EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000010960 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2895 bases
Position: chr22:755381-758275
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000016054	RVT_1	PF00078.27	2.9e-31	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000016428	-	2895	-	ENSACLP00000016054	964 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000010960	-	57	51.950	ENSACLG00000027341	-	97	51.950
ENSACLG00000010960	-	66	47.235	ENSACLG00000017812	-	99	47.235
ENSACLG00000010960	-	80	53.350	ENSACLG00000014396	-	98	53.350
ENSACLG00000010960	-	66	56.442	ENSACLG00000011875	-	99	56.442
ENSACLG00000010960	-	50	54.800	ENSACLG00000022764	-	99	54.800
ENSACLG00000010960	-	61	50.573	ENSACLG00000013125	-	99	50.573
ENSACLG00000010960	-	92	55.653	ENSACLG00000026772	-	91	56.314
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ENSACLG00000010960	-	66	55.828	ENSACLG00000025590	-	99	55.828
ENSACLG00000010960	-	53	46.221	ENSACLG00000025038	-	98	46.655
ENSACLG00000010960	-	61	52.066	ENSACLG00000008650	-	97	52.066
ENSACLG00000010960	-	50	52.600	ENSACLG00000000407	-	99	52.600
ENSACLG00000010960	-	62	55.263	ENSACLG00000016439	-	99	55.263
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ENSACLG00000010960	-	81	48.112	ENSACLG00000009711	-	99	48.112
ENSACLG00000010960	-	66	42.980	ENSACLG00000020682	-	98	43.902
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ENSACLG00000010960	-	58	58.261	ENSACLG00000022810	-	87	58.261
ENSACLG00000010960	-	67	52.950	ENSACLG00000018185	-	98	52.950
ENSACLG00000010960	-	97	53.935	ENSACLG00000008405	-	99	53.935
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ENSACLG00000010960	-	61	48.636	ENSACLG00000023986	-	98	48.636
ENSACLG00000010960	-	57	58.319	ENSACLG00000013867	-	95	58.435
ENSACLG00000010960	-	62	55.592	ENSACLG00000002457	-	99	55.592
ENSACLG00000010960	-	77	47.949	ENSACLG00000013943	-	99	47.949
ENSACLG00000010960	-	58	58.609	ENSACLG00000004866	-	95	58.609
ENSACLG00000010960	-	74	36.822	ENSACLG00000023271	-	99	36.822
ENSACLG00000010960	-	62	55.428	ENSACLG00000026914	-	99	55.428
ENSACLG00000010960	-	81	47.990	ENSACLG00000018019	-	99	47.990
ENSACLG00000010960	-	66	53.149	ENSACLG00000021352	-	97	53.149
ENSACLG00000010960	-	66	56.061	ENSACLG00000009243	-	98	56.061
ENSACLG00000010960	-	53	51.985	ENSACLG00000010342	-	99	51.985
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ENSACLG00000010960	-	85	37.872	ENSACLG00000025005	-	99	37.872
ENSACLG00000010960	-	81	47.212	ENSACLG00000004681	-	98	47.212
ENSACLG00000010960	-	81	47.990	ENSACLG00000007135	-	99	47.990
ENSACLG00000010960	-	52	53.191	ENSACLG00000017714	-	99	53.191
ENSACLG00000010960	-	75	96.322	ENSACLG00000026562	-	100	96.322
ENSACLG00000010960	-	63	52.480	ENSACLG00000013012	-	98	52.480
ENSACLG00000010960	-	56	50.265	ENSACLG00000006203	-	86	50.265
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ENSACLG00000010960	-	66	46.936	ENSACLG00000026734	-	99	46.936
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ENSACLG00000010960	-	66	54.312	ENSACLG00000001588	-	98	54.312
ENSACLG00000010960	-	61	48.315	ENSACLG00000007604	-	98	48.315
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ENSACLG00000010960	-	53	51.017	ENSACLG00000019058	-	95	51.020
