EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000012014 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2715 bases
Position: chr7:21328834-21331548
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000017562	RVT_1	PF00078.27	1e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000017981	-	2715	-	ENSACLP00000017562	904 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000012014	-	83	42.252	ENSACLG00000012019	-	99	42.252
ENSACLG00000012014	-	52	50.633	ENSACLG00000014537	-	99	50.633
ENSACLG00000012014	-	100	99.004	ENSACLG00000015650	-	100	99.004
ENSACLG00000012014	-	65	45.946	ENSACLG00000015659	-	99	45.946
ENSACLG00000012014	-	54	35.642	ENSACLG00000016231	-	83	34.827
ENSACLG00000012014	-	92	45.305	ENSACLG00000002468	-	98	45.305
ENSACLG00000012014	-	55	43.548	ENSACLG00000012352	-	99	43.548
ENSACLG00000012014	-	64	45.769	ENSACLG00000022169	-	97	45.769
ENSACLG00000012014	-	54	31.643	ENSACLG00000023590	-	97	31.237
ENSACLG00000012014	-	99	40.914	ENSACLG00000027511	-	78	40.914
ENSACLG00000012014	-	59	98.883	ENSACLG00000015507	-	99	98.883
ENSACLG00000012014	-	75	44.772	ENSACLG00000005017	-	99	44.772
ENSACLG00000012014	-	70	50.157	ENSACLG00000003670	-	99	50.157
ENSACLG00000012014	-	54	31.070	ENSACLG00000008551	-	87	31.070
ENSACLG00000012014	-	52	48.298	ENSACLG00000014661	-	99	48.298
ENSACLG00000012014	-	100	99.004	ENSACLG00000025119	-	100	99.004
ENSACLG00000012014	-	52	53.782	ENSACLG00000012219	-	99	53.782
ENSACLG00000012014	-	57	48.369	ENSACLG00000005921	-	99	48.369
ENSACLG00000012014	-	67	40.630	ENSACLG00000004144	-	83	40.630
ENSACLG00000012014	-	75	41.691	ENSACLG00000009807	-	94	41.691
ENSACLG00000012014	-	71	47.360	ENSACLG00000005570	-	99	47.360
ENSACLG00000012014	-	64	45.704	ENSACLG00000015704	-	94	45.704
ENSACLG00000012014	-	52	98.517	ENSACLG00000019420	-	99	94.800
ENSACLG00000012014	-	92	45.540	ENSACLG00000004826	-	98	45.540
ENSACLG00000012014	-	79	44.011	ENSACLG00000013061	-	98	44.011
ENSACLG00000012014	-	62	42.215	ENSACLG00000005642	-	99	42.215
ENSACLG00000012014	-	74	96.852	ENSACLG00000005212	-	100	96.852
ENSACLG00000012014	-	62	99.109	ENSACLG00000000182	-	100	99.109
ENSACLG00000012014	-	51	45.203	ENSACLG00000012094	-	97	45.203
ENSACLG00000012014	-	74	99.255	ENSACLG00000020183	-	100	99.255
ENSACLG00000012014	-	59	97.393	ENSACLG00000009903	-	95	97.393
ENSACLG00000012014	-	99	42.464	ENSACLG00000017412	-	97	42.464
ENSACLG00000012014	-	74	99.106	ENSACLG00000008571	-	100	99.106
ENSACLG00000012014	-	67	44.646	ENSACLG00000014642	-	99	44.646
ENSACLG00000012014	-	92	45.423	ENSACLG00000023885	-	98	45.423
ENSACLG00000012014	-	51	53.132	ENSACLG00000006014	-	100	53.132
ENSACLG00000012014	-	60	94.679	ENSACLG00000018945	-	93	94.679
ENSACLG00000012014	-	73	50.743	ENSACLG00000013805	-	80	50.743
ENSACLG00000012014	-	72	48.930	ENSACLG00000008859	-	96	48.930
ENSACLG00000012014	-	70	49.687	ENSACLG00000014746	-	99	49.687
ENSACLG00000012014	-	51	79.221	ENSACLG00000005844	-	84	79.221
ENSACLG00000012014	-	50	98.884	ENSACLG00000001556	-	95	98.884
ENSACLG00000012014	-	52	55.042	ENSACLG00000009011	-	99	55.042
ENSACLG00000012014	-	100	96.018	ENSACLG00000005662	-	100	96.018
ENSACLG00000012014	-	71	96.714	ENSACLG00000023557	-	99	96.714
ENSACLG00000012014	-	85	46.096	ENSACLG00000027996	-	99	46.096
ENSACLG00000012014	-	76	44.068	ENSACLG00000002614	-	99	44.068
ENSACLG00000012014	-	57	97.303	ENSACLG00000006327	-	100	97.303
ENSACLG00000012014	-	100	98.673	ENSACLG00000000393	-	100	98.673
ENSACLG00000012014	-	97	98.855	ENSACLG00000000395	-	100	98.855
ENSACLG00000012014	-	74	98.510	ENSACLG00000001758	-	100	98.510
ENSACLG00000012014	-	100	99.004	ENSACLG00000025376	-	100	99.004
ENSACLG00000012014	-	71	50.847	ENSACLG00000022841	-	82	50.847
ENSACLG00000012014	-	91	41.627	ENSACLG00000009939	-	83	41.627
ENSACLG00000012014	-	58	98.846	ENSACLG00000024400	-	100	98.846
ENSACLG00000012014	-	92	41.518	ENSACLG00000021051	-	99	41.518
ENSACLG00000012014	-	82	40.296	ENSACLG00000015331	-	93	40.296
ENSACLG00000012014	-	94	99.293	ENSACLG00000009850	-	97	99.293
ENSACLG00000012014	-	74	98.957	ENSACLG00000001405	-	100	98.957
ENSACLG00000012014	-	83	42.119	ENSACLG00000020248	-	99	42.119
ENSACLG00000012014	-	72	97.542	ENSACLG00000014915	-	100	97.542
ENSACLG00000012014	-	71	51.156	ENSACLG00000014911	-	99	51.156
ENSACLG00000012014	-	62	98.930	ENSACLG00000021814	-	100	98.930
ENSACLG00000012014	-	92	45.423	ENSACLG00000008391	-	98	45.423
ENSACLG00000012014	-	100	98.783	ENSACLG00000010900	-	100	98.783
ENSACLG00000012014	-	58	45.644	ENSACLG00000018107	-	98	44.708
ENSACLG00000012014	-	100	99.115	ENSACLG00000022844	-	100	99.115
ENSACLG00000012014	-	59	48.603	ENSACLG00000017297	-	99	49.074
ENSACLG00000012014	-	50	48.478	ENSACLG00000021937	-	96	48.478
ENSACLG00000012014	-	52	57.717	ENSACLG00000000230	-	99	57.717
ENSACLG00000012014	-	100	40.088	ENSACLG00000003857	-	80	40.088
ENSACLG00000012014	-	61	47.559	ENSACLG00000010082	-	98	47.559
ENSACLG00000012014	-	56	30.435	ENSACLG00000017241	-	83	30.040
ENSACLG00000012014	-	67	97.030	ENSACLG00000012279	-	98	97.030
ENSACLG00000012014	-	89	45.973	ENSACLG00000008383	-	97	45.973
ENSACLG00000012014	-	85	98.442	ENSACLG00000018252	-	98	98.442
ENSACLG00000012014	-	100	42.123	ENSACLG00000007643	-	85	42.123
ENSACLG00000012014	-	100	99.336	ENSACLG00000015667	-	100	99.336
ENSACLG00000012014	-	51	45.238	ENSACLG00000012447	-	99	45.238
ENSACLG00000012014	-	58	54.511	ENSACLG00000022853	-	97	54.511
ENSACLG00000012014	-	96	43.800	ENSACLG00000000734	-	99	43.800
ENSACLG00000012014	-	75	49.057	ENSACLG00000000736	-	97	49.057
ENSACLG00000012014	-	56	39.961	ENSACLG00000008832	-	99	40.351
ENSACLG00000012014	-	51	31.957	ENSACLG00000010366	-	99	31.522
ENSACLG00000012014	-	82	99.054	ENSACLG00000013844	-	96	99.054
ENSACLG00000012014	-	91	97.202	ENSACLG00000017448	-	99	97.202
ENSACLG00000012014	-	83	42.876	ENSACLG00000019194	-	99	43.007
ENSACLG00000012014	-	91	42.788	ENSACLG00000009590	-	98	42.788
ENSACLG00000012014	-	61	98.182	ENSACLG00000010664	-	99	98.182
ENSACLG00000012014	-	73	30.938	ENSACLG00000006988	-	98	30.352
ENSACLG00000012014	-	51	45.905	ENSACLG00000011058	-	96	45.905
ENSACLG00000012014	-	89	40.470	ENSACLG00000019519	-	98	40.470
ENSACLG00000012014	-	58	47.048	ENSACLG00000013932	-	96	47.048
ENSACLG00000012014	-	92	45.657	ENSACLG00000021287	-	98	45.657
ENSACLG00000012014	-	52	42.979	ENSACLG00000008218	-	100	42.979
ENSACLG00000012014	-	79	44.011	ENSACLG00000017692	-	98	44.011
ENSACLG00000012014	-	70	50.390	ENSACLG00000005547	-	99	50.390
ENSACLG00000012014	-	58	46.970	ENSACLG00000025957	-	99	46.970
ENSACLG00000012014	-	75	44.772	ENSACLG00000014413	-	99	44.772
ENSACLG00000012014	-	74	98.659	ENSACLG00000000536	-	100	98.659
ENSACLG00000012014	-	85	45.466	ENSACLG00000020864	-	99	45.466
ENSACLG00000012014	-	52	57.082	ENSACLG00000025009	-	99	57.082

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000012014	-	94	45.116	ENSATEG00000010674	-	99	45.116	Anabas_testudineus
ENSACLG00000012014	-	94	45.116	ENSATEG00000019512	-	99	45.116	Anabas_testudineus
ENSACLG00000012014	-	68	48.377	ENSATEG00000015490	-	99	48.377	Anabas_testudineus
ENSACLG00000012014	-	68	48.539	ENSATEG00000002739	-	99	48.539	Anabas_testudineus
ENSACLG00000012014	-	51	51.777	ENSATEG00000004857	-	99	51.777	Anabas_testudineus
ENSACLG00000012014	-	55	50.598	ENSATEG00000015931	-	99	50.598	Anabas_testudineus
ENSACLG00000012014	-	56	50.000	ENSATEG00000014607	-	98	50.000	Anabas_testudineus
ENSACLG00000012014	-	62	41.831	ENSATEG00000004798	-	97	41.831	Anabas_testudineus
ENSACLG00000012014	-	99	36.424	ENSATEG00000012907	-	92	36.645	Anabas_testudineus
ENSACLG00000012014	-	90	35.610	ENSATEG00000005707	-	99	35.854	Anabas_testudineus
ENSACLG00000012014	-	67	38.134	ENSATEG00000023197	-	94	38.079	Anabas_testudineus
ENSACLG00000012014	-	53	35.343	ENSAMXG00000037974	-	91	35.343	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000012014	-	72	60.000	ENSAMXG00000032588	-	99	60.000	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000012014	-	88	46.675	ENSAMXG00000033551	-	95	46.675	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000012014	-	88	33.047	ENSAMXG00000036646	-	89	34.406	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000012014	-	54	65.226	ENSAMXG00000043461	-	98	65.226	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000012014	-	77	36.519	ENSAMXG00000030246	-	97	36.805	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000012014	-	89	57.002	ENSAMXG00000043574	-	99	57.002	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000012014	-	83	48.344	ENSAMXG00000043096	-	99	48.344	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000012014	-	72	32.153	ENSAMXG00000033415	-	88	33.584	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000012014	-	99	35.268	ENSAMXG00000040053	-	92	35.449	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000012014	-	60	51.188	ENSAMXG00000040860	-	98	51.188	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000012014	-	70	59.219	ENSAMXG00000041791	-	95	59.219	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000012014	-	89	57.196	ENSAMXG00000039914	-	99	57.196	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000012014	-	63	35.529	ENSAMXG00000041363	-	97	35.529	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000012014	-	52	62.633	ENSAMXG00000043740	-	95	62.633	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000012014	-	55	64.329	ENSFHEG00000008959	-	100	64.329	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000012014	-	64	39.831	ENSHBUG00000016298	-	99	39.831	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000012014	-	51	43.750	ENSHBUG00000015916	-	98	43.750	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000012014	-	59	37.616	ENSIPUG00000009483	-	99	37.989	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000012014	-	84	37.565	ENSIPUG00000013060	-	90	37.827	Ictalurus_punctatus
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ENSACLG00000012014	-	67	81.967	ENSOMEG00000008893	-	99	81.967	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000012014	-	58	85.385	ENSOMEG00000000651	-	100	85.385	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000012014	-	58	85.577	ENSOMEG00000014130	-	100	85.577	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000012014	-	69	31.366	ENSOMEG00000023554	-	97	31.366	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000012014	-	75	41.424	ENSOMEG00000010070	-	100	41.558	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000012014	-	67	83.003	ENSOMEG00000004562	-	95	83.003	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000012014	-	100	79.093	ENSOMEG00000019543	-	100	79.093	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000012014	-	99	79.356	ENSOMEG00000018218	-	99	79.356	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000012014	-	99	47.072	ENSOMEG00000015779	-	95	47.072	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000012014	-	99	39.471	ENSOMEG00000012480	-	85	39.471	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000012014	-	52	47.569	ENSPKIG00000025243	-	99	47.569	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000012014	-	50	48.661	ENSPREG00000011748	-	85	48.661	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000012014	-	53	47.500	ENSPREG00000000138	-	95	47.817	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000012014	-	51	43.668	ENSPREG00000009370	-	99	43.668	Poecilia_reticulata
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ENSACLG00000012014	-	50	70.288	ENSPREG00000015023	-	96	70.288	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000012014	-	59	70.189	ENSPREG00000006761	-	99	70.189	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000012014	-	62	45.811	ENSPNYG00000010678	-	99	45.811	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000012014	-	74	98.063	ENSPNYG00000008434	-	100	98.063	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000012014	-	58	57.685	ENSPNAG00000001796	-	99	57.685	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000012014	-	57	30.899	ENSSFOG00015004172	-	89	30.899	Scleropages_formosus
ENSACLG00000012014	-	64	41.356	ENSSLDG00000007615	-	97	41.286	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000012014	-	79	40.694	ENSXMAG00000020920	-	99	40.694	Xiphophorus_maculatus
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ENSACLG00000012014	-	61	47.576	ENSXMAG00000027740	-	99	47.576	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000012014	-	67	46.470	ENSXMAG00000027958	-	93	46.470	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000012014	-	100	43.249	ENSXMAG00000021735	-	81	43.249	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000012014	-	61	47.397	ENSXMAG00000020915	-	99	47.397	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000012014	-	59	69.492	ENSXMAG00000024274	-	99	69.492	Xiphophorus_maculatus