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Description

Ensembl ID: ENSACLG00000011458 (Gene tree)
Gene ID: 113016052
Gene Symbol: ipo13
Alias: -
Full Name: importin 13
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 18465 bases
Position: chr23:6272337-6290801
Accession: ZDB-GENE-070706-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000016856	Xpo1	PF08389.12	1.6e-22	1	1
ENSACLP00000016856	IBN_N	PF03810.19	4.9e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000017267	-	2769	-	ENSACLP00000016856	922 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000011458	ipo13	99	69.817	ENSACLG00000013726	si:ch73-182a11.2	96	69.645

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000011458	ipo13	100	81.236	ENSG00000117408	IPO13	95	81.236	Homo_sapiens
ENSACLG00000011458	ipo13	99	70.398	ENSAPOG00000022358	si:ch73-182a11.2	96	70.291	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	99.024	ENSAPOG00000003308	ipo13	96	99.024	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	81.128	ENSAMEG00000001123	IPO13	95	81.128	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000011458	ipo13	99	93.709	ENSACIG00000008146	ipo13	100	93.804	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000011458	ipo13	99	69.742	ENSACIG00000011776	si:ch73-182a11.2	96	69.785	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000011458	ipo13	99	69.107	ENSAOCG00000024622	si:ch73-182a11.2	95	68.999	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000011458	ipo13	100	98.915	ENSAOCG00000004943	ipo13	96	98.915	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000011458	ipo13	100	98.915	ENSAPEG00000011282	ipo13	96	98.915	Amphiprion_percula
ENSACLG00000011458	ipo13	99	69.214	ENSAPEG00000001137	si:ch73-182a11.2	95	69.107	Amphiprion_percula
ENSACLG00000011458	ipo13	99	68.568	ENSATEG00000001251	si:ch73-182a11.2	98	68.314	Anabas_testudineus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	98.373	ENSATEG00000018367	ipo13	96	98.373	Anabas_testudineus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	81.907	ENSAPLG00000001349	IPO13	95	81.907	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000011458	ipo13	100	81.562	ENSACAG00000014300	IPO13	96	81.562	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000011458	ipo13	100	81.236	ENSANAG00000034183	IPO13	95	81.236	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000011458	ipo13	100	91.649	ENSAMXG00000005200	ipo13	96	91.649	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	64.100	ENSAMXG00000006313	si:ch73-182a11.2	96	64.100	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	80.477	ENSBTAG00000018887	IPO13	95	80.477	Bos_taurus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	81.345	ENSCJAG00000007453	IPO13	95	81.345	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	80.911	ENSCAFG00000004875	IPO13	95	80.911	Canis_familiaris
ENSACLG00000011458	ipo13	100	80.911	ENSCAFG00020017359	IPO13	95	80.911	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000011458	ipo13	100	80.586	ENSCHIG00000008341	IPO13	95	80.586	Capra_hircus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	81.236	ENSTSYG00000035980	IPO13	95	81.236	Carlito_syrichta
ENSACLG00000011458	ipo13	88	81.489	ENSCAPG00000001972	IPO13	94	81.489	Cavia_aperea
ENSACLG00000011458	ipo13	99	80.811	ENSCPOG00000012445	IPO13	95	80.811	Cavia_porcellus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	81.345	ENSCCAG00000022035	IPO13	95	81.345	Cebus_capucinus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	81.236	ENSCATG00000041276	IPO13	95	81.236	Cercocebus_atys
ENSACLG00000011458	ipo13	100	80.911	ENSCLAG00000002914	IPO13	95	80.911	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000011458	ipo13	100	81.236	ENSCSAG00000001190	IPO13	95	81.236	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000011458	ipo13	99	82.116	ENSCPBG00000003471	IPO13	100	82.116	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000011458	ipo13	100	37.647	ENSCING00000001863	-	97	37.540	Ciona_intestinalis
