EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000010900 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2715 bases
Position: chr7:66351736-66354450
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000015964	RVT_1	PF00078.27	3.2e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000016332	-	2715	-	ENSACLP00000015964	904 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000010900	-	74	98.957	ENSACLG00000008571	-	100	98.957
ENSACLG00000010900	-	96	43.800	ENSACLG00000000734	-	99	43.800
ENSACLG00000010900	-	75	48.766	ENSACLG00000000736	-	97	48.766
ENSACLG00000010900	-	83	41.722	ENSACLG00000020248	-	99	41.722
ENSACLG00000010900	-	92	45.305	ENSACLG00000008391	-	98	45.305
ENSACLG00000010900	-	52	42.553	ENSACLG00000008218	-	100	42.553
ENSACLG00000010900	-	50	30.197	ENSACLG00000019219	-	83	32.552
ENSACLG00000010900	-	59	97.020	ENSACLG00000009903	-	95	97.020
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ENSACLG00000010900	-	62	98.752	ENSACLG00000021814	-	100	98.752
ENSACLG00000010900	-	71	96.557	ENSACLG00000023557	-	99	96.557
ENSACLG00000010900	-	52	53.361	ENSACLG00000012219	-	99	53.361
ENSACLG00000010900	-	100	98.783	ENSACLG00000022844	-	100	98.783
ENSACLG00000010900	-	92	41.281	ENSACLG00000021051	-	99	41.281
ENSACLG00000010900	-	60	94.495	ENSACLG00000018945	-	93	94.495
ENSACLG00000010900	-	89	40.099	ENSACLG00000019519	-	98	40.099
ENSACLG00000010900	-	70	50.078	ENSACLG00000005547	-	99	50.078
ENSACLG00000010900	-	100	95.907	ENSACLG00000005662	-	100	95.907
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ENSACLG00000010900	-	58	54.511	ENSACLG00000022853	-	97	54.511
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ENSACLG00000010900	-	57	97.688	ENSACLG00000006327	-	100	97.688
ENSACLG00000010900	-	58	46.667	ENSACLG00000013932	-	96	46.667
ENSACLG00000010900	-	51	44.989	ENSACLG00000012094	-	97	44.989
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ENSACLG00000010900	-	52	57.717	ENSACLG00000000230	-	99	57.717
ENSACLG00000010900	-	61	47.378	ENSACLG00000010082	-	98	47.378
ENSACLG00000010900	-	65	45.439	ENSACLG00000015659	-	99	45.439
ENSACLG00000010900	-	100	98.673	ENSACLG00000015650	-	100	98.673
ENSACLG00000010900	-	52	50.211	ENSACLG00000014537	-	99	50.211
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ENSACLG00000010900	-	75	44.330	ENSACLG00000014413	-	99	44.330
ENSACLG00000010900	-	52	54.622	ENSACLG00000009011	-	99	54.622
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ENSACLG00000010900	-	91	41.507	ENSACLG00000009939	-	83	41.507
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ENSACLG00000010900	-	99	42.024	ENSACLG00000017412	-	97	42.024
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ENSACLG00000010900	-	56	40.583	ENSACLG00000008832	-	99	40.971
ENSACLG00000010900	-	64	45.329	ENSACLG00000022169	-	97	45.329
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ENSACLG00000010900	-	85	45.844	ENSACLG00000027996	-	99	45.844
ENSACLG00000010900	-	67	40.630	ENSACLG00000004144	-	83	40.630
ENSACLG00000010900	-	82	99.054	ENSACLG00000013844	-	96	99.054
ENSACLG00000010900	-	85	45.214	ENSACLG00000020864	-	99	45.214
ENSACLG00000010900	-	94	99.058	ENSACLG00000009850	-	97	99.058
ENSACLG00000010900	-	85	98.442	ENSACLG00000018252	-	98	98.442
ENSACLG00000010900	-	74	98.361	ENSACLG00000001758	-	100	98.361
ENSACLG00000010900	-	97	98.855	ENSACLG00000000395	-	100	98.855
ENSACLG00000010900	-	100	98.341	ENSACLG00000000393	-	100	98.341
ENSACLG00000010900	-	82	40.296	ENSACLG00000015331	-	93	40.781
ENSACLG00000010900	-	74	98.510	ENSACLG00000000536	-	100	98.510
