EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000010284 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1542 bases
Position: chr12:23769940-23771481
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000015095	RVT_1	PF00078.27	5.6e-19	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000015450	-	1542	-	ENSACLP00000015095	356 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000010284	-	91	47.239	ENSACLG00000024184	-	74	47.239
ENSACLG00000010284	-	92	57.362	ENSACLG00000010082	-	58	57.362
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ENSACLG00000010284	-	68	56.379	ENSACLG00000010474	-	53	56.379
ENSACLG00000010284	-	93	63.939	ENSACLG00000026963	-	86	64.329
ENSACLG00000010284	-	73	45.769	ENSACLG00000006327	-	54	46.071
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ENSACLG00000010284	-	91	47.853	ENSACLG00000020601	-	74	47.853
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ENSACLG00000010284	-	91	51.070	ENSACLG00000005547	-	51	51.070
ENSACLG00000010284	-	92	63.830	ENSACLG00000005593	-	86	63.830
ENSACLG00000010284	-	59	31.193	ENSACLG00000023056	-	72	31.163
ENSACLG00000010284	-	53	45.455	ENSACLG00000020388	-	60	42.661
ENSACLG00000010284	-	91	49.691	ENSACLG00000027135	-	93	49.691
ENSACLG00000010284	-	91	50.000	ENSACLG00000025009	-	68	50.000
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ENSACLG00000010284	-	91	50.915	ENSACLG00000007318	-	85	50.915
ENSACLG00000010284	-	71	61.905	ENSACLG00000002591	-	83	61.905
ENSACLG00000010284	-	91	51.376	ENSACLG00000014746	-	51	51.376
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ENSACLG00000010284	-	91	51.070	ENSACLG00000022051	-	85	51.070
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ENSACLG00000010284	-	88	48.562	ENSACLG00000015659	-	53	48.562
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ENSACLG00000010284	-	91	46.341	ENSACLG00000004581	-	85	46.341
ENSACLG00000010284	-	96	48.105	ENSACLG00000020302	-	89	48.105
ENSACLG00000010284	-	91	50.613	ENSACLG00000020926	-	85	50.613
ENSACLG00000010284	-	92	55.963	ENSACLG00000013483	-	96	55.963
ENSACLG00000010284	-	89	49.530	ENSACLG00000024568	-	75	49.530
ENSACLG00000010284	-	91	51.070	ENSACLG00000022656	-	75	51.070
ENSACLG00000010284	-	91	47.853	ENSACLG00000017363	-	74	47.853
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ENSACLG00000010284	-	91	49.383	ENSACLG00000022853	-	60	49.383
ENSACLG00000010284	-	77	51.079	ENSACLG00000022219	-	74	51.079
ENSACLG00000010284	-	92	100.000	ENSACLG00000014537	-	69	100.000
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ENSACLG00000010284	-	91	49.541	ENSACLG00000013583	-	85	49.541
ENSACLG00000010284	-	91	50.000	ENSACLG00000002171	-	99	50.000
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ENSACLG00000010284	-	91	48.160	ENSACLG00000000182	-	58	48.160
ENSACLG00000010284	-	63	31.304	ENSACLG00000008159	-	71	30.870
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ENSACLG00000010284	-	91	47.853	ENSACLG00000026769	-	74	47.853
ENSACLG00000010284	-	91	72.615	ENSACLG00000005711	-	100	72.615
ENSACLG00000010284	-	91	48.160	ENSACLG00000016639	-	71	48.160
ENSACLG00000010284	-	87	48.077	ENSACLG00000023425	-	85	49.080
ENSACLG00000010284	-	66	84.615	ENSACLG00000013521	-	59	84.615
ENSACLG00000010284	-	90	50.774	ENSACLG00000011570	-	85	50.774
ENSACLG00000010284	-	87	64.309	ENSACLG00000022741	-	91	63.030
ENSACLG00000010284	-	84	46.358	ENSACLG00000018346	-	67	46.358
ENSACLG00000010284	-	58	45.894	ENSACLG00000005259	-	64	45.894
ENSACLG00000010284	-	89	70.662	ENSACLG00000027774	-	100	70.662
ENSACLG00000010284	-	91	48.160	ENSACLG00000017093	-	74	48.160
ENSACLG00000010284	-	78	48.921	ENSACLG00000003344	-	89	48.921
ENSACLG00000010284	-	63	30.870	ENSACLG00000000710	-	64	30.435