ENSACLG00000011458	ipo13	99	36.578	ENSCSAVG00000001368	-	97	36.471	Ciona_savignyi
ENSACLG00000011458	ipo13	100	81.236	ENSCANG00000009091	IPO13	95	81.236	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	79.935	ENSCGRG00001021177	Ipo13	95	79.935	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000011458	ipo13	100	79.935	ENSCGRG00000012411	Ipo13	95	79.935	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000011458	ipo13	100	94.252	ENSCSEG00000007713	ipo13	96	94.252	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000011458	ipo13	99	63.226	ENSCSEG00000016612	si:ch73-182a11.2	95	63.226	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000011458	ipo13	100	97.831	ENSCVAG00000013039	ipo13	96	97.831	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000011458	ipo13	97	66.371	ENSCVAG00000007910	si:ch73-182a11.2	96	66.371	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	66.486	ENSDARG00000076996	si:ch73-182a11.2	97	66.269	Danio_rerio
ENSACLG00000011458	ipo13	100	91.106	ENSDARG00000060618	ipo13	97	91.106	Danio_rerio
ENSACLG00000011458	ipo13	100	80.911	ENSDNOG00000016583	IPO13	95	80.911	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	81.128	ENSDORG00000005471	Ipo13	95	81.128	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000011458	ipo13	100	68.314	ENSEBUG00000006281	ipo13	100	67.711	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000011458	ipo13	100	80.911	ENSEASG00005001738	IPO13	95	80.911	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	80.911	ENSECAG00000015508	IPO13	95	80.911	Equus_caballus
ENSACLG00000011458	ipo13	68	85.185	ENSEEUG00000011681	IPO13	78	85.185	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	93.601	ENSELUG00000001498	ipo13	98	93.534	Esox_lucius
ENSACLG00000011458	ipo13	100	66.844	ENSELUG00000003341	si:ch73-182a11.2	96	66.631	Esox_lucius
ENSACLG00000011458	ipo13	100	81.020	ENSFCAG00000006488	IPO13	95	81.020	Felis_catus
ENSACLG00000011458	ipo13	99	81.788	ENSFALG00000005368	IPO13	100	81.788	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000011458	ipo13	100	80.803	ENSFDAG00000015599	IPO13	95	80.803	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000011458	ipo13	99	67.815	ENSFHEG00000015719	si:ch73-182a11.2	96	67.704	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	97.505	ENSFHEG00000023271	ipo13	96	97.505	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000011458	ipo13	99	59.549	ENSGMOG00000016863	si:ch73-182a11.2	95	59.719	Gadus_morhua
ENSACLG00000011458	ipo13	100	95.341	ENSGMOG00000015856	ipo13	96	95.341	Gadus_morhua
ENSACLG00000011458	ipo13	100	81.670	ENSGALG00000010087	IPO13	96	81.670	Gallus_gallus
ENSACLG00000011458	ipo13	99	67.492	ENSGAFG00000011643	si:ch73-182a11.2	96	67.277	Gambusia_affinis
ENSACLG00000011458	ipo13	100	97.614	ENSGAFG00000006361	ipo13	96	97.614	Gambusia_affinis
ENSACLG00000011458	ipo13	99	69.256	ENSGACG00000016242	si:ch73-182a11.2	95	69.256	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	95.558	ENSGACG00000014562	ipo13	96	95.558	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	82.124	ENSGAGG00000008331	IPO13	97	82.124	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000011458	ipo13	100	81.236	ENSGGOG00000016375	IPO13	95	81.236	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000011458	ipo13	99	68.743	ENSHBUG00000015271	si:ch73-182a11.2	95	68.568	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000011458	ipo13	100	99.783	ENSHBUG00000018605	ipo13	100	98.048	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000011458	ipo13	100	80.694	ENSHGLG00000001822	IPO13	95	80.694	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000011458	ipo13	100	80.694	ENSHGLG00100015830	IPO13	95	80.694	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000011458	ipo13	99	64.208	ENSHCOG00000005273	si:ch73-182a11.2	98	64.208	Hippocampus_comes
ENSACLG00000011458	ipo13	100	92.082	ENSHCOG00000018408	ipo13	94	94.940	Hippocampus_comes
