCANG00000040397	RAB25	93	66.667	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000010251	rab25b	99	70.952	ENSCGRG00001017341	Rab25	99	70.952	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000010251	rab25b	99	70.952	ENSCGRG00000012173	Rab25	99	70.952	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000010251	rab25b	100	85.782	ENSCSEG00000011982	rab25b	97	87.204	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000010251	rab25b	99	82.381	ENSCSEG00000017026	rab25a	99	82.381	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000010251	rab25b	100	89.904	ENSCVAG00000020003	rab25b	100	89.904	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000010251	rab25b	99	82.381	ENSCVAG00000008126	-	99	82.381	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000010251	rab25b	100	83.333	ENSDARG00000052954	rab25b	100	83.333	Danio_rerio
ENSACLG00000010251	rab25b	99	79.904	ENSDARG00000058800	rab25a	99	79.904	Danio_rerio
ENSACLG00000010251	rab25b	92	72.396	ENSDNOG00000039155	RAB25	76	72.396	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000010251	rab25b	98	69.082	ENSDORG00000002922	Rab25	97	69.082	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000010251	rab25b	98	71.014	ENSEASG00005019133	RAB25	97	71.014	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000010251	rab25b	98	71.014	ENSECAG00000023191	RAB25	97	71.014	Equus_caballus
ENSACLG00000010251	rab25b	96	71.859	ENSEEUG00000014804	RAB25	85	71.859	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000010251	rab25b	99	80.861	ENSELUG00000006604	rab25a	98	80.861	Esox_lucius
ENSACLG00000010251	rab25b	100	85.782	ENSELUG00000012060	rab25b	100	85.782	Esox_lucius
ENSACLG00000010251	rab25b	98	70.874	ENSFCAG00000011775	RAB25	97	70.874	Felis_catus
ENSACLG00000010251	rab25b	93	68.528	ENSFALG00000002597	RAB25	79	68.000	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000010251	rab25b	99	70.952	ENSFDAG00000006897	RAB25	99	70.952	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000010251	rab25b	99	81.905	ENSFHEG00000014186	rab25a	99	81.905	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000010251	rab25b	100	91.787	ENSFHEG00000003018	rab25b	100	91.787	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000010251	rab25b	82	76.331	ENSGMOG00000006444	rab25b	100	76.331	Gadus_morhua
ENSACLG00000010251	rab25b	93	83.938	ENSGMOG00000003577	-	97	83.938	Gadus_morhua
ENSACLG00000010251	rab25b	99	70.476	ENSGALG00000029812	RAB25	98	70.476	Gallus_gallus
ENSACLG00000010251	rab25b	99	81.905	ENSGAFG00000011713	rab25a	94	93.590	Gambusia_affinis
ENSACLG00000010251	rab25b	100	88.942	ENSGAFG00000021724	rab25b	100	88.942	Gambusia_affinis
ENSACLG00000010251	rab25b	100	87.500	ENSGACG00000013249	rab25b	99	87.500	Gasterosteus_aculeatus
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ENSACLG00000010251	rab25b	99	69.668	ENSGAGG00000020703	RAB25	99	69.668	Gopherus_agassizii
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