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ENSACLG00000010960	-	61	51.736	ENSACLG00000027266	-	92	51.736
ENSACLG00000010960	-	86	43.729	ENSACLG00000004816	-	98	44.457
ENSACLG00000010960	-	52	57.364	ENSACLG00000001010	-	100	57.364
ENSACLG00000010960	-	53	45.343	ENSACLG00000012388	-	98	46.303
ENSACLG00000010960	-	81	48.112	ENSACLG00000007871	-	99	48.112
ENSACLG00000010960	-	57	57.218	ENSACLG00000012608	-	95	57.218
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ENSACLG00000010960	-	53	52.174	ENSACLG00000010340	-	99	52.174
ENSACLG00000010960	-	89	38.365	ENSACLG00000019409	-	91	38.365
ENSACLG00000010960	-	57	51.681	ENSACLG00000001996	-	92	51.499
ENSACLG00000010960	-	60	96.271	ENSACLG00000004081	-	98	96.271
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ENSACLG00000010960	-	52	96.712	ENSACLG00000016051	-	100	96.712
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ENSACLG00000010960	-	62	55.263	ENSACLG00000015884	-	99	55.263
ENSACLG00000010960	-	89	48.488	ENSACLG00000009480	-	91	48.600
ENSACLG00000010960	-	52	57.282	ENSACLG00000004278	-	99	57.282
ENSACLG00000010960	-	50	54.418	ENSACLG00000014875	-	94	54.418
ENSACLG00000010960	-	89	38.033	ENSACLG00000009610	-	99	38.033
ENSACLG00000010960	-	68	51.760	ENSACLG00000009614	-	99	51.760
ENSACLG00000010960	-	61	52.231	ENSACLG00000019303	-	97	52.231
ENSACLG00000010960	-	77	37.422	ENSACLG00000015560	-	99	37.422
ENSACLG00000010960	-	57	58.144	ENSACLG00000025391	-	97	58.261
ENSACLG00000010960	-	77	56.047	ENSACLG00000006159	-	100	56.047
ENSACLG00000010960	-	90	55.430	ENSACLG00000020939	-	97	55.530
ENSACLG00000010960	-	54	45.455	ENSACLG00000010333	-	97	45.664
ENSACLG00000010960	-	86	47.972	ENSACLG00000017643	-	99	47.972
ENSACLG00000010960	-	56	52.236	ENSACLG00000022645	-	98	52.236
ENSACLG00000010960	-	62	55.263	ENSACLG00000013135	-	99	55.263
ENSACLG00000010960	-	52	59.144	ENSACLG00000024108	-	97	59.144
ENSACLG00000010960	-	53	45.518	ENSACLG00000010064	-	98	46.303
ENSACLG00000010960	-	58	56.818	ENSACLG00000015629	-	99	56.818
ENSACLG00000010960	-	66	42.796	ENSACLG00000005236	-	98	43.266
ENSACLG00000010960	-	89	44.995	ENSACLG00000002513	-	100	45.210
ENSACLG00000010960	-	52	95.938	ENSACLG00000010271	-	100	95.938
ENSACLG00000010960	-	81	47.990	ENSACLG00000000479	-	99	47.990
ENSACLG00000010960	-	81	47.868	ENSACLG00000009552	-	99	47.868
ENSACLG00000010960	-	72	49.374	ENSACLG00000025930	-	99	49.374
ENSACLG00000010960	-	51	52.745	ENSACLG00000005528	-	98	52.745

Orthologs

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ENSACLG00000010960	-	52	59.768	ENSATEG00000010371	-	99	59.768	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010960	-	93	55.326	ENSATEG00000006850	-	91	55.806	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010960	-	57	54.352	ENSATEG00000011431	-	100	54.352	Anabas_testudineus
ENSACLG00000010960	-	50	58.954	ENSATEG00000018669	-	99	58.954	Anabas_testudineus
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ENSACLG00000010960	-	66	56.712	ENSATEG00000005419	-	99	56.712	Anabas_testudineus
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ENSACLG00000010960	-	52	59.381	ENSATEG00000019660	-	99	59.381	Anabas_testudineus
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