ENSACLG00000010900	-	92	45.305	ENSACLG00000023885	-	98	45.305
ENSACLG00000010900	-	59	98.883	ENSACLG00000015507	-	99	98.883
ENSACLG00000010900	-	71	50.847	ENSACLG00000022841	-	82	50.847
ENSACLG00000010900	-	91	42.548	ENSACLG00000009590	-	98	42.548
ENSACLG00000010900	-	75	44.330	ENSACLG00000005017	-	99	44.330
ENSACLG00000010900	-	91	97.324	ENSACLG00000017448	-	99	97.324
ENSACLG00000010900	-	57	47.985	ENSACLG00000005921	-	99	47.985
ENSACLG00000010900	-	52	48.085	ENSACLG00000014661	-	99	48.085
ENSACLG00000010900	-	70	49.843	ENSACLG00000003670	-	99	49.843
ENSACLG00000010900	-	76	43.927	ENSACLG00000002614	-	99	43.927
ENSACLG00000010900	-	64	45.533	ENSACLG00000015704	-	94	45.769
ENSACLG00000010900	-	52	98.517	ENSACLG00000019420	-	99	94.800
ENSACLG00000010900	-	50	48.478	ENSACLG00000021937	-	96	48.478
ENSACLG00000010900	-	55	42.944	ENSACLG00000012352	-	99	42.944
ENSACLG00000010900	-	100	41.904	ENSACLG00000007643	-	85	41.904
ENSACLG00000010900	-	89	45.973	ENSACLG00000008383	-	97	45.973
ENSACLG00000010900	-	51	31.965	ENSACLG00000010366	-	99	31.533
ENSACLG00000010900	-	100	39.759	ENSACLG00000003857	-	80	39.759
ENSACLG00000010900	-	100	98.673	ENSACLG00000025376	-	100	98.673
ENSACLG00000010900	-	62	98.930	ENSACLG00000000182	-	100	98.930
ENSACLG00000010900	-	51	77.922	ENSACLG00000005844	-	84	77.922
ENSACLG00000010900	-	71	51.310	ENSACLG00000014911	-	99	51.310
ENSACLG00000010900	-	57	30.545	ENSACLG00000008551	-	92	30.545
ENSACLG00000010900	-	74	98.510	ENSACLG00000001405	-	100	98.510
ENSACLG00000010900	-	58	45.455	ENSACLG00000018107	-	98	44.526
ENSACLG00000010900	-	73	30.938	ENSACLG00000006988	-	98	30.352
ENSACLG00000010900	-	67	43.987	ENSACLG00000014642	-	99	43.987
ENSACLG00000010900	-	56	30.392	ENSACLG00000017241	-	83	30.000
ENSACLG00000010900	-	83	42.745	ENSACLG00000019194	-	99	42.876
ENSACLG00000010900	-	67	96.865	ENSACLG00000012279	-	98	96.865
ENSACLG00000010900	-	52	57.082	ENSACLG00000025009	-	99	57.082
ENSACLG00000010900	-	74	96.402	ENSACLG00000005212	-	100	96.402
ENSACLG00000010900	-	79	43.733	ENSACLG00000013061	-	98	43.733
ENSACLG00000010900	-	92	45.188	ENSACLG00000002468	-	98	45.188
ENSACLG00000010900	-	92	45.423	ENSACLG00000004826	-	98	45.423
ENSACLG00000010900	-	83	41.854	ENSACLG00000012019	-	99	41.854
ENSACLG00000010900	-	100	98.783	ENSACLG00000012014	-	100	98.783
ENSACLG00000010900	-	74	99.106	ENSACLG00000020183	-	100	99.106
ENSACLG00000010900	-	70	49.373	ENSACLG00000014746	-	99	49.373
ENSACLG00000010900	-	62	42.042	ENSACLG00000005642	-	99	42.042
ENSACLG00000010900	-	100	99.226	ENSACLG00000015667	-	100	99.226
ENSACLG00000010900	-	51	52.700	ENSACLG00000006014	-	100	52.700
ENSACLG00000010900	-	75	41.545	ENSACLG00000009807	-	94	41.545
ENSACLG00000010900	-	99	40.468	ENSACLG00000027511	-	78	40.468
ENSACLG00000010900	-	79	43.733	ENSACLG00000017692	-	98	43.733

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000010900	-	94	44.884	ENSATEG00000010674	-	99	44.884	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010900	-	56	49.804	ENSATEG00000014607	-	98	49.804	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010900	-	90	35.244	ENSATEG00000005707	-	99	35.488	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010900	-	94	44.884	ENSATEG00000019512	-	99	44.884	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010900	-	55	50.398	ENSATEG00000015931	-	99	50.398	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010900	-	99	35.982	ENSATEG00000012907	-	92	36.203	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010900	-	51	51.523	ENSATEG00000004857	-	99	51.523	