EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000012094 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1449 bases
Position: chr3:4931795-4933243
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000017684	RVT_1	PF00078.27	1.8e-42	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000018105	-	1449	-	ENSACLP00000017684	482 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

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ENSACLG00000012094	-	88	44.366	ENSPKIG00000003826	-	71	44.366	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000012094	-	80	48.969	ENSPKIG00000024437	-	69	48.969	Paramormyrops_kingsleyae
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ENSACLG00000012094	-	97	46.203	ENSPMEG00000002401	-	53	46.203	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000012094	-	74	47.107	ENSPREG00000012441	-	82	47.107	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000012094	-	55	53.759	ENSPREG00000020670	-	58	53.759	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000012094	-	91	54.362	ENSPNAG00000009566	-	84	54.362	Pygocentrus_nattereri
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ENSACLG00000012094	-	80	69.898	ENSSMAG00000020789	-	71	69.898	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000012094	-	73	73.295	ENSSMAG00000017564	-	83	73.295	Scophthalmus_maximus
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ENSACLG00000012094	-	94	49.002	ENSSDUG00000012909	-	72	47.826	Seriola_dumerili
ENSACLG00000012094	-	73	39.607	ENSSPUG00000004689	-	65	39.607	Sphenodon_punctatus
ENSACLG00000012094	-	87	66.983	ENSTRUG00000024195	-	93	66.983	Takifugu_rubripes
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ENSACLG00000012094	-	81	67.513	ENSTRUG00000024564	-	88	67.513	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000012094	-	97	46.596	ENSXMAG00000028039	-	67	46.596	Xiphophorus_maculatus