EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000010305 (Gene tree)
Gene ID: 113019336
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9207 bases
Position: chr3:33296754-33305960
Accession: 113019336
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000015149	eRF1_2	PF03464.15	1.2e-32	1	1
ENSACLP00000015137	eRF1_2	PF03464.15	1.2e-32	1	1
ENSACLP00000015137	eRF1_3	PF03465.15	6.9e-26	1	1
ENSACLP00000015149	eRF1_3	PF03465.15	4.6e-14	1	1
ENSACLP00000015137	eRF1_1	PF03463.15	6.8e-52	1	1
ENSACLP00000015149	eRF1_1	PF03463.15	7e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000015492	-	1158	-	ENSACLP00000015137	385 (aa)	XP_026018751	UPI000329FF65
ENSACLT00000015504	-	1107	-	ENSACLP00000015149	368 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACLG00000010305's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACLG00000010305's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSG00000152684	PELO	100	80.260	Homo_sapiens
ENSACLG00000010305	pelo	67	92.308	ENSAPOG00000000616	pelo	90	92.308	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010305	pelo	100	91.948	ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.948	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010305	pelo	67	92.308	ENSAPOG00000023700	-	90	92.308	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.000	ENSAMEG00000007734	PELO	100	80.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000010305	pelo	97	88.740	ENSACIG00000014386	pelo	97	93.491	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000010305	pelo	100	92.208	ENSAOCG00000023717	pelo	100	92.208	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000010305	pelo	100	92.208	ENSAPEG00000011235	pelo	100	92.208	Amphiprion_percula
ENSACLG00000010305	pelo	100	91.948	ENSATEG00000019550	pelo	100	91.948	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010305	pelo	77	70.470	ENSAPLG00000013265	PELO	100	70.470	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000010305	pelo	97	79.467	ENSACAG00000004352	PELO	100	78.961	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000010305	pelo	100	79.740	ENSANAG00000014096	PELO	100	79.740	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000010305	pelo	97	90.885	ENSAMXG00000020299	pelo	100	90.155	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010305	pelo	100	79.740	ENSBTAG00000003268	PELO	99	79.740	Bos_taurus
ENSACLG00000010305	pelo	97	61.333	WBGene00011280	pelo-1	98	61.333	Caenorhabditis_elegans
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.000	ENSCJAG00000035190	PELO	100	80.000	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSCAFG00020023234	PELO	100	80.260	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000010305	pelo	100	79.481	ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.481	Capra_hircus
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.519	ENSTSYG00000005203	PELO	100	80.519	Carlito_syrichta
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.260	Cavia_porcellus
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.000	ENSCCAG00000035600	PELO	100	80.000	Cebus_capucinus
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSCATG00000011829	PELO	100	80.260	Cercocebus_atys
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSCLAG00000005043	PELO	100	80.260	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSCSAG00000016692	PELO	100	80.260	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSCHOG00000000523	PELO	100	80.260	Choloepus_hoffmanni
ENSACLG00000010305	pelo	97	80.000	ENSCPBG00000007544	PELO	100	79.481	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000010305	pelo	97	64.611	ENSCING00000001979	-	100	64.935	Ciona_intestinalis
ENSACLG00000010305	pelo	100	66.753	ENSCSAVG00000006158	-	100	66.753	Ciona_savignyi
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSCANG00000023382	PELO	100	80.260	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000010305	pelo	97	79.893	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000010305	pelo	97	80.697	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	80.779	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000010305	pelo	100	90.649	ENSCSEG00000008807	pelo	100	90.649	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000010305	pelo	100	91.169	ENSCVAG00000016082	pelo	100	91.169	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000010305	pelo	100	88.831	ENSDARG00000055477	pelo	100	88.831	Danio_rerio
ENSACLG00000010305	pelo	100	77.720	ENSDNOG00000036721	PELO	100	77.720	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.779	ENSDORG00000016689	Pelo	100	80.779	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000010305	pelo	96	67.568	FBgn0011207	pelo	97	66.319	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000010305	pelo	71	77.778	ENSEBUG00000004955	pelo	99	77.778	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000010305	pelo	100	79.740	ENSEASG00005013348	PELO	100	79.740	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000010305	pelo	100	90.390	ENSELUG00000023229	pelo	100	90.390	Esox_lucius
