EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000011642 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12776 bases
Position: chrLS419793.1:456990-469765
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000017104	zf-C2H2	PF00096.26	4e-61	1	12
ENSACLP00000017104	zf-C2H2	PF00096.26	4e-61	2	12
ENSACLP00000017104	zf-C2H2	PF00096.26	4e-61	3	12
ENSACLP00000017104	zf-C2H2	PF00096.26	4e-61	4	12
ENSACLP00000017104	zf-C2H2	PF00096.26	4e-61	5	12
ENSACLP00000017104	zf-C2H2	PF00096.26	4e-61	6	12
ENSACLP00000017104	zf-C2H2	PF00096.26	4e-61	7	12
ENSACLP00000017104	zf-C2H2	PF00096.26	4e-61	8	12
ENSACLP00000017104	zf-C2H2	PF00096.26	4e-61	9	12
ENSACLP00000017104	zf-C2H2	PF00096.26	4e-61	10	12
ENSACLP00000017104	zf-C2H2	PF00096.26	4e-61	11	12
ENSACLP00000017104	zf-C2H2	PF00096.26	4e-61	12	12
ENSACLP00000017104	zf-met	PF12874.7	1.9e-27	1	5
ENSACLP00000017104	zf-met	PF12874.7	1.9e-27	2	5
ENSACLP00000017104	zf-met	PF12874.7	1.9e-27	3	5
ENSACLP00000017104	zf-met	PF12874.7	1.9e-27	4	5
ENSACLP00000017104	zf-met	PF12874.7	1.9e-27	5	5

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000017518	-	1293	-	ENSACLP00000017104	430 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000011642	-	78	45.802	ENSACLG00000018716	-	86	45.455
ENSACLG00000011642	-	99	39.403	ENSACLG00000016841	-	84	31.511
ENSACLG00000011642	-	81	45.583	ENSACLG00000020260	-	99	45.583
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ENSACLG00000011642	-	100	59.130	ENSACLG00000023513	-	97	59.504
ENSACLG00000011642	-	83	32.143	ENSACLG00000026103	znf526	64	34.465
ENSACLG00000011642	-	82	52.968	ENSACLG00000012251	-	50	52.968
ENSACLG00000011642	-	78	37.815	ENSACLG00000017449	-	59	39.683
ENSACLG00000011642	-	80	50.714	ENSACLG00000015462	-	61	50.714
ENSACLG00000011642	-	98	56.024	ENSACLG00000024459	-	88	58.261
ENSACLG00000011642	-	86	54.000	ENSACLG00000021184	-	63	54.000
ENSACLG00000011642	-	82	44.369	ENSACLG00000027424	-	67	44.369
ENSACLG00000011642	-	99	57.714	ENSACLG00000024670	-	89	57.714
ENSACLG00000011642	-	78	42.424	ENSACLG00000004663	-	73	42.424
ENSACLG00000011642	-	81	46.696	ENSACLG00000019270	-	78	46.696
ENSACLG00000011642	-	80	39.550	ENSACLG00000014600	-	90	39.662
ENSACLG00000011642	-	78	42.014	ENSACLG00000015816	-	92	42.014
ENSACLG00000011642	-	97	48.936	ENSACLG00000026538	-	94	51.838
ENSACLG00000011642	-	78	42.857	ENSACLG00000012046	-	55	39.394
ENSACLG00000011642	-	94	57.692	ENSACLG00000020975	-	93	57.692
ENSACLG00000011642	-	78	34.016	ENSACLG00000022287	-	59	34.016
ENSACLG00000011642	-	80	54.878	ENSACLG00000019424	-	96	44.688
ENSACLG00000011642	-	78	42.932	ENSACLG00000019482	-	94	42.932
ENSACLG00000011642	-	100	43.612	ENSACLG00000006757	-	56	41.739
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ENSACLG00000011642	-	79	45.509	ENSACLG00000000411	-	89	45.509
ENSACLG00000011642	-	82	42.403	ENSACLG00000022475	-	89	42.403
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ENSACLG00000011642	-	78	36.778	ENSACLG00000005594	ZNF319	95	40.328
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ENSACLG00000011642	-	81	51.020	ENSACLG00000014349	znf341	50	43.478
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ENSACLG00000011642	-	65	53.521	ENSACLG00000020333	-	52	53.521
ENSACLG00000011642	-	73	58.482	ENSACLG00000013935	-	81	58.482
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Orthologs

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ENSACLG00000011642	-	81	40.719	ENSEBUG00000015155	-	68	40.719	Eptatretus_burgeri
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