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010900	-	68	48.377	ENSATEG00000002739	-	99	48.377	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010900	-	68	48.214	ENSATEG00000015490	-	99	48.214	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010900	-	67	37.643	ENSATEG00000023197	-	94	37.583	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010900	-	62	41.113	ENSATEG00000004798	-	97	41.113	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010900	-	63	35.355	ENSAMXG00000041363	-	97	35.355	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010900	-	88	32.801	ENSAMXG00000036646	-	89	34.158	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010900	-	60	51.188	ENSAMXG00000040860	-	98	51.188	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010900	-	70	59.531	ENSAMXG00000041791	-	95	59.531	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010900	-	89	57.319	ENSAMXG00000039914	-	99	57.319	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010900	-	52	62.845	ENSAMXG00000043740	-	95	62.845	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010900	-	77	36.091	ENSAMXG00000030246	-	97	36.377	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010900	-	53	35.135	ENSAMXG00000037974	-	91	35.135	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010900	-	72	32.006	ENSAMXG00000033415	-	88	33.434	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010900	-	99	34.907	ENSAMXG00000040053	-	92	35.230	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010900	-	54	65.226	ENSAMXG00000043461	-	98	65.226	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010900	-	72	60.153	ENSAMXG00000032588	-	99	60.153	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010900	-	89	57.125	ENSAMXG00000043574	-	99	57.125	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010900	-	88	46.550	ENSAMXG00000033551	-	95	46.550	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010900	-	83	48.344	ENSAMXG00000043096	-	99	48.344	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000010900	-	55	64.329	ENSFHEG00000008959	-	100	64.329	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000010900	-	64	39.864	ENSHBUG00000016298	-	99	39.661	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000010900	-	51	43.750	ENSHBUG00000015916	-	98	43.750	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000010900	-	84	37.173	ENSIPUG00000013060	-	90	37.386	Ictalurus_punctatus
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ENSACLG00000010900	-	95	79.347	ENSOMEG00000014758	-	99	79.347	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000010900	-	61	82.182	ENSOMEG00000011101	-	99	82.182	Oryzias_melastigma
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ENSACLG00000010900	-	73	39.852	ENSOMEG00000000808	-	96	39.852	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000010900	-	52	47.357	ENSPKIG00000025243	-	99	47.357	Paramormyrops_kingsleyae
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ENSACLG00000010900	-	74	97.914	ENSPNYG00000008434	-	100	97.914	Pundamilia_nyererei
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ENSACLG00000010900	-	58	57.495	ENSPNAG00000001796	-	99	57.495	Pygocentrus_nattereri
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ENSACLG00000010900	-	64	41.356	ENSSLDG00000007615	-	97	41.286	Seriola_lalandi_dorsalis
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ENSACLG00000010900	-	79	40.833	ENSXMAG00000020920	-	99	40.833	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000010900	-	67	46.305	ENSXMAG00000027958	-	93	46.305	Xiphophorus_maculatus