EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000012223 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3105 bases
Position: chr3:5191381-5194485
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000017865	RVT_1	PF00078.27	1.6e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000018291	-	3105	-	ENSACLP00000017865	1034 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000012223	-	62	41.615	ENSACLG00000010059	-	70	41.615
ENSACLG00000012223	-	75	47.409	ENSACLG00000003130	-	85	47.409
ENSACLG00000012223	-	89	33.656	ENSACLG00000023850	-	73	33.656
ENSACLG00000012223	-	96	35.277	ENSACLG00000009895	-	77	35.458
ENSACLG00000012223	-	99	47.322	ENSACLG00000012503	-	81	47.322
ENSACLG00000012223	-	99	33.529	ENSACLG00000023216	-	69	33.529
ENSACLG00000012223	-	98	46.844	ENSACLG00000002299	-	79	46.844
ENSACLG00000012223	-	98	41.904	ENSACLG00000010561	-	93	41.904
ENSACLG00000012223	-	53	38.628	ENSACLG00000003896	-	97	38.628
ENSACLG00000012223	-	99	47.322	ENSACLG00000023207	-	81	47.322
ENSACLG00000012223	-	95	35.365	ENSACLG00000025597	-	80	35.365
ENSACLG00000012223	-	97	44.687	ENSACLG00000014673	-	79	44.786
ENSACLG00000012223	-	91	35.467	ENSACLG00000007324	-	98	35.467
ENSACLG00000012223	-	99	33.333	ENSACLG00000019378	-	69	33.333
ENSACLG00000012223	-	91	47.413	ENSACLG00000015440	-	86	47.413
ENSACLG00000012223	-	98	32.619	ENSACLG00000002829	-	76	32.619
ENSACLG00000012223	-	97	32.742	ENSACLG00000019734	-	80	32.742
ENSACLG00000012223	-	76	48.861	ENSACLG00000007947	-	72	48.861
ENSACLG00000012223	-	86	38.159	ENSACLG00000018177	-	78	38.159
ENSACLG00000012223	-	76	36.763	ENSACLG00000020106	-	99	36.763
ENSACLG00000012223	-	76	37.186	ENSACLG00000008786	-	97	37.186
ENSACLG00000012223	-	98	37.635	ENSACLG00000005466	-	79	37.635
ENSACLG00000012223	-	62	30.577	ENSACLG00000014667	-	50	30.577
ENSACLG00000012223	-	98	42.100	ENSACLG00000003800	-	80	42.100
ENSACLG00000012223	-	98	35.490	ENSACLG00000002748	-	85	35.490
ENSACLG00000012223	-	98	33.562	ENSACLG00000012298	-	80	33.562
ENSACLG00000012223	-	80	33.053	ENSACLG00000027045	-	99	33.053
ENSACLG00000012223	-	94	44.810	ENSACLG00000027433	-	99	44.810
ENSACLG00000012223	-	98	31.992	ENSACLG00000022582	-	71	31.992
ENSACLG00000012223	-	75	35.741	ENSACLG00000026023	-	72	35.741
ENSACLG00000012223	-	74	39.896	ENSACLG00000020021	-	92	39.687
ENSACLG00000012223	-	62	31.685	ENSACLG00000005544	-	57	31.685
ENSACLG00000012223	-	63	30.441	ENSACLG00000006792	-	53	30.441
ENSACLG00000012223	-	99	37.741	ENSACLG00000023597	-	80	37.741
ENSACLG00000012223	-	84	36.446	ENSACLG00000018473	-	95	36.446
ENSACLG00000012223	-	98	32.679	ENSACLG00000014342	-	71	32.679
ENSACLG00000012223	-	62	41.331	ENSACLG00000009410	-	66	41.331
ENSACLG00000012223	-	81	47.602	ENSACLG00000011463	-	99	47.602
ENSACLG00000012223	-	76	36.386	ENSACLG00000020885	-	97	36.386
ENSACLG00000012223	-	61	42.047	ENSACLG00000014178	-	67	42.047

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000012223	-	99	48.333	ENSAPOG00000011184	-	90	48.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000012223	-	97	33.202	ENSAPOG00000013536	-	80	33.202	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000012223	-	80	45.858	ENSAOCG00000013559	-	99	45.858	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000012223	-	98	35.763	ENSAOCG00000017326	-	77	35.763	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000012223	-	99	44.477	ENSAOCG00000019370	-	93	44.477	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000012223	-	98	35.984	ENSAOCG00000021572	-	82	35.984	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000012223	-	91	36.146	ENSAOCG00000017045	-	82	36.146	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000012223	-	77	46.926	ENSAOCG00000022482	-	99	46.926	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000012223	-	98	34.694	ENSAOCG00000011998	-	93	34.694	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000012223	-	81	37.383	ENSAPEG00000017325	-	92	37.383	Amphiprion_percula