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.000	ENSFCAG00000032341	PELO	100	80.000	Felis_catus
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.000	ENSFALG00000004559	PELO	100	80.000	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000010305	pelo	77	80.634	ENSFDAG00000002076	PELO	88	80.634	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000010305	pelo	100	90.130	ENSFHEG00000009769	pelo	100	90.130	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000010305	pelo	98	88.329	ENSGMOG00000005849	pelo	100	88.052	Gadus_morhua
ENSACLG00000010305	pelo	100	89.870	ENSGAFG00000019350	pelo	100	89.870	Gambusia_affinis
ENSACLG00000010305	pelo	100	90.649	ENSGACG00000007245	pelo	100	90.649	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000010305	pelo	97	80.000	ENSGAGG00000004018	PELO	100	79.481	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSGGOG00000012635	PELO	100	80.260	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000010305	pelo	100	100.000	ENSHBUG00000005866	pelo	100	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSHGLG00000005932	PELO	100	80.260	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000010305	pelo	100	78.701	ENSHGLG00100017627	PELO	100	78.701	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000010305	pelo	100	90.909	ENSHCOG00000016782	pelo	100	90.909	Hippocampus_comes
ENSACLG00000010305	pelo	100	89.091	ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.091	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.779	ENSSTOG00000027378	PELO	100	80.779	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000010305	pelo	100	78.182	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	78.182	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000010305	pelo	100	90.649	ENSKMAG00000021305	pelo	100	90.649	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000010305	pelo	100	90.909	ENSLBEG00000022399	pelo	100	90.909	Labrus_bergylta
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.519	ENSLAFG00000020551	PELO	100	80.519	Loxodonta_africana
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSMFAG00000000651	PELO	100	80.260	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSMMUG00000039101	PELO	100	80.260	Macaca_mulatta
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSMNEG00000035538	PELO	100	80.260	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSMLEG00000039113	PELO	100	80.260	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000010305	pelo	97	94.102	ENSMAMG00000013260	pelo	100	93.247	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000010305	pelo	100	100.000	ENSMZEG00005014258	pelo	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.519	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	80.519	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSMICG00000044040	PELO	100	80.260	Microcebus_murinus
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.519	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	80.519	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000010305	pelo	100	91.169	ENSMMOG00000001324	pelo	100	91.169	Mola_mola
ENSACLG00000010305	pelo	100	92.208	ENSMALG00000008194	pelo	100	92.208	Monopterus_albus
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.519	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	80.519	Mus_caroli
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.000	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	80.000	Mus_musculus
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	80.260	Mus_pahari
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.000	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	80.000	Mus_spretus
ENSACLG00000010305	pelo	100	79.740	ENSMLUG00000024132	PELO	100	79.740	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000010305	pelo	100	81.039	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	81.039	Nannospalax_galili
ENSACLG00000010305	pelo	100	99.481	ENSNBRG00000011799	pelo	100	99.481	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSNLEG00000035970	PELO	100	80.260	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000010305	pelo	100	78.961	ENSMEUG00000005468	PELO	100	78.961	Notamacropus_eugenii
ENSACLG00000010305	pelo	98	79.420	ENSOPRG00000018793	PELO	100	79.420	Ochotona_princeps
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.000	ENSODEG00000017579	PELO	100	80.000	Octodon_degus
ENSACLG00000010305	pelo	100	97.922	ENSONIG00000011511	pelo	100	97.922	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.779	ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.779	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000010305	pelo	100	90.390	ENSORLG00000005827	pelo	100	90.390	Oryzias_latipes