ENSACLG00000011458	ipo13	100	59.892	ENSIPUG00000010787	si:ch73-182a11.2	97	59.892	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	90.239	ENSIPUG00000011283	IPO13	95	90.239	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	81.128	ENSSTOG00000003611	IPO13	95	81.128	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	80.911	ENSJJAG00000018591	Ipo13	95	80.911	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000011458	ipo13	99	97.593	ENSKMAG00000007869	ipo13	96	97.593	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000011458	ipo13	99	69.752	ENSKMAG00000006041	si:ch73-182a11.2	96	69.495	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000011458	ipo13	99	68.221	ENSLBEG00000011390	si:ch73-182a11.2	96	68.118	Labrus_bergylta
ENSACLG00000011458	ipo13	100	95.770	ENSLBEG00000007442	ipo13	95	95.770	Labrus_bergylta
ENSACLG00000011458	ipo13	75	31.902	ENSLACG00000002351	TNPO3	78	32.110	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000011458	ipo13	100	76.699	ENSLACG00000016657	IPO13	96	76.699	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000011458	ipo13	100	84.848	ENSLOCG00000010620	ipo13	96	84.848	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	79.351	ENSLAFG00000017144	IPO13	95	79.351	Loxodonta_africana
ENSACLG00000011458	ipo13	100	81.236	ENSMFAG00000032846	IPO13	95	81.236	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000011458	ipo13	100	81.236	ENSMMUG00000015142	IPO13	95	81.236	Macaca_mulatta
ENSACLG00000011458	ipo13	100	81.236	ENSMNEG00000041971	IPO13	95	81.236	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000011458	ipo13	100	81.236	ENSMLEG00000044330	IPO13	95	81.236	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	98.048	ENSMAMG00000017290	ipo13	96	98.048	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000011458	ipo13	99	69.645	ENSMAMG00000000328	si:ch73-182a11.2	96	69.495	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	100.000	ENSMZEG00005019335	ipo13	96	100.000	Maylandia_zebra
ENSACLG00000011458	ipo13	99	69.710	ENSMZEG00005009283	si:ch73-182a11.2	96	69.537	Maylandia_zebra
ENSACLG00000011458	ipo13	100	80.152	ENSMGAG00000009898	IPO13	98	80.152	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000011458	ipo13	82	82.190	ENSMAUG00000013018	Ipo13	94	82.190	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000011458	ipo13	93	83.776	ENSMICG00000011003	IPO13	95	82.639	Microcebus_murinus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	80.694	ENSMOCG00000008881	Ipo13	95	80.694	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000011458	ipo13	99	67.241	ENSMMOG00000018046	si:ch73-182a11.2	96	67.026	Mola_mola
ENSACLG00000011458	ipo13	100	94.143	ENSMMOG00000001954	ipo13	98	94.143	Mola_mola
ENSACLG00000011458	ipo13	99	81.134	ENSMODG00000003017	IPO13	100	81.134	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000011458	ipo13	99	95.983	ENSMALG00000010805	ipo13	100	95.983	Monopterus_albus
ENSACLG00000011458	ipo13	81	69.536	ENSMALG00000006451	si:ch73-182a11.2	94	69.536	Monopterus_albus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	80.911	MGP_CAROLIEiJ_G0026367	Ipo13	95	80.911	Mus_caroli
ENSACLG00000011458	ipo13	100	80.911	ENSMUSG00000033365	Ipo13	95	80.911	Mus_musculus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	83.550	MGP_PahariEiJ_G0028698	Ipo13	97	83.550	Mus_pahari
ENSACLG00000011458	ipo13	100	80.911	MGP_SPRETEiJ_G0027339	Ipo13	95	80.911	Mus_spretus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	75.255	ENSMPUG00000013635	IPO13	96	75.255	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000011458	ipo13	100	81.128	ENSMLUG00000006360	IPO13	95	81.128	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000011458	ipo13	100	81.020	ENSNGAG00000013019	Ipo13	95	81.020	Nannospalax_galili
ENSACLG00000011458	ipo13	87	73.029	ENSNBRG00000006781	si:ch73-182a11.2	92	73.029	Neolamprologus_brichardi
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