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Description

Ensembl ID: ENSACLG00000011828 (Gene tree)
Gene ID: 113022763
Gene Symbol: celf4
Alias: zgc:92761
Full Name: CUGBP Elav-like family member 4
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 87562 bases
Position: chr5:26677436-26764997
Accession: 113022763
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000017456	RRM_1	PF00076.22	1.1e-52	1	3
ENSACLP00000017456	RRM_1	PF00076.22	1.1e-52	2	3
ENSACLP00000017456	RRM_1	PF00076.22	1.1e-52	3	3
ENSACLP00000017413	RRM_1	PF00076.22	1.5e-52	1	3
ENSACLP00000017413	RRM_1	PF00076.22	1.5e-52	2	3
ENSACLP00000017413	RRM_1	PF00076.22	1.5e-52	3	3
ENSACLP00000017390	RRM_1	PF00076.22	1.7e-41	1	3
ENSACLP00000017390	RRM_1	PF00076.22	1.7e-41	2	3
ENSACLP00000017390	RRM_1	PF00076.22	1.7e-41	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000017873	-	1980	-	ENSACLP00000017456	488 (aa)	XP_026024320	UPI00032A125F
ENSACLT00000017831	-	2091	-	ENSACLP00000017413	525 (aa)	XP_026024315	UPI0006C9C22E
ENSACLT00000017808	-	1323	-	ENSACLP00000017390	440 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000011828	celf4	82	66.106	ENSACLG00000009631	celf3a	97	66.024
ENSACLG00000011828	celf4	66	31.818	ENSACLG00000002317	-	53	34.177
ENSACLG00000011828	celf4	95	46.733	ENSACLG00000013768	-	85	80.952
ENSACLG00000011828	celf4	55	33.750	ENSACLG00000013048	RBMS1	55	33.750
ENSACLG00000011828	celf4	70	35.821	ENSACLG00000002786	elavl4	73	40.741
ENSACLG00000011828	celf4	86	95.238	ENSACLG00000016215	si:dkey-205h23.2	99	95.238
ENSACLG00000011828	celf4	67	32.500	ENSACLG00000002393	rbms2a	78	32.500
ENSACLG00000011828	celf4	74	34.375	ENSACLG00000018260	elavl3	85	41.860
ENSACLG00000011828	celf4	59	41.975	ENSACLG00000002715	ELAVL2	77	41.975
ENSACLG00000011828	celf4	52	45.679	ENSACLG00000009328	elavl1a	78	45.679
ENSACLG00000011828	celf4	56	47.436	ENSACLG00000019504	-	92	46.914
ENSACLG00000011828	celf4	56	37.349	ENSACLG00000009399	pabpc1a	57	37.349
ENSACLG00000011828	celf4	91	47.948	ENSACLG00000010181	-	98	46.336
ENSACLG00000011828	celf4	91	46.186	ENSACLG00000003085	-	98	47.447
ENSACLG00000011828	celf4	57	36.250	ENSACLG00000018506	rbms3	56	36.250
ENSACLG00000011828	celf4	91	72.985	ENSACLG00000020342	celf3b	100	72.052
ENSACLG00000011828	celf4	91	75.055	ENSACLG00000023709	celf5a	85	74.398

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000011828	celf4	100	81.678	ENSG00000101489	CELF4	100	94.030	Homo_sapiens
ENSACLG00000011828	celf4	100	99.810	ENSAPOG00000002964	celf4	100	99.810	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000011828	celf4	88	81.473	ENSAMEG00000017059	CELF4	99	82.143	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000011828	celf4	99	92.273	ENSACIG00000018097	celf4	100	92.273	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000011828	celf4	100	99.810	ENSAOCG00000020590	celf4	100	99.810	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000011828	celf4	55	68.699	ENSAOCG00000019919	-	78	69.531	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000011828	celf4	99	95.260	ENSAPEG00000002940	celf4	99	95.260	Amphiprion_percula
ENSACLG00000011828	celf4	99	95.238	ENSATEG00000023731	celf4	100	95.238	Anabas_testudineus
ENSACLG00000011828	celf4	72	75.063	ENSAPLG00000007830	-	100	74.811	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000011828	celf4	50	84.615	ENSACAG00000012428	CELF4	92	87.500	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000011828	celf4	100	81.678	ENSANAG00000029499	CELF4	100	82.340	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000011828	celf4	100	93.905	ENSAMXG00000007935	celf4	100	93.905	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000011828	celf4	100	82.056	ENSBTAG00000004940	CELF4	98	92.683	Bos_taurus
ENSACLG00000011828	celf4	100	80.632	ENSCJAG00000021135	CELF4	100	80.736	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000011828	celf4	100	82.056	ENSCHIG00000007169	CELF4	98	92.683	Capra_hircus