ENSACLG00000010284	-	91	35.890	ENSACLG00000024587	-	69	35.890
ENSACLG00000010284	-	89	63.836	ENSACLG00000003937	-	80	63.836
ENSACLG00000010284	-	91	50.613	ENSACLG00000013932	-	60	50.613
ENSACLG00000010284	-	91	47.853	ENSACLG00000002680	-	80	47.853
ENSACLG00000010284	-	91	48.160	ENSACLG00000000437	-	87	48.160
ENSACLG00000010284	-	92	55.828	ENSACLG00000024414	-	85	55.215
ENSACLG00000010284	-	92	65.549	ENSACLG00000012076	-	87	65.549
ENSACLG00000010284	-	91	47.853	ENSACLG00000011151	-	87	47.853
ENSACLG00000010284	-	91	48.160	ENSACLG00000024400	-	62	48.160
ENSACLG00000010284	-	87	48.408	ENSACLG00000006014	-	68	48.408
ENSACLG00000010284	-	87	64.630	ENSACLG00000009983	-	86	63.333
ENSACLG00000010284	-	89	49.530	ENSACLG00000014642	-	53	49.530
ENSACLG00000010284	-	91	51.070	ENSACLG00000009011	-	69	51.070

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000010284	-	91	54.462	ENSAOCG00000004576	-	88	54.462	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000010284	-	92	53.354	ENSAPEG00000024502	-	88	53.354	Amphiprion_percula
ENSACLG00000010284	-	87	40.705	ENSATEG00000019241	-	88	40.705	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010284	-	91	51.235	ENSATEG00000015931	-	64	51.235	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010284	-	89	50.629	ENSATEG00000004857	-	69	50.629	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010284	-	86	40.260	ENSATEG00000014055	-	53	40.260	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010284	-	92	39.939	ENSATEG00000004798	-	54	40.705	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010284	-	91	50.926	ENSATEG00000014607	-	63	50.926	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010284	-	91	50.926	ENSATEG00000015490	-	53	50.926	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010284	-	91	51.235	ENSATEG00000002739	-	53	51.235	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010284	-	92	39.818	ENSAMXG00000035545	-	92	40.432	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010284	-	76	40.959	ENSAMXG00000032328	-	81	40.959	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010284	-	64	39.827	ENSAMXG00000029786	-	58	39.035	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010284	-	92	41.337	ENSAMXG00000039054	-	92	41.796	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010284	-	68	38.776	ENSAMXG00000041932	-	58	38.367	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010284	-	92	48.930	ENSAMXG00000043740	-	66	48.930	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010284	-	92	40.729	ENSAMXG00000029419	-	93	41.176	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010284	-	67	53.586	ENSAMXG00000038571	-	58	53.586	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010284	-	88	42.587	ENSAMXG00000043932	-	90	42.587	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010284	-	73	42.045	ENSAMXG00000034283	-	76	42.045	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010284	-	92	40.060	ENSAMXG00000037298	-	93	40.491	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010284	-	75	42.435	ENSAMXG00000032194	-	70	42.435	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010284	-	74	54.924	ENSAMXG00000038658	-	78	54.924	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010284	-	88	42.271	ENSAMXG00000032827	-	90	42.271	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010284	-	88	41.587	ENSAMXG00000025823	-	80	41.587	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010284	-	76	41.392	ENSAMXG00000036759	-	82	41.392	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010284	-	91	47.385	ENSAMXG00000043461	-	65	47.385	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010284	-	77	45.455	ENSCVAG00000013070	-	99	45.455	Cyprinodon_variegatus
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