ENSACLG00000010305	pelo	100	90.130	ENSORLG00020016456	pelo	100	90.130	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000010305	pelo	100	90.130	ENSORLG00015014447	pelo	100	90.130	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000010305	pelo	100	91.429	ENSOMEG00000021567	pelo	100	91.429	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.519	ENSOGAG00000027940	PELO	100	80.519	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000010305	pelo	100	79.740	ENSOARG00000008324	PELO	99	79.740	Ovis_aries
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSPPAG00000038951	PELO	100	80.260	Pan_paniscus
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.000	ENSPPRG00000018800	PELO	100	80.000	Panthera_pardus
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.000	ENSPTIG00000019988	PELO	100	80.000	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.000	ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.000	Pan_troglodytes
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSPANG00000010902	PELO	100	80.260	Papio_anubis
ENSACLG00000010305	pelo	100	88.312	ENSPKIG00000015190	pelo	100	88.312	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000010305	pelo	97	79.733	ENSPSIG00000004971	PELO	100	79.221	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000010305	pelo	69	91.339	ENSPMGG00000014561	pelo	94	91.339	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.519	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	80.519	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000010305	pelo	100	79.740	ENSPCIG00000004880	PELO	100	79.740	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000010305	pelo	100	91.169	ENSPFOG00000007277	pelo	100	91.169	Poecilia_formosa
ENSACLG00000010305	pelo	100	91.169	ENSPLAG00000020787	pelo	100	91.169	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000010305	pelo	100	91.169	ENSPMEG00000016964	pelo	100	91.169	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000010305	pelo	100	91.169	ENSPREG00000023071	pelo	100	91.169	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000010305	pelo	97	80.697	ENSPPYG00000015451	PELO	96	80.519	Pongo_abelii
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSPCOG00000021178	PELO	100	80.260	Propithecus_coquereli
ENSACLG00000010305	pelo	100	100.000	ENSPNYG00000017325	pelo	100	100.000	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000010305	pelo	97	91.153	ENSPNAG00000012458	pelo	99	89.870	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.779	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	80.779	Rattus_norvegicus
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSRBIG00000007299	PELO	100	80.260	Rhinopithecus_bieti
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSRROG00000035507	PELO	100	80.260	Rhinopithecus_roxellana
ENSACLG00000010305	pelo	97	32.895	YNL001W	-	97	32.895	Saccharomyces_cerevisiae
ENSACLG00000010305	pelo	100	79.740	ENSSBOG00000036140	PELO	100	79.740	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACLG00000010305	pelo	63	76.639	ENSSHAG00000010770	PELO	100	76.639	Sarcophilus_harrisii
ENSACLG00000010305	pelo	98	89.390	ENSSFOG00015013399	pelo	100	89.091	Scleropages_formosus
ENSACLG00000010305	pelo	100	91.169	ENSSMAG00000017171	pelo	100	91.169	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000010305	pelo	100	91.688	ENSSDUG00000022938	pelo	100	91.688	Seriola_dumerili
ENSACLG00000010305	pelo	100	88.052	ENSSLDG00000017884	pelo	100	88.052	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000010305	pelo	97	81.067	ENSSPUG00000005545	PELO	100	80.519	Sphenodon_punctatus
ENSACLG00000010305	pelo	98	92.573	ENSSPAG00000008501	pelo	100	92.208	Stegastes_partitus
ENSACLG00000010305	pelo	100	78.701	ENSSSCG00000016884	PELO	100	78.701	Sus_scrofa
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.519	ENSTGUG00000002416	PELO	100	80.519	Taeniopygia_guttata
ENSACLG00000010305	pelo	100	89.870	ENSTRUG00000005809	pelo	100	89.870	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000010305	pelo	100	90.649	ENSTNIG00000018937	pelo	100	90.649	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.000	ENSTTRG00000001857	PELO	100	80.000	Tursiops_truncatus
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSUAMG00000002535	PELO	100	80.260	Ursus_americanus
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSUMAG00000005809	PELO	100	80.260	Ursus_maritimus
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.000	ENSVPAG00000001113	PELO	100	80.000	Vicugna_pacos
ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	ENSVVUG00000025499	PELO	100	80.260	Vulpes_vulpes
ENSACLG00000010305	pelo	81	77.419	ENSXETG00000018368	pelo	100	76.074	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000010305	pelo	100	91.688	ENSXMAG00000018474	pelo	100	91.688	Xiphophorus_maculatus