ENSACLG00000011828	celf4	94	81.250	ENSTSYG00000000816	CELF4	80	87.742	Carlito_syrichta
ENSACLG00000011828	celf4	100	79.208	ENSCPOG00000035956	CELF4	99	80.000	Cavia_porcellus
ENSACLG00000011828	celf4	100	81.678	ENSCCAG00000028373	CELF4	100	82.340	Cebus_capucinus
ENSACLG00000011828	celf4	100	81.678	ENSCATG00000045293	CELF4	100	82.340	Cercocebus_atys
ENSACLG00000011828	celf4	100	83.762	ENSCLAG00000008344	CELF4	99	84.554	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000011828	celf4	90	87.921	ENSCSAG00000017933	CELF4	100	89.888	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000011828	celf4	92	83.473	ENSCPBG00000005237	CELF4	96	84.034	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000011828	celf4	100	81.678	ENSCANG00000036735	CELF4	100	82.340	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000011828	celf4	76	77.573	ENSCGRG00001018085	Celf4	89	78.947	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000011828	celf4	100	99.048	ENSCSEG00000007074	celf4	99	100.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000011828	celf4	100	93.065	ENSCVAG00000017617	celf4	100	94.183	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000011828	celf4	100	94.476	ENSDARG00000070045	celf4	100	95.802	Danio_rerio
ENSACLG00000011828	celf4	90	84.511	ENSDNOG00000032492	CELF4	99	86.957	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000011828	celf4	100	83.762	ENSDORG00000007169	Celf4	99	84.554	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000011828	celf4	78	93.750	ENSETEG00000007432	-	53	93.750	Echinops_telfairi
ENSACLG00000011828	celf4	100	82.495	ENSEASG00005016534	CELF4	100	82.340	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000011828	celf4	100	80.632	ENSECAG00000008810	CELF4	99	81.225	Equus_caballus
ENSACLG00000011828	celf4	87	66.216	ENSEEUG00000003763	CELF4	99	66.892	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000011828	celf4	100	82.294	ENSFCAG00000045234	CELF4	100	82.522	Felis_catus
ENSACLG00000011828	celf4	90	89.045	ENSFALG00000009188	CELF4	98	90.169	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000011828	celf4	100	79.802	ENSFDAG00000010287	CELF4	99	80.000	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000011828	celf4	99	80.810	ENSFHEG00000003431	celf4	99	85.163	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000011828	celf4	85	92.683	ENSGMOG00000011747	-	74	92.683	Gadus_morhua
ENSACLG00000011828	celf4	100	78.368	ENSGMOG00000008703	celf4	100	78.368	Gadus_morhua
ENSACLG00000011828	celf4	100	99.048	ENSGAFG00000021515	celf4	94	98.861	Gambusia_affinis
ENSACLG00000011828	celf4	100	91.098	ENSGACG00000008752	celf4	100	91.082	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000011828	celf4	71	85.185	ENSGAGG00000017672	-	86	90.217	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000011828	celf4	63	81.789	ENSGAGG00000023014	-	98	83.067	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000011828	celf4	100	81.678	ENSGGOG00000013920	CELF4	100	82.340	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000011828	celf4	100	100.000	ENSHBUG00000021618	celf4	100	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000011828	celf4	100	80.990	ENSHGLG00000003130	CELF4	99	81.188	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000011828	celf4	100	83.168	ENSHGLG00100006394	CELF4	99	83.960	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000011828	celf4	100	91.031	ENSHCOG00000012195	celf4	100	90.359	Hippocampus_comes
ENSACLG00000011828	celf4	100	84.190	ENSIPUG00000010810	celf4	96	83.683	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000011828	celf4	100	82.970	ENSJJAG00000016892	Celf4	99	83.762	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000011828	celf4	100	98.476	ENSKMAG00000019602	celf4	100	98.476	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000011828	celf4	100	93.946	ENSLBEG00000000940	celf4	100	93.946	Labrus_bergylta
ENSACLG00000011828	celf4	93	81.390	ENSLOCG00000004792	celf4	99	81.390	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000011828	celf4	100	83.730	ENSLAFG00000021352	CELF4	99	84.524	Loxodonta_africana
ENSACLG00000011828	celf4	100	81.678	ENSMFAG00000042983	CELF4	100	82.340	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000011828	celf4	100	80.990	ENSMMUG00000006866	CELF4	99	81.386	Macaca_mulatta
ENSACLG00000011828	celf4	100	82.294	ENSMNEG00000033449	CELF4	100	82.340	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000011828	celf4	92	80.440	ENSMLEG00000028543	CELF4	99	80.659	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000011828	celf4	100	94.382	ENSMAMG00000018573	celf4	99	94.382	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000011828	celf4	100	100.000	ENSMZEG00005026879	celf4	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSACLG00000011828	celf4	64	67.296	ENSMGAG00000017029	CELF4	100	67.508	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000011828	celf4	100	80.632	ENSMICG00000006984	CELF4	100	80.736	Microcebus_murinus
ENSACLG00000011828	celf4	100	83.366	ENSMOCG00000011985	Celf4	99	84.356	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000011828	celf4	99	94.104	ENSMMOG00000012281	celf4	100	94.104	Mola_mola
ENSACLG00000011828	celf4	78	70.757	ENSMODG00000000306	CELF4	91	78.613	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000011828	celf4	100	99.429	ENSMALG00000001696	celf4	100	99.429	Monopterus_albus
ENSACLG00000011828	celf4	100	83.564	MGP_CAROLIEiJ_G0022058	Celf4	100	83.473	Mus_caroli
ENSACLG00000011828	celf4	100	83.702	ENSMUSG00000024268	Celf4	99	86.720	Mus_musculus
ENSACLG00000011828	celf4	100	83.564	MGP_PahariEiJ_G0018792	Celf4	100	83.473	Mus_pahari
ENSACLG00000011828	celf4	100	83.564	MGP_SPRETEiJ_G0022969	Celf4	99	84.356	Mus_spretus
ENSACLG00000011828	celf4	86	92.857	ENSMPUG00000001027	CELF4	100	72.834	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000011828	celf4	90	87.131	ENSMLUG00000001755	CELF4	100	87.131	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000011828	celf4	100	83.762	ENSNGAG00000000761	Celf4	99	84.554	Nannospalax_galili
ENSACLG00000011828	celf4	100	100.000	ENSNBRG00000018194	celf4	100	100.000	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000011828	celf4	77	77.937	ENSMEUG00000007202	-	100	78.510	Notamacropus_eugenii
ENSACLG00000011828	celf4	89	81.013	ENSOPRG00000014415	CELF4	89	81.329	Ochotona_princeps
ENSACLG00000011828	celf4	100	83.762	ENSODEG00000018464	CELF4	99	84.554	Octodon_degus
ENSACLG00000011828	celf4	100	99.619	ENSONIG00000019463	celf4	100	99.619	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000011828	celf4	88	85.092	ENSOCUG00000024790	CELF4	81	85.321	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000011828	celf4	100	99.429	ENSORLG00000008913	celf4	100	99.429	Oryzias_latipes
ENSACLG00000011828	celf4	100	99.429	ENSORLG00020008454	celf4	100	99.429	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000011828	celf4	100	99.429	ENSORLG00015004115	celf4	100	99.429	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000011828	celf4	100	99.619	ENSOMEG00000002391	celf4	100	99.619	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000011828	celf4	94	80.000	ENSOGAG00000010018	CELF4	100	81.647	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000011828	celf4	63	84.076	ENSOARG00000005276	CELF4	100	86.943	Ovis_aries
ENSACLG00000011828	celf4	92	83.956	ENSPPAG00000020644	CELF4	99	84.176	Pan_paniscus
ENSACLG00000011828	celf4	100	81.678	ENSPPRG00000007683	CELF4	100	82.340	Panthera_pardus
ENSACLG00000011828	celf4	100	81.678	ENSPTRG00000009982	CELF4	100	82.340	Pan_troglodytes
ENSACLG00000011828	celf4	100	81.678	ENSPANG00000006365	CELF4	100	82.340	Papio_anubis
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