ENSACLG00000012223	-	98	35.887	ENSAPEG00000017003	-	82	35.887	Amphiprion_percula
ENSACLG00000012223	-	95	33.267	ENSAPEG00000019256	-	99	33.267	Amphiprion_percula
ENSACLG00000012223	-	98	32.527	ENSAPEG00000013213	-	80	32.527	Amphiprion_percula
ENSACLG00000012223	-	77	37.160	ENSAPEG00000015961	-	99	37.160	Amphiprion_percula
ENSACLG00000012223	-	96	37.401	ENSAPEG00000002768	-	71	37.401	Amphiprion_percula
ENSACLG00000012223	-	98	32.527	ENSAPEG00000003616	-	80	32.527	Amphiprion_percula
ENSACLG00000012223	-	76	38.384	ENSAPEG00000003065	-	91	38.384	Amphiprion_percula
ENSACLG00000012223	-	98	35.756	ENSAPEG00000007540	-	85	35.756	Amphiprion_percula
ENSACLG00000012223	-	79	36.495	ENSAPEG00000010007	-	99	36.527	Amphiprion_percula
ENSACLG00000012223	-	76	38.384	ENSAPEG00000002696	-	91	38.384	Amphiprion_percula
ENSACLG00000012223	-	98	36.904	ENSAPEG00000003655	-	70	36.904	Amphiprion_percula
ENSACLG00000012223	-	98	35.984	ENSAPEG00000006674	-	82	35.984	Amphiprion_percula
ENSACLG00000012223	-	98	35.694	ENSAPEG00000001971	-	82	35.694	Amphiprion_percula
ENSACLG00000012223	-	87	46.051	ENSAMXG00000041150	-	86	46.051	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000012223	-	98	34.770	ENSAMXG00000036146	-	80	34.770	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000012223	-	58	41.791	ENSAMXG00000040121	-	71	41.791	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000012223	-	96	33.137	ENSAMXG00000037256	-	79	33.169	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000012223	-	75	35.533	ENSDARG00000103562	CU462878.2	90	35.472	Danio_rerio
ENSACLG00000012223	-	99	37.938	ENSDARG00000088493	si:ch211-149k12.3	81	38.035	Danio_rerio
ENSACLG00000012223	-	77	39.228	ENSDARG00000086420	CABZ01046949.1	99	39.352	Danio_rerio
ENSACLG00000012223	-	96	35.341	ENSKMAG00000000885	-	88	35.341	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000012223	-	81	39.641	ENSKMAG00000014872	-	100	39.641	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000012223	-	76	36.192	ENSKMAG00000015028	-	98	36.192	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000012223	-	86	32.186	ENSKMAG00000003480	-	88	32.297	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000012223	-	98	32.070	ENSKMAG00000006247	-	80	32.070	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000012223	-	98	32.070	ENSKMAG00000008495	-	80	32.070	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000012223	-	98	36.775	ENSKMAG00000022168	-	80	36.899	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000012223	-	52	30.258	ENSKMAG00000006039	-	55	30.275	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000012223	-	85	38.041	ENSKMAG00000015838	-	99	37.856	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000012223	-	97	36.256	ENSKMAG00000015152	-	79	36.256	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000012223	-	82	32.908	ENSKMAG00000006263	-	85	32.908	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000012223	-	54	40.917	ENSKMAG00000009272	-	69	40.917	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000012223	-	98	37.070	ENSKMAG00000015935	-	87	36.909	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000012223	-	98	39.823	ENSKMAG00000000167	-	92	39.823	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000012223	-	50	41.255	ENSKMAG00000014507	-	67	41.255	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000012223	-	52	34.823	ENSLBEG00000015758	-	79	34.823	Labrus_bergylta
ENSACLG00000012223	-	98	32.581	ENSMZEG00005026873	-	70	32.581	Maylandia_zebra
ENSACLG00000012223	-	94	32.824	ENSMZEG00005020294	-	85	32.824	Maylandia_zebra
ENSACLG00000012223	-	53	41.123	ENSMZEG00005021767	-	69	41.123	Maylandia_zebra
ENSACLG00000012223	-	71	32.561	ENSMZEG00005012878	-	92	32.561	Maylandia_zebra
ENSACLG00000012223	-	97	32.146	ENSMZEG00005024554	-	67	32.146	Maylandia_zebra
ENSACLG00000012223	-	76	36.637	ENSMZEG00005015509	-	98	36.842	Maylandia_zebra
ENSACLG00000012223	-	98	32.978	ENSORLG00000022346	-	84	32.978	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	93	33.470	ENSORLG00000029491	-	99	33.846	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	63	42.337	ENSORLG00000028313	-	77	42.337	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	83	33.793	ENSORLG00000026318	-	99	33.793	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	63	41.551	ENSORLG00000016964	-	52	41.551	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	83	35.447	ENSORLG00000027043	-	96	35.447	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	89	35.867	ENSORLG00000023016	-	95	35.768	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	61	36.476	ENSORLG00000029071	-	93	36.476	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	61	36.196	ENSORLG00000029928	-	95	36.196	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	76	34.739	ENSORLG00000025476	-	95	34.739	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	93	34.423	ENSORLG00000030529	-	99	34.423	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	86	45.424	ENSORLG00000024714	-	99	45.198	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	97	34.216	ENSORLG00000024526	-	92	33.855	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	97	34.766	ENSORLG00000024415	-	92	34.766	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	86	34.372	ENSORLG00000029308	-	97	34.372	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	99	35.449	ENSORLG00000023283	-	70	35.449	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	97	34.216	ENSORLG00000027515	-	92	34.216	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	97	34.863	ENSORLG00000021840	-	92	34.863	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	97	34.020	ENSORLG00000027031	-	92	33.659	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	97	33.789	ENSORLG00000027755	-	93	33.789	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	76	34.082	ENSORLG00000025260	-	99	34.082	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	76	33.752	ENSORLG00000023575	-	99	33.752	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	76	35.075	ENSORLG00000025901	-	97	35.075	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	79	33.094	ENSORLG00000029714	-	95	33.094	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	97	34.216	ENSORLG00000027152	-	83	34.216	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	55	40.317	ENSORLG00000023604	-	69	40.317	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	63	40.303	ENSORLG00000027405	-	72	40.335	Oryzias_latipes
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ENSACLG00000012223	-	90	33.298	ENSORLG00000024972	-	95	33.298	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	83	34.491	ENSORLG00000025323	-	99	34.491	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	83	34.415	ENSORLG00000028121	-	99	34.415	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	75	38.095	ENSORLG00000030415	-	97	38.095	Oryzias_latipes
ENSACLG00000012223	-	97	45.120	ENSORLG00000026511	-	99	45.120	Oryzias_latipes
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ENSACLG00000012223	-	89	31.692	ENSXMAG00000027569	-	98	31.692	Xiphophorus_